中草藥的分類方法有多種，歷史上主要有三品分類法、自然屬性分類法、功效分類法等。此外，現(xiàn)代還有按照中草藥的性能、中草藥的主治、中草藥的化學(xué)成分、按藥物的自然屬性和親緣關(guān)系分類、藥名的筆畫及結(jié)合西醫(yī)藥理論進(jìn)行分類中草藥的。

為方便臨床用藥，并且其分類方法能夠揭示藥物防病治病作用的區(qū)別和聯(lián)系，目前主要采取功效分類法，即依據(jù)藥物的主要功效進(jìn)行藥物分類的方法。

現(xiàn)代中草藥學(xué)一般將藥物分為解表藥、清熱藥、瀉下藥、祛風(fēng)濕藥、利水滲濕藥、化濕藥、溫里藥、理氣藥、消食藥、驅(qū)蟲藥、止血藥、活血化淤藥、化痰止咳平喘藥、安神藥、平肝息風(fēng)藥、開竅藥、補(bǔ)益藥、收澀藥、涌吐藥、外用藥等。其下再分若干小類（節(jié)），如清熱藥又分清熱瀉火藥、清熱燥濕藥、清熱解毒藥、清熱涼血藥、清虛熱藥等。