時汀、漳、左溪賊酋藍天鳳與贛、南、上新、穩下等硐賊酋雷鳴聰、高文輝等相結，盤據千里，荼毒三省。公與諸從事議曰：“諸巢為患雖同，事勢各異。以湖廣言之，則桶岡諸巢為賊之咽喉，而橫水、左溪諸巢為之腹心。以江西言之，則橫水、左溪諸巢為賊之腹心，而桶岡諸巢為之羽翼。今不先去橫水、左溪腹心之患，而欲與湖廣夾攻桶岡，進兵兩寇之間，腹背受敵，勢必不利。今我出其不意；進兵速擊，可以得志。已破橫水、左溪，移兵而臨桶岡，勢如破竹矣。”議既決，命指揮鄧文帥兵千余，自大庚縣義安入；知府唐淳帥兵千余，自大庚縣聶都入；知府季斅帥兵千余，自大庚縣穩下入；縣丞舒富帥兵千余，自上猶縣金坑入；親帥兵千余，自南康進屯至坪，期直搗橫水，與諸軍會；命副使楊樟，參議黃宏，監督各營官兵往來給餉，以促其后。是月初七日，各哨齊發。初十日，進兵至坪。會間諜詗知，各險隘皆設滾木壘石。公度此時賊已據險，勢未可近，乃自率兵乘夜遂進。未至賊巢三十里止舍，使人伐木立柵，開塹設堠，示以久屯之形。復遣官分帥鄉兵及樵豎善登山者四百人，各與一旗，赍銳炮鉤鐮，使由間道攀崖壁而上，分列遠近極高山頂以覘賊，張立旗幟，熱茅為數千灶，度我兵至險，則舉炮燃火相應。十二日黎明，公進兵至十八面隘。賊方據險迎敵，驟聞遠近山頂炮聲如雷，煙焰四起，我兵復呼哨分逼，銃箭齊放，賊皆驚潰失措，以為官兵盡破其巢，遂棄險退走。公預遣千戶陳偉、高睿分帥壯士數十緣崖上，奪賊險，盡發其滾木壘石。我兵乘勝驟進，指揮謝昹、馬廷瑞兵由間道先入，悉焚賊巢。賊退無所據，乃大敗奔潰。橫水既破，遂乘勝進攻左溪，擒斬首級無算，俘獲男婦牛馬什物不可勝算。會霧雨連日，公令休兵犒勞。
是月二十七日，官兵乘勝進攻桶岡。公復議：桶岡天險，四山壁立萬仞，中盤百余里，連峰參天，深林絕谷，不睹日月。因詢訪鄉導，賊所由入惟鎖匙龍、葫蘿洞、茶坑、十八磊、新地五處，皆假棧梯壑，夤懸絕壁而上；惟上章一路稍平，然深入湖廣，迂回取道，半月始至。令移屯近地，休兵養銳，振揚威聲，使人諭以禍福，彼必懼而請服。其或不從，乘其猶豫，襲而擊之，乃可以逞?？v所獲桶岡賊鐘景縋入賊營，期以翼日早，使人于鎖匙龍受降。賊方恐，集眾會議。又遣縣丞舒富帥數百人屯鎖匙龍，促使出降。遣知府邢珣入茶坑，伍文定入西山界，唐淳入十八磊，知縣張戩入葫蘿洞，皆于是月晦日乘夜各至分地。遇大雨，不得進。明早，冒雨疾登。賊酋藍天鳳方就鎖匙龍聚議，聞各兵已入險，皆驚愕散亂。猶驅其男婦千余人據內隘，絕險隔水為陣以拒。我兵渡水前擊，復分部左右夾攻，賊不能支，且戰且卻。及午，雨霽，各兵鼓奮而前，賊乃敗走。桶岡諸巢悉平。
親行相視形勢，據險之隘，議以其地請建縣治，控制三省諸瑤，斷其往來之路。又進兵攻穩下、朱坑等巢，悉平。又以湖、廣二省之兵方合，雖近境之賊悉以掃蕩，而四遠奔突之虞難保必無，乃留兵二千余，分屯茶、寮諸隘，余兵令回近縣休息，候二省夾攻盡絕，然后班師。驅卒不過萬余，用費不滿三萬，兩月之間，俘斬六千有奇，破巢八十有四，渠魁授首，噍類無遺。又疏請三縣適中之處立崇義縣，移置小溪驛于大庾縣城內，使督兵防遏。
浰頭賊酋池大鬢等聞橫水諸巢皆破，始懼加兵，乃遣其弟池仲安等率老弱二百余，徒赴軍門投降，隨眾立效，意在緩兵，因窺虛實，乘間內應。公逆知其謀，乃陽許之。及進攻桶岡，使領其眾截路于上新地以遠其歸途。十一月，池大鬢等聞復破桶岡，益懼，為戰守備。公使人賜各酋長牛酒，以察其變。賊度不可隱，詐稱龍川新民盧珂等將掩襲之，是密為之防，非虞官兵也。亦陽信其言，因復陽怒盧珂等擅兵仇殺，移檄龍川，使廉其實；且趣伐木開道，將回兵浰頭，取道往征之。賊聞之，且喜且懼。盧珂、鄭志高、陳英者，皆龍川舊招新民，有眾三千余，為池大鬢所脅，而三人者獨深忌之，乃來告變。云池大鬢僭號設官，及以偽授廬珂等金龍霸王官爵印信來首。公先已諜知其事，乃復陽怒，不信，遂械系盧珂，而使人密諭其意。珂遂遣人歸集其眾，待時而發。又使人往諭池大鬢，且密購其所親信頭目二十人，陰說之同部下百八十人使自來投訴。還贛，乃張樂大享將士，下令城中散兵，使各歸農，示不復用。賊眾皆喜，遂弛其備。池大鬢等乃謂其眾曰：“若要伸，先用屈。贛州伎倆，亦須親往勘破。”率其麾下四十人自詣贛。公使人探知池大鬢已就道，密遣人先行屬縣，勒兵分哨，候報而發。又使人督集盧珂等兵，俱至，令所屬官寮以次設羊酒，日犒池大鬢等，以緩其歸。會正旦之明日，復設犒于庭，先伏甲士，引池大鬢入，并其黨悉擒之。出盧珂等所告狀，訊鞫皆伏，置于獄斬之。夜使人趨發屬縣兵，期以初七日入巢。諸哨兵皆從各徑道以入；自率帳下官兵，從龍南縣令水直揭下浰大巢，與各哨兵會于三浰。先是賊徒得池大鬢報，謂贛州兵已罷歸，皆已弛備，散處各巢。至是驟聞官兵四路并進，皆驚懼，分投出御；悉其精銳千余據險設伏，并勢迎敵于龍子嶺。我兵聚為三沖，犄角而前，大戰良久，賊敗。復奮擊數十合，遂克上、中、下三浰。各哨官兵遙聞三浰大巢已破，皆奮勇齊進，各賊潰敗。
遂進攻九連山。于是選精銳七百余人，皆衣所得賊衣，佯若奔潰者，乘暮直沖賊所，據崖下澗道而過。賊以為各巢敗散之黨，皆從崖下招呼。我兵亦佯應之。賊疑，不敢擊。已度險，遂斷其后路。次日，賊始知為我兵，并勢沖敵。我兵已據險，從上下擊，賊不能支。公度其必潰，預令各哨官兵四路設伏以待。賊果潛遁，邀擊而悉俘之，前后擒斬首級無算，俘獲男婦牛馬器仗什物不可勝計。余黨張仲全等二百余人，及遠近村寨，一時為賊所驅，從惡未久者，勢窮計迫，聚于九連谷口呼號痛哭，誠心投降。遣邢珣驗實，量加責治，籍其名數，悉安插于白沙。相視險易，經理立縣設隘可以久安長治之策，留兵防守而歸。贛人皆戴香遮道而迎，為立生祠，又家肖其像，而歲時祭禱。
上疏乞休致，不允。又以龍川諸處系山林險阻之所，盜賊屯聚之鄉，當四縣交界之隙，乃三省閏余之地，政教不及，人跡罕到。其間接連閩、廣，反覆賊巢，動以百數。據而守之，真足控諸賊之往來，杜奸宄之潛匿。遂疏請于和平地方建設和平縣治，以扼其要害。又以大賊酋龔福全、高仲仁、李斌、吳[王凡]等邀路劫殺軍民，攻掠郡縣，命三省將官剿平。上三省夾剿捷音疏。朝廷論功行賞，升右副都御史，蔭子一人錦衣衛，世襲百戶，寫敕獎勵。懇疏辭免，乞原職致仕。溫旨慰留。因奏平定廣東韶州府樂昌縣等賊捷音，查例加升子本衛，世襲副千戶。
在贛雖軍旅擾擾，四方從游日眾，而講學不廢。褒崇象山陸子之后以扶正學。贛人初與賊通，俗多鄙野。為立保甲十家牌法，于是作業出入皆有紀。又行鄉約，教勸禮讓。又親書教試四章，使之家喻戶曉。而贛俗丕變，贛人多為良善，而問學君子亦多矣。
十四年正月，再疏乞放歸田里。當路忌公，欲從其請。王公瓊逆知宸濠必將為變，一日，召其屬主事應典曰：“我置王某于江西，與之便宜行事者，不但為溪洞諸賊而已，或有他變，若無便宜行事敕書旗牌，將何施用？”時福建有軍人進貢等之變，王公曰：“此小事，不足煩王某。但假此以牽便宜敕書在彼手中，以待他變。爾可為我做一題稿來看?！备宄?，具題。降敕與公曰：“福州三衛軍人進貢等協眾謀反，特命爾暫去彼處地方會同查議處置，參奏定奪?！?
時濠陰謀不軌，亦已有年。一日，命安福舉人劉養正往說公云：“寧王尊師重道，有湯、武之資。欲從公講明正學。”公笑曰：“殿下能舍去王爵否？”既而令門人冀元亨先往，與濠講學，以探其誠否。元亨與語矛盾；濠怒，遣還，密使人殺于途，不果。公以六月初九日自贛往福建勘事。十五日至豐城縣界，典史鄧人報濠反狀。繼而知縣顧佖具言之。公度單旅倉猝，兵力未集，難即勤王，亟欲溯流趨吉安。南風方盛，舟人聞宸濠發千余人來劫公，畏不敢發，乃以逆流無風為辭。公密禱于舟中，誓死報國。無何，北風大作。舟人猶不肯行；拔劍馘其耳，遂發舟。薄暮，度勢不可前，潛覓漁舟，以微服行；留麾下一人服己冠服在舟中。濠兵果犯舟，而公不在。欲殺其代者，一人曰：“何益？”遂舍之。故追不及。是夜至臨江。知府戴德孺喜甚，留公入城調度。曰：“臨江居大江之濱，與省城相近，且當道路之沖，莫若吉安為宜?！庇忠匀呋I之曰：“濠若出上策，直趨京師，出其不意，則宗社危矣。若出中策，則趨南都，大江南北亦被其害。若出下策，但據江西省城，則勤王之事尚易為也。”
行至中途，恐其速出，乃為間諜，假奉朝廷密旨先知寧府將反，行令兩廣、湖、襄都御史楊旦、秦金及兩京兵部各命將出師，暗伏要害地方，以俟寧府兵至襲殺。復取優人數輩，各與數百金以全其家，令至伏兵處所飛報竊發日期，將公文各縫置袷衣絮中。將發間，又捕捉偽太師李士實家屬至舟尾，令其覘知。公即佯怒，牽之上岸處斬，已而故縱之，令其奔報。宸濠邏獲優人，果于袷衣絮中搜得公文，遂疑不發。
十八日至吉安。知府伍文定甚喜，軍民皆遮道呼號。公入城撫慰，兩上疏告變，請命將征討，以解東南倒懸。奏至，王公瓊揚言于朝曰：“王某在南贛，必能擒之。不久當有捷報至。但朝廷不命將出師，則無以壯其軍威。”
時濠畜養死士二萬，招誘四方盜賊渠魁亦萬數，舉事之日，復驅其護衛黨與并脅從之人又六七萬，虐焰張熾。公以百數從卒，退保吉安，遙為牽制之圖。遠近軍民劫于濠積威，道路以目，莫敢出聲。公率知府伍文定、戴德孺、邢珣、徐璉等調集軍民兵快，石募四方報效義勇，會計應解留錢糧，支給糧賞，造作軍器戰船，奏留公差回任御史謝源、伍希儒分職任事，約會鄉官致仕右副都御史王懋忠，養病編修鄒守益，郎中曾直，評事羅僑，丁憂御史張鰲山，赴部調用僉事劉藍，依親進士郭持平，致仕副使劉遜，參政黃繡，閑住知府劉昭等，相與激勸忠義，曉諭禍福。調度已定，移檄遠近，宣布朝廷仁德，暴濠罪惡。濠始覺為公所欺，亟欲引兵而出。公謂：急沖其鋒，攻其有備，皆非計之得也；始示以自守不出之形，必俟其出，然后尾而圖之。先復省城以搗其巢穴，彼聞必回兵來援。我則出兵邀而擊之。此全勝之策也。濠果使人探公未出，先發兵出次南康、九江，自居省城以御公。
七月初二日，濠又使人探公兵果不出，乃留兵萬余，屬其腹心宗室及儀賓內官并偽部都督都指揮等官使守省城，自引兵向安慶。公知其出，遂急促各府兵，期以本月十五日會于臨江樟樹鎮；身督伍文定等兵徑下。于是知府戴德孺引兵自臨江來，知府徐璉引兵自袁州來，知府邢珣引兵自贛州來，通判胡堯元、童琦引兵自瑞州來，通判談儲，推官王暐、徐文英，新淦知縣李美，太和知縣李楫，寧都知縣王天與，萬安知縣王冕，亦各以兵來赴。十八日遂至豐城，分布哨道。使伍文定攻廣潤門，邢珣攻順化門，徐璉攻惠民門，戴德孺攻永和門，胡堯元、童琦攻章江門，李美攻德勝門，都指揮余恩攻進賢門。談儲、王暐、李楫、王天與、王冕等各以其兵乘七門之釁，從旁夾擊，以佐其勢。又探得濠伏兵千余于新舊墳廠，以備省城之援。乃遣奉新知縣劉守緒，典史徐誠，領兵四百，從間道夜襲破之，以搖城中。
十九日，登市汊誓師，且申布朝廷之威，再暴濠惡。約諸將一鼓而附城，再鼓而登城，三鼓不克誅其伍，四鼓不克斬其將。誓已，莫不切齒痛心，踴躍激奮。薄暮徐發。
二十日黎明，各至信地。城中為備甚嚴，滾木、灰瓶、火炮、石弩、機毒之械，無不畢具。及我兵已破新舊墳廠，敗潰之卒皆奔告城中。城中聞我師四面驟集，莫不震駭。我師呼噪并進，梯絙而登。城中倒戈而奔。遂破擒其居守宜春王栱樤及偽太監萬銳等千余人。宮眷縱火自焚，延燒居民房屋。公令各官分道救火，撫定居民，釋其脅從，封其府庫。搜出原收大小衙門印信九十六顆。其脅從布政使胡廉、參政劉斐、參議許效廉、副使唐錦、僉事賴鳳、都指揮王玘，皆自上江西捷音疏，仍分兵四路追躡。
是時濠攻安慶未下，親自督兵運土填塹，期在必克。及聞我兵至豐城，大恐，即欲回舟。李士實阻勸，以為必須徑往南京，既登大寶，則江西自服。濠不應。次日，遂解安慶之圍，移兵泊阮子江，會議歸援。