埤南附近呂家望社番素稱強悍，役使鄰近百數十里之各番社，號曰番王。上年戕殺射馬干社番兩人，抗犯不交。本年五月，哈水社番負米歸社，復被劫殺，經索犯訊明正法。六月，該社勾結埤南轄境大莊諸化番七百余人，匪首劉添汪助之，焚劫大莊民宅；除粵人外，概被殺戮，并戕殺分防營弁委員雷福海等。圍攻廳治，眾至四千余人，全臺大震。張兆連千五百人壁埤南，分防六百里；賊圍廳治及張營，攻守十七日幾死。劉銘傳命總兵萬國本以威定兵船炸炮解其圍，別命吳宏洛往討，電知北洋總兵丁汝昌以兵輸炸炮佐之。八月，賊集鄰番以死拒。諸將血戰半月，毀其巢。于是諸叛番皆乞撫；獲匪首劉添汪誅之。而中路萬霧社獨悍虐異他番，通判吳本杰令各社壯丁為營勇箝之，輒逃歸肆殺。乃下令絕鹽糧、火藥入山中，萬霧懼，乃復降；送子入學且為質，許焉。北路繞食、竹加山、衣卯、京孩兒諸番數十社既降，仍肆殺不可制。是月軍至，其酋紅衫佩鈴，鵠立待戰。于是鄭有勤、劉朝帶苦戰，冒絕險，盡拔之。獨前營總兵陳羅剿內溪既定，雨作，浮橋沖失，疑為該番折毀，陷害官軍，斬六級；番怒，襲殺營官、練官十余人。有勤移軍討之，撤罷陳羅軍，內溪四社復乞撫（劉壯肅奏議）。

十五年（一八八九）二月，嘉義戶部主事徐德欽獲王煥解臺北，訊知鹿紳無通匪實據，復密派委員程起鶚提查鹿局，亦無接濟軍火。始放釋在押鄭營，令到鹿罰捐三萬兩充為軍費。除施家珍一人仍歸案拏辦外，其紳商概不追究。鹿港遵諭繳捐，王煥仍在監（施案紀錄）。

三月，卞寶第、劉銘傳、林維源奏：全臺生番一律歸化，逆首就擒，請將出力人員獎勵（東華錄）。

九月，副將劉朝帶開山，中伏陣亡。臺灣內山八、九月間，生番例殺人曰做享；劉朝帶自內山開巨道八十里，遙達花蓮港，中伏陣亡，弁勇死者二百人。巡撫劉銘傳察其地近老狗社、加九岸，則令吳宏洛統諸軍，十一月入內山攻剿。十二月，大軍至白阿社，番酋筑碉堡死拒。大軍筑臺山巔，用炸炮環擊，破其巢，獲其酋有敏阿斬之。加九岸平。

十二月，全臺清丈給單完竣。原額賦銀十八萬兩，清丈后年額征五十一萬二千九百余兩；隨征補水、平余，加以官莊租額，新墾、舊墾全年共征銀六十七萬余兩。除補水、平余外，實計正額溢出銀三十六萬余兩。澎湖一廳，地皆斥鹵，祗能栽種雜糧；年征地糧等銀一百三兩零，仍循其舊。初，乾隆間大學士?？蛋惨粤炙闹畞y，番目潘明慈等助戰有功；亂定，選番屬四千人，設屯十有二，以番社長授千把、外委十八人為屯軍，授番地及民田近十萬畝，歲折征番銀四萬元，備屯軍俸餉。閱歲既久，番不能耕，輾轉歸民，番乃益病。至是整頓屯田，無論屯田番地，切實丈量，歸入清賦案內，分別升科；將各屯編籍為民，俾令各執各業。屯丁仍留原額四千，按月加給番銀四元，每年按屯抽調，分扼山內生番；坐餉八元歸臺灣鎮支發，出防行糧歸統將發給。

十六年（一八九〇）正月，劉銘傳親赴宜蘭蘇澳督戰。老狗番去蘇澳深入八十里，山高路絕，乃命軍開道、設橋梁以往。二月，宏洛自南渙循高山以進，諸將自溪底赴之。社番拒，輒破。師行十日，乃至老狗社隘口；兩山壁立，絕壑巉巖，中道僅一人出入?？偙鴤骺碌鹿挠路饺耄鳎乐?；后軍至，已無跡矣。宏洛自武搭山巔走西北，抄老狗社后，與溪底軍懸絕二十里，聲息俱窮，山險不得下。眾番數百人突至，血戰破之。是日，銘傳自登武搭山勘形勢，宏洛已去二十里，不相聞。武塔以西，奇峰迭嶂，天日不開，師危甚。土人言老狗諸番無村落，散處群谷間，雖深入不獲也；獨地狹無田，非出山不獲食。大軍誠壁隘、絕其糧，可不戰下也。銘傳從之，乃令宏洛毋下山折兵銳，設地雷群隘絕之；開道武搭山南，與溪底軍合。番夜出求糧，值地雷，盡死。三日餓益甚，痛哭送子以降；乃振旅而返。是役也，始以游擊鄭有勤冒餉、違節度，誅之；終以提督李定明失援傅柯德，罷其軍奪職，眾乃竦然（以上劉壯肅奏議）。

十月，臺灣巡撫劉銘傳革職留任。當法踞基隆，毀壞煤礦，乏煤應用。十二年，商人張學熙接辦該礦，積水過深，學熙無力購辦機器，僅用人力開辦；數月虧折本銀數千兩，力不能支，退辦。銘傳商同江督曾國荃、船政裴蔭森并臺灣各湊本銀二萬兩，委派補用知府張士瑜招集商股六萬兩，合成本銀十二萬兩。十三年正月，開局試辦。自春至冬，經士瑜添購機器、雇用洋師，抽去礦中積水，每日可出煤百噸；核計出售價值，局用僅可勉支，毫無利息。推原其故，皆由煤炭出礦之后，運至基隆?？冢I浪大，難用駁船；旱道山路，腳費太多，非造鐵路以利轉輸，煤務不能獲利。查礦局官商原本十二萬兩，辦理機器工程尚形竭蹶，無力再辦鐵路火車。十二月，復收回官辦，所有商本銀六萬兩并船政原入銀二萬兩，由臺灣捐輸存余項下籌撥歸還。另派洋師瑪體蓀監督，由鐵路公司自八斗煤礦分接車路一道，直通基隆碼頭。迄十五年六月，綜核出入，每月虧折銀三、四千兩。據洋師察勘，非添本百萬、另開新礦，不能獲利。適有英商范嘉士愿集本銀百余萬，來臺承辦，議議章程十一條奏請；經總理衙門、戶部會奏議駁。十六年，經林維源訪招富商蔡應維、馮城勛、林元勝等情愿鳩資三十萬元，與官合辦，為期二十年；官一商二，仍繳原礦本銀十二萬兩，承受礦存房屋機器。以十萬元作官本，其余按月繳煤扣除；礦務一切事宜由商經營，官不過問。批準定于七月一日接辦。復經總理衙門、戶部會奏：此次所奏，僅稱訪招富商同官合辦，迨章程送部后，會同查核，其辦法種種紕繆可疑者三、必不可行者五。此事既經官商合辦，自應官為主持，何以一切事宜悉授權于商人，官竟不能過問？且章程內既稱各股皆系華人，何以總管礦務轉用洋人？顯有冒充影射情事。其開挖河道，自撤藩籬，更于海防大有關系。以特旨飭令另議之件，該撫并不奏明請旨，輒即議立章程，擅行開辦，尤非尋常輕率可比；請旨交部議處。部議革職；奉旨：革職留任。于是煤務飭商退辦，暫仍其舊（劉壯肅奏議）。

十七年（一八九一）二月，劉銘傳奏：臺灣高山巨嶺，地利宜茶；第民人種輟無定，因就茶收豐歉量抽撫墾經費，包商繳收。光緒十三年試辨之初，收數未暢。十五、六兩年每年約可收銀六、七萬兩，均隨時撥充辦理撫墾之需；按年截清數目，匯入善后案內列款造報。

三月，劉銘傳奏病仍未痊，懇請開缺。奉旨：準其開缺。

四月，以邵友濂為福建臺灣巡撫。

十八年（一八九二）正月，邵友濂奏：查臺北大嵙崁、三角涌、雙溪口一帶地方逼近番社，光緒十七年三、四月以來，屢有兇番殺害民人，自一、二命至十余命不等。迭據各撫墾委員稟經前護撫臣沈應奎嚴飭統帶隘勇各營總兵陳羅，督飭駐防弁員拿護番犯邁灰西學、帶木烏蕓、哇素老涯、野微罅隆等四名，訊明分別懲辦。馬速社番拒捕，傷斃勇丁八名；將該社立時焚毀。嗣因查辦番案日久無功，當由沈應奎將陳羅及隘勇前，左兩營管帶各員先后撤換。九月間，三角涌等處殺人之案愈出愈多，兇番嘯聚成群，膽敢于吶哮及古擺鶴等處地方圍攻碉堡，肆行焚殺；分防隘勇地廣兵單，迭有傷亡，不敷堵御。沈應奎飭調定海正、副二營六成勇丁暨就地陸續添募土勇千余名，并經商準幫辦林維源親赴大嵙崁督飭剿辦，當于竹頭角、吶哮等處會軍兜剿。詎兇番糾結后山內加輝各社圍撲隘勇，前營隔絕，所扎碉堡糧運水道一息不通，軍火施放殆盡。該營管帶游擊林福喜間道馳書告急；接統隘勇各營已革游擊鄭榮督帶土勇冒險馳救，伏番遍地，動輒傷亡。雇募化番前驅，自十月二十四、十一月初六日將該處九碉次第援應，一面飭派通事諭散勾結，各軍會搗合吻坪，兇番節節抗拒，勇丁奮擊，互有死傷。鄭榮由竹頭角進扎吶哮，土勇隊長六品軍功林李川于夾板山接仗陣亡。撫墾委員直隸州知州陳長泰會同定海正、副營由后策應，鎗傷腰脅，仍復揮軍進擊，番眾潰散。土勇管帶軍功陳福勝、守備林建庸等分由大霸、大窩前進，各毀兇番之社；已據瞠眼等社哀求歸撫，但未一律敉平。臣自到任后，屢次會唔林維源詳加查度，內山咸菜甕、五指山一帶社番均甚平靖，其加輝各社并已悔罪乞降；惟淺山、水流東各社橫梗于中，若非亟予懲剿，難保不煽惑化番，滋蔓難圖。惟所藉剿番之勇，僅止定海正、副營六哨及新募士勇，兵力尚嫌單??；現經飭調道員林朝棟督率所部棟字各營，克日馳赴會剿。

五月，邵友濂奏：臺灣孤懸海島、屏蔽七省，設立行省，外固海防、內辦撫墾，均須重兵擇要布扎，訓練防守。全臺原有三十一營十七哨、屯軍五哨、炮勇五哨、練軍三營，嗣因內山大嵙崁一帶社番滋事，兵力單??；當經奏明添募四營，以資兜剿。計截至光緒十七年底止，淮軍共三十五營十七哨、屯軍五哨、炮勇五哨、練軍三營。其修建西學堂、基隆海口洋式炮臺、臺灣等縣衙署、監獄、壇廟、祠宇等項工程，添購外洋器械以及一切籌辦情形，均隨時分別奏咨在案。茲據臺灣善后局司道詳稱：臺灣籌辦海防善后并招撫事務，自光緒十七年正月起、至十二月底止，海防善后報銷新收臺灣關稅、鹽課、厘平余及遵刪等款銀一百五十五萬四千六百一十九兩零，開除及給淮軍官弁勇夫辦公經費薪糧柴草工食、炮勇、輪船弁勇、屯丁鹽糧、水陸練兵薪糧公費、隨營文武員弁及各局員役鹽菜夫折、購買外洋軍火器械價值、正腰站書兵工食、修建西學堂書院、洋式炮臺、恒春縣城垣、兵勇營房、倉庫、衙署、監獄、壇廟、祠宇、基隆社寮浮橋平船各工、制造旗幟工料以及一切雜支各款，共銀一百九十四萬六千五百三十六兩零，尚不敷銀三十九萬一千九百一十六兩零。又光緒十六年臺防前后報銷案內，不敷銀八萬六千一百四十兩零。統共不敷銀四十七萬八千五十六兩八錢零。

邵友濂奏：臺灣云林一縣，向在林圯埔建治，業經前督、撫臣奏明有案。茲查林圯埔迫近內山，氣局褊小，催科撫字，時有鞭長莫及之虞。前據代理臺灣府知府龍景惇轉據紳董鄭芳春等以林圯埔相距二十五里之斗六地方，村落相連、人煙稠密、田土膏潤、形勢適中，稟請將縣治移設該處；當經批飭核議。嗣據臺灣府知府陳文騄前往查勘，該處地屬中央，西螺、涂庫、他里霧、林圯埔環其四隅，為云林扼要之區。南至嘉義，北抵彰化，東入山，西至海，道途遠近相若，足資控制；且斗六門舊有都司一員，文武同城，遇有會商，亦甚便利。惟城工需費浩繁，現擬暫植竹圍，并建置四城門樓，以資捍衛。衙署廟宇，一切亦擬次第興造。前項工程，先由該處紳富勸辦；如有不敷，再請公帑。衙署未造以前，暫以昭忠祠為棲止。至林圯埔地方空虛，應否添設佐雜分防？侯察奪情形，再行妥籌辦理。

十二月，邵友濂奏：恒春射不力社番滋事，經派記名提督臺灣鎮總兵萬國本、記名提督張兆連督兵剿辦，攻克吧仕嚜社；一面密約后山各營規取草埔后社，以炮為號。八月十一、二等日，該番截我運道，乘夜撲營，攻打徹曉。十六日五鼓，山后炮作，萬國本、張兆連分督十二營，前后各分兩路，募令屯兵化番響導進兵；該番阻扼淡水坑，伏塹憑高，極力抵拒。官軍一鼓作氣，奪其所據，進逼草埔后社；山勢險阻，徑窄只容一人，官軍驟以開花炮、洋火箭進轟，屹然不動。各營復選精壯軍鎗，更番迭上。自午至酉，卒不能入。萬國本熟商張兆連，用大炮、抬鎗連環互擊；十七日黎明，山谷驟震，各營弁勇番丁聲勢百倍，陣亡接踵，兵不回顧，節節進剿，隘卡盡為我奪。該番聚保大社，力漸不支。日晡，官軍乘勢猛攻將軍埔后社，立時平毀；四面追殺，斃番八十余人，奪獲洋鎗一十七桿、鏢刀各百余件，擒獲番目加必、姑柳、龜令、萬貴等四名，搜捕首犯零阿零父子未獲。十八日夜，臺囗〈風貝〉驟來，山溪暴漲，萬國本、張兆連激勵將士忍耐饑寒，于狂風猛雨中擎槍危立。二十一日，乃得引火為炊，伐木樹營，以資守衛。該番橫被風雨，無社可歸，呼號四徹。迨風定雨霽，官軍漸整隊伍，廣購眼線，蹗知零阿零嘯聚兇番二、三十人竄匿家新路。二十八日，官軍猝往掩捕，該番驚出不意，憑倚深林，且竄且拒；弁勇林外堵截，擊斃數番，冒險入林，將首犯零阿零生擒到營。二十九日，搜獲從犯加別一名。九月初三日，又獲吧咕一名。先后發交恒春縣知縣陳文緯訊明，一并軍前正法。初八、十六、二十等日，各營搜剿余匪，迭有斬獲。萬國本、張兆連撫定余番，督同恒春營、縣妥籌善后，赦令先獲犯目加必、大木、郎失炎等回山約束。改謝不力為善化社，另立社長，誓與就近莊民永遠相安。官軍先后陣亡勇丁、化番四十四名，被水沖斃十三名，受傷五十一名，合上次吧仕嚜社傷亡各勇，分別查驗恤賞醫養（以上東華錄）。

臺灣府知府程起鶚在二林堡購獲李盤，送省轅斬之（施案紀錄）。