圣祖康熙元年（永歷一六年、一六六二），魯王在金門（海東逸史）。

正月初八日，匡城外屋，王令要六千間。水部門城邊起至路通橋共一千三百間，內(nèi)空地千余間；不足。二十日，復(fù)匡荷宅、柳宅、金墩下、鄭道窟、打鐵墩等處復(fù)千余間；又不足。將村邊田園百余畝盡填作地起蓋，又不足。復(fù)自半洋起至東門河港浦下止，洋中之田量二百余畝作地起蓋。所匡屋給銀大間八兩、中間六兩、小間四兩，每畝三兩。即日逐民離屋別住，與左右兩鎮(zhèn)兵住。城內(nèi)住兵名曰「包」，城外住兵名曰「鎮(zhèn)」。經(jīng)院巷與妓女住，開元寺前戲子住，龍山巷與打花鼓人住，各千余人。

王兵家眷搬至本年正月未盡；蓋實(shí)兵有六千人，而門下作買賣者十余萬(wàn)，往來(lái)船只，民間寸步難行。復(fù)于各鄉(xiāng)取正舵工；鄉(xiāng)間人未必能使船，每名折銀五兩（以上榕城紀(jì)聞）。

四月，福建總督李率泰奏：定海小埕賊眾盤踞，臣密會(huì)靖藩各調(diào)官兵擊走之。又萬(wàn)安所先經(jīng)遷毀，續(xù)被偽鎮(zhèn)楊宣等筑壘新踞。臣復(fù)密會(huì)提臣馬得功調(diào)發(fā)官兵夾剿，賊不能支，揚(yáng)帆遠(yuǎn)遁（東華錄）。

五月八日，明招討大將軍延平王鄭成功薨于東寧。初，后提督萬(wàn)禮密約黃梧，欲據(jù)思明州以叛，后隨征南京死，已祀忠臣祠矣；事泄，撤其木主。守銅山將蔡祿、郭義，其黨也，脅忠匡伯張進(jìn)叛。進(jìn)詐許，置酒請(qǐng)會(huì)，欲發(fā)火藥與之俱焚。蔡、郭知之，不赴，進(jìn)遂放火自焚。清兵入銅山，洪旭會(huì)南澳忠勇侯陳豹敗之，清兵退。成功拔翁天佑鎮(zhèn)守銅山，而厚恤張進(jìn)之家。豹守南澳近二十年，許龍、蘇利皆畏之，驕傲專恣，數(shù)違成功令。周全斌以銅山、思明州兵取南澳，豹不敢迎戰(zhàn)，揚(yáng)帆入廣東投誠(chéng)，封為慕化伯；未幾，病疫死。成功嚴(yán)諭搬眷，而鄭泰、洪旭、黃廷等皆不欲行，于是不發(fā)一船至臺(tái)灣，而差船來(lái)調(diào)監(jiān)紀(jì)洪初辟等十人分管番社，皆留住不遣，島上信息隔絕。四月，成功遣兵官楊都事奉令箭到思明州殺董氏及其長(zhǎng)子經(jīng)，以與乳母生子之故。洪旭等不肯奉令，殺楊都事；而訛傳周全斌奉密諭欲殺諸將十余人，于是人人自危。旭使全斌回廈門港，即執(zhí)而拘之，黃昌勸鄭泰遂殺之；全斌求救于董氏，洪旭亦依違，乃得免。至是，成功疾革，猶日強(qiáng)起登將臺(tái)，持千里鏡望澎湖諸島。是日登臺(tái)，罷冠帶，請(qǐng)?zhí)嬗?xùn)出，坐胡床進(jìn)酒；讀至第二帙，嘆曰：『我有何面目見先帝于地下也』？?jī)墒盅诿娑?。?jì)成功自隆武丙戌起兵，經(jīng)營(yíng)海外十余載，進(jìn)取之志卒未能達(dá)；及退據(jù)臺(tái)灣，越年竟歿，春秋三十有九。提督馬信及諸鎮(zhèn)將黃昭等議以其弟世襲護(hù)理大將軍印。未幾，馬信以哭成功過(guò)哀病故。世襲以黃昭、蕭拱宸為腹心，劉國(guó)軒管鎮(zhèn)事，謀自立。報(bào)至思明州，鄭泰、洪旭、黃廷、工官馮澄世、參軍蔡鳴雷等立長(zhǎng)子經(jīng)為嗣，稱世子，發(fā)喪即位。是年，永歷帝已先一日被難，而經(jīng)猶奉其正朔（海上見聞錄、小腆紀(jì)年、清史紀(jì)事本末）。

海上諸臣議復(fù)奉魯王監(jiān)國(guó)（海東逸史）。

平南王尚可喜奏：總兵官許龍擒鄭成功之弟鄭成賜于廈門。得旨嘉獎(jiǎng)，下部議敘。

六月，諭兵部：福建水師應(yīng)設(shè)提督一員、總兵二員。此水師官兵應(yīng)駐何處、每處應(yīng)設(shè)官兵船若干？爾部會(huì)同大學(xué)士蘇納海、尚書車克速議奏聞。

七月，靖南王耿繼茂奏：漳州水師經(jīng)制兵三千，原設(shè)游擊二，分為二營(yíng)；恐兵多不便約束，請(qǐng)?jiān)鲇螕粢?，改為中、左、右三營(yíng)。從之。

增福建長(zhǎng)樂(lè)營(yíng)游擊一（以上東華錄）。

十月（小腆紀(jì)年作十一月事），洪旭、鄭泰以兵千余人送世子經(jīng)臺(tái)灣，周全斌為五軍，馮錫范（澄世子）為侍衛(wèi)，陳永華為咨議參軍。至澎湖，其將李思忠船飄至臺(tái)灣，知諸將有謀，逃回。經(jīng)因乘風(fēng)入鹿耳門登岸，全斌令連夜伐木為柵扎營(yíng)。次早，黃昭會(huì)諸將出兵，值大霧，晝冥，跬步不可視，諸將多迷誤失期；惟黃昭兵先至攻其前，劉國(guó)軒兵至攻其后，破營(yíng)而入。經(jīng)兵卻，復(fù)擠而前，黃昭攀木為梯，為流矢所中墜下；全斌斬其首，大呼示眾，軍士皆迎降。大霧忽晴，日已向午。經(jīng)入安平鎮(zhèn)，請(qǐng)世襲待之如初。世襲委罪于其仆蔡云，云自縊。收殺蕭拱宸、李應(yīng)情、曾從龍等，余不問(wèn)；諸將營(yíng)兵守汛地如故。時(shí)靖南王耿繼茂移鎮(zhèn)福建，與總督李率泰遣中軍李有功等至思明州。鄭泰等議照朝鮮國(guó)例復(fù)耿、李，使疏請(qǐng)。泰遣中軍楊來(lái)嘉入京待命，不報(bào)。來(lái)嘉回，京中遣戶部郎中賁岱、兵部郎中金世德入閩招撫，凡海上文武官投誠(chéng)者照品級(jí)補(bǔ)用（海上見聞錄）。

十一月，經(jīng)率周金斌等同其叔世襲回思明州。后世襲入京歸命，授精奇尼哈番。顏氏、芝豹自戍所發(fā)回，準(zhǔn)在京同?。ㄍ希?

二十三日，魯王殂于臺(tái)灣（海東逸史、小腆紀(jì)年）。

靖南王耿繼茂奏：偽鎮(zhèn)威將軍左都督楊學(xué)皋率所屬官兵三千余名、人民家口三萬(wàn)有余投誠(chéng)，請(qǐng)從優(yōu)議敘。得旨：歸順人民聽其自便安插。尋授學(xué)皋左都督，加太子太保，給三等阿思哈尼哈番。

十二月，耿繼茂奏：總兵官吳萬(wàn)福奉命招撫偽總兵王士鰲等歸誠(chéng)。

耿繼茂奏：自順治十八年九月起、至康熙元年七月止，陸續(xù)招撫偽將軍、都督、總兵并副、參、游、守、千、把總等官共二百九十員，兵共四千三百三十四名，家口共四百六十七名，請(qǐng)敕部酌議各官給與銜俸，兵丁入伍支糧。

命福建水師提督帶兵四千駐扎海澄縣，左路水師總兵官帶兵三千駐扎閩安縣，右路水師總兵官帶兵三千駐扎同安縣。

裁福建海澄總兵官（以上東華錄）。

二年（永歷一七年、一六六三），永明王訃至，鄭經(jīng)猶稱永歷年號(hào)（三藩紀(jì)事本末）。

三月，荷蘭國(guó)遣出海王統(tǒng)領(lǐng)兵船至福建閩安鎮(zhèn)助剿鄭氏（東華錄）。

鄭經(jīng)使洪旭守思明州、鄭泰守金門、黃廷守銅山。而經(jīng)得泰與黃昭往來(lái)書，欲襲取之；泰不自安，稱病不來(lái)見。四月，參軍陳永華謀以經(jīng)將回東寧，調(diào)泰為居守戶官，統(tǒng)轄諸鎮(zhèn)；鑄居守戶官印，遣協(xié)理吳慎赍至金門。泰遣弟鳴駿入謝，經(jīng)慰諭之；見陳永華，情款甚密。鳴駿回，力勸其行；泰遂于六月六日帶兵船并餉銀十萬(wàn)至思明州。經(jīng)以通書黃昭事面質(zhì)之，遂交與洪旭監(jiān)留。周全斌率兵并其船，獨(dú)蔡璋一船走脫。天未明，至金門。鳴駿倉(cāng)卒與泰子纘緒率諸將及兵丁眷口下船，入泉州港，向總督李率泰投誠(chéng)；船二百余號(hào)，兵八千余人。全斌等追之不及。泰見子弟家眷兵眾皆入泉州港，遂自盡而死（海上見聞錄、小腆紀(jì)年）。

七月，以黃而輝（黃廷子）為思明知州（海上見聞錄）。

八月，黃廷自銅山入見，經(jīng)慰諭之。右武衛(wèi)楊富、左武衛(wèi)何義、禮官都事陳彭等皆先后內(nèi)渡投誠(chéng)（同上）。

靖南王耿繼茂奏：偽尚書參知軍政事蔡雷鳴密令其子偽侍郎蔡協(xié)吉、偽通政蔡源等攜眷來(lái)歸，應(yīng)請(qǐng)敘錄。

投誠(chéng)同安伯鄭鳴駿奏報(bào)：伊兄鄭泰遺命子鄭纘緒統(tǒng)所部文武各官四百余員、水陸兵丁七千三百余名各帶家眷，駕舟艦一百八十余號(hào)，直抵泉郡港口投誠(chéng)，并繳偽敕印等件。授福建投誠(chéng)同安伯鄭鳴駿為遵義侯、永成伯鄭纘緒為慕恩伯。

九月，耿繼茂奏：偽慶都伯王秀奇投誠(chéng)。

福建總督李率泰奏：偽忠靖（一作精忠）伯陳輝率文武偽官一百三十三員、兵一千六百名、家口八百余名投誠(chéng)。管理福建安輯投誠(chéng)事務(wù)郎中賁岱奏：偽統(tǒng)領(lǐng)掛寧南將軍印左都督陳舜穆率轄下總兵二員、副總兵六員、參將二十員、游擊十九員、都司三員、守備一員、兵部主事一員、工部郎中一員、監(jiān)紀(jì)推官二員、兵丁一千名投誠(chéng)（以上東華錄）。

荷蘭集夾版船十六只、兵數(shù)千人，會(huì)約靖南王總督同攻金、廈兩島，事定之日，欲求浯嶼筑城貿(mào)易，如廣東香山澳例，復(fù)準(zhǔn)納貢互市（海上見聞錄）。

十月，陸路提督馬得功督鄭鳴駿以船數(shù)百號(hào)出泉州港，水師提督施瑯同黃梧出海澄港，靖南王耿繼茂同荷蘭兵札營(yíng)同安劉五店，約期渡海。

李率泰奏：偽總兵魏明等率眾來(lái)歸，請(qǐng)從優(yōu)錄敘。

李率泰奏：延、建等處皆高山峻嶺，賊首王鐵佛等倚險(xiǎn)結(jié)巢；建寧、延平、邵武將弁統(tǒng)兵克期夾剿，三路齊進(jìn)，奮勇力戰(zhàn)，殺賊一百一十七人、生擒王鐵佛等六十八人正法。又奏：鄭錦遣偽副將林維等率舟師由海門欲乘風(fēng)直入海澄，燒新造戰(zhàn)船。提臣施瑯密遣守備王明等統(tǒng)水師，夜半直抵海門；賊囗〈舟宗〉前來(lái)拒敵，我兵奮勇，陣殺偽副將林維等，生擒賊將兵丁共一百二十五名，奪獲船只、器械。

十一月，李率泰奏：?？芪灏儆嗳擞闪荷角址负＝?，總兵官王進(jìn)功、參將折光秋夾擊，大敗之，殺賊一百六十余人、生擒九人。

耿繼茂奏：鄭芝龍子鄭世襲素蓄歸順之心，緣鄭成功攜往臺(tái)灣。及成功暴亡，復(fù)被逆孽鄭經(jīng)帶回廈門，脫身無(wú)術(shù)。至是，乘間率偽文武官二百二十四員、水陸兵一百二十名家口、船只、盔甲、器械等物投誠(chéng)。又偽都督鄭賡系同安伯鄭鳴駿之弟，攜帶官兵共三百一十五員名、家屬共三百四十二名口投誠(chéng)。

耿繼茂奏：偽都督僉事陳宗等文武官二百三員、兵丁三千二百二十五名并戰(zhàn)艦、盔甲器械等物投誠(chéng)（以上東華錄）。

鄭經(jīng)率黃廷、周全斌等會(huì)于金門。全斌曰：『海澄之師猝未敢前，惟泉州會(huì)合紅夷夾板而來(lái)，其勢(shì)甚銳；破之，則各港氣奪，不戰(zhàn)自退矣』。洪旭曰：『先王破達(dá)素，悉空廈門，背城一戰(zhàn)』。乃出眷口暨流寓之宗室、紳兵寄椗各嶼，而列舟師于大擔(dān)，以為全斌援。荷蘭船高而且大，一船有大小熕銃千余號(hào)，橫截中流，為清船藩蔽。是日，炮聲自辰至酉，相續(xù)不絕，一似霹靂。經(jīng)見荷蘭船炮多，眾寡不敵，乘潮漸漸退出浯嶼。全斌等十三號(hào)船在后，迫于潮長(zhǎng)不得出，直繞荷蘭船之后，沖囗〈舟宗〉大而入。荷蘭船發(fā)熕齊擊，無(wú)一中者。馬得功坐鳴駿中軍船，全斌誤以為鳴駿，直前攻之。黃廷中軍將吳朝宰、經(jīng)親軍將蕭乘龍前后夾攻，揮兵過(guò)船。得功親隨鐵甲精兵三百人皆被殺，得功頓足，自投水而死。全斌訊降卒知之，嘆曰：『吾欲擒獐，乃中一虎，豈是賊未合死邪』？再遇楊富船，全斌喝曰：『叛賊！今日是汝死日』！沖入逼之，富投水，遇小艇救之得免。已而守高崎將陳升密款于官軍，漳州軍施瑯、黃梧乘潮落援之，耿繼茂、李率泰亦各濟(jì)師，經(jīng)眾寡不敵，退守銅山。黃廷議欲再守?cái)?shù)日，全斌以為船多損壞，不可；遂棄兩島而去。官軍入，墮其城，收其寶貨婦女而北。梧勸率泰乘勝逼銅山。率泰曰：『窮寇勿追，急之則逸，入臺(tái)灣后難圖矣。乘彼人心未定，招撫以散其黨羽，計(jì)之上也』。乃遣使至銅山，宣布朝廷德意，密通諸將，許生擒鄭經(jīng)者封同安侯，鎮(zhèn)守泉州如海澄公例。惟洪旭笑而卻之。先是，李率泰給示，準(zhǔn)島中百姓過(guò)界。思明州知州黃而輝請(qǐng)準(zhǔn)島民渡海，令下三日，永華復(fù)復(fù)經(jīng)禁之。至是清民入島，遺民尚數(shù)十萬(wàn)，多遭兵刃，男婦系累、童稚成群，若驅(qū)犬羊，連日不絕。而投誠(chéng)兵搜掠財(cái)物，發(fā)掘冢墓，至剖鄭彩之棺而殘其尸；墮城焚屋，斬刈樹木，遂空其地，「嘉禾斷人種」之讖應(yīng)焉（海上見聞錄、小腆紀(jì)年）。

十二月，耿繼茂、李率泰等奏：臣等統(tǒng)率大軍，渡海攻克廈門，賊眾驚潰登舟；水師提督施瑯會(huì)荷蘭國(guó)夾板船邀擊之，斬首千余級(jí)，乘勝取浯嶼、金門二島。鄭錦、周全斌等勢(shì)窮宵遁（東華錄）。

案此次戰(zhàn)事，官軍實(shí)大敗，大將馬得功至投水死，乃掩敗為勝如此；則經(jīng)自棄兩島，而官軍得以為功耳。

耿繼茂等奏：十月二十八日，鄭錦等遣兵五千人突犯云霄；右路總兵官王進(jìn)功率官兵逆擊之，斬殺過(guò)半，余眾盡赴水死（東華錄）。

總督趙廷臣閱界（福州府志）。

三年（永歷十八年、一六六四）正月，管理福建安輯投誠(chéng)事務(wù)戶部郎中賁岱奏：鄭芝豹生母黃氏率子侄眷屬等赴閩投誠(chéng)。

李率泰奏：原任提督馬得功攻取廈門、金門二島，力戰(zhàn)死。得旨：從優(yōu)議恤。

靖南王耿繼茂奏：年雖未邁，疾病相仍，子精忠未諳軍旅，懇賜遣歸，俾臣力疾教之，訓(xùn)以備驅(qū)策；允之。

授福建投誠(chéng)偽伯陳輝為慕仁伯。

二月，耿繼茂等奏：福寧總兵官吳萬(wàn)福招撫偽鎮(zhèn)林國(guó)梁投誠(chéng)，隨遣游擊李應(yīng)先等協(xié)同攻克長(zhǎng)腰、東蚶二島，寇巢破滅，阮春雷、張煌言僅以身免。得旨：從優(yōu)議敘（以上東華錄）。

鄭經(jīng)駐銅山，諸軍乏糧。周全斌欲襲洪旭而并其船，旭亦防之；值海風(fēng)大作，船各飄開，全斌遂率其眾入漳投誠(chéng)。旭以杜輝守南澳，輝亦掠其輜重投誠(chéng)。林順亦自鎮(zhèn)海投誠(chéng)。旭謂經(jīng)曰：『金、廈新破，差官仆仆前來(lái)，非為招撫，實(shí)窺探以散人心；當(dāng)速過(guò)臺(tái)灣，遲則變生肘腋矣』。三月，經(jīng)乃同馮錫范、陳永華等悉眾東徙，命黃廷斷后。工官馮澄世一船為其家丁所迫，自投海中死。旭以二十舟候黃廷同行；廷部兵將多不愿，適黃梧遣陳克竣來(lái)招降，廷遂入漳投誠(chéng)。旭自往東寧。過(guò)澎湖，設(shè)重鎮(zhèn)守之。改東都為東寧，天興、萬(wàn)年二縣為州。分諸將耕屯荒地，造京館以處宗室遺老之相從者。度曲征歌，示無(wú)西意，以與民休息焉。李率泰盡徙諸島遺民于內(nèi)地，開界溝、筑界墻，五里設(shè)炮臺(tái)、煙墩，二十里設(shè)營(yíng)將守之。弁兵得賄，縱出入；或睢眥殺人。失業(yè)流離之狀，不可言矣（海上見聞錄、小腆紀(jì)年、皇朝年表）。

耿繼茂奏：偽將張燦、吳盛等率領(lǐng)兵民渡海投誠(chéng)，群賊分囗〈舟宗〉來(lái)追，意欲乘機(jī)入犯內(nèi)地；總兵官王進(jìn)功統(tǒng)兵馳剿，殲賊眾于陸鰲、破賊巢于下蔡，斬首千余級(jí)，接應(yīng)投誠(chéng)人等入界。