排除了這些雜牌部隊之后，舟山明軍的戰斗力反而有所提升。沈廷揚的軍隊以自己的嫡系和黃斌卿的舊部為骨干，已經形成了一個很穩定的團體，水師張名振、阮進、王朝先、劉孔炤四部雖然和沈廷揚部多有矛盾，但是大體上還維持著和睦。周瑞與周鶴芝不和，周瑞加入了鄭彩麾下，周鶴芝則投靠了阮進。陸地力量以王之仁部為主，得到了充足的糧食補給之后，王之仁也多少能約束一下軍紀了。鄭軍沒有在寧波久留，隨著福建開來更多的援軍，他們轉而攻擊只有少量清軍占領的浙南地區，由于原本駐防浙南的清軍馬進寶部在寧波之戰中被干掉了，鄭軍的攻勢十分順利，目前鄭鴻逵占據臺州，鄭彩占據溫州，但鄭森并沒有隨著叔父一起南下，而是留在了寧波。
去年錢塘江之役的教訓證明，王之仁雖然不缺乏勇氣，卻缺乏戰斗力。因此寧波明軍把希望寄托在水師炮船上，他們疏浚奉化江的河道，最大限度地發揮水師的優勢。但是這樣的部署能不能擋住清軍的攻擊，誰心里都沒有底。現在徽州的明軍馬惟興部正在杭州、嚴州一帶襲擾清軍，而鄭軍的注意力主要集中在臺州和溫州，福建明軍楊文驄部反攻處州，目前還沒得手。寧波明軍最能指望的還是衢州的援兵，在劉芳亮的主力到來之前，張鵬翼和郭瑤就已經出兵攻擊蘭溪、湯溪兩個縣城，如果劉芳亮趕到之后，能順利奪下金華，從西南威脅紹興，馬得功就不得不放棄攻擊寧波的計劃了。假如劉芳亮從金華北進嚴州，就會占據錢塘江上游，對杭州形成威脅，說不定馬得功連紹興都要放棄。
當然，如果事情真有這么順利，清軍也不至于拿下半壁江山了。
就在寧波告捷的時候，山東戰場的明軍卻遭到了慘重的損失。去年由于張存仁的部下被調走了一部分，魯西榆園軍的壓力減輕了不少。但是隨著湖北和陜西戰事的結束，清軍卷土重來，加大了對義軍的鎮壓力度。就在義興三年正月三日這一天，一場突如其來的大水驟然而至。
曹州、濮州、定陶、城武、巨野、東明等十余州縣被災，大片土地化為水鄉澤國。這些地方的清朝官員大多政令不出縣城，農村盡是義軍的天下，經此一劫，榆園軍這些年的成果幾乎全部付之東流，百姓更是遭遇了前所未有的浩劫。即便在滔天洪水中僥幸逃得性命，也無家可歸，洪水退后，大片土地都變成了黃泛區，無法再耕種，只剩下遍地腫脹腐爛的人畜尸體。
過了很久，馬應試才終于搞明白，張存仁竟然掘開了黃河大堤！
這樣喪心病狂的舉動完全超出了馬應試的想象力，各部清軍隨即大舉出動，圍剿榆園軍。清軍使用的是殺光、搶光、燒光的政策，所到之處盡皆夷為平地，連樹林都全部砍伐，不給義軍留下藏身之處。義軍原本用地道來機動，清軍采用煙熏、水灌等戰術，令義軍損失慘重。馬應試的部下梁敏、張七等人戰死，馬應試不得不又帶著殘部逃入了沂蒙山區。清軍緊隨而至，夏承德部駐軍沂州，佟養量駐軍沂水，宜永貴駐軍新泰，張存仁自己親自率領保定總兵魯國男部前往兗州，四面張網，鐵壁合圍，組織對沂蒙山區的大掃蕩。
“權將軍，我們突出來了！”馬寶又見到了宮文彩，無比激動。剛才這一場惡戰，他手下的人死傷過半，馬寶有好幾次都以為自己這回鐵定要完了。再看看宮文彩，他身后只剩下一百多人了，連宮文彩本人都受了傷。宮文彩說：“我們是分頭突圍的，張大人另走一路，不知現在在何處。”
馬寶嘆道：“這一仗誒，我們幾年的心血都算白費了。”宮文彩說：“也不是白費，這些年我們殺了這么多韃子，幫著南方的兄弟們分了虜兵之勢，就算我們都打光了，也是有功于國。”
馬寶沒有為國捐軀的覺悟，但是他也并不愿意去給清廷當奴才，不到萬不得已，他還是會堅持戰斗的。馬寶用樹枝在地上劃著：“沂水、沂州、費縣、蒙陰、莒州，全都是敵人，沂水沿岸部署了重兵，向東突圍恐怕不可能，我們要不要試著向陪尾山一帶發展？”宮文彩說：“多半也不成，我們剛從蒙山下來，韃子應該還在那里沒走，現在向西，只怕會一頭撞上。”
兩人談論了半天，也談不出個什么結果，經過了一番血戰，明軍損失慘重，很難再發動有效的反擊，這樣一來，就陷入了被動挨打的局面。接下來的幾天之內，宮文彩和馬寶與馬應試合并一處，連續在山區中穿行，每天都要和清軍交戰一兩次。終于，他們與張家玉和莊鼐會合了。
張家玉和莊鼐也很狼狽，他們被清軍一路追逐，幸得本地土寨接濟才脫身。沂蒙山中有很多士紳結寨自保，此次清軍的大掃蕩對他們也造成了嚴重的損害，許多山寨被清軍摧毀。清軍掘開河堤、實行焦土政策的無差別攻擊把山東父老徹底得罪光了，那些原本搖擺不定的山寨也開始倒向明軍。如果是在經過了多年鏖戰，山東民力耗竭的情況下，可能這并不會改變戰局，但現在，清軍的屠戮還沒有到把山東殺得十室九空的地步，人心向背還是很要緊的。除了謝遷和蔡仕之外，山東明軍的領導者都聚在一起了，宮文彩、馬應試、馬寶、張家玉、莊鼐五人一同分析了目前的局勢，一致認為，繼續在山中打轉是沒有出路的，必須跳到外線，在濱海地區發動反擊才行。但是要想實現這個目標，必須闖過清軍沿沂水布置的封鎖線。
目前宮文彩等人能集結起來的兵馬不超過七千人，而沿河布防的佟養量、夏承德兩部清軍在一萬以上，不消說肯定是一場苦戰，而張存仁、魯國男、宜永貴等人指揮的超過兩萬清軍猶自尾隨在后。散落在沂蒙山各處的明軍應該還有數千人，由于被清軍打散，現在難以聚攏，已經顧不上了。如果明軍在短時間內不能突破封鎖線，那么將會被清軍前后夾擊，只有全軍覆沒一途。