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什么是DNA

本書(shū)并非論述人類的起源,而是論述人類的旅程。因?yàn)槲覀內(nèi)匀徊恢谰烤故裁丛蚝脱莼^(guò)程,在大約19.5萬(wàn)年以前出現(xiàn)了生物學(xué)意義上的現(xiàn)代人類。我們非常確定的只有一個(gè)事實(shí):所有人屬動(dòng)物都起源于非洲。

本書(shū)并非論述基因,基因是遺傳學(xué)概念,“遺傳學(xué)之父”孟德?tīng)栕钤绨l(fā)現(xiàn)遺傳過(guò)程中存在基因作用。英文基因是Gene,日文是遺傳子(遺傳因子)。人們?cè)?jīng)認(rèn)為,遺傳基因的媒介可能是血型,后來(lái)認(rèn)為可能是蛋白質(zhì),直到1950年代才最終確認(rèn)是DNA……人類對(duì)遺傳基因的認(rèn)識(shí)不斷深化。DNA是生物組織中最穩(wěn)定的化學(xué)結(jié)構(gòu),基因通過(guò)DNA得以傳承和表達(dá)。現(xiàn)在,為了方便和簡(jiǎn)單起見(jiàn),人們往往用一段DNA表示一個(gè)基因。正是通過(guò)DNA,人們最終發(fā)現(xiàn)了人類走出非洲的六萬(wàn)年旅程。

研究DNA的歷史,正是人類一次又一次發(fā)現(xiàn)自己的錯(cuò)誤的歷史。

研究DNA的歷史,也是人類一次又一次修正自己的錯(cuò)誤的歷史。

一百多年來(lái),人們一次又一次發(fā)現(xiàn),人類對(duì)于遺傳——基因——DNA——生命的認(rèn)識(shí)是錯(cuò)誤的。這正是科學(xué)研究的本質(zhì)之一。德國(guó)戲劇家與詩(shī)人貝爾托·布萊希特(Bertolt Brecht)在他的著名劇作《伽利略的一生》(Life of Galileo)中這樣總結(jié)伽利略推翻地心說(shuō)、建立日心說(shuō)的對(duì)與錯(cuò):

科學(xué)的目標(biāo),

不是為無(wú)限的智慧,打開(kāi)一扇大門(mén),

而是為無(wú)限的失誤,設(shè)定一個(gè)限度。

千百年來(lái),人們都知道孩子與父母很相像,男女結(jié)合,女性受孕10個(gè)月后就會(huì)產(chǎn)生一個(gè)孩子。但是,遺傳的機(jī)理一直是個(gè)奧秘,人們從未停止嘗試建立各種遺傳學(xué)說(shuō)。在古希臘文獻(xiàn)中,大量的資料提到家族內(nèi)的相似性,對(duì)這些問(wèn)題的思考和爭(zhēng)辯,成為早期哲學(xué)家們最喜歡爭(zhēng)議的話題之一。

希波克拉底(Hippocrates)認(rèn)為,生育時(shí)男性和女性都產(chǎn)生一種精液,受精后,部分雙方的精液混合,占上風(fēng)的部分決定了嬰兒的各種性狀。這個(gè)過(guò)程的結(jié)果,會(huì)使一個(gè)孩子可能擁有父親的眼睛和母親的鼻子,如果父母雙方?jīng)Q定某一種形狀的流質(zhì)不相上下,孩子就可能表現(xiàn)居中,比方說(shuō)頭發(fā)的顏色處于父母頭發(fā)顏色之間。

哲學(xué)家亞里士多德在大約公元前335年沒(méi)有任何根據(jù)地寫(xiě)道:總的來(lái)說(shuō),父親決定孩子的模樣,母親的貢獻(xiàn)僅限于孩子在子宮里和出生后。這種哲學(xué)思想反映了當(dāng)時(shí)以男性為主導(dǎo)的觀點(diǎn)——孩子的健康和形態(tài)狀況,以及心理和生理的一切特性都源于父親。但是,亞里士多德也沒(méi)有否定選擇妻子的重要性——肥沃的土壤總比貧瘠的土壤更適合種植。但是,另一個(gè)問(wèn)題產(chǎn)生了:假如孩子是因?yàn)楦赣H產(chǎn)生的,那么,男人怎么會(huì)有女兒呢?

亞里士多德一生都受到這一問(wèn)題的挑戰(zhàn)。他的回答含糊其詞,幾乎是狡辯:所有嬰兒在各方面都應(yīng)和父親一樣,包括性別應(yīng)該為男性,除非在子宮里受到某種“干擾”。有時(shí)候這種“干擾”比較小,產(chǎn)生微不足道的變異,例如孩子長(zhǎng)出紅頭發(fā),而不是父親的黑頭發(fā);有時(shí)候這種“干擾”比較大,例如畸形或女性。

希波克拉底(Hippocrates,約前460-前370,希臘名醫(yī),他把醫(yī)學(xué)從哲學(xué)和巫術(shù)中分離開(kāi)來(lái),被譽(yù)為“西方醫(yī)學(xué)之父”

亞里士多德(Aristotle,前384-前322),希臘三大哲學(xué)家之一,亞歷山大大帝的老師

這種古代哲學(xué)理論發(fā)展成了人胚全息論。人胚全息論認(rèn)為,在性交過(guò)程中,一個(gè)微小的人體被放進(jìn)女性體內(nèi)。為了保持皇家血統(tǒng)的純正,從埃及帝國(guó)到曾經(jīng)控制幾乎所有歐洲王室的強(qiáng)大的哈布斯堡王朝,都流行近親婚姻以維護(hù)統(tǒng)治。從現(xiàn)在的遺傳學(xué)來(lái)看,這些封閉的王室之間的婚姻,就像同一個(gè)村莊里的沒(méi)有太多選擇的婚配,配偶都是自己的親戚或鄰居。這種婚配方式導(dǎo)致后代出現(xiàn)大量遺傳疾病,成為這些帝國(guó)滅亡的重要原因之一。

雷戈?duì)枴ぜs翰·孟德?tīng)枺℅regor Johann Mendel,1822-1884),他發(fā)現(xiàn)了遺傳基因的作用,被譽(yù)為“遺傳學(xué)之父”

弗雷德里?!っ仔獱枺‵riedrichMiescher,1844-1895),瑞士生物學(xué)家,DNA的發(fā)現(xiàn)者。諾華制藥(Novartis)是世界10大醫(yī)藥集團(tuán)之一,諾華制藥一個(gè)研究所即以弗雷德里希·米歇爾命名:FMI,F(xiàn)riedrich Miescher Institut(弗雷德里?!っ仔獱栄芯克?/p>

18世紀(jì)初,顯微鏡之父安東尼·馮·列文虎克(Antonie van Leeuwenhoek,1632-1723)認(rèn)為,他可以在精子頭部看到蜷縮的微型人體。

19世紀(jì),兩項(xiàng)技術(shù)的發(fā)展使人類發(fā)現(xiàn)了染色體。一項(xiàng)技術(shù)是紡織工業(yè)出現(xiàn)的新的化學(xué)染料,另一項(xiàng)技術(shù)是顯微鏡的性能得到重大改進(jìn)。

染色體(Chromosome)源于希臘語(yǔ),意思是“染上顏色的物體”。高倍放大能力使人們很容易觀察單個(gè)細(xì)胞,細(xì)胞的內(nèi)部結(jié)構(gòu)用新的染料染色后,可以清晰地顯現(xiàn)出來(lái)。人們?cè)陲@微鏡中驚訝地看到:在受精過(guò)程中,大的卵細(xì)胞和小的精子結(jié)合時(shí),細(xì)胞分裂,奇怪的線狀結(jié)構(gòu)聚合起來(lái),平均分配到兩個(gè)新的細(xì)胞中。這個(gè)過(guò)程叫作有絲分裂。

首先發(fā)現(xiàn)基因作用的孟德?tīng)柺墙菘瞬剪斨Z市(Brno)的一個(gè)修道士,1850-1860年,他在修道院花園里通過(guò)大量的豌豆雜交實(shí)驗(yàn),奠定了現(xiàn)代遺傳學(xué)的基礎(chǔ)。1856-1863年,孟德?tīng)栐陔s交實(shí)驗(yàn)了大約2.9萬(wàn)棵植株之后,發(fā)表了論文《植物雜交試驗(yàn)》。孟德?tīng)栒J(rèn)為存在一些遺傳物質(zhì)(后世的科學(xué)家把這種物質(zhì)稱為基因)。孟德?tīng)柕贸鲆粋€(gè)結(jié)論:無(wú)論是什么物質(zhì)決定了遺傳,父母雙方總是把這種物質(zhì)等量地傳給后代。非常遺憾的是,他的論文在當(dāng)時(shí)沒(méi)有引起任何人的重視。

孟德?tīng)枦](méi)有看到染色體就去世了,但是,他的預(yù)言后來(lái)被生物學(xué)證實(shí)是正確的。人類的23對(duì)46個(gè)染色體,從父母雙方等量遺傳(除了線粒體DNA和Y染色體)。在受精過(guò)程中,染色體這種奇怪的線狀物,一部分來(lái)自父親的精子,另一部分來(lái)自母親的卵子。

1869年,25歲的弗雷德里?!っ仔獱?,在德國(guó)圖賓根(Tubingen)的一座古代城堡地下室的簡(jiǎn)陋實(shí)驗(yàn)室里發(fā)現(xiàn)了核酸(Nucleic acid)。這種物質(zhì)就是DNA的構(gòu)成單元。他被認(rèn)為是DNA的發(fā)現(xiàn)者,但是當(dāng)時(shí)沒(méi)有人注意他的這個(gè)發(fā)現(xiàn)。

1903年,人們發(fā)現(xiàn)染色體在遺傳中可能扮演重要角色。

1928年,孟德?tīng)柦胁怀雒值摹斑z傳物質(zhì)”,第一次被稱為基因(Gene)。

1944年,人們發(fā)現(xiàn)DNA是染色體的主要成分,人們將這種物質(zhì)命名為脫氧核糖核酸(DNA,Deoxyribonucleic acid),并且經(jīng)過(guò)實(shí)驗(yàn)確認(rèn)DNA是遺傳基因的載體。這是一個(gè)偉大的進(jìn)步,但是當(dāng)時(shí)大部分人認(rèn)為蛋白質(zhì)是遺傳物質(zhì),這個(gè)進(jìn)步被埋沒(méi)了。

1953年,劍橋大學(xué)的兩個(gè)年輕科學(xué)家,詹姆斯·沃森(James Watson)和弗朗西斯·克里克(Francis Crick)發(fā)現(xiàn)了DNA的分子結(jié)構(gòu)。當(dāng)時(shí)人們已經(jīng)查清一些蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu),沃森和克里克認(rèn)為,利用檢測(cè)蛋白質(zhì)的現(xiàn)成技術(shù)或許可以發(fā)現(xiàn)DNA的分子結(jié)構(gòu),然后通過(guò)DNA可能找出遺傳的奧妙。沃森和克里克使用了分析蛋白質(zhì)的同樣辦法:首先使DNA成為結(jié)晶纖維,再用X射線照射DNA,大部分X射線會(huì)直線穿透DNA分子結(jié)構(gòu)的間隙,從后側(cè)出來(lái),還有一些會(huì)撞擊到DNA分子結(jié)構(gòu)里的原子,彈到一旁。用X射線的照相膠片上的分布形態(tài)和位置,可以推算出DNA內(nèi)部的原子位置,然后查清DNA的分子結(jié)構(gòu)。

但是,DNA的這些X射線的照片的形態(tài)太奇特了,他們兩人很久都沒(méi)有找到與之相吻合的DNA化學(xué)結(jié)構(gòu)。最后,沃森和克里克采用了非常笨拙的“原始”方法,用一條一條的硬紙板和一片一片的金屬片和金屬絲,構(gòu)建各式各樣的模型,試圖重現(xiàn)DNA的結(jié)構(gòu)。他們最后發(fā)現(xiàn)有一種雙螺旋模型完全吻合X射線的分布。這種模型很簡(jiǎn)單,像兩個(gè)螺旋形的梯子扭結(jié)在一起。而且這種結(jié)構(gòu)非常穩(wěn)定——只有穩(wěn)定的結(jié)構(gòu)才能作為遺傳物質(zhì)。DNA正是一種極其穩(wěn)定的化學(xué)結(jié)構(gòu),僅由4種核苷酸堿基構(gòu)成的一種糖類骨架。這4種核苷酸的化學(xué)名稱如下:

A 腺嘌呤

C 胞嘧啶

G 鳥(niǎo)嘌呤

T 胸腺嘧啶

人類的染色體

4個(gè)堿基之一腺嘌呤(A=Adenine)的示意圖。莫爾斯電報(bào)的“建材”只有2種:點(diǎn)和劃,表達(dá)我們的語(yǔ)言和信息;DNA的“建材”是4種:4種堿基表達(dá)基因的語(yǔ)言和遺傳信息

沃森、克里克和他們的第一個(gè)立體DNA模型

DNA的結(jié)構(gòu)

DNA中的4種堿基A,T,C,G

我們不必記住這些源自希臘語(yǔ)的核苷酸堿基的麻煩名字,只需記住它們的首寫(xiě)字母:A,C,G,T。即使是科學(xué)家,也是經(jīng)過(guò)50多年的研究才查清了這4種核苷酸堿基的基本結(jié)構(gòu)。

對(duì)遺傳媒介的最重要的要求是可以一代又一代地忠實(shí)復(fù)制。當(dāng)細(xì)胞分裂時(shí),兩個(gè)新的細(xì)胞核里都必須有一套染色體。每次細(xì)胞分裂時(shí),染色體內(nèi)的遺傳物質(zhì)必須復(fù)制成兩份。復(fù)制的質(zhì)量必須很高,不允許出現(xiàn)錯(cuò)誤。沃森和克里克發(fā)現(xiàn),每個(gè)DNA分子都由兩條很長(zhǎng)的鏈構(gòu)成,就像兩條纏繞的螺旋形,他們稱之為“雙螺旋”結(jié)構(gòu)。復(fù)制開(kāi)始的時(shí)候,這個(gè)雙螺旋的兩條螺旋解開(kāi),分別重新制造出一模一樣的另外兩個(gè)雙螺旋,然后再分別存進(jìn)兩個(gè)新的細(xì)胞里。

當(dāng)時(shí),他們不知道自己是否是正確的。起初,他們兩人甚至無(wú)論如何也畫(huà)不出一個(gè)合乎邏輯的平面結(jié)構(gòu)草圖。最后,弗朗西斯·克里克請(qǐng)他的太太,一位英法混血的女畫(huà)家?jiàn)W迪爾·克里克繪制出了“世界上第一個(gè)DNA的平面圖”。然后,克里克拿著這張簡(jiǎn)陋的草圖,高高興興地找到喝得醉醺醺的沃森:“你看,就是這樣的,就是這個(gè)!”然后,他倆才好不容易最終拼湊出這個(gè)奇形怪狀的立體模型。然后,他們把這個(gè)發(fā)現(xiàn)寫(xiě)成了論文。1962年,9年之后,沃森和克里克獲得諾貝爾獎(jiǎng)。

左:弗朗西斯·克里克(Francis Crick,1916-2004),英國(guó)分子生物學(xué)家、生物物理學(xué)家和神經(jīng)學(xué)家右:詹姆斯·沃森(James Watson,1928-),美國(guó)分子生物遺傳學(xué)家。曾經(jīng)在劍橋大學(xué)與克里克合作1953年他們合作發(fā)現(xiàn)DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)。1962年獲得諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)

這些DNA密碼寫(xiě)成的“整套裝配手冊(cè)”叫作基因組(genome,又稱染色體組),可以組裝出完整的獨(dú)一無(wú)二的物理個(gè)體,即一個(gè)人的全部信息。這套裝配手冊(cè)就像用分子寫(xiě)成的一本《百科全書(shū)》式巨著,大約有30億個(gè)文件夾(核苷酸)。

雖然沒(méi)有辦法作出統(tǒng)計(jì),但人們通常認(rèn)為一個(gè)人大約有100萬(wàn)億個(gè)細(xì)胞,每個(gè)細(xì)胞里都存放了這樣一本巨大的裝配手冊(cè)——23對(duì)46個(gè)染色體構(gòu)成的基因組。每個(gè)基因組的物理長(zhǎng)度約2米,所以不能直接插在人體中,更無(wú)法放進(jìn)每一個(gè)細(xì)胞里。于是,這本“巨著”基因組被折疊起來(lái),螺旋狀緊緊纏繞著放在每一個(gè)細(xì)胞的23對(duì)46個(gè)染色體里。

大約46億年前地球形成,大約35億年前第一個(gè)細(xì)胞出現(xiàn)在地球上:基因組出現(xiàn)了,第一個(gè)細(xì)胞分裂就是基因組的復(fù)制。人類已經(jīng)知道一些基因的功能,雖然還不清晰,而且對(duì)大部分基因的功能至今仍然一無(wú)所知。例如,我們知道,有的基因裝配成為腎臟,有的基因裝配成為肺,但是我們卻不知道裝配的細(xì)節(jié);我們僅僅知道這些器官的基本功能,卻不知道它們?nèi)绾喂ぷ骱拖嗷f(xié)調(diào)?;蚪M的這套密碼和人體組織過(guò)于龐大和復(fù)雜了。

詹姆斯·沃森和弗朗西斯·克里克獲得諾貝爾獎(jiǎng),并非因?yàn)樗麄z僅僅拼出了這個(gè)奇形怪狀的雙螺旋結(jié)構(gòu)的立體模型,沃森和克里克還發(fā)現(xiàn)雙螺旋的兩條鏈的“裝配原則”:一條鏈上的A只能與另一條鏈上的T相連,一條鏈上的C只能與另一條鏈上的G相連。

A與T

C與G

①DNA的結(jié)構(gòu)②蛋白質(zhì)把DNA繞成長(zhǎng)串小珠③DNA繞成圈④DNA繞成玫瑰花結(jié)樣式⑤DNA卷成螺線管塞進(jìn)染色體里。23對(duì)46條安放DNA的染色體全部在細(xì)胞核里:合稱基因組或染色體組

這是永遠(yuǎn)不變的規(guī)則,從大約35億年前就開(kāi)始了,至今沒(méi)有改變。根據(jù)這個(gè)規(guī)則,4個(gè)字母組成的序列被永久保存下來(lái)。這種字母序列叫作DNA序列。DNA序列“密碼”蘊(yùn)含著基因信息,又稱遺傳信息或遺傳密碼。

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