基督教無論天主教、東正教和新教，都會渲染神跡，也力圖讓信徒們相信上帝和天使的神跡，類似我們中國人所謂的顯靈。這樣的故事，車載斗量，不可勝數。凡是宗教，其實在這個問題上，都差不多。人們經常會宣稱看見了上帝，看見了天使飛舞，看見了只有上帝才能制造的神奇事物。但是，基督教卻絕少有過上帝的降神附體的說法。上帝下凡可以，但附著在某個具體的人身上，借這個人的嘴說話，這在基督教里面，是絕對不可能的事情。但是，在洪秀全的拜上帝教里，這樣的奇跡，居然出現了。
一種說法是，在紫荊山區傳教之時，馮云山被人告發，拿到官府里，洪秀全張皇失措，多半是出于害怕，離開了紫荊山。已經成規模的拜上帝教群龍無首，于是，有人就借上帝和耶穌降神附體，假稱上帝耶穌的旨意，穩定教眾。其中，做得最好而且在教眾中最有威望的，就是楊秀清和蕭朝貴兩人，一個代上帝立言，一個替耶穌說話。等馮云山的案子了結，洪秀全和馮云山重新回到紫荊山，只能承認既成事實。
還有一種說法是，楊秀清和蕭朝貴的降神附體，原本就是洪秀全和馮云山策劃好的，為的就是借他們的降神附體，通過上帝和耶穌的口，將洪秀全編出來關于他和上帝之間的故事落實，楊、蕭的降神附體，最大的獲益者是洪秀全。
其實，既然降神附體是發生在馮云山和洪秀全離開之后，那么，最大的可能是出于楊秀清和蕭朝貴的自主，有這樣自主性的人，當然不止他們兩個。紫荊山的客家人，沒有人樂意看到拜上帝教的垮臺，必須采取某種措施來挽救危局，降神附體即是最合適的一種。而其他人同樣的行為之所以被制止，在很大程度上是由于楊、蕭二人的人緣和能力。而且正是由于楊蕭二人的努力，教眾們才再度團結起來，合力湊錢，救出了馮云山。既然楊蕭二人已經控制了局面，洪秀全再回來的時候，當然不得不認可楊、蕭由降神附體而獲得的特殊權力，而楊蕭二人，主要是蕭朝貴，也得借附體印證洪秀全的特殊地位，作為回報。這種時候，誰也離不開誰。
楊秀清和蕭朝貴是燒炭為生的窮苦人，但卻是窮人中的梟雄。楊秀清幼年父母雙亡，屬于僥幸長大的苦孩子，不識字。這樣的人，從本質上就有異樣的稟賦。蕭朝貴狀況稍好，識幾個字，但也等于是文盲。只是，他們跟土里刨食的農夫不一樣，見過世面，能言善辯。盡管人窮，卻在同儕之中有人望，具有農民式的狡猾，在某種程度上，是天生的領袖和戰將。這樣的人，在歷史上從來不乏其人，朱溫、朱元璋、李自成和張獻忠，都是這樣的人。只要有相應的土壤和時機，這樣的人就能脫穎而出，掀起大風大浪。
可以想象，楊蕭二人既然能在教眾群龍無首、陷入混亂之際挺身而出，那么，即使沒有這個機會，只要拜上帝教坐大，鬧出事來，他們一樣也會嶄露頭角，進入領導階層。只是沒有了降神附體，他們的地位就不會有如此之高，也不一定會演變成太平天國領導體制的二元結構了。
降神附體，其實就是一種原始巫術。在很多地方，都有類似的現象。巫術，一般盛行在宗教發育之前的社會狀態中，在原始的初民社會，相當發達。但是，中國比較特殊，西周之前，掌握巫術的巫師，是統治階層中人，西周之后，巫師逐漸衰落，讓位于史官。但民間的巫師，依舊事業興盛。這樣的狀況，即使到了出現道教，甚至佛教傳入之后，依舊沒有太大的改變。巫術是鄉村生活的一部分，巫婆神漢依然是鄉村社會不可或缺的人物。人們有病有災，首先想到的，就是巫婆神漢。巫師施展的巫術中，比較常見的一種，就是降神附體。降神附體有兩種形式，或者神靈附巫師自己的體，或者在巫師的操控下，神靈附某個靈媒的體，這種靈媒，在廣西就叫“僮”。所以，降神附體，又叫降僮附體。有的時候，這樣的巫術，附體的不是神靈，而是死去的人，這樣的巫術，也被稱為“走陰”。能夠走陰的巫師，具有跟陰間死去的人交流溝通的能力，有本事將死在陰間的人的靈魂喚回。相對而言，這樣的巫術，對人們的征服力，要遠遠大過其他的巫術。神的聲音，人們無法辨析，怎么說怎么是。走陰有難度，因為死去的親人，說話的口音和語氣人家熟悉。但有些善于走陰的巫師，的確可以模仿死去人的聲音，以死人的身份和口吻對人講話。很多經過的人回憶，當時的確感到震撼。同時，降神附體，具有很強的儀式性，一般來說，降神者口中念念有詞，突然倒地，口吐白沫，然后站起，用一種怪聲怪調的聲音說話，旁觀的人們明白，此時，這人已經被神或者鬼附體了。
當然，這樣的巫術，原本很可能就是一種戲法。在江湖闖蕩多年的楊秀清和蕭朝貴，自然明白里面的奧秘。情急之下，采用這樣的招數，合情合理。顯然，他們并沒有通神的本事，無非是在一個特別的情形下，施展一種騙術而已。最初的時候，會玩這樣把戲的，不止他們兩個。估計大家都會突然倒地，口吐白沫，然后借神的名義說話。最后大家認了他們兩個，顯然不是說楊蕭二人玩得更逼真，而是他們更有人緣，有人望，人們更樂于相信他們。但是，從此之后，他們就具有了非?？膳碌慕虄鹊匚?，只要他們想，打一個滾，吐幾口白沫，翻轉過來，就可以怪聲怪調地自稱上帝或者耶穌了。他們說的話，無論什么形式，什么內容，都成了最高指示。即使教主，也得乖乖地跪下聽命。
歷史上，基督教也很難說沒有過巫術的痕跡，但在它的傳播史上，每每特意與巫術劃清界限，如果某個女人被視為巫婆，一般很難逃脫被燒死或者沉水淹死的命運。后來的天主教，雖然有驅魔的儀式，但對于常見的巫術，也是極力排斥的。至于新教，對于巫術就更不留情了。但是，表面上看，像是脫胎于新教的拜上帝教，卻可以公然肆行降神附體的巫術。由此可以證明，拜上帝教在本質上不是基督教，僅僅是頂著上帝帽子的中國本土民間教門。只要現實的需要，他們沒有什么禁忌可言，什么都可以干。盡管有了降神附體之后，拜上帝教離基督教更遠了，但應該說，自打楊蕭二人降神附體以來，拜上帝教的事業更加光大了。
只是，這樣一來，卻又有了新的問題。有人可以通過降神附體，代上帝說話之后，那么，在拜上帝教以及后來的太平天國中，到底誰是老大呢？理論上講，當然是洪秀全，他是教主，具有被上帝和耶穌降神附體之后證實了的神性。但是，他再怎么牛，也壓不過上帝和耶穌，況且，楊秀清和蕭朝貴，在上帝大家庭里，也同樣是上帝之子，同樣具有神性，只是，他們的神性祭壇上的位置，比洪秀全靠后一點而已。在馮云山早早陣亡之后，洪秀全事實上無論從交情，還是比本事，都壓不住楊秀清，那么太平天國，也只能是楊秀清的天下。代耶穌說話的蕭朝貴，也早早在進攻長沙的戰斗中陣亡。兩個降神附體的大神，去了一個，只剩下一個，麻煩就更大。太平天國的成事，都要歸功于楊秀清。而洪秀全，只能借他的神學知識，給楊秀清加上一個又一個顯赫的頭銜，封他為九千歲，圣神風（基督教進入中國之初翻譯三位一體的說法），贖病主（傳教士最早對耶穌基督譯法）。賜給的頭銜越多，洪秀全剩下的資本就越少。太平天國是個二元領導結構，但這樣的結構，卻是一個偏正框架，楊秀清這一元，越來越膨脹，而洪秀全這一元，越來越萎縮。
顯然，這樣的二元結構，盡管其中的一元很萎縮，隱患卻越來越大。在造反之前，這樣的隱患還不明顯，定都南京之后，楊秀清陶醉于自己事實上天國一號的地位，隨著天國的凱歌行進，愈發妄自尊大，竟然忘記了洪秀全也有野心和自尊，而且這種野心和自尊，還相當強烈。所以，一旦洪秀全受不了楊秀清的氣，另外的野心家乘虛而入，發動政變，完全沒有防備的楊秀清，也就只能授首了。自然，一旦上帝大家族自相殘殺，所謂天國的事業，也就瀕臨破產了。