清廷為傳諭滇、蜀備青海兵到供應，而青海兵不赴，達賴反為三桂乞裂土罷兵，圣祖拒之，此達賴在日，政由第巴。自明末召青海兵入戕藏巴而握全藏實權，至是皆喇嘛昏庸，第巴專擅之時代也。二十二年而達賴示寂，以后遂為第巴諱不發喪，稱喇嘛名號行事，殘喀爾喀，袒噶爾丹，以致噶爾丹就滅。凡朔漠之役，清廷命達賴和解而益決裂，噶爾丹輒挾達賴以要索土謝圖汗及哲卜尊丹巴喇嘛，達賴有所奏請，皆不便于事，敕責之。達賴尋奏乞給第巴爵，詔封第巴為唐古特國王。三十五年親征噶爾丹，俘降眾，得第巴奸狀，敕責第巴，第巴疏稱，“達賴喇嘛尚存”，而別令其使尼麻唐呼圖克圖密奏：“達賴示寂，恐唐古特生變，故隱之，今第六世繼體已十五年，乞勿遽宣。”帝遣使往視新達賴喇嘛，嚴詰第巴罪，第巴具服。帝諭獎達賴汗，達賴汗遣使賀捷，并遣子拉藏內附。未幾，達賴汗卒，拉藏嗣。第巴惡拉藏，計毒之不死，拉藏執殺第巴。奏至，敕封拉藏輔教恭順汗，諭獻第巴所立達賴喇嘛。使至，策妄阿喇布坦亦遣人往迎。拉藏兩不遣，帝諭近臣：“蒙古奉佛，有達賴喇嘛名，皆皈向之，倘為策妄迎歸，則蒙藏皆向彼矣，然拉藏必終執獻朝廷也。”既而果執獻，而此喇嘛道死。
策妄阿喇布坦自噶爾丹既死，盡收準噶爾故地，圣祖以其有絕噶爾丹后路功，劃阿爾泰山以西予之。策妄乃盡效噶爾丹所為，漸圖吞四衛拉特為一，先取土爾扈特阿玉奇汗女，而離間其父子，其子攜眾萬五千戶至，沒入之，復阻其貢道，禁其入藏熬茶，阿玉奇遂全部投俄羅斯而土爾扈特歸策妄矣。杜爾伯特本與準噶爾同族，皆明時也先之后，分牧而為所屬。復潛師入藏，襲殺拉藏汗，又并在藏之和碩特部，時在康熙五十六年，而西藏又為準部所據矣。是時乃有達賴喇嘛之具呼畢勒罕發見。當四十五年，拉藏汗之獻偽喇嘛而死于道也，藏中復立博克達山之阿旺伊什嘉穆錯為達賴喇嘛，而其時里塘有名索諾木達爾札者，生子名羅卜藏噶勒藏嘉穆錯，幼而慧，唐古特眾及青海諸臺吉敬事之。拉藏汗以已執獻一達賴，又扶立一達賴，不欲復有達賴出，將殺之，索諾木達爾札襁負走免。青海諸臺吉爭言拉藏不辨真偽，拉藏挾班禪喇嘛共證其所立之達賴為真，且謂青海諸臺吉所共信，請給冊印，詔即封之，事在四十九年三月。
青海臺吉白拉藏辭誣，爭不已，清廷乃諭徙羅卜藏噶勒藏嘉穆錯置內地，以其父護之，居西寧宗喀巴瘞胞衣地之黃教祖寺。及五十六年，策妄阿喇布坦襲殺拉藏，禁所立之達賴于札克布里廟。明年，事聞，詔西安將軍額倫特赴援，侍衛色棱宣諭青海蒙古以兵來會。甫入藏，為準噶爾兵潛出大軍之后，截餉道，師遂潰，盡覆焉。于是青海蒙古憚進藏，慫恿罷奉達賴羅卜藏噶勒藏嘉穆錯，奏言隨地可安禪榻，興大兵恐擾眾，王大臣皆懲前敗，不決進兵議。圣祖命皇十四子固山貝子允為撫遠大將軍，四川巡撫年羹堯為四川總督，仍管巡撫事，旋諭議政大臣等：“新胡必爾汗（此從《東華錄》，即呼畢勒罕。）奏稱：‘各處俱有禪床，皆可安設，若為我興兵，實關系眾生。’此或是新胡必爾汗之意，或是青海臺吉等密屬具奏。儻新胡必爾汗與青海臺吉同意，此胡必爾汗不可送往青海；若無此意，必將新胡必爾汗送往，安設禪床，廣施法教，令土伯特之眾誠心歸向，則策零敦多卜（策妄所遣將兵入藏之臺吉）。自畏勢逃遁。
我師進藏定立法教之后，或留兵一二千暫行看守，或久住，則藏眾即我兵，縱策妄策零發兵前來，彼勞我逸，即可剿滅。今若照眾大臣議，唯自守我邊，則自西寧至川滇邊內外，皆土番雜居，與藏番俱是一類，藏為彼據，則藏兵即彼兵，邊疆土番，亦不能保為我有。爾等所議不合，著另行周詳定議具奏。”又諭：“往年用兵三藩，用兵外蒙，皆有不主進兵之親貴大臣，隨時撤回，幸不失機會。茲眾喀爾喀及青海等俱服風化，而策妄霸占藏地，毀其寺廟，散其番僧，青海臺吉理應奮勇致討，乃口稱維持黃教，卻無實心效力之人。策零敦多卜領兵在藏，我兵隔遠不能救，伊等步行一年，忍饑帶餒，尚能到藏，我兵獨不能赴乎？今滿漢大臣咸謂不必進兵。此時不進兵安藏，賊無忌憚，或煽惑沿邊番部，將作何處置耶？安藏大兵，決宜前進。”是時已在五十九年正月，既決策，由撫遠大將軍允遵旨傳集青海王、臺吉等會議進兵安藏，及送新胡必爾汗往藏，皆無異言，覆奏并請封新胡必爾汗。以五十九年二月癸丑，封為“宏法覺眾第六世達賴喇嘛”，賜金冊印，定派滿漢官兵及青海兵送入藏，內、外蒙各部并澤卜尊丹巴胡土克圖等亦遣使會送。
斯時西藏于宗教之信仰則尚甚堅，圣祖以獨斷安邊，恰中肯綮，乘青海之有信心，又和碩特與準噶爾之有仇恨，藏眾則喇嘛被禁，法器被遷，亦望新胡畢勒罕如望歲。是時以大軍之聲威，鼓吹青海之信仰，號召內、外蒙及澤卜尊丹巴喇嘛之景從，冊印新頒，此真彼贗，情勢自定。又發兩路兵，以靖逆將軍富寧安出北路，由外蒙阿爾泰山；振武將軍傅爾丹、征西將軍祁里德等出南路，由甘肅邊外巴爾庫爾（即巴里坤）。分入準噶爾境。南路兵以本年七月初一日起程，北路兵以六月十六日起程。以擴軍統領噶爾弼為定西將軍，都統延信為平逆將軍，率青海及內外蒙、西套蒙古兵護達賴喇嘛行。阿爾泰及巴爾庫爾兵攻準部，前進迭有擒斬，策妄不暇救藏。
而噶爾弼自四川進拉里，稍有戰事，所至第巴喇嘛紛紛迎降，拉藏遺臣康濟鼐從中起而相應。延信自青海進卜克河，策零敦多卜迎戰，累敗之。撫遠大將軍領大兵駐西寧邊外理入藏諸軍餉，奏言：“八月二十三日官兵進藏，探知策零敦多卜等已遁還準部，請撤駐防兵。”蓋清軍已平藏。執附準部喇嘛百余，斬其渠五人。達賴喇嘛以九月壬申入拉薩圣地坐床，第五輩達賴示寂幾四十年，第六輩達賴始定。明年，敘藏人迎降功，封第巴康濟鼐、阿爾布隆固山貝子，隆布鼐輔國公，理前藏務，頗羅鼐札薩克一等臺吉，理后藏務，皆拉藏時遺臣。藏安而西寧、青海、川、滇之邊舉安，以宗教為綱領而提挈之，初不甚費兵力，蓋處之得其道也。唯準部尚在，西域未平，尚在雍、乾兩朝之繼述。然在康熙時則為中國所拓之藩籬，較漢、唐盛時已駕而上之，更無論宋、明兩代矣。
第七、留頭還是留發
入關之初，以兵事為重，其于政務，但期規復明代紀綱，即不至凌亂無序，故以引用明季舊臣為急。舊臣之肯效用，皆后世所定為貳臣，其人風骨自不足言，用其明習故事，而以滿洲重臣驅策之，士大夫之風范，未有聞也。世祖朝所任宰相，初年則范文程、寧完我，稍知政體，亦不足開一朝風氣。至后來引援用者，若馮銓、金之俊、王永吉、謝升、劉正宗之徒，人才卑下；又如陳名夏、陳之遴輩，稍稍用事，恩禮不終，亦不足甚惜。至傅以漸、呂宮為開國首兩科一甲一名進士，用為閣臣，不過以狀元宰相歆動漢人，爭思入彀，其為公輔之器與否，非所計也。各部院大臣，順治五年以前，無漢尚書缺。四年以前，都察院止有滿人為承政，后始以漢人為左都御史，所用亦多為貳臣。督撫在兵事時，任用亦未如法，皆所謂過渡時代。唯清廷自入關即痛抑苛斂，有獻聚斂之議者力斥之，若蘇撫土國寶之流是也。故根本不朘民生，不失為開國氣象。若云君明臣良，有師濟之風，則猶有待。
圣祖嗣位，初政屬在輔臣，未見起色，熊賜履以忤鰲拜意，屢欲譴之，帝即從中保全，至鰲拜敗，遂以傾害賜履為罪狀之一。賜履雖非醇儒，然知尊重儒術，為圣祖討論宋儒經說所自始。康熙初為弘文院侍讀，上萬言書：“請甄別督撫，以民生苦樂為守令之賢否，以守令貪廉為督撫之優劣，而本原之地在朝廷，尤在立綱陳紀用人行政之間。一曰參酌古今，勒為《會典》，則上有道揆，下有法守。一曰修舉職業，肅官箴而奮士氣。力指當時憂憤者謂之疏狂，任事者目為躁競，廉靜者斥為矯激，端方者詆為迂腐，聞有讀書窮理之士則群指為道學，誹笑詆排，欲禁錮其終身而后已。一曰庠序之教，在讀書講學，求圣賢理道之歸，不使高明者或泛濫于百家，沉淪于二氏；下之則唯揣摩舉業，為弋科名掇富貴之具。
一曰明詔內外，一以儉約為尚，自正公以及上庶，凡宮室車馬衣服，規定經制，不許逾越。痛陳禮壞俗奢，為饑寒之本原，盜賊訟獄兇荒所由起。末言根本尤在皇上，生長深宮，春秋方富，宜慎選左右，熏陶德性，隆師傅之禮，選侍從之賢。講幄非事虛文，經筵非應故事。考六經之文，監歷代之跡，體諸身心，為敷政出治之本。佞幸不置于前，聲色不御于側。非圣之書不讀，無益之事不為。內而深宮燕閑，外而大廷廣眾，微而言動起居，維持此身，防閑此心。主德清明，君身強固，直接二帝三王之心法，自足措斯世于唐虞，又何吏治之不清，民生之不遂？”此疏即為鰲拜所惡，請以妄言罪之，而帝不許，轉遷侍讀學士。復疏言：“朝政積習未除，國計隱憂可慮。”鰲拜傳旨詰問積習隱憂實事，以無據妄奏沽名議鐫級，帝又原之。以迄于鰲拜逮問，復疏舉經筵，即擢國史院學士。未幾復設內閣，設翰林院，以為掌院學士。舉經筵，即用為講官。
侍圣祖講學最親且久者，莫如李光地。光地天資敏銳，讀書析理能入細，御纂諸經皆光地居校理之名，當即光地主其事。故雖有偽道學之間為圣祖所覺，而恩眷仍隆。觀光地自撰《語錄》，詐億不信，是其所長，不似學道人渾厚之態。圣祖尊宋學，所纂集經說，乃欲集宋學之成，故徐乾學以藏宋經學家言之富，假手于權相明珠之子性德，刻《通志堂經解》，以供搜采。乾學與性德，溺于詞章，能刻經解，不能充道學；光地與熊賜履則愿以纂經解、治道學自任。熊、李有師生之誼，李入翰林，熊為教習庶吉士官，且于上前力保之。然以爭寵相軋有隙，熊始倚修書，后移其事任于光地，熊甚憾李，李亦深謗熊，二人蓋以道學為得君之專業，故人品皆不純。然上有好者，下必甚焉，天下不敢以佻達之見菲薄道學，而真儒遂得用世，不以迂拙樸僿見擯，則熊、李猶金臺之郭隗，當居招致之功，要為人君好尚之標幟耳。熊、李雖皆有偽道學之疵病，然官至極品，以清廉終，李稍任封疆，亦有政績，究尚自愛其鼎，未嘗敢盡逾道學之閑。提倡道學，究能養成士大夫風氣，此亦其征驗也。今略敘熊、李偽道學之據。
賜履于康熙十四年，由內閣學士超授武英殿大學士，兼刑部尚書。十五年，陜西總督哈占疏報獲盜，開復疏防官，下內閣，賜履誤票三法司核擬，既檢舉得旨免究，賜履改草簽，欲諉咎同官杜立德，又取原草簽嚼而毀之。立德以語索額圖，事上聞，吏部議賜履票擬錯誤，欲諉咎同官杜立德，改寫草簽，復私取嚼毀，失大臣體，坐奪官歸。此為《清史稿·本傳》文。光地《語錄》述此事，窮形盡相，據言賜履既誤票，帝詰問，未辨為何人所票也，賜履回閣取誤票之本，插入他閣臣票本內，以同宮中杜立德較粗疏，故插杜票本中，而易其一本歸己，謄寫所票簽，取其原簽嚼毀之。立德審誤票之本，非己所曾閱，簽上字跡，問代寫之中書林麟焻，亦不認，檢用過之簽條，亦較本數少一條，立德向首相索額圖喧爭，一滿學士覺羅沙麻言：“今日來過早，在南炕倒著，見熊阿里喀達（即中堂）。檢本，口內嚼一簽。”索遂與杜同啟奏，熊落職回。既回寓江寧，帝猶以經義與相通問，至二十九年再起，而光地已向用矣。