朱逷先先生曰：『漳州海門(mén)之戰(zhàn)，清兵由漳港、同安港兩路出師，而各有重要人物主持。此書(shū)對(duì)于兩港主要敵師，既不明敘，已無(wú)知彼知己之明，又不能先提綱領(lǐng)，再為分?jǐn)?，遂致兩港人物，時(shí)有混淆。如敘漳港之師，而言黃梧、施瑯等不敢前進(jìn)，只在觀望。而阮旻錫敘此戰(zhàn)則較明晰。如云：「漳州港內(nèi)，先遣大船一百號(hào)，配以漢兵，部院李率泰同海澄公黃梧督之，出海澄港。同安港收拾小船，滿(mǎn)將軍達(dá)素同同安總鎮(zhèn)施瑯，配以滿(mǎn)兵，橫渡高崎」（見(jiàn)海上見(jiàn)聞錄上）』。
二十日，拔前協(xié)何義為虎衛(wèi)左鎮(zhèn)，拔陳廣入侍衛(wèi)管效缺。
二十五日，報(bào)達(dá)素回省，傳令各船并舵梢暫發(fā)回候，七月有令再吊（調(diào)）。
藩集諸將議曰：『此番達(dá)虜來(lái)侵，雖被我殺敗，其船只所失無(wú)幾，滿(mǎn)慮領(lǐng)先鋒者所擒殺亦不多。偽朝既吊（調(diào)）數(shù)省兵馬船只，動(dòng)費(fèi)許多錢(qián)糧，若此一戰(zhàn)，達(dá)素、率太亦難回奏，勢(shì)必湊集再?zèng)Q勝負(fù)。但舵梢囗吊（調(diào)）齊，動(dòng)京（經(jīng)）數(shù)月，我?guī)熂Z費(fèi)浩繁，豈能坐待其戰(zhàn)？爾等各歸原汛，就地養(yǎng)兵，又須囗家眷囗浯州、金門(mén)，并空思明以待之。諸將但囗聽(tīng)令派札汛地』。遣左先鋒札佛潭橋，宣毅右鎮(zhèn)札銅山、古雷，宣毅左鎮(zhèn)、右沖〔鎮(zhèn)〕札云霄，義武鎮(zhèn)、游兵鎮(zhèn)札舊鎮(zhèn)、杜潯，智武鎮(zhèn)、前沖鎮(zhèn)札南溪、錢(qián)山、龍井，援剿右鎮(zhèn)札海門(mén)，禮武鎮(zhèn)札三都，援剿左鎮(zhèn)札崇武，奇兵鎮(zhèn)札湄洲，正兵鎮(zhèn)札南日，宣毅前鎮(zhèn)札海壇，后勁鎮(zhèn)札詔安、玄鐘，援剿前〔鎮(zhèn)〕札高崎，左沖鎮(zhèn)札新城，前提督札思明州，親軍等鎮(zhèn)隨本藩駐札浯州。
六月初囗日，藩駕駐浯州后埔城。其思明州將領(lǐng)官兵家眷一盡移金門(mén)、浯州、烈?guī)Z等處。居民有搬移過(guò)水者，聽(tīng)其自便，不禁。
藩發(fā)諭與達(dá)素并偽院李率太，約其合兵再戰(zhàn)，仍遣以巾幗，不敢再戰(zhàn)則受之。差禮武鎮(zhèn)、犯罪中軍吳亮并罪犯俞承二人，俱持巾幗，并諭赴達(dá)素等二處投遞。達(dá)素、率太答書(shū)俱受巾幗，厚待差員。而回書(shū)諭俱在禮科。
七月，藩駕駐后浦城。
初五日，藩差員特頒左沖鎮(zhèn)黃安銀三百兩賜之，以孤城鎖鑰，前臨大敵，尤（猶）撥出陳廣為水師，得功受賞。其自守城池，固如金湯。茲番大隊(duì)出征，并空思明，又獨(dú)任而不請(qǐng)代，真良將也。左沖鎮(zhèn)望北拜受，仍以三百兩頒分將領(lǐng)官兵，均沾藩賜，三軍倍為歡騰。
初十日，遣右武衛(wèi)周全斌提督親軍驍騎鎮(zhèn)馬信率左右虎衛(wèi)鎮(zhèn)、后沖、中沖、正兵、奇兵等鎮(zhèn)北征，略地取糧。囗吊（調(diào)）囗勁囗協(xié)防漳港。
二十日，右武衛(wèi)周全斌等攻破囗頑寨。其寨依山近水，我?guī)煘巢矗瑫r(shí)常恃囗阻梗，出沒(méi)牽我哨船，至是平之，藉其資重糧米甚多。
八月，藩駕駐后浦城。
初八日，吊（調(diào)）回奇兵鎮(zhèn)札興化一帶地方，正兵鎮(zhèn)札福清一帶地方，宣毅右鎮(zhèn)黃元統(tǒng)領(lǐng)仁武、義武二鎮(zhèn)札澄海、小埕、長(zhǎng)樂(lè)一帶地方，聯(lián)絡(luò)征餉。
九月，藩駕駐后浦城。
初三日，思明知州鄧會(huì)條陳：
『思明附城內(nèi)外百姓未有回家，惟有禾山四都一二貧民婦女竊自逃回。據(jù)百姓紛訴：「本藩令諭搬移，出于愛(ài)民，敢不遵依。第搬移日久，風(fēng)餐露宿，百苦備嘗，搬回出于不得已也」。職思狡慮既已敗回，再犯必奉偽旨。百姓搬出已久，若不放其歸回，四民失業(yè)，未困于敵，先死于饑也。除搬回者暫準(zhǔn)安住，其未回者聽(tīng)從民便』。
藩批曰：『是』。繇（由）是思明百姓并將領(lǐng)家眷絡(luò)繹而回。
二十日北征右武衛(wèi)等班回，藩令各鎮(zhèn)修葺船只，輪番出征。
十月，藩駕回駐思明州。報(bào)達(dá)素回京，各水師盡吊（調(diào)），俱閣在岸邊。
催各鎮(zhèn)修葺船只，限月終報(bào)竣，赴十一月出征。
十一月，藩駕移駐金門(mén)城。
初二日，遣右武衛(wèi)周全斌為總督，提調(diào)左右虎衛(wèi)鎮(zhèn)、援剿后鎮(zhèn)；以馬掛印為副督，提調(diào)羅蘊(yùn)章；仍以宣毅后鎮(zhèn)吳豪暫統(tǒng)宣毅前鎮(zhèn)、殿兵、游兵等鎮(zhèn)及后沖副將張華；以中沖鎮(zhèn)暫統(tǒng)領(lǐng)宣毅左鎮(zhèn)、右衛(wèi)等鎮(zhèn)；以援剿前鎮(zhèn)暫統(tǒng)領(lǐng)英兵、后勁二鎮(zhèn)；而后沖鎮(zhèn)總領(lǐng)水師官兵；前往南下取糧。
是月右武衛(wèi)等師到潮陽(yáng)縣，進(jìn)入和平貴嶼取糧。攻破鳳囗，殺敗潮州援虜。各船俱取有糧米稱(chēng)是。
十二月，藩駕駐金門(mén)，吊（調(diào)）右武衛(wèi)等南征大師班回。
十五年辛丑（一六六一）正月，藩駕駐思明州。傳令大修船只，聽(tīng)令出征。集諸將密議曰：『天未厭亂，閏位猶在，使我南都之勢(shì)，頓成瓦解之形。去年雖勝達(dá)虜一陣，偽朝未必遽肯悔戰(zhàn)，則我之南北征馳，眷屬未免勞頓。前年何廷斌所進(jìn)臺(tái)灣一圖，田園萬(wàn)頃，沃野千里，餉稅數(shù)十萬(wàn)，造船制器，吾民麟集，所優(yōu)為者。近為紅夷占據(jù)，城中夷伙，不上千人，攻之可垂手得者。我欲平克臺(tái)灣，以為根本之地，安頓將領(lǐng)家眷，然后東征西討，無(wú)內(nèi)顧之憂(yōu)，并可生聚教訓(xùn)也』。時(shí)眾俱不敢違，然頗有難色。惟宣毅后鎮(zhèn)吳豪京（經(jīng)）到此處，獨(dú)言『風(fēng)水不可，水土多病』，藩心含之，謂其有阻貳師也。獨(dú)協(xié)理中軍戎政楊朝棟倡言可行，藩嘉與之，故于事平日任以府尹事，誅吳豪。
二月，藩提師札金門(mén)城，候理船只，進(jìn)平臺(tái)灣。時(shí)船只修葺未備，派首二程而行。首程本藩并文武親軍右武衛(wèi)、左右虎衛(wèi)提督驍騎鎮(zhèn)、左先鋒、中沖〔鎮(zhèn)〕、后沖鎮(zhèn)、宣毅前后鎮(zhèn)、禮武鎮(zhèn)、援剿后鎮(zhèn)等刻期先行。令鎮(zhèn)守澎湖游擊洪暄前導(dǎo)引港。以兵官前提督居守思明州，戶(hù)官居守金門(mén)。藩親祭江，傳令船只盡駕到料羅澳，催官兵候齊聽(tīng)令，下船開(kāi)駕。
三月初十日，藩駕駐料羅候順風(fēng)囗，囗多以過(guò)洋為難，思逃者多。隨委英兵鎮(zhèn)陳瑞搜獲捉解。
二十二日，催官兵在船。
二十三午，天時(shí)霽靜，自料羅囗。
二十四日，各船俱齊到澎湖，分各嶼駐札。藩駐塒內(nèi)嶼，候風(fēng)開(kāi)駕。
二十七日，大師開(kāi)駕，至柑桔嶼阻風(fēng)，又收回彭湖塒內(nèi)嶼。時(shí)官兵多不帶行糧，因何廷斌稱(chēng)數(shù)日到臺(tái)灣，糧米不竭，至是阻風(fēng)乏糧。藩令戶(hù)都事同洪游擊就彭湖三十六嶼囗取行糧囗正供。時(shí)吊（調(diào)）集各澳長(zhǎng)追取接給，各澳長(zhǎng)搜索二日，回稱(chēng)：『各嶼并無(wú)田園，可種禾粟，惟蕃薯、大麥、黍稷，升斗湊解，合有百余石，不足當(dāng)大師一餐之用』。藩驚乏糧，又恐北風(fēng)無(wú)期，隨于三十晚傳令開(kāi)駕。時(shí)風(fēng)報(bào)（暴）未息，風(fēng)雨陰?kù)F，管中軍船蔡翼并陳廣等跪稟：『暫候風(fēng)雨開(kāi)駕』。藩諭曰：『冰堅(jiān)可渡，天意有在。天意若付我平定臺(tái)灣，今晚開(kāi)駕后，自然風(fēng)恬浪靜矣。不然，官兵豈堪坐困斷島受餓也』？是晚一更后，傳令開(kāi)駕，風(fēng)雨少間，然波浪未息，驚險(xiǎn)殊甚。迨至三更后，則云收雨散，天氣明朗，順風(fēng)駕駛。
四月初一日黎明，藩坐駕船即至臺(tái)灣外沙線(xiàn)，各船魚(yú)貫絡(luò)繹亦至。辰時(shí)天亮，即到鹿耳門(mén)線(xiàn)外。本藩隨下小哨，繇（由）鹿耳門(mén)先登岸，踏勘營(yíng)地。午后，大船齊進(jìn)鹿耳門(mén)。先時(shí)此港頗淺，大〈舟宗〉船俱無(wú)出入，是日水漲數(shù)尺，我舟極大者亦無(wú)囗，囗天意默助也。是晚，我舟齊到，泊禾寮港，登岸，札營(yíng)近街坊梨囗鎮(zhèn)督虎衛(wèi)將坐銃船札鹿耳門(mén)，囗水師甲板，并防北線(xiàn)尾。
是晚，赤崁城夷長(zhǎng)貓難實(shí)叮發(fā)炮擊我營(yíng)盤(pán)，并焚馬囗。其赤崁街系我民居草厝，藩恐被焚毀糧粟，特差戶(hù)都事楊英持令箭委同楊戎政督同援剿后鎮(zhèn)張志官兵看守堵御，不許官兵混搬，亦不可致紅夷焚毀，候明日分派發(fā)給官兵糧食。繇（由）是各街米粟看守完全，無(wú)敢侵?jǐn)_。次日，即令戶(hù)都事楊英將街中米粟，一盡分發(fā)各鎮(zhèn)兵糧，計(jì)勻足半個(gè)月。
初三日，宣毅前鎮(zhèn)囗官兵札營(yíng)北線(xiàn)尾，夷長(zhǎng)揆一城上見(jiàn)我北線(xiàn)尾官兵未備，遣戰(zhàn)將拔鬼仔率鳥(niǎo)銃兵數(shù)百前來(lái)沖囗，被宣毅前鎮(zhèn)督率向敵一鼓而殲，夷將拔鬼仔戰(zhàn)死陣中，余夷被殺殆盡。
初四日，赤崁城夷長(zhǎng)貓難實(shí)叮以孤城援絕，城中乏水，欲降。先一日，其弟同婦外囗游，被我兵捉獲解藩，藩慰諭囗，加意囗送歸赤崁城，與兄實(shí)叮道述德意。至是日議降，藩遣番通事吳邁、李仲同楊戎政招諭之，誓無(wú)殺害之意。遂赴藩前納降，仍令原駐城中，并厚賜唐山土儀。藩遂遣實(shí)叮往臺(tái)灣城招揆一來(lái)降。令諭招我百姓回家樂(lè)業(yè)。
初五日，夷王揆一遣我民充番通事胡興同揆一人囗藩說(shuō)和，藩諭令夷長(zhǎng)來(lái)見(jiàn)。
初六日，揆一遣夷長(zhǎng)囗等同實(shí)叮囗見(jiàn)，藩賜宴厚禮之，令何廷斌問(wèn)：『揆一何日出降』？答云：『揆一無(wú)降，若藩主兵將抽回，年輸囗稅若干萬(wàn)并土產(chǎn)囗貨隨意聽(tīng)從，年年照例貢納。至此番大師船只俱納囗歸官兵，愿送勞師銀十萬(wàn)兩』云云，余無(wú)敢言。藩卻之，令發(fā)回。
各近社土番頭目，俱來(lái)迎附，如新善、開(kāi)感等里，藩令厚宴，并賜正副土官袍帽靴帶。繇（由）是南北路土社聞風(fēng)歸附者接踵而至，各照例宴賜之。土社悉平，懷服。
時(shí)紅夷尚有水師甲板在港。藩遣宣毅前鎮(zhèn)、侍衛(wèi)鎮(zhèn)陳廣并左虎協(xié)陳沖等為水師攻打甲板一囗，囗?yè)舫良装逡恢?，燒焚甲板一只，走回一只。自后甲板泊宿臺(tái)灣城下。