十一月癸亥（十四日），定遠平寇大將軍貝子章泰、征南大將軍都統賴塔等奏：『十月初八日臣等統率滿、漢官兵進薄云南省城下，并力環攻，賊勢惶迫無措。二十八日夜，偽將軍線緎、吳國柱、吳世吉、黃明、原任都統何進忠、原任巡撫林天擎等謀擒逆首吳世璠、郭壯圖以獻；吳世璠聞變自殺，郭壯圖及其子郭宗汾自刎死。二十九日，線緎率眾出城降，遂擒首謀獻計之偽大學士方光琛及其子方學潛、侄方學范至軍前磔之。戮吳世璠尸，傳首京師。偽官弁一千五百八十余員、兵五千一百三十余名俱投誠：云南平』。得旨：『覽貝子等奏，統領滿、漢官兵遵奉成命恢復云南省城，疆宇蕩平。具見籌劃周詳，調度有方，剿撫并用，克奏膚功；朕心深為嘉悅！著從優議敘具奏』。

十二月戊子（初九日），敘恢復海澄、廈門、金門十九寨功，授福建提督楊捷三等阿達哈哈番。

癸巳（十四日），召議政王大臣、大學士、學士、九卿、詹事、科道等官至干清門，命大學士勒德洪等傳諭曰：『頃九卿等以大憝既除、寰宇底定，奏請上朕尊號。朕思曩者平南王尚可喜奏請回籍時，朕與閣臣面議，圖海言斷不可遷移；朕以三藩俱握兵柄，恐日久滋變，馴致不測，故決意撒回。不圖吳三桂背恩反叛，天下騷動；偽檄一傳，四方響應。八年之間，兵民交困。賴上天眷佑、祖宗福庇，逆賊蕩平。倘復再延數年，百姓不幾疲敝耶！憶爾時惟有莫洛、米斯翰、明珠、蘇拜、塞克德等言應遷移，其余并未言遷移、吳三桂必致反叛也。議事之人至今尚多，試問當日曾有言吳三桂必反者否？及吳逆倡叛、四方擾亂，多有退而非毀，謂因遷移所致。若彼時朕諉過于人，將會議言應撤者盡行誅戮，則彼等含冤泉壤矣！朕素不肯諉過臣下，即令部院事有錯誤，朕亦自任。朕自少時以三藩勢焰日熾，不可不撤；豈因吳三桂反叛，遂諉過于人耶！今亂賊雖已削平，而瘡痍尚未全復；君臣宜益加修省，恤兵養民，布宣德化，務以廉潔為本，共致太平。若遂以為功德，崇上尊稱，濫邀恩賞，實為可恥』！

康熙二十一年壬戌（一六八二）春正月戊辰（二十日），議政王大臣會議「逆賊耿精忠等分別凌遲處斬」具題。得旨：『耿精忠革去王爵，著即凌遲處死。其子耿顯祚革去散秩大臣，著即處斬。徐文耀、王世瑜、白顯中、江元勛、曾養性、王振邦、蔣得〈車宏〉、劉進忠，俱即凌遲處死。黃國瑞、林芳孫、廖廷云、李似桂、夏季旺、呂應斗、武灝、司定猷、沈偉、郭景汾、羅萬里、祖宏勛、陳儀、陳斌、呂八，俱著即處斬。耿精忠、劉進忠首級，著梟示。田起蛟、金鏡、李學詩、陳夢雷，俱從寬免死。內系旗人，給與伊本主為奴；系民，入官給披甲新滿洲為奴。余如議』。

二月丙戌（初八日），調董國興為福建巡撫。

辛卯（十三日），敘恢復海澄、廈門、金門功，給福建總督姚啟圣拜他喇布勒哈番又一拖沙喇哈番。

夏四月甲午（十七日），先是，福建提督施瑯奏：『賊〈舟宗〉久泊澎湖，悉力固守。當此冬、春之際，颶風時發，我舟驟難過洋。臣見在練習水師；又遣間諜通臣舊時部曲，使為內應。請俟明年三、四月間進兵，可獲全勝』。上允之。至是，施瑯奏：『夏至南風盛發，不可進兵；請至十月大舉』。上命議政王大臣集議，僉謂師期不便屢遷，應檄總督姚啟圣、提督施瑯克期于夏至后進取臺灣。得旨：『進剿海寇，關系重大。總督姚啟圣、提督施瑯身在地方，將海面形勢，賊中情狀審察確實，如有可破、可剿之機，著協謀合慮酌行剿撫，毋失機會』！

五且乙亥（二十八日），安塘筆帖式報稱：『大兵進取臺灣，以風大不得前；總督姚啟圣尚駐銅山，提督施瑯移泊云霄。聞海賊劉國軒等扼守澎湖諸隘，瞷我兵前進，即鈔襲其后』。于是議政王大臣等會議：『請檄總督姚啟圣、提督施瑯：若目前風大，未便進剿，即統官兵回汛，整飭舟師，相機再舉』。從之。

秋七月癸酉（二十八日），諭大學士等：『天道關于人事，彗星上見，政事必有闕失。其應行、應革者，令九卿、詹事、科道會議以聞』。于是尚書介山、侍郎沙賴、科爾坤等奏：請安插裁汰各省兵丁，令其得所。尚書魏象樞奏：請察裁兵中或有效力行間者，不令裁汰。尚書梁清標奏：今天下太平，凡事不宜開端，當以安靜為主。左都御史徐元文奏：請暫停臺灣進剿。侍郎杜臻奏：請全復浙省運丁裁扣錢糧。漢給事中、御史等奏：請潼關收稅免差。少詹事及滿給事中等奏：大同、宣府宜設滿州官兵，則無田產滿兵皆有裨益。上曰：『裁兵務使得所，慎勿汰及效力之人；另降諭旨。梁清標所言凡事不宜開端、當安靜，甚得為治之要。近總督姚啟圣奏稱十月進剿臺灣，可暫行停止；俟十月后再行定奪。復運丁錢糧及免差潼關收稅，令各所司議奏。大同、宣府設滿洲官兵事，宜令該部于議覆凱音布、噶爾泰等條奏時，一并確議以聞』。

八月壬寅（二十七日），福建總督姚啟圣奏：『閩省有綠旗兵，又有漢軍甲兵；進取臺灣、防守地方，業已足用。大兵似宜撤回』。上命將軍喇哈達等盡率福建大兵還京師。

冬十月己卯（初六日），福建提督施瑯奏：『臣于水師營中簡精兵二萬余、戰船三百艘，已足破滅海寇。請令督、撫趕辦糧餉給臣軍；而獨任臣以討賊，無拘時日。臣整理舟師，時加操練；但遇風利，即可進兵』。得旨：『進剿海寇，關系緊要。著該督、撫同心協力催趲糧餉，勿致遲誤。前姚啟圣具題「功罪定例」，交與施瑯遵行。海寇固無能為，鄭錦在時猶茍延抗拒；鄭錦死，首寇既除，余黨彼此稽疑、各不相下，眾皆離心，乘此撲滅甚易。施瑯相機自行進剿，極為合宜』。

丁酉（二十四日），兵部奏：『議敘應升京堂刑部郎中姚儀，奉有「才干素優，準改武職」之旨。查郎中與參領對品，參領既以總兵官用，郎中姚儀應授為都督僉事，以總兵官推用』。從之。

康熙二十二年癸亥（一六八三）春三月丙辰（十四日），以金鋐為福建巡撫（由督捕右侍郎遷）。

丁卯（二十五日），福建提督施瑯奏：『進剿臺灣，選派水陸官兵已足辦賊。平陽總兵官朱天貴所部之兵，似不必更留福建，虛糜糧餉；請發回原汛』。議政王大臣議如所請。得旨：『提督施瑯進剿臺灣，深入海島；朱天貴及原帶官兵仍留福建，在后策應，聽施瑯調遣』。

夏四月己亥（二十七日），議政王大臣等會議：『都統喇哈達自到浙江，并不前進剿賊；及降諭嚴趣，方進衢州。閩省初定，又不能攻破海澄縣賊眾。功罪相抵，應革去都統及恩詔所得拜他喇布勒哈番佐領。其父兄之三等阿達哈哈番，與應襲之人承襲』。上曰：『喇哈達不能攻海澄賊眾，以致賊眾圍困海澄；其后賴塔雖至，亦不能救援，情罪頗重。但隨康親王平閩有功，又歷任年久，能勝都統職任，且多有勞績；從寬降五級，留都統任并所襲阿達哈哈番，革去拜他喇布勒哈番佐領』。

五月甲子（二十三日），先是，福建總督姚啟圣奏：『海賊劉國軒遣偽官黃學赍書至，請照琉球、高麗等外國例，稱臣進貢，不薙發登岸；應否如所請，請旨定奪』。上曰：『臺灣賊皆閩人，不得與琉球、高麗比。如果悔罪薙發歸誠，該督、撫等遴選賢能官前往招撫。或賊聞知大兵進剿，計圖緩兵，亦未可料。共審察確實，倘機有可乘，可令提督即遵前旨進兵』。至是，姚啟圣奏：『遣福州副將黃朝用往諭劉國軒等，仍如前言』。上乃趣施瑯速進兵。

閏六月戊午（十八日），福建總督姚啟圣奏報：提督施瑯進剿臺灣，克取澎湖。

己巳（二十九日），福建水師提督施瑯奏報：『臺灣逆賊劉國軒知臣等將乘南風進剿，傾巢而來，堅守澎湖。凡沿海之處小船可以登岸者，盡筑短墻，安置腰銃。臣總統舟師，于六月十六日進發。署右營游擊藍理等以鳥船首先攻敵，時值潮水正發，前鋒數船被賊圍困；臣親駕船沖入，殺退賊〈舟宗〉。興化鎮臣吳英繼后夾攻，焚殺偽將軍沈誠等大小賊目七十余員、賊兵三千余名。十八日，進取虎井、桶盤嶼。二十二日，遣總兵官陳蟒、魏明等領船五十只為奇兵，直入雞籠嶼、四角山夾攻；又遣隨征總兵官董義、康玉等駕船五十只為疑兵，直入牛心灣牽制。又將大鳥船五十六只居中，分為八隊，每隊駕船七只，各作三迭；留船八十只為后援。臣指揮督率直進撲剿，賊船齊出迎戰。總兵林賢、朱天貴等繼進夾擊，自辰至申，我師奮不顧身，戮力殺賊，擊沈大小賊船一百九十四只，焚殺偽官三百余員、賊兵一萬二千有奇。劉國軒力不能支，乘快船從吼門潛遁。偽將軍楊德等一百六十五員，率賊兵四千八百余名倒戈投降。是役也，以七日夜破數十年盤踞之賊。抵澎之后，海不揚波。進師之時，潮漲四尺，以佐成功：此皆皇上天威所致。至各將土戮力用命，督臣姚啟圣親來廈門、餉運不匱；并請議敘。又總兵官朱天貴、游擊趙邦試陣亡，亦請優恤』。得旨：『據奏總統舟師、分配將士，將年久盤踞海逆深入進剿，屢次擊敗賊眾，斬殺甚多，燒毀打沈賊船，克取澎湖，招降偽官兵丁，得獲炮位等項：具見卿籌劃周詳、調度有方，官兵奮勇攻拔海洋險要重地，深為可嘉！在事有功人員，從優議敘。姚啟圣親至廈門彈壓，殫心催攢糧運、鼓勵將士克奏捷功，亦從優敘。朱天貴等，從優議恤』。

秋七月丙申（二十七日），「海逆」鄭克塽遣偽官鄭平英等赍降表至提督施瑯軍前，總督姚啟圣轉奏請頒赦招撫。上命撰敕發姚啟圣同施瑯酌行，敕曰：『皇帝敕諭鄭克塽、劉國軒、馮錫范等：帝王撫御寰區，仁覆無外；即海隅日出之邦，無不欲其咸登衽席，共享升平。爾祖父自明季以來，出沒海洋，盤踞島嶼；本朝定閩之后，爾祖鄭成功竊據一隅，甘外王化。以及爾父鄭錦，茍延歲月，假息偷生；句引奸徒，窺伺內地。屢經剿撫，仍執迷不悟，頑梗怙終。至爾年方童稚，惑于黨類之言，妄思效爾前人，竄伏臺灣，恃為窟穴；倚險負固，飄突靡常：以致沿海地方里闬不寧，時遭兵燹之厄。朕念中外兵民皆屬赤子，何忍聽其久罹兵災，不加拯救！故特命提督施瑯選將練兵，整飭戰艦，揚帆進剿，直入大洋。旋據奏報，已克澎湖；爾抗拒大兵者殲滅殆盡，余眾敗遁臺灣。目今舟師進剿，指日蕩平。近據總督姚啟圣奏：爾等具奏請降，又據來使呈乞恩赦。朕體上天好生之心，薄海內外，率俾安全。特頒敕旨，前往開諭。爾等果能悔過投誠、傾心向化，率所屬偽官軍民人等悉行登岸，將爾等從前抗違之罪，盡行赦免；仍從優敘錄，加恩安插，務令得所。煌煌諭旨，炳如日星，朕不食言。倘仍懷疑畏、猶豫遷延，大兵一至，難免鋒鏑之危；傾滅身家，噬臍莫及！爾等其審圖順逆，善計保全，以副朕宥罪施仁至意』。

丁酉（二十八日），贈澎湖陣亡左都督平陽總兵官朱天貴太子少保，準一子為蔭生。

八月壬子（十三日），福建水師提督施瑯奏：『七月十五日，鄭克塽遣偽官馮錫珪等，偽侯劉國軒、偽伯馮錫范遣其弟偽副使劉國昌、馮錫韓等赍降表文稿詣臣軍前，請繳偽冊印，率眾登岸，以求安插。臣隨遣侍衛吳啟爵、筆帖式常在同馮錫珪等持榜示往臺灣曉諭偽官兵民，驗視薙發；即令鄭克塽等繕寫降表，并偽冊印一并赍送，以便代奏。至臺灣雖在海外，地方千余里、戶口數十萬；或棄、或守，伏候上裁』。得旨：『海洋遠徼，盡入版圖；積年逋寇，悉皆向化：具見卿籌劃周詳、剿撫并用，克奏膚功，朕心深為嘉悅！在事有功人員，該部一并從優議敘；余令議政王大臣會議以聞』。尋議：『臺灣應棄、應守，俟鄭克塽等率眾登岸，令侍郎蘇拜與該督、撫、提督會同酌議具奏』。從之。

戊辰（二十九日），福建水師提督施瑯奏：『臣于八月十一日，率領官兵自澎湖進發；十三日，入鹿耳門，至臺灣。十八日，鄭克塽及文武官俱已薙發；宣讀敕詔，鄭克塽等歡呼踴躍，望闕叩頭謝恩。所有鄭成功之子偽輔政公鄭聰等六人，鄭錦之子鄭克塽及其弟偽恭謹侯鄭克塽等九人，偽武平侯劉國軒、偽忠誠伯馮錫范等子弟及明裔朱桓等十七人，并續順公下官兵家口、海澄公家口，俱撥船配載，官兵陸續護送，移入內地；并移咨侍郎蘇拜及督，撫，聽其安插。其余偽文武各官家口，見在趣令起行；兵丁有愿入伍及歸農者，聽其自便。至于江浙、閩、粵各省被獲男婦，臣仰體皇仁，已悉令回籍。其冊印、扎付，已次第追繳；倉庫人民戶口冊籍、船艘軍器，俱令巡海道線一信等察收』。下所司知之。