南直：南直隸的簡稱。明代稱直屬于京師的地區為直隸。自明成祖永樂初建都北京（今北京市）后，又稱直屬于北京的地區為北直隸，直屬于南京（今南京市）的地區為南直隸。南直隸轄區相當于現在的江蘇、安徽兩省。上海：今上海市。節：守節。矯摯（治zhì）：矯健勇猛。摯，通“鷙”，兇猛。饒：富于。英分：天分。躡（聶niè）：輕步爬登。雉（志zhì）：“雉堞”的簡稱。城上矮墻。龍華寺：在上海市西南郊。陟（秩zhì）：登高。趺（膚fǖ）：盤膝而坐。頂盤：塔建筑的頂部分有盤，稱作“頂盤”。層折：一層一層地轉折。進凡思五六指，乃祝筆：深入思考，總要想到五六層意思，才開始動筆。指，借為“旨”。祝，屬。這句說：讀他的文章，要不辭辛苦，一再深思，雖然倉猝之間還不能體會，可是文中所說的事，實際上是可以試驗施行的。顧盼：警覺。仞：古時以周尺八尺為“仞”。千仞：八尺。這句意思說：他能夠立在很高的高度來思考事物。北雍：北直隸的國子監（太學）。雍，“辟雍”的省稱，太學。順天：順天府，今北京市。首解：就是“解元”，鄉試第一名的稱呼。徐光啟于萬歷二十五年（）舉順天鄉試第一。甲辰：萬歷三十二年（）。庶常：“庶吉士”的另稱。明代在翰林院高吉士官，選進十之優于文學、書法者擔任。約以二言：歸結為兩句話。萬歷：明神宗年號（—），其最后一年，自八月起，改稱泰昌元年，為光宗年號。廟謨：國政。臣勞：大臣的職事。頹：敗壞。優尊：養尊處優。此四字：指“求精”、“責實”。可呼沉寐：可以喚醒沉睡。長計：上策。甫：剛才。釋褐（赫hè）：換去布衣穿上官服，指考中進士（舊制新進士到太學行“釋褐”禮）。褐，粗布衣服。一口裕之也：（徐光啟）一句話就充分地把它說出來了。簡討：翰林院的官名，職位次于編修。“簡”原作“檢”，因避明思宗朱由檢的諱，改為“簡”字。徐光啟于萬歷三十五年（）任翰林院簡討。禮闈：擔任考試官。因為考試進士的事務由禮部的管理，故稱“禮闈”。徐光啟于萬歷四十一年（）任考官。魏南樂：就是魏廣微。因他是南樂（今河北南樂）人，故稱為魏南樂。為人狡猾，沒有氣節，宦官魏忠賢得勢后，他以同鄉、同姓依附于魏忠賢，官至禮部尚書兼東閣大學士，參與機務，更加諂附忠賢，陷害好人。崇禎初年，削奪官職。不協：不合。移病：移書稱病，即上書請病假。津門：天津。徐光啟于萬歷四十一年（）八月托病請假，赴天津屯墾。間疆：邊地、荒地。《農政全書》共分十二個部分，計六十卷。這里所說的“十二卷”，實際上是“十二門”。春坊：太子官的稱呼。有左、右春坊。贊善：太子官屬的名稱。有左、右贊善。徐光啟在萬歷四十五年（）任左春坊左贊善職。敕：皇帝的詔令。慶藩：慶王。奉命冊立諸王，照例受到贈禮。慶王援例送二百金及幣、儀等物給徐光啟，光啟都退還了。于此可見他的廉潔。萬歷四十六年（），清兵攻占撫順，明朝東疆緊張。明廷派楊鎬（號hào）經略遼東。楊領兵十三萬，分四路進兵：馬林帥北路軍，杜松帥西路軍，劉綎（廳tīng）帥東南路軍。這種布置，戰績很長，兵力分散，在戰略上是很失策的。策：預料。杜將軍：杜松。杜松的部隊出撫順，沿渾河左岸進蘇子河谷，至新賓西吉林崖，中清兵埋伏，全軍覆沒，杜松戰死。劉綎軍也相繼大敗，明軍全線潰退。這時是萬歷四十七年（）三月。訓兵：練兵。通州：北通州，今北京市通縣。詹事府：管理太子家庶務的衙門。設詹事、少詹事職。徐光啟于萬歷四十七年（）九月升詹事府少詹事職。河南道：轄河南府（府治在今洛陽）及汝州（今河南臨汝）。御史：監察官。更番：軍隊調訪。神廟崩：明神宗在萬歷四十八年（）七月去世。予告：舊時朝廷官員年老歸家稱“予告”。籍：原籍。天啟：明熹宗年號，元年為公元年。遼警：（清軍入侵）遼東邊防告警。這句說：起用徐光啟參與軍務。知，主管。熊廷弼：字飛百，江夏（今湖北武昌）人。楊鎬被清軍打敗后，代鎬經略遼東。勞子：勞苦的兒子。予：給。遼陽：今遼寧省遼陽市。海、蓋四州：海州衛（今遼寧海城縣）、蓋州衛（今遼寧蓋平縣）、復州衛（今遼寧復縣）、金州衛（今遼寧金縣）。第：但是。斷：決人計。浪營城外：輕率地布防在城外。寒：使單薄。指：宗旨、規劃。廟：朝廷。成畫：確定的計劃。黨事：黨派的意見。左：違。沈、遼：沈陽、遼陽。廣寧：今遼寧北鎮縣。經、撫：經略、巡撫。當時院落經略為熊廷弼，廣寧巡撫為王化貞。按理王化真應受熊廷弼的節制，但因委任不專，王化貞不聽熊廷弼的指揮。熊主守，王主攻。大壞：大局的敗壞。臺：御史臺的簡稱。抨：抨擊。疾歸：稱病辭歸。癸亥：明熹宗天啟三年（）。《神廟實錄》：即《神宗實錄》。“實錄”是記載一朝帝王史事的官書，在一個帝王的去世后編修。魏珰（當dāng）：指魏忠賢。珰，本是帽子上的一種裝飾，宦官所戴的帽，飾有金珰，故以“珰”為宦官的別稱。南樂廣微：指魏廣微。通譜：同姓通譜，表示是一家人。參見前注。固不應：徐光啟堅持不與魏廣微等同流合污，互相勾結。嗾（sǒu）臺臣論劾：指使那些御史彈劾（徐光啟）。崇禎初：崇禎元年是公元年。這時，明思宗登位，歎除弊政，斥魏忠賢，起用忠正大臣。經筵：講經官和帝王聯講認經史。稱為經筵。這句說：上奏章建議，在經筳中除了時論經史外，同時也評論目前軍國大事和古今政治沿革利弊。太子賓客：官名。職務是對太子進行調整護和規諫。副總裁：副總編輯。插：蒙古部落插漢（也寫作“察罕”）的簡稱。居住在原察哈爾地區。偤：偤長。虎墩兔：插漢部族打來孫的四世孫，很為強悍，有時率領他的部族犯明產疆，有時又與清軍火敵。宣、大：宣化、大同。虎墩兔犯宣、大，是崇禎元年（）事。唯臣所須：讓我來安排用途。須，需用。牽沮：牽制和阻礙。執：擔任。咎（救jiù）：過失。改本部左：改任禮部左侍郞。前面說，“拜禮部右侍郞”，故這里的“本部”指“禮部”。遵化不守：崇禎二年（）十一月，清軍攻下長城在北京紫禁城內。垛（朵duǒ）：土堆的防御工事。毖（避bì）：謹慎，這里指妥善準備。走勅：派人持令奔走。招徠：搜集散兵和逃亡的老百姓。袁崇煥：明末名將。以兵部尚書職督師薊（河北）、遼（遼東）。遼左：遼東。倖戰：徼幸作戰。辛未：崇禎四年（）。大凌河：指大凌河城，在遼寧錦江縣東四十里（現在是大凌河店，沈、山鐵路經過它），明初所建。明末，清兵屢在此處與明軍作戰，至崇禎四年攻下后，城墻被清軍毀掉。孫元化：江蘇嘉定人，天啟舉人。徐光啟的學生，精通西洋火器。崇禎初年，任登、萊巡撫。登州：登州府，位在山東半島東端，治所當今山東蓬萊縣。吳橋之變：崇禎四年（）十月，登、萊巡撫孫元化的部下鋀州游擊孔有德，率部屬千余人循陸路赴寧遠衛（今遼寧興城縣）增援，閏十一月，行至吳橋（今河北吳橋縣），逢大雪，無所得食，發生兵變。史稱“吳橋之變”。酷水火：意思是說：斗爭得很嚴重、殘酷，有如水火不相容。逢：逢迎。自盡：自己盡自己的能力。將：將事，即辦事的意思。東閣：明朝的大學士都帶殿、閣的頭銜，其中之一是東閣。孫承宗：字稚繩，高陽人，明末名將，通曉邊事。天啟初年，累官兵部尚書，自請以原官督理遼東防務。行邊：督理邊防事務。老謝事：年老請求退休。太保：位望高重的官職，為三公（太師、太傅、太保）之一。文淵閣：明朝皇家藏書閣名。享：祭祀。太廟：帝王的祖廟。釋奠：設置酒食來祭祀。先師：孔子。代表朝廷祭祀太廟與先師，是德高望重的表征。李天經：精通算法、天文。初為山東參政，后任光祿寺卿。與徐光啟、李之藻及西洋人龍華民、湯若望等同修《崇禎歷書》。完成修訂歷法的事務，誠：叮囑。年七十有二：“二”原作“三”，今依各種傳記資料和《后樂堂徐氏家譜》訂正。少保：也是位望高理的官職，為三少（少師、少傅、少保）之一。裨：益。邦本：國家的根本。兩廕（印yìn）：兩代借廕庇而敘官。廕，同“蔭”。舊時的制度凡是子孫因先世的勛勞而鍂敘官職的，稱為廕。澹：同“淡”。無間：沒有間隔。這各大說；不管睡眠和吃飯時候，都不忘記研討富國強兵的學問。先子：稱去世的父親。徐光啟的父親名思誠，字懷西。勇退：勇于退讓。就是“不爭先”的意義。權之：權衡于。火攻：用火器（指火炮）作戰。漕河：水運叫做“漕”。明朝北都的官糧、軍糧，都依賴大運河從東南運來，故稱大運河為“漕河”。二年：“二”原誤作“元”，據徐光啟《治歷疏稿》及《明史·莊烈帝本紀》、《明史·歷志》校改。欽天監推算刻數不合：崇禎二年五月朔（年月日），日蝕。欽天監依《大統歷》推算蝕三分二十四秒，依《回回歷》推算蝕五分五十二秒，都不合。徐光啟依西洋歷法預推：順天府（今北京市）蝕二分多一點，應天府（今南京市）蝕八分多一點，瓊州（今海南島海口市）全蝕，大寧（今內蒙古平泉縣北）以北不蝕。證驗下來，完全符合。光啟受命監修歷事：崇禎二年五月朔日食，欽天監依舊法推算不合后，禮部奏請修改歷法，推徐光啟、李之藻和西洋人龍華民等任其事。崇禎帝即予批準。徐光啟就開設歷局，翻譯歷書，并進行觀測。龍華民：NicolausLongobardi，意大利西濟利亞人，生于年，卒于年。年來華。譯有《地震解》等書。湯若望：AdamSchallvonBell，日爾曼人。生于年，卒于年。年來華。譯有《渾天儀說》、《交食歷指》等天文、歷法書甚多。上《歷書》前后共三十一卷：歷局所上《歷書》，前后五次，總數一百三十七卷。這里寫“三十一卷”，是不完全的統計。交食：日、月蝕。太陽和月亮同在黃道和白道的交點附近某一范圍之內，便會發生日、月蝕，故稱日、月蝕為交食。計十二目：《農政全書》分十二個部分，就是：農本、田制、農事、水利、農器、樹藝、蠶桑、蠶桑廣類（講木棉和麻）、種植、牧養、制造、荒政。立虛、實二法招徠之：招徠民眾墾荒，徐光啟建議虛、實二法：虛法是給以爵、祿，爵是虛名，祿是墾者自己耕種的果實，也是虛的；實法則為在科舉考試制度中，另立屯額鄉試，給以特殊的科名機會，借此來鼓勵人口繁密的地方移民屯墾。惟：謀，考慮。漕議：徐光啟著《漕河議》（文見《明經世文編》卷四百九十一），討論漕河的利害，并建議治黃河的對策。因為漕河的一段奪去了黃河故道。靡：靡費。這句說：國家貧困的原因，就是由于漕運運費太大，西北一地坐在那里靡費了東南大量的財富。滋：灌溉。會通河：即今山東省東平縣安山鎮到臨清市之間的運河。元世祖至元二十六年（）開筑，全長二百五十余里，上連御河（今衛河），下接泗水；引汶水通航。禹河故道：相傳夏禹所治河（指黃河）的下游老路，當在山東東平境。“禹河故道”四字原殘缺，據《漕河議》補。準望：古代的地理學和測量學名詞，就是“方位”。地形：“形”字原殘缺，所《漕河議》補。經、權：永久辦法和臨時措施。《漕河議》說：“定形為經，時變為權。”我可待河：“我”、“河”兩字原殘缺，據《漕河議》補。而河不能為我難：徐光啟的治河主張是：不可以急于求功。但不急則影響到漕運，將使北都發生糧食恐慌。所以要采用“支運”的辦法，來解決兩者之間的矛盾。這個矛盾解決后，那末就形成“我可待河，而河不能為我難”了。支運：漕河分段駁接運輸，叫做“支運”；與一船直運叫做“長運”的相對而言。節次：調度。志：《罪惟錄》的一部分是“志”，有《天文志》、《歷志》、《屯田志》、《漕志》、《兵志》等。這句說：徐光啟的各種奏議，雜見于各“志”中。宦邸：官邸。蕭然：寂寞得很。敝衣：破舊的衣服。襲：套。手草居：即起居。約嗇（澀sè）：簡樸。姬媵（應yìng）：侍妾。廳事：廳堂。旋馬：轉過馬來。這是形容廳堂的狹小。毋（吳wú）空期明日：不要放松今天，而空推托到明天。夙：向來。主退：主張退讓。就是前面所說的“此先予‘勇退’遺教”。作解：作有解說。這篇文章現在不存。這句是徐光啟的預言。意思說：到了他的孫子一輩，便免不了要做亡國奴了。審：果真。這句是作者查繼佐的感慨。意思說：（徐光啟不幸而言中，后來明朝亡于清了。）難道這果真是天意嗎？疏（庶shù）：我國古書的一種體裁。它的意義是疏通或說明。《甘藷疏》就是“甘藷淺說”的意思。

查繼佐，字伊璜，浙江海寧人。生于明萬歷二十九年（），卒于清康熙十五年（）。崇禎六年（）舉人。南明魯王授以職方主事。明亡后，不再出仕。晚年辟敬修堂于杭州的鐵冶嶺，著書其中，學者稱敬修先生。

查繼佐在北都傾覆（崇禎甲申，即年）以后，就立志編寫明朝一代的歷史，經歷二十九年，至康熙十一年（）完成，名為《罪惟錄》，全書分紀、志、傳三體，共一百零二卷。在撰著期中，于康熙元年（）遭莊氏（廷鑨）史獄，牽連被捕，后由廣東提督吳六奇營救出獄，仍不舍前志，寫成全書。但鑒于史禍，不敢傳布。原稿歷經秘密保存，幸未散佚，至年才由涵芬樓影印行世。清代官修的《明史》，由于撰寫時趨避忌諱，史料價值很受影響。《罪惟錄》雖是私人所撰國史，但是多存遺文逸事，足以訂補《明史》的地方極多。

查繼佐所作《徐光啟傳》，在《罪惟錄》卷十一下《經濟諸臣列傳》中，敘事及概括徐光啟的政治與學術成就，遠遠超過《明史》卷二百五十一的本傳。徐光啟是一位愛國的科學家，在明末東疆危急的時代，曾迭籌練兵抵御外患。可是《明史》因為這些觸犯忌諱，只是草草表過。查繼佐在撰寫《罪惟錄》時，系故國之思，故特別著眼于徐光啟的戰略思想和高尚風格，而能以生動的筆觸，栩栩如繪地把它描寫出來。

這篇傳記中有少數的紀年錯誤，又《罪惟錄》原稿因保存年久，遭蟲鼠嚙傷，間有缺字。現在考查有關的材料，加以訂補，均在注文中說明。