十四日，同沈都司出車城堡南門，由新街路過溪，行至龜潭，有日營兵約百名左右，均右手抱槍站隊。轉行至日營西鄉住屋竹籬前下轎。福島九成至轎前來請，西鄉在院中迎接，入座上茶。琦向書記生吳碩曰：久仰中將大名，今日幸得拜晤。碩轉述。西鄉應曰：咳。碩道謝。沈都司面遞夏、潘兩大人名片，代問中將安好。碩轉述。西鄉諭碩均致意請安。琦將沈、潘兩大人會銜照會面遞。西鄉拆閱。西鄉問：貴府現帶兵若干名？琦曰：五百名；現留一百五十名，余仍由原船回郡。陸路尚有五百名。西鄉問：何日可到？琦對曰：現駐赤山，約十七日以前可到。西鄉諭碩告曰：撤回之兵已五百余名。楓港之兵，約十七、八可以撤歸。俟三、四日，敝國大船到時，將現存兵卒陸續載回。刻下營內空出兵營數十間，貴國兵到，可以居住。琦對曰：兩國兵卒同住一營，恐不方便，仍候貴國兵卒全數撤退，再行酌量派扎。碩轉述。西鄉曰：咳。琦將沈、潘兩大人前發照會五件，開單請換。福島領事已先檢出面交。琦亦將該營兩次照覆面交，西鄉中將接收，轉交福島領事。琦曰：尚有閩浙總督李兩次照會，可并交否？福島領事對曰：我中將亦有照覆之件，我至廈門與道臺互換。琦曰：我奉沈、潘兩大人札文，內指明凡民間交涉字據，請一并檢還。碩對曰：所有生番租地契文，從前俱無。如其買物等件，或有收單，須俟查明送交。琦曰：不是生番，是我瑯〈王喬〉本處人民，當貴營初到此地時，與張光清等租地合同各件。復開一單，遞與西鄉閱看，請其飭交。福島隨即接閱，日：內有數件，系我經承見過，容再查明檢送。琦曰：貴國兵卒骸骨，葬在此地，未免孤寂，何不遷回，省得伊家屬前來掃祭？碩對曰：我國兵卒尸骸，昨已全數起運回國；現在遺骸，系琉球被害人民，手足不全，且是否確系琉球人骨，亦不可考，故不必起回。遂陳酒果糖食四件，西鄉親自酌酒。琦曰：本處土產帶有數包，容再送來。碩轉述。西鄉道謝。沈都司曰：貴中將面目較前癯瘦。琦曰：督兵勞苦，中將是好將材，在我中國亦并不可多得。碩轉述。西鄉諭碩曰：營中無以為敬，請開槍隊以盡禮數。琦遜謝。西鄉諭福島領事傳營官數人來說了幾句言語而去。旋隊伍齊至籬門外，西鄉起立曰：兵卒均喜打仗。琦對曰：彼此兵卒，總是一般見識。西鄉笑應之。請同走營，至龜山前面海埔，坐閱演放洋槍隊完竣。琦曰：手法熟練，步伐整齊，欽佩之至。西鄉遜（謝）。仍同走回營。途次，福島九成曰：我中將大人擬在山頂造一花園。琦曰：惡風濁水，花園無趣；我國將造炮臺，以備轟擊洋面船只。福島轉述。西鄉笑應之。回營入座。茶畢，琦起立，又訂將人民交涉字據檢還。碩曰：現已飭檢，如有，自當送交。我中將大人另日再當會敘。西鄉中將等均送至轎前而回。至龜潭地方，槍隊均雙手捧槍拱立。
十五日下后三點鐘，西鄉令福島九成等來寓曰：今日天氣甚熱，敝營相距三里以外，無處雇夫，中將大人難以步行，另日再行親詣，先遣敝領事等來回拜。琦遜謝。福島曰：張光清合同，先檢出七件奉繳。此項地租合同，原系彭城中平收管，該員現已病故，恐檢不齊全。琦曰：請仍細查。碩曰：續有查出，再行奉繳。福島曰：我明日赴楓港撤兵，請派員前往。所派何員，請即知會。琦曰：楓港系周巡檢管轄地方，即派該員前去。福島曰：甚好。碩曰：西鄉大人請先致意，此間地主雇工人等，懇免查辦。琦曰：兩國用兵，此等奸民，應即正法；現雖無兵事，容稟明欽差察辦。至營中備用土人，事所常有，可以從寬免咎，將來欲至貴國，亦須雇用貴處百姓也。碩曰：彼此一樣。琦曰：龜山頂聞有豎立大日本營字樣，應請毀去。福島曰：不知，容再查。琦曰：此地百姓呈有告示，內有民人歸之清國等語，殊屬不是。本我大清國之民人，并非貴國之民人，何用歸還？請毀去。碩曰：容稟西鄉奉復。陳茶酒點食，時已上燈，借小轎而去。
十月二十三日上諭
軍機大臣密寄，同治十三年十月二十三日奉上諭：沈葆楨等奏，臺灣近日情形，并淮軍到臺一折。日本兵船尚未退去臺灣，刻下退兵章程，業經定議。惟此后海防各事宜，亟宜講求，以期有備無患。現在淮軍三起均抵澎湖，應如何分扎要隘之處，仍著沈葆楨等酌度情形，妥為布置。其南北開路，以及郡城修筑炮臺各事，并著該大臣等悉心經理，毋得以日本事已辦結，稍形松動。莿桐腳莊民已與龜紋社釋嫌尋好，瑯〈王喬〉諸社均受約束，其余亟須次第備查，惟入山愈深，番社愈雜，北路復有生番撲犯碉樓、傷斃兵丁之事，亟應妥為籌辦，俾番眾悉為我用，藉可自固藩籬。著沈葆楨、文煜、李鶴年、王凱泰、潘霨飭令派出各員，設法招徠，隨時撫恤。招墾事宜，仍須商同羅大春認真籌劃。臺郡城工，業已過半；安平炮臺現擬設于三鯤身地方，一切工程，沈葆楨等務當悉心經畫，毋得畏難畏阻。將此由五百里密諭沈葆楨、文煜、李鶴年、王凱泰，并傳諭潘霨知之，欽此。遵旨寄信前來。
委員鄭秉機探報
十六日午刻，到倭人輪船一只。十七日辰刻，又到倭輪船一只。
十六日酉刻，倭輪船一只載去倭兵、夫役人等共五百余名，及軍裝等項。
十八日辰刻，瑯〈王喬〉倭營派船到楓港，悉將該處并莿桐腳所扎之倭兵、夫役、槍炮、軍裝等項，盡數下船，于二十日申刻，由瑯〈王喬〉開去。
二十日未刻，瑯〈王喬〉到倭輪船二號。二十一日卯刻，又到一號。
二十一日午刻，瑯〈王喬〉開倭輪船一號，載去傷兵、夫役人等四百余名，以及糧米、軍裝等項。
二十三日，倭官西鄉從道約會同本府，二十四日己刻交割后灣營房以及一切事宜。
二十三晚，瑯〈王喬〉開去倭輪船一號，內載倭兵、夫役五百余名。
二十四日午刻，周本府與西鄉中將將營房圖冊、字據，一切交割。西鄉即帶同倭兵夫役一千余名，盡數下船，于亥刻開去。安撫軍隨即鎮扎后灣營內。
欽差大臣沈葆楨等奏
為倭兵盡數退出，業將草房營地撤回，恭折馳陳，仰祈圣鑒事。竊臣等于本年十月十四日，業將倭使遵約撤兵，派往交代情形，奏明在案。嗣迭據臺灣府知府周懋琦稟稱：十月十三夜，帶同委員陳謨、都司沈國光等抵瑯〈王喬〉登岸，隨即函知倭將西鄉從道。十四日，該倭將遣其通事吳碩來請到彼營會晤，即交出臣等前發照會五件，該府亦將倭營前發照會兩件還之，且向索倭營與民間交涉字據，倭將允諾，因出酒果相款，排槍隊送歸。十五日未刻，倭官福島九成送來本處民人租地合同七紙，并通知十六日先撤楓港之兵。是日游擊鄭榮所帶安撫軍適至，該府遂派巡檢周有基引鄭榮所部把總沈如生前赴楓港。迨十八日，該處倭兵始掃數登舟。福島九成寄繳楓港租約呈詞十一紙。該府復索民間尚有呈詞字跡。旋據西鄉函復，以該營人員內有數員病故，無從尋檢，以后均為廢紙，兩無異言等語。其遺下營房三十七間，經周有基等接收填扎。二十四日己刻，西鄉從道將龜山老營兵勇五百余人登舟；酉刻，福島九成復將兵役五百余人登舟。一面開單遣人交出草房一百零二間，板片一千二百零五片。當即派巡檢周有基、千總郭占鰲照數點收，復由鄭榮派安撫軍四哨赴該營填扎。西鄉之船，于是夜亥刻開駛而去。其余倭船于二十五日盡行放洋等因。現在交代事竣，該府周懋琦已于二十六日坐揚武輪船回郡。龜山、楓港兩處，留鄭榮駐扎，以資彈壓。至所有瑯〈王喬〉一帶善后事宜，容臣等悉心妥籌，再行請旨定奪。茲先將倭兵盡退及交代營房情形，恭折由輪船到滬，交上海縣付驛六百里馳奏，伏乞皇上圣鑒訓示。再此折系臣葆楨主稿，合并聲明。謹奏。
十一月十三日上諭
軍機大臣密寄，同治十三年十一月十三日奉上諭：沈葆楨等奏，日本遵約退兵，收回草房營地一折。日本兵船盡數退去臺灣，其遺下營房、草房、板片，均經點收完竣，該處已派官軍填扎。惟瑯〈王喬〉一帶善后機宜，亟須悉心籌劃，妥善經營。所有招撫生番及修城開路各事宜，仍當妥籌辦理，毋得以倭兵已退，即形松懈。著沈葆楨、文煜、李鶴年、王凱泰、潘霨凜遵十二月二十八日諭旨，妥為布置，毋稍因循。倭人詭譎性成，此次退兵，原不足恃，沈葆楨等惟當于此時力圖自強之策，以期未雨綢繆，庶幾有備無患。另片奏道員黎兆棠因病回籍等語，該員現經簡放津海關道，即著沈葆楨傳知黎兆棠，病痊后迅速赴任，以重職守。將此由五百里密諭沈葆楨、文煜、李鶴年、王凱泰，并傳諭潘霨知之，欽此。遵旨寄信前來。