五月，耿繼茂等奏：三月初六日，臣與總督李率泰、提督王進(jìn)功、海澄公黃梧等領(lǐng)兵先后至八尺門，偽威遠(yuǎn)將軍翁求多率兵民六萬余人納款。十四日夜半渡海，進(jìn)拔銅山，斬首三千二百余級(jí)；偽都督余寬等率偽官兵家屬人等三萬二千四百余名出降，所獲船只、盔甲、器械無算。鄭經(jīng)僅存數(shù)十艘，乘風(fēng)遁走臺(tái)灣。計(jì)閩海地界凡數(shù)十島，賊巢布列，至是掃滅殆盡。授投誠周全斌為承恩伯，食三等伯俸。

六月，李率泰以病求罷，諭留之。

以朱昌祚為福建總督（由浙江巡撫遷）。授投誠黃廷為慕義伯。加致仕福建總督李率泰為正一品。

李率泰奏：總兵官李長榮等出洋會(huì)剿張煌言，擊敗五千余人，擒偽總兵張賢等，并獲船只、器械。

七月，管理福建安輯投誠事務(wù)賁岱奏：自康熙元年至三年止，合計(jì)投誠文武官三千九百八十五員、食糧兵四萬九百六十二名、歸農(nóng)官弁兵民六萬四千二百三十名口、眷屬人役六萬三千余名口、大小船九百余只（以上東華錄）。

八月，李率泰上疏議取臺(tái)灣，以福建水師提督施瑯為靖海（一作南）將軍，承思伯周全斌、太子少師左都督楊富副之，整舟師數(shù)百號(hào)候風(fēng)開洋（海上見聞錄、皇朝年表）。

十月，耿繼茂奏：荷蘭國出海王于八月十六日帶領(lǐng)番船十只、番兵千人抵閩安鎮(zhèn)，約九月二十至圍頭取齊，于十月初旬往澎湖攻賊巢，候風(fēng)便進(jìn)取臺(tái)灣（東華錄）。

四年（永歷十九年、一六六五）正月，李率泰奏：閩海廈門各島前已蕩平，惟南山、鎮(zhèn)海、佛潭橋一帶余孽盤踞；總兵劉進(jìn)忠等進(jìn)剿，于三年九月初四日親統(tǒng)官兵，陣斬七千有奇，招撫男婦一萬三千余名（東華錄）。

水師提督施瑯疏請(qǐng)攻臺(tái)，與周全斌等出洋，未至澎湖，颶風(fēng)大作，各船飄散，不能相顧，皆引還。未幾，瑯、全斌入京。進(jìn)瑯伯銜，為內(nèi)大臣，歸旗（海上見聞錄、三藩紀(jì)事本末）。

五月，議政王等會(huì)議吏部奏請(qǐng)裁并督撫一疏，得旨：福建仍留總督一員。

六月，李率泰奏：漳、汀地方遼闊，請(qǐng)以守漳道仍駐漳州，巡建道仍兼轄延平，守建道自建寧府改駐汀州，兼轄郡武；從之。

八月，兵部議敘康熙二年進(jìn)取金門、廈門、康熙三年攻克銅山等處功，加靖南王耿繼茂俸銀一千兩，賞海澄公黃梧大蟒、貂裘、鞍轡等物，加黃順等二十人為左都督、施瑯等六人為右都督、陳斌等十一人為都督同知、黃英等十一人為都督僉事。總兵楊富以進(jìn)援中傷，落水復(fù)出，授拜他喇布勒哈番，準(zhǔn)襲二次。各將士加等授職有差。

九月，李率泰奏：水師右路總兵官杜永和連破海寇，斬偽將烏角車等。

上諭：設(shè)立水師提督、總兵官等，原為防御海寇。今福建銅山、炫鐘等處賊船挽泊，提鎮(zhèn)官等并未帶領(lǐng)官兵撲剿，至賊船飄往廣東，并未跟蹤追殺，又不豫檄廣東各官在前截殺，則設(shè)立水師提督何用？以后若再如此，定行治罪。

五年（永歷二十年、一六六六）正月，李率泰卒。遺奏閩海余氛遠(yuǎn)竄臺(tái)灣，奉旨撤兵，與民休息，洵為至計(jì)；惟是將眾兵繁，若撤之太驟，不無驚惶，太遲又恐貽患。目下當(dāng)安反側(cè)之心，日久務(wù)防難制之勢(shì)。紅毛夾板船雖已回國，然往來頻仍，異時(shí)恐生釁端。閩省兵馬、錢糧專望協(xié)餉，倘若外解不周，即有意外之慮。至數(shù)年以來，海禁甚嚴(yán)，遷移之民盡失故業(yè)；宜略寬界限，俾獲耕漁，稍蘇殘喘。

以張朝璘為福建總督（原任江西總督）。

十一月，福建巡撫許世昌以病乞休，命以原官致仕。以劉秉政為福建巡撫（以上東華錄）。

是年，曾養(yǎng)性補(bǔ)福建巡撫（逆臣傳）。

六年（永歷二十一年、一六六七）三月，以祖澤溥為福建總督（貳臣傳）。

七年（永歷二十二年、一六六八）四月，海澄公黃梧奏：海疆底定，非昔日強(qiáng)寇出沒可比。福建全省之兵并歸經(jīng)制，獨(dú)同安城守一營官兵，尚屬臣標(biāo)；請(qǐng)將城守營副將一員、兵一千名悉歸經(jīng)制，聽總督、提督管轄。從之（東華錄）。

八年（永歷二十三年、一六六九）正月（紀(jì)事本末作七年事），浙江投誠將孔元璋請(qǐng)往臺(tái)灣招撫；京中遣大臣明珠、蔡毓英至泉州，加興化知府慕天顏卿銜，渡海往議。鄭經(jīng)遣柯平、葉亨到泉州，議照朝鮮例稱臣奉貢，不剃發(fā)、不登岸。議竟不成。經(jīng)在東寧，以陳永華理國政，馮錫范管侍衛(wèi)、劉國軒等管兵。洪旭病故，其子洪磊及永華侄繩武等皆任用。置鳳山、諸羅二縣，課耕種、通魚鹽，安撫土番、貿(mào)易外國，數(shù)年間海上亦相安無事（海上見聞錄、三藩紀(jì)事本末）。

三月，以劉兆麒為浙江福建總督。

九年（永歷二十四年、一六七〇）閏二月，復(fù)設(shè)福建總督一。

四月，復(fù)設(shè)福建分守興泉道、巡延建邵道，其福州府、福寧州海防事歸驛鹽道兼管，興、泉二府海防事歸興泉道兼管。

以劉斗為福建總督。

十月，浙江福建總督劉兆麒奏：偽寧遠(yuǎn)將軍林柏馨、偽都督施轟率偽官百四十四員、兵千六百九十名、船三十只自臺(tái)灣赴浙投誠。

十年（永歷二十五年、一六七一）正月，耿繼茂奏：舊疾日劇，請(qǐng)以長子精忠管理軍務(wù)；從之（以上東華錄）。

耿繼茂卒，子和碩額駙精忠襲（皇朝年表）。

五月，予故靖南王耿繼茂謚「忠敏」。

八月，福建總督劉斗奏：海寇自撤水師之后，帆檣出沒，侵犯靡常，甚至在各島嶼蓋造房舍。臣等密商機(jī)宜，配發(fā)水陸官兵陸續(xù)搜剿。今已搜剿六十余島，斬溺賊眾五千三百八十余人（以上東華錄）。

十一年（永歷二十六年、一六七二）九月，命福建總督自漳州移駐省城（東華錄）。

是月，范承謨?yōu)楦＝偠剑|華錄）。

十二年（永歷二十七年、一六七三）二月，鄭經(jīng)將劉國軒下海澄，遂圍漳、泉。先是，都統(tǒng)胡圖復(fù)漳、泉，經(jīng)奔廈門，國軒亦棄惠州去，凡七府一時(shí)俱潰。至是，國軒復(fù)出，沿洲堡連下十余處；兵僅數(shù)千，飄驟馳突，鋒銳不可當(dāng)。于是都統(tǒng)穆赫林?jǐn)∮跒逞鼧洌瑢④娎_(dá)、都統(tǒng)胡圖敗于鎮(zhèn)北山，將軍賴塔、提督段應(yīng)舉敗于福山頭。國軒遂取平和、漳平，進(jìn)破海澄，斬應(yīng)舉及總兵黃藍(lán)，兵士死者三萬余、馬萬余匹，軍勢(shì)益振；乘勝下漳平、長泰、同安，略取南安、惠安、安溪、永春、德化諸邑。國軒自圍漳，遣兵圍泉。康王杰書時(shí)駐軍福州，不敢進(jìn)。已而在籍學(xué)士李光地為鄉(xiāng)導(dǎo)，引賴塔兵由安溪間道出同安，泉州圍解，國軒退入海澄；時(shí)出窺漳州，相持年余不決（清史紀(jì)事本末）。

七月，靖南王耿精忠奏請(qǐng)將部下官兵撤回安插（東華錄）。

議政王大臣等議奏：福建今已底定，地方有防守官兵；靖南王既請(qǐng)自福建遷移，應(yīng)將王本身并標(biāo)下十五佐領(lǐng)官兵家口均行遷移。從之（東華錄）。

十一月，吳三桂反，止閩、粵兩藩勿撤（皇朝年表）。

十三年（永歷二十八年、一六七四），三藩難作，耿精忠據(jù)福建以叛。三月十五日（李文襄年譜作二十九日），精忠傳各官入府議事。總督范承謨不屈，被拘，以巡撫劉秉政為統(tǒng)制使，蕭震為布政司，自稱總統(tǒng)兵馬上將軍，移檄各府縣；望風(fēng)降。泉州提督王進(jìn)功夜縱諸將焚劫；馬惟興劫興化、郭維藩劫惠安，獨(dú)同安城守張學(xué)堯、晉江水師營李尚文所部無犯。初，精忠遣通事王鏞至臺(tái)灣乞師，請(qǐng)以舟師由海出江南，而自統(tǒng)陸師出浙江；鏞回言海上船不滿百、兵不滿萬，精忠輕之。經(jīng)遣協(xié)理柯平至福州報(bào)命，精忠謾應(yīng)曰：『世藩來甚善，各分地自戰(zhàn)可也』。臺(tái)灣侍衛(wèi)馮錫范、鎮(zhèn)將劉國軒率舟師數(shù)十、兵數(shù)千至廈門。精忠調(diào)諸路兵出關(guān)，以黃梧為平和公。梧病疽，受印不數(shù)日，疽潰而死；子芳度遣黃翼帶兵千余人，從精忠兵出關(guān)。海澄總兵趙得勝與錫范密約，以海澄降。精忠召泉州提督王進(jìn)功至省，以張學(xué)堯鎮(zhèn)泉州、花尚蘭守同安。錫范等至同安，尚蘭迎降，獲學(xué)堯家口。學(xué)堯聞變趨回，俱降于經(jīng)（海上見聞錄）。

鄭經(jīng)至思明州，以趙得勝為左都督，封興明伯張學(xué)堯?yàn)樽笙蠕h鎮(zhèn)、花尚蘭為仁武鎮(zhèn)。遣人于精忠借漳、泉二府，并議撥船；精忠不許，又禁買船料貨物。耿、鄭交惡，精忠遣王進(jìn)率部卒千人入泉州。進(jìn)原為漳州副將，時(shí)提標(biāo)五營不應(yīng)調(diào)。王進(jìn)至，與城守賴玉相結(jié)，以提標(biāo)守備戴國用為爪牙，勒令王進(jìn)功家眷入省。進(jìn)功子藩錫與楊青等以藩錫母命召諸將議事，賴玉、戴國用、李尚文至，執(zhí)之，率兵攻王進(jìn)。進(jìn)走登涂門樓，意氣自若。提標(biāo)兵無統(tǒng)帥，相持竟日。進(jìn)恐海船至，更深整隊(duì)出城而去。六月三日，范錫至，殺賴玉，分其尸。四日，絞殺戴國用，釋李尚文，迎經(jīng)入城。經(jīng)以范錫為指揮使，暫理提督軍務(wù)。遣人諭黃芳度降，封德化公、授前提督，漳屬錢糧聽其征給。芳度終不自安，差人間道赍密疏入京。潮州總鎮(zhèn)劉進(jìn)忠降于精忠，密請(qǐng)漳浦鎮(zhèn)劉炎率兵會(huì)之；夜攻同城，續(xù)順公沈瑞并其兵（海上見聞錄、三藩紀(jì)事本末）。

七月，以郎廷佐為福建總督，以楊熙為福建巡撫（東華錄）。

尚可喜遣兵圍劉進(jìn)忠于潮州，精忠不能援，因求救于經(jīng)；經(jīng)遣援剿后鎮(zhèn)金漢忠率舟師援之。以進(jìn)忠為右都督，封定虜伯（海上見聞錄）。

八月，黃芳度間道赍奏，言父梧于三月病故，不得已權(quán)送敕命于精忠，仍密行招募，合舊兵共得六千余名。六月初四日，斬偽城守都督劉豹等三人，保守漳州。惟望大兵入閩救應(yīng)，隨往迎接。得旨：大兵由浙江、江西、廣東三路進(jìn)閩，黃芳度偵何處先到，即來迎會(huì)。尋芳度兄一等侍衛(wèi)芳世乞隨大兵進(jìn)剿，救援伊弟；因授芳世為隨征福建總兵官，進(jìn)剿福建（東華錄）。

九月，精忠遣王進(jìn)以步騎三萬攻泉州，并命漳浦降總兵劉炎與進(jìn)為犄角。進(jìn)至惠安，肆行焚掠；經(jīng)命劉國軒統(tǒng)營兵御之。王進(jìn)退屯楓亭，列營二十余里。十月，國軒至涂嶺，嚴(yán)陣會(huì)戰(zhàn)。進(jìn)見前陣皆新募之兵，直前擊之，新募兵殊死戰(zhàn)。國軒令許耀分兵襲其營，進(jìn)大敗。國軒追至興化城外而還，劉炎以兵會(huì)上。經(jīng)檄黃芳度擊走其兵。精忠復(fù)遣徐鴻弼會(huì)云霄鎮(zhèn)劉成龍兵入漳浦。經(jīng)以馮錫范、趙得勝督諸軍迎戰(zhàn)于羅山。右虎衛(wèi)何佑揮軍擊之，鴻弼等敗回漳浦城。錫范以沖天炮擊入城，炎大懼，同鴻弼、成龍等出降（海上見聞錄、三藩紀(jì)事本末）。

十二月，金漢忠一軍殲于潮州。鄭經(jīng)遣趙得勝督軍援之，與尚可喜兵戰(zhàn)于黃花岡，廣兵敗走，潮圍解。

經(jīng)設(shè)六官：洪磊為吏官、楊英為戶官、鄭斌為禮官、柯平為刑官、楊賢為工官，兵官缺。置六科都事、察言司、承宣司、賓客司等。陳永華為總制，留守，兼管勇衛(wèi)；馮錫范為侍衛(wèi)；二衛(wèi)皆親軍。薛進(jìn)忠為左武衛(wèi)、劉國軒為右武衛(wèi)、何佑為右虎衛(wèi)、施福為五軍，其左右先鋒及諸鎮(zhèn)營皆聽五提督調(diào)遣。凡文武事宜，皆參軍陳繩武、侍衛(wèi)馮錫范主之。經(jīng)之來思明州也，兵餉取給于東寧。洪磊承其父遺命，助餉銀十萬兩。至是兵眾餉多，乃以六官督比紳士富民以充之。以鄭省英為宣慰使，督理各府縣錢糧。百姓年十六以上、六十以下，每人月納銀五分，曰「毛丁」；船計(jì)丈尺納稅，名曰「梁頭」。及設(shè)各府鹽引，分管鹽場，以給兵食（海上見聞錄）。

黃芳度奏：臣練勁卒滿萬，堅(jiān)守漳城及龍溪五縣。耿逆潛師援漳浦，臣分兵邀擊，賊眾大潰。鄭經(jīng)復(fù)遣偽侍衛(wèi)趙得勝來攻漳浦。乞發(fā)大兵，不拘何路進(jìn)閩，與臣會(huì)合。得旨：尚可喜即發(fā)兵應(yīng)援黃芳度，康親王杰書、將軍希爾根由浙江、江西作速進(jìn)剿福建。大兵一到，移知黃芳度速赴會(huì)合（東華錄）。

十四年（永歷二十九年、一六七五）正月（三藩紀(jì)事本末作十三年事），耿精忠遣張文韜至泉州鄭經(jīng)處賀正議和，送船五只。經(jīng)遣鄭斌報(bào)使，約以楓亭為界，始通好（海上見聞錄）。

二月，永春馮眺峰寨民呂華不服征派，鄭將薛進(jìn)忠圍之，三月不下。知縣鄭時(shí)英諭之出降，釘殺之，家族發(fā)淡水充軍。續(xù)順公沈瑞駐驍平，廣兵來援，何佑遇于百子橋，破走廣兵，瑞出降，封懷安公（海上見聞錄）。

五月，鄭經(jīng)至海澄，遣鄭斌入漳慰諭芳度。東兵入見，芳度不受命，密調(diào)回黃翼出關(guān)兵。精忠移檄召之，亦以疾辭（海上見聞錄）。

六月，經(jīng)自海澄移檄萬松關(guān)。芳度令其下俱剃發(fā)據(jù)守，遣其兄芳泰入粵請(qǐng)?jiān)耘c諸將守四門。經(jīng)進(jìn)攻不利，援剿后鎮(zhèn)萬宏登梯中炮死，乃筑屯圍之。調(diào)何佑從潮州先攻平和縣，守將賴升降，諸屬皆下（海上見聞錄）。

十月，海澄標(biāo)將吳淑以漳州降鄭氏。初，淑歸清，屬海澄公標(biāo)，黃梧待之厚。梧將死，呼淑托曰：『吾兒年少，君可保全之』。及城被困日，淑謂其弟潛曰：『我本海上舊將，公雖待我厚，我負(fù)罪于先藩實(shí)深。今世藩待我眷族尤有加，豈可反圖逆命』？遂以十月六日開城，芳度倉皇投開元寺東井而死（三藩紀(jì)事本末作十三年事）。經(jīng)兵入，獲其將黃翼等斬之；沒其家，剖黃梧棺戮尸斬首，及芳度首揭以徇眾。有議發(fā)梧祖冢者，經(jīng)曰：『罪止其身，于先世何與』？不許。芳泰會(huì)其兄芳世，由州汀至永定，聞?wù)闹萁担舐佣荨＝?jīng)以吳淑為后提督，出江右（海上見聞錄、逆臣傳、皇朝年表）。

十五年（永歷三十年、一六七六）五月，精忠汀州守將劉應(yīng)麟以州款于鄭經(jīng)。經(jīng)使吳淑入據(jù)之，以應(yīng)麟為奉明伯，始叛盟也（三藩紀(jì)事本末）。

七月，以郎廷相為福建總督（由原任河南巡撫遷）。

九月，福建總督范承謨陷賊三年，耿精忠多方偪誘，誓死不屈。至是，與稽永仁等并遇害（海上見聞錄、東華錄）。