民國建立之初，各省紛紛獨立，軍隊眾多，江南亂成了一團麻。蘇州都督程德全是一個官僚革命者，總算是從前清蛻變出來了。上海都督陳其美、鎮江都督林述慶、清江都督蔣雁行、揚州都督徐寶山都是獨張一幟，各自為政。

南北統一之后，南京臨時政府搬到了北京，按理說應該裁剪南方的軍隊。于是袁世凱命令黃興留在南京處理裁兵的事情，并把王芝祥撥給了黃興當助理。之后各鎮的都督都被陸續撤銷，黃興看事情都處理得差不多了，于是就發電報給袁世凱提出辭職。袁世凱卻回電說要黃興停止裁兵，并把陸軍次長蔣作賓調到南京去。一個王芝祥，一個蔣作賓，都是袁世凱安排的眼線。但黃興執意辭職，又遞上了辭職書，袁世凱只好派之前的程德全到南京接手裁兵的事情，并命令黃興去北京商議政事。這時孫中山正在各省游歷，到處宣揚民生主義，不請他也未免尷尬，所以也發了電報邀請孫中山進京商議要事。之后袁世凱又正式任命了各省都督。列舉如下：

直奉都督馮國璋、奉天都督趙爾巽、吉林都督陳昭常、江蘇都督程德、江西都督李烈鈞、福建都督孫道仁、湖南都督譚延闿、河南都督張鎮芳、陜西都督張鳳翙、新疆都督楊增新、廣東都督胡漢民、云南都督蔡鍔、黑龍江都督宋小濂、安徽都督柏文蔚、浙江都督朱瑞、湖北都督黎元洪兼領、山東都督周自齊、山西都督閻錫山、甘肅都督趙惟熙署、四川都督尹昌衡、廣西都督陸榮廷、貴州都督唐繼堯署。

袁世凱還規定了官職的等級，像國務總理以及各部總長、各省都督這種級別最高的職務都是特任官職，下面又分成九等，一二等是簡任官，三四五等是薦任官，六七八九等是委任官。還制定了勛章等級，大勛章由總統佩戴，上面刻著日月星辰山龍華蟲宗彝藻火粉米黼黻十二章，之下也分了九等，都刻有嘉禾，只以顏色的差別區別等級。陸海軍勛章用白鷹和文虎，也分成九等，用顏色區分。除了勛章以外，還有勛位，大勛位最高，依次到勛五位。除了五色旗是國旗之外，海軍沿用青天白日旗、陸軍之前用的十八星旗改為十九星旗。所有的禮節，男子都行脫帽鞠躬，大禮三鞠躬，常禮一鞠躬，平時見面打招呼摘下帽子就行了。女子的行禮方式也差不多，只是不用摘帽子，只鞠躬就行了。

陸軍官制分三等九級，上等稱做將官，中等稱做校官，初等稱做尉官，各分上中少三級，軍士分上士中士下士，兵卒分上等兵一等兵二等兵，軍隊編制，每十四個步兵人作為一棚，三棚為一排，三排為一連，四連為一營，三營為一團，二團為一旅，二旅為一師。把前清鎮協標隊的名稱，統統改名。海軍的官制稍有差別，例如軍醫、軍需造械、造艦等等職位，還有總監主監上監中監少監等職位，都跟陸軍不同。

學校也分成四個等級，一等是大學，接著是中學，再低一等高等小學，最后是小學。后來都改稱為國民學校。小學四年畢業，高等小學校，三年畢業，中學校四年畢業，大學本科，三年或四年畢業、專科三年。類別有師范學校、實業學校，專門學校，大致都是四年或三年畢業。

法院分為了四級三審，大理院是法院最高機關，下面是高等審判廳、地方審判廳、初級審判廳。由初級審判廳起訴，如果不服判決，則上訴到地方廳，再不服地方廳的判決，上訴到高等廳，高等廳判決都就成定案，不能再上訴到大理院。但從地方廳起訴之后，不服判決，就可以經過高等廳上訴到大理院，這就稱為三審。訴訟條規有刑事民事二種，刑事條件是被告應該懲罰，也稱為公訴。民事條件是被告未必犯了罪，但侵害到了個人利益，請求司法官私了賠償，所以又稱為私訴。刑法分為主刑和從刑，主刑分為五等，死刑最重，無期徒刑次之，接著還有有期徒刑和拘役或罰款。從刑分為兩個等級，一是剝奪政治權利，二是沒收財產。

另外，立法機關是共和國中的根本，之前參議院是各省的代表組成的，現在國家統一了，應該改成國會。并且《臨時約法》中第五十三條規定，限期十個月之內，頒布國會明文，袁世凱不能違約，參議院也不能延遲商議，于是選定了日期開會，決定國會組織法和參議院、眾議院議員選舉法。

國會組織法共二十二條，施行兩院制——參議院和眾議院。參議院議員由各省省議會選出，每省十名。蒙古選二十七名，西藏選出十名，青海選出三名，中央學會得選出八名，華僑選出六名，一共二百九十四人。眾議院議員由各地人民選舉，每八十萬個人選出一人，各省的人口數量不一樣，所以選出的議員數量也不同。初定直隸省四十六名，奉天省十六名，吉林省十名，黑龍江省十名，江蘇省四十名，安徽省二十九名，江西省三十五名，浙江省三十八名，福建省二十四名，湖北省二十六名，湖南省二十七名，山東省三十三名，河南省三十二名，山西省二十四名，陜西省二十一名，甘肅省十四名，新疆省十名，四川省三十五名，廣東省三十名，廣西省十九名，云南省二十二名，貴州省十三名，蒙古二十七名，西藏十名，青海三名，一共五百九十五人。

參議員任期六年，每二年改選三分之一，眾議員任期三年。兩院議員的職權，一是建議權，二是質問權，三是有權請求查辦官吏受賄的行為，四是答復政府的咨詢，五是受理人民的請愿，六是允許逮捕違法的議員，七是制定院內的法規。至于預算和決算，以及議定憲法都由兩院合辦。兩院議員的人數必須達到半數出席才能開始商議，議案也必須得到過半數議員的同意后才能決定，同意票與否定票相同的時候，由議長決定結果。每年開會的時間加起來有四個月，如果事情重大來不及決策，就延遲會期，這些便是國會組織法的大概了。

兩院議員的選舉采用記名投票的方式，得票過半就生效。參議院由省議會選舉會選出，眾議員由人民公選。人民的權利分選舉和被選舉權兩種，選舉權專屬于民國國籍并且年滿二十一周歲的男子，同時還要滿足以下四個條件之一才具有選舉權：一是每年繳稅兩元以上；二是有五百元以上的不動產，蒙、藏、青海三地可以加上動產；三是已經從小學或者以上學校畢業的；四是具備小學以上畢業資格的。被選舉人也有資格限定，首先必須是民國國籍男子，年齡要年滿二十五歲。如果是蒙、藏、青海等地的人還必須通曉漢語。對于犯法后被剝奪了政治權利的，以及宣告破產、或者患有精神病、吸鴉片煙和不識字的人，都不具有選舉和被選舉權。

正在服役的海陸軍人、處于征調期的續備軍人、現任的行政司法人員和巡警、僧人、道士和其他宗教師、小學教師、選舉現場的工作人員都暫停選舉與被選舉權。蒙、藏、青海只有軍人可以停止選舉權和被選舉權，選舉除蒙、藏、青海三地之外都分為初選和復選兩道程序。初選在各縣舉行，名額定為最后正式議員數量的五十倍，通過初選的人才能進入復選。不管是初選還是復選，都設置有監督人員，初選的監督人員是該選區的行政長官，復選的則是全省的行政長官。

各項選舉方法經過參議院決議之后，全都交給了袁世凱過目。袁世凱當即公布，并且下令由內務部規定選舉區，然后一一公布。各地正在緊張籌備的時候，四川都督尹昌衡忽然連發了幾份電報稱，西藏動亂，影響目前的形勢，并且請命西征。袁世凱隨即準了他的請命，把四川所有的印章交給胡景伊保管。于是尹昌衡率領了兩千五百人浩浩蕩蕩出征西藏，真有一種步年羹堯后塵的感覺。

清末光緒年末的時候，西藏教主達賴喇嘛曾經入京覲見，還被封為西天大善自在佛。這時光緒帝和慈禧太后相繼逝世了，達賴念經超度忙活了好幾天，等到兩宮都安葬好了，達賴回到西藏卻受了俄國人的蠱惑，竟然在西藏造反擾亂秩序。清廷于是削去了他的封號，把他驅逐出國，并下令讓駐藏大臣重新立了一位達賴喇嘛。

這事還沒平息，中國又興起了革命軍。退位的達賴喇嘛手下有一名俄國參謀，一直深得達賴喇嘛的信任，曾經還被達賴派遣去俄國首都圣彼得堡傳遞秘密。這次聽說中國內地各省有大半都已經獨立，俄國參謀竟然極力慫恿達賴帶領西藏獨立。達賴喇嘛偷偷回到西藏后，就把清廷派遣來的官吏全部驅逐出去，自己獨立了起來，還揚言要殺掉所有在西藏的漢人。

幸好陸軍的統領鐘穎帶兵趕到，竭盡全力保住了西藏，達賴喇嘛這才不敢再輕舉妄動。于是尹昌衡任命鐘穎為西藏行政使，后來漢人與藏人又多次發生沖突，英國軍隊以保護僑商的名義進兵西藏。尹昌衡立即通知了北京，請求任命鐘穎為辦事長官，袁世凱當然允許了請求。但藏獨分子一直歧視漢人，不管鐘穎如何威脅打壓，他們始終不肯就范。還有漢人在拉薩搭臺演講，也不知如何得罪了藏人，竟然造成了雙方決裂，還為此大動干戈。

藏人于是起來紛紛響應，把漢人困在了拉薩后，分成兩股勢力，一股從西面入侵西藏后方，一股從東面進攻里塘。里塘位于打箭爐的西面，雖然是駐藏大臣來往的驛道，但是跟四川的省會距離太遠，守兵實在少得可憐。藏人一來，守兵只好把所有兵力集中用來守住陣地，并飛鴿傳書到北京請求支援，可遠水又怎么救得了近火？支援軍隊好幾天都沒到，最后里塘失守，漢人紛紛逃往內地。藏人占領了里塘后趁勢想要占領巴塘，四川邊境岌岌可危，尹昌衡于是請命出師，并被加授為鎮撫使。

尹昌衡率軍西征的途中收到巴塘的捷報，心里稍微安心了一些。又過了兩三天，竟然也傳來了里塘的喜報。原來是邊境軍隊的統領顧占文因為里塘失守，加強了防守，并派遣心腹四處打探藏人的消息。七月上旬的時候，顧占文得知藏人要分兩路進攻巴塘，一路堂而皇之的從大路進攻，一路從偷偷小路翻山越嶺。顧占文知道了這個詭計后索性將計就計，一邊派兵在大路截住藏人，自己卻帶著精兵到了小路，設了埋伏守住要害。

藏人翻山越嶺，還特意繞了遠路而來，但他們爭先恐后，毫無組織和紀律，這邊幾十個人，那邊幾十個人，還只能靠這雙腳走路。他們快走到大朔山旁邊的時候，天色暗了下來，遙望前面，只看得見參天的古樹和滿地的蔓草，隱隱約約露出一點夕陽，遮掩住滿山的秋色。藏人來不及欣賞美景了，憑著毅力一直往前走，暗自想著翻過這座山就到巴塘了。而且沿途一直都很安穩，沒有遇到漢人阻攔，這出其不意的攻擊一定可以一舉拿下巴塘。

正在他們趾高氣昂打著如意算盤的時候，猛聽得一聲號響，震得山谷俱鳴，木葉亂下。大家都慌了神，齊聲叫著：“不好了！不好了！”話還沒說完，只看見漢人從四面八方殺過來，槍聲炮聲不斷，躲都沒地方躲。藏人逃命要緊，竟然巴塘也不要了，四處逃竄。逃到東邊，也響起一陣槍聲，打死了好多藏人，折回到西邊，又碰到一隊漢人惡狠狠的沖過來，活捉了好多藏人。有幾個藏人仗著一股蠻力拼死突圍了出去，最后死了一半、逃了一半。

顧占文乘勝追擊，順路趕到里塘，里塘此時沒人駐守，顧占文不費絲毫力氣就收復了里塘。從大路進攻的藏兵得到小路部隊失敗的消息后，也都狼狽地逃生去了，顧占文隨即率領軍隊追殺出去，一場圍剿殺死一百多個藏人，只有幾個命大的逃了出去。捷報頻傳，尹都督十分欣慰，于是趕回了打箭爐。打箭爐是四川、西藏來往的孔道，漢人藏人生活在一起。尹都督于是就駐扎在這了，免不得要欣賞一番美景。偶爾見到一些女子，比較之下，覺得有幾個風姿綽約，面不粉而白，口不脂而紅，眉不黛而翠，顯得比漢人更加楚楚動人。山泉藤蔓旁還經常有姐妹花唱著南蠻歌曲呢，尹昌衡飄飄乎過著神仙一般的日子。于是挑選了幾個美女填充后室，樂不思蜀。

西藏的事情還沒平息，湖北又起了風波，詳細情況下章敘述。