馬士英請召黔兵入衛，辦走貴陽；工科吳希哲力諫，乃止。
鎮江龍潭驛探馬至，報北兵編木為筏，乘風而下。又一報至，江中發一炮，鎮江城裂四垛。最后楊文驄令箭至，云江中有數筏，疑是北兵；架炮城下，火從后炸，震倒城半垛。再放三炮，江筏粉碎矣』。馬士英將前報二人捆責，而重賞后使。自是，探報寂然。
二十八日（庚辰）
召對百官于武英殿。自左兵報至，帝日怨馬士英究審王之明事，謀所以自全。是日召對，上下默無一言；良久，帝云：『外人皆傳朕囗出去』。王鐸曰：『此語從何而來』？帝指一小奄。鐸正色語奄：『外邊話，不可亂傳』！鐸因請講期，帝曰：『且過端午節』。
北兵將至，朱國弼屏人密奏；帝慨然曰：『太祖陵寢在此，走將焉往？惟死守耳』！
大清遣內院大學士洪承疇招撫江南、御史黃熙胤招撫福建。
五月壬午朔
福王以李彬為都察院右僉都御史，巡撫河南。
是早，有書聯于東、西長安門柱者云：『福王沉醉未醒，全憑馬上胡謅；幕府凱歌已休，猶聽阮中曲變』。又云：『福運告終，只看驢（盧九德）前馬（士英）后；崇基盡毀，何勞東捷（張捷）西沾（李沾）』。
初二日（癸未）
移惠王于嘉興。
初五日（丙戌）
端陽節也；帝因演劇，不視朝。
加黃得功左柱國，進封靖國公，世襲。
賞江上功，加黃得功太傅，遣太監王肇基勞之。并加阮大鋮、朱大典俱太子太保，總兵張武、鄭彩、黃蜚各加三級，副將以下各加一級。
禮部題編修陳之遴、給事中戴英福建主考。
黃得功收軍屯蕪湖。
內侍傳御旨（一作中旨），命乞兒捕蝦蟆為房中藥。時目為「蝦蟆天子」。
初六日（丁亥）
封鄭鴻逵伯爵。
鴻逵封靖鹵伯。
以楊文驄為都察院右僉都御史，巡按常、鎮二府兼察沿海等處軍務（一作兼轄揚州沿海等處軍務）。
有一騎從金川門入馬士英寓。午后，士英入大內，盧九德、田成傳令各門下閘，辰開、申閉。
大清兵駐瓜洲，列營北岸；楊文驄駐京口，合鄭鴻逵、黃斌卿、黃蜚等兵于南岸，隔江相持。大清兵編大筏，置燈火，夜放之中流。南岸軍發炮石，以為克敵也，日奏捷。
大清帥張天祿，故史可法愛將也；鄭鴻逵傷其目一。
馬士英調黔兵三千入城，駐雞鳴山，踐踏僧房、民舍殆遍；每夜，撥二百名守護私寓。
初七日（戊子）
百官集清議堂會議，凡十有六人：馬士英、王鐸、蔡奕琛、張捷、張有譽、錢謙益、李沾、唐世濟、陳盟、李喬、楊維垣、陳于鼎、錢增、張孫振、秦鏞、趙之龍也。坐堂上竊竊偶語，百官集者甚眾，皆不得預聞。臨散，唐世濟、李喬同聲相和曰：『即降志辱身，亦所甘矣』！后有叩之大僚者云：『北信甚急，今已無妨』。蓋所為會議者，藉之龍款之大清也。
初八日（己丑）
發黔兵六百人守孝陵，門禁益嚴。
夜，大清兵乘霧潛濟。迫南岸，諸軍始知；倉皇列陣甘露寺，鐵騎沖之悉潰。
初九日（庚寅）
福建援師潰，楊文驄走蘇州、鄭鴻逵以舟師遁入海。時鴻逵鎮京口，有武弁王姓者以三千金賂職方司黃期升，欲得京口；期升遂調鴻逵鎮山東。未發而北兵臨江，鴻逵聞風先遁。兵皆福建人，紅布裹頭，望之如火；善水戰，號黑鬼。然無守江之志，徑由江入海。
總兵黃斌卿棄軍登舟逃，帝命翁之琪領其軍（之琪，仁和人，崇禎十六年武進士。官副將，隸斌卿標下）。
是日昧爽，煙霧蔽江。大清兵開閘縛芻置木筏上，蔽江而下；三鎮各揚帆東遁，江南諸帥皆潰。蘇松巡撫霍達尚未到任；聞變，即易服潛奔蘇州。黔兵從楊文驄者，止五百人。傳言大清兵已渡江，鎮江無備，南都大震。
大清以疑兵遏……。
初，金華令徐調元擒斬許都謀主房大成，立阻陳子龍撫議；朱大典深恨之，因事羅織，逮下刑部獄。至是，大典兵潰，調元得脫歸（調元，字爾贊，無錫人；崇禎十年進士）。
初十日（辛卯）
福王夜奔太平。
帝傳旨：『三淑女在經廠者，放還母家。縉紳家眷，不許出城』。喚集梨園子弟入大內演劇，帝與盧九德、田成、屈尚忠等雜坐酣飲。二鼓后，帝跨馬與太后、一妃、內奄多人，從通濟門出奔太平府。是日晝晦，大風猛雨，各城門緊閉。
大清兵薄都城，城中無一卒登陣御敵者。
十一日（壬辰）
馬士英奉王母妃以黔兵四百人為衛，走浙江。
黎明，錢謙益肩輿過士英寓，門庭寂然。良久，士英前衣小帽出，向錢拱手云：『詫異，詫異！我有老母，不能隨君殉國矣』！即上馬去。后隨婦女多人，皆馬上妝；家丁百余人擁出城。至孝陵，詭妝其母為太后；以守陵黔兵自衛，走浙江。
按士英走杭，群書皆謂詭妝其母為后。而「明史」「奸臣傳」云：「士英奉王母妃出走』；「諸王傳」云：『潞王奉母妃降于大清』：則以為真。史家固然傳信，而一時劉宗周、熊汝霖、王思任、趙景和諸賢無不責其棄天子挾母后為詐，似非誣也。姑兩存之，以俟考。
帝既出，宮門大開，內外鼎沸，宮女雜走。百姓亂擁入宮，搶掠，御用物件，遺落滿街。內庫銀絹、米荳、物玩、弓刀之屬，皆被劫罄盡。文武百官一時隱匿，洗去寓所封示。男女出城者如蟻，有出而復返者。居民又盡殺城內外黔兵，靡有孑遺。
城門柵門盤詰馬士英中軍八人，送戎政趙之龍斬之。
亂兵擁立王之明于南京。
午刻，百姓千余人擒王鐸至中城獄，令認太子，即群毆之；罵曰：『若偽太子，辜先帝恩』。鐸辨：『非干我事，皆馬士英所使』。百姓曰：『汝舌在士英口中耶』？復毆之，須發俱盡；太子即傳諭止之。百姓隨擁太子上馬，入西華門武英殿；又擁至西宮，取帝所遺冠袍服之，即于武英殿登坐，群呼萬歲。連日天氣陰霾凄慘，是日天日晴朗，眾心歡悅。部寺署官見者，俱行四拜禮；大僚亦間有至者。提督京城趙之龍因民心恨鐸，藏之中城獄中。
戎政趙之龍出示安民，有「此土已致大清國大帥」之語。
十二日（癸巳）
帝至太平府，劉孔昭閉門不納，傍徨江上；不得已，就黃得功營。
太子詔諭民，略曰：『先帝丕承大鼎，惟茲臣庶，同共甘苦；胡天不佑，慘罹奇禍。凡有血氣，裂眥痛心！泣予小子，分宜殉國。思以君父大讎不共戴天，皇祖基業汗血匪易；忍垢避匿，圖雪國恥。幸文武先生迎立福藩；予惟先帝之哀，奔投南國，實欲泣陳大義。不意巨奸構陷，致攖桎梏；予雖幽囚，無日不痛哭也（一作痛絕）。福王聞兵遠遁，先為民望，其如高皇帝陵寢何？泣予小子，父老人民圍抱出獄，擁入皇宮；予身負重冤，豈南面稱尊之日乎！謹此布告，在京勛舊文武先生、士庶人等念此痛懷，勿惜會議！予當拱聽，共抒皇猷。勿以前日不識予之嫌，靳予經綸之教也』。
福王至蕪湖，阮大鋮與朱大典入見舟中，共誓力戰；因命大鋮、大典俱兼東閣大學士督師。
以揚州府同知李繼晟為都察院右僉都御史，巡撫安慶。
黃得功方收兵屯蕪湖，福王潛入其營；得功驚泣曰：『陛下死守京城，臣等猶可盡力！奈何聽奸人言，倉卒至此。且臣方敵寇，安能扈駕』？王曰：『非卿無可仗者』！得功泣曰：『愿效死』！
得功向帝泣曰：『陛下倉卒行幸，今進退無據；此陛下自誤，非臣等誤陛下也。臣營軍薄如此，其何以處陛下哉』！帝俛首無語，暫留營中。
十三日（甲午）
太子令釋王鐸于中城獄，仍命為大學士；釋高夢箕于刑部獄，升禮部右侍郎兼東閣大學士。鐸、夢箕出獄，即遁去。
趙之龍召勇衛營兵入城，城中乘間而出者甚眾，柵禁稍寬；店肆亦有開張者。
文武諸官集中府會議，錢謙益太息曰：『事至此，惟有作小朝廷求活耳』。齒及太子，皆有難色。曰：『前日幾番之囗，恐有蹈呂、張之咎者。且弘光帝復來，奈何』？趙之龍曰：『此中復有新主，款使北歸，其無辭以善后』！眾皆然之，遂散。各衙門出示安民，但言守城，并不及立新主之事矣。
百姓焚毀馬士英、馬錫寓并阮大鋮家。士英寓在西華門；錫寓在雞鵝巷，即北門喬都督公署。大鋮家最富，歌姬甚盛，頃刻星散。
太子敕封中城獄神為王，差官捧敕，二人前導；至獄中，開讀敕文，稱崇禎十八年。兵馬司官素服迎之。
侍郎陳盟、王一心等逃。
監生徐瑜、蕭某謁趙之龍，勸其早奏請太子即位；之龍立斬之。推官某自北軍歸，趙之龍入西宮勸太子避位，斬為首擁立太子者趙某等三人。懷遠侯常延齡身自灌園，蕭然布衣以終老。福王時，諸徹侯莫不恣睢，獨延齡以守
職見稱（延齡，遇春十一世孫）。
刑部尚書高倬投繯死。
左副都御史楊維垣驅二妾入井，整衣冠自經死；人以為晚云。
吏部尚書張捷，走雞鳴寺投繯死。捷居家孝友，在官有清節，雅為鄉人所稱；以惡東林，終身與匪人比，名因以隳。然其死也，士論咸與之。
張捷聞太子即位，王鐸被毆幾死，恐以次及己；微行至雞鳴寺，以佛旛帶自縊于僧舍。楊維垣亦懼見討，先勒二妾朱氏、孔氏死；為買棺木三，旁置二妾、中題楊維垣之柩，并埋中堂。身挈一仆夜遁；至土橋，為怨家所殺。數日，仆蹤跡之，尸為犬食過半。
許譽卿薙發為僧，久之卒。
馬士英經廣德州，知州趙景和曰：『彼不奉君而奉母后，詐也』！閉門拒守。士英攻城破，執景和殺之，大掠而去。
景和，字萬育，天啟六年舉人。崇禎末，官瀘州知州，未赴。弘光立，調廣德。士英帷其母車中，詐稱太后；士卒著紅綺婦人衣，臂釧、髻發重簪，望之若優伶。所過村落，焚掠一空。道過廣德，檄知州備法駕迎皇太后，且獻庫金萬緡犒軍；景和裂其檄，出示毋納賊臣。士英攻城，四門縱火。城陷，景和坐廳事；士英曰：『爾小臣，敢抗命耶』？景和曰：『汝為國元臣，棄君不顧，敢冒太后名，誰不知為若母也者！吾恨不能殲賊臣以謝天下』！士英顧卒兵之，景和罵不絕口而死。妾秦氏，哭之曰：『公為國死，我當從公』！從樓上跳入井中死。
中書舍人陳爊及子伯俞殉節。爊，字胤業，孟津人，崇禎十六年進士；授青浦知縣。未之任，朝于南京。福王在潛邸時，避兵孟津，識之；因改授中書。聞帝奔太平，欲追駕；慮不及，遂死之。伯俞，崇禎十五年舉人；抱父尸痛死。
光祿寺卿葛征奇、戶部員外劉光弼，俱殉節死。
總督京營忻城伯趙之龍具表將出降，入戶部封府庫。郎中劉成治憤甚，手搏之；之龍跳而免（成治，字廣如，漢陽人，崇禎七年進士）。
誠意伯劉孔昭遁。麾下總兵彭述性合家投水死。李全祿先沉其妾，乃自沉（述性，九江人；全祿，四川人）。
十四日（乙未）
無錫知縣林飭遁，內衙搶掠一空；邑紳請教授朱伯連掌印，而印已被林飭挈去。先是，十二日，衙役王喜向庫吏索債，庫吏以喜劫庫告林；即刻殺喜。各衙役大哄，口稱為喜報仇；林遂夜遁。
十五日（丙申）
大清兵營于城北，勛臣自趙之龍、湯國祚、柳祚昌等、文臣自王鐸、錢謙益、張孫振等文武數百員、馬步兵二十余萬，俱迎降。
大清兵到，戎政府、都察院各遣官二員迎跪道旁，高聲報名。將近豫王前，兵士高聲喝起。文武百官隨即出城迎接，時正大雨淋漓，無一人敢稍后者。豫王頓兵城外，駐天壇中（豫王：名多多）。
總督京營戎政少保兼太子太保忻城伯趙之龍，以軍士二十二萬迎降。
太子太保禮部尚書兼文淵閣大學士蔡奕深、太子太保禮部尚書兼翰林院學士錢謙益、太子太保左都御史李沾、太子太保左都御史管右都御史事唐世濟迎降。
自署掌都察院事兵部右侍郎李喬迎降。
兵部左侍郎朱之臣、右侍郎梁云構迎降。
翰林院掌院事詹事府正詹事陳于鼎、右諭德兼翰林院編修程正揆、翰林院李景濂、劉正宗、張居等迎降。
右僉都御史鄒之麟迎降。
給事中錢增、陸朗、丁允元、王之晉等迎降。
御史張孫振、徐復陽、袁弘勛、王懩等迎降。
魏國公徐允爵、保國公朱國弼、靈璧侯湯國祚、安遠侯柳祚昌、永康侯徐弘爵、臨淮侯李述祖、鎮遠侯顧鳴郊、隆平侯張拱日、懷寧侯孫維城、寧安侯鄧文郁、南和伯方一元、博平伯郭祚永、寧東伯焦夢熊、寧晉伯劉印吉、惠安伯張承志、大興伯鄒存義、洛陽伯黃中鼎、襄惠伯常應俊等迎降。
柳祚昌投誠惟恐不及，一隸卒哭止之曰：『侯世受國恩，此行可緩，愿自愛』！祚昌叱之，卒牽衣不放。祚昌怒，批其頰。至中河橋，卒曰：『侯不聽我，我死矣』！仰天擗踴，遂投河死。
錢謙益姬柳如是勸謙益取義全大節，以副盛名。謙益有難色，如是奮身欲沉池水中，謙益持之不得入。長洲沈明倫館于其家，所親見者。后錢、柳游拂水山莊，錢見石澗流泉澄潔可愛，欲濯足其中，而不勝前卻；柳戲語曰：『此溝渠水，豈秦淮河耶』！錢有恧容。
掌宗人府事太子太保駙馬都尉齊贊元迎降。
太監高起潛迎降。
承天守備盧九德迎降。
安慶鎮將楊振宗降于大清，仍授總兵官。極言羅九武等為江北害，豫王遣卜從善、張天祿擒羅九武、孫得功斬于市而散其所部兵，并釋所掠子女。
欽天監五官挈壺正陳于階，字瞻一，上海人。聞帝出奔，毅然曰：『主辱臣死，豈獨為公卿大臣詔哉』！往天皇堂禮拜。至夜，自縊死。
江寧黃金璽聞大臣皆降，大書于壁曰：『大明武舉黃金璽一死以愧人臣之懷二心者』；遂自縊。
戶部江西司郎中劉成治自縊死。先兩月，有所善僧精「易數」，為成治筮，得大兇兆；成治曰：『事果不測，愿自殉以報先皇帝』！遂寄孤于洞庭，訣辭甚愴。