監軍兵部主事黃師正進督師史可法遺疏；王曰：『可法名重山河、光爭日月，至今兒童走卒咸知其名。方當擊楫渡江、速圖恢復，乃為強鎮力阻、奸黨橫行，竟賷志以歿也，惜哉！讀遺表，令人憤恨。應得贈恤、祭葬、易名未盡事宜，行在該部即行詳議覆奏！其母、妻猶陷虜城，一子未知存亡；作何尋獲？黃師正多方圖之』！
太仆少卿凌超疏陳『急做、實做，不出「臣謀君斷」四字』；王稱其要言不煩，下部議之。
初六日（癸丑）
王于建寧府登舟，十一日抵延平駐蹕。
鄭芝龍欲挾帝以自重，固請回天興，命軍民數萬遮道號呼擁王，駕不得行；乃駐蹕延平，以府署為行宮。
初，芝龍以海寇受撫，雖晉五等爵，與地方有司不相統屬；閩中士大夫輒呼之為賊，絕不與通。及擁帝即位，芝龍位益高、權益重，全閩兵馬、錢糧皆芝龍兄弟領之：是芝龍以虛名奉帝，而帝以全閩與芝龍也。故芝龍不肯聽帝出關，思常有全閩也。
金堡至行在繳還敕印，帝欲奪情官之。堡辭再三，不允；因引先朝楊嗣昌奪情為黃道周諸人所不容為案。奉旨：『嗣昌小人，何得與爾比例』！鄭芝龍聞之，以為行為大拜也，恨益甚；輔臣曾櫻陰知鄭意，密勸帝欲保全金堡，莫若聽其辭去。
堡七疏辭，同官朱某亦為之請；始允。
唐王誅都督陳謙，以御史錢邦芑劾其外媾也。
陳謙奉魯王使命入關，久駐衢州，持兩端；云魯王已封靖夷侯，欲以此要帝封。帝敕鄭芝龍取其侯印為驗，謙賷印至；帝即召入關。御史錢邦芑劾其久駐衢州，徘徊浙、閩之界，自以舉足左右為輕重；因欲要取侯封：以閩要浙、以浙要閩，祗持媾斗之謀、敢行挾制之術！又歷數在衢奸淫不法諸惡狀。遂下之獄。芝龍疏救，不允；又行賭五千金于邦芑，請免死。邦芑懼，密啟于帝，謂『陳謙為魯王心腹，與鄭至交；不急除，恐為內患』。帝遂決意殺之，即命邦芑監刑；芝龍請以己官贖謙死，帝不聽。謙既死，芝龍哭極哀，厚殮之；為文以祭，有『我雖不殺伯仁，伯仁由我而死』之語。從此，芝龍蓋懷異志。
謙，武進人；出身甚微，作鎮金、衢。甲申秋，賷弘光詔封芝龍為南安伯；比啟讀券，乃誤書「安南」。謙謂芝龍曰：『安南則兼兩廣，南安僅一邑耳；請留券而易詔，更晉伯為侯』。芝龍大喜，厚贈而別；未復命而南京陷。故芝龍德之，力為申救。
有云：邦芑監刑，芝龍過市，命且停刑，極入朝申救；帝密敕速行刑，故與芝龍款語。及芝龍出，而謙首已斬。有云：芝龍謂謙就戮必經其門，臨期救之未晚；帝于夜半內傳片紙，別移謙他所斬之者。按此時帝在建寧，芝龍留守福京；何由入朝見帝、夜半傳紙乎？皆附會之說也。
是時兵羸、餉絀，舉朝如夢如醉，無談及軍事者；惟日媾帝與魯王為仇。士英激斬清源、邦芑疏斬謙，自相殘賊，皆小人為之也。
魯王以田仰為東閣大學士。仰率兵二千從海道至紹興謁王，故有是命。
張國柱者，故劉澤清標將；航海至浙東，依王鳴謙于定海。有弓箭手五百余人，足以制鳴謙；乃劫之內向，掠余姚，其部曲張邦寧掠慈溪。行朝震恐，議者以伯爵縻之；孫嘉績等量署為「勝鹵將軍」，始還定海。
楊展盡取上川南地，屯嘉定，與曹勛等相聲援；而王應熊及王祥在遵義，馬干、曾英在重慶：皆宿重兵。張獻忠勢日蹙，惟保寧、順慶為賊將劉進忠所守，進忠戰又數敗。獻忠怒，遣孫可望、劉文秀、王尚禮、狄三品、王復臣等攻川南郡縣；王應熊、樊一蘅急令楊展、侯天錫、屠龍、馬應試及顧存志、莫宗文、張登貴連營犍為、敘州以御之。賊連戰不利，曾英、王祥乘間趨成都；獻忠立召可望等還。
十五日（壬戌）
魯王既斬閩使，恐閩發兵來討；又以大清兵固守杭州，堅不可破：遂定議抽兵屬張國維西征，以禮部尚書余煌兼兵部尚書督師江上。
唐王擢熊緯為給事中。緯，字文江，南昌人，崇禎十六年進士；授行人。兩京既覆，每飲酒，輒涕泗橫流；友人語之曰：『昔狼曋有言：「吾未獲死所」。子既有志，曷求所乎』？乃赴延平謁王，授官。
敕諭兵部侍郎于華玉曰：『朕痛南京繼覆，止因兵民相恨，致危宗社。今日僅有彈丸資此民生，以期恢復一統；若復傷民，即促國脈。卿宜仰體朕意，實令民安；新兵嘩噪擾民乃未經制者，卿當亟振刷精神（一作陋規），毋徒憂讒畏謗』！
黃道周至江寧，幽別室中。囚服著書，絕粒積十有四日不死；大清攝政王命斬之。臨刑，過東華門，坐不起；曰：『此與高皇帝陵寢近，可死矣』！監刑者從之。幕下士中書賴雍、蔡紹謹、兵部主事趙士超等皆死（道周學冠古今，所至學者云集。銅山在孤島中，有石室；道周自幼坐臥其中，故學者稱為「石齋先生」。精天文、歷數、皇極諸書，所著「易象正」、「三易洞璣」及「太函經學」者，窮年不能通其說；而道周用以推驗治亂。歿后，家人得其小冊，自謂「終于丙戌，年六十二歲」；始信其能知來也）。
大清內院洪承疇與道周同鄉，致書勸降；道周罵曰：『承疇死久矣！松山之敗，先帝痛其死，賜祭九壇、親自哭臨，備極恤典；焉得尚存？此無賴小人冒名耳』！遂被囚系。門生往見者，講習吟詠如常；都人士爭索其書，皆藏之以為寶。承疇欲生之，具疏言『道周清節夙學，負有重望；今罪在不赦。而臣察江南人情，無不憐憫痛惜道周者。伏望皇上赦其重罪，待以不死』！攝政王不允。臨刑過市，見有豎「福建」門牌者；指「福建」二字曰：『我君在焉、我親在焉，死于此可也』！南面再拜，不去；遂被戮于門牌下。士超等四人同死；士超罵承疇不絕口，死尤烈。道周既死，門人陸自嚴收其元首，并身瘞之；橫黃石為記。閱數年，蔡夫人命長子霓載其喪歸，葬于贈公之側；復將士超等四人葬于道周之側。按從死四人：趙士超、蔡春溶、賴繼謹、毛玉潔也。史作賴雍、蔡紹謹而遺毛玉潔。魯王諸將驕橫，諸臣競營高爵，請乞無厭；兵部尚書余煌疏言：『今國勢愈危，朝政愈紛；尺土未復，戰守無資。諸臣請祭，則當思先帝蒸嘗未備；請葬，則當思先帝山陵未營；請封，則當思先帝宗廟未享；請蔭，則當思先帝子孫未保；請謚，則當思先帝光烈未昭』！時以為名言。
唐王將取道于汀，餉部李長倩以汀屬空虛，請留餉三萬以訓練士著，備緩急；王可其議。
左都督楊鼎卿細陳起義情由；詔答之曰：『人君大柄，止在知人善任；人臣大義，惟是勿欺至公。朕久歷艱難，稍識情偽。朝廷壞于朋黨，宗社由此而危。北京之失，東林之罪何辭？南都之陷，魏黨之咎莫謝！其余門戶聲氣，朕自有萬古鑒衡，以御天下；諸臣萬疏千章，豈能奪朕心公斷！靖夷侯方國安力扼江干，大功實在宗社。朕今親征在邇，指日相見；未盡之情，還俟面奏。楊鼎卿父子還當終始調聯，以侍王師之至』！
贛兵復需粵餉，以前十萬兩不足用。李長倩以為言；王云：『留餉已有前旨，該鎮共事一方，著與通融接濟！俟朕至軍前，再行酌處；毋得紛爭』！
松江奏捷，賜督臣荊本徹、鎮臣黃斌卿、張名振各銀二十四萬兩、表里四端，以示激勸；其余將帥，各升級有差。
諭浙江撫按敕曰：『天下之壞，不壞于寇而壞于兵、不壞于兵而壞于官，殊可痛念！浙江無所事事之官，逍遙于家、驛騷于途；漁獵細民的，通著撫按細察撤回，安輯地方』！
楊廷麟聞唐王將赴贛，往朝之；萬元吉代守吉安。先是，崇禎末，命中書舍人張同敞調云南兵；至是抵江西，兩京已相繼失，因退還吉安。廷麟留與共守，用客禮待之。其將趙印選、胡一青頻立功，而元吉約束甚嚴，諸將漸不悅。時有廣東兵，亦以赴援至。而新軍張安復撫州有功，且招他營盡降；元吉以新軍足恃也，蔑視云南、廣東兵：二軍皆解體。然安卒故為賊，居贛恣淫掠；遣援湖西，所過殘破。
同敞持牙牌調發滇兵，兵未集而京師陷；弘光朝復敕陳藎押赴南京。抵江省，南京復陷；因留守吉。
帝召廷麟入直，以元吉代廷麟駐吉安。初，元吉與金聲桓善；聲桓收江右，以書招元吉，元吉辭以各行其志，聲桓弗迕也。至是，元吉主撫聲桓以收復江西，因遣使密誘聲桓來歸。聲桓得書不報，械系其使于庭；夜分，解其縛，飲食勞苦之，問督師起居意甚殷勤。天未明而縱之。蓋是時聲桓已懷異忘而未決也。
工部侍郎葛寅亮疏言『務去飾治繁文，必收近取實局』。王目為老成格言，『朕當言銘座右』。
十九日（丙寅）
毅宗大祥，魯王主事董守諭請朝廷（一作堂）哭臨、三軍縞素一日；王從之。
唐王諭戶部曰：『納貢事例，原非得已。大縣量準四名、中縣三名、小縣二名，不得濫收！事平即止』。
左都御史張肯堂疏薦周崔芝善于用海，有舡五十余號、有兵二千余名；『乞釋罪圖功，置臣標下』！王曰：『前楊耿糾其募賊入港，因發兵捕剿；卿既信其無他，即準隨卿前進。宜限其早到，以便卿乘風吉行。崔芝俟立功，即與掛印』。
逮僉都御史田辟下詔獄。辟，河南人；甲戌進士。弘光時，以戶部榷稅處州。唐王登極，募兵入衛；改署都察院事。疏糾閣臣曾櫻，語連中宮；王含怒未發。繼遣錦衣衛王之臣閱其師，并發月餉。之臣迎合上意，疏糾辟詭兵冒餉；遂下詔獄。然兵籍俱實，餉又未發；班行多為申救，王怒不解。
魯王贈黃端伯太常寺卿，謚「忠節」；賜祭葬，蔭一子入監。
二十二日（己巳）
唐王敕諭楊文驄曰：『大明寶祚啟自太祖，兩遭覆陷。凡為太祖親孫，有能攘臂先立，則太祖神靈有依、大明國祚斯立。朕與魯王，大義正在于先后、名分尤在于叔侄。魯王先立，朕雖叔輩，斷當北面魯王，以存太祖。若復后立，是名為爭；總一立也，先立以存太祖為孝、后立以壞祖宗法為不孝。今朕先監國，登極四十日，在萬古自有至公；豈今日一、二佞舌可以顛倒！楊文驄受知最早，殺蘇撫以明大義、勸魯藩而篤尊親；本末甚明。人言難如其面，朕心自有鑒裁。所進陳函輝啟稿，不堪一笑；鬼蜮滿紙，宜靖夷侯參奏以為「食肉寢皮」之可恨也。朕愛侄王，萬不得已，業允勛鎮所請，以明太祖大法。該督尚宜慎終如始，善保地方、善行宣撫；得覲孝陵，朕必不負元功』。
江督萬元吉、御史王賡疏請再召滇、黔兵馬，以圖恢復；王曰：『東南只此幅員、生民止此膏血，不難于調兵、難于措餉；雖土司官兵忠義勇敢，必先議餉銀出于何處，然后召兵不難也』。
魯王將士與大清兵隔江相拒，屢戰不勝；各營西望心碎。王之仁上疏，言『事起之日，人人有直搗黃龍之志；乃一敗后，遽欲以錢塘為鴻溝。天下事，何可忍言！臣為今日計，惟有前死一尺；愿以所隸沉舡一戰！今日欲死，猶戰而死；他日即死，恐不能戰也』！
唐王贈金聲禮部尚書，謚「文毅」。
聲子敦涵入關，投熊開元；開元為請于王，得易名。
敕于華玉曰：『卿才敵萬夫，豪爽忠敏；受朕深知重倚。其迎駕之兵，必要嚴加約束，令民間草木不驚，方為扈駕時雨之師』。
大學士曾櫻薦同鄉劉逵堪為御史；王曰：『御史為朝廷法官，若不清勤激切，何以明目達聰！從來巡方積弊積玩，朕所親見；這所舉用劉達堪巡粵左，即著允行』。
二十四日（辛未）
大清兵逼吉安，楊廷麟留屯贛州城外；日馳疏，陳援吉防贛事宜。而云、廣諸軍皆內攜，新軍又在湖西；城中軍不戰而潰，吉安遂破。
大清將柯永盛添兵攻吉安，守將胡長蔭違元吉節制，不戰而潰；城遂陷。職方主事郭錕死之，鄒文鼎避永豐、鄒敬走興國。
萬元吉退屯皂口，檄諭贛州，極言云南兵棄城罪；其眾遂西去。
元吉與都憲陳賡、兵曹王其宖議列柵張家渡，且戰且守；諸軍潰奔，不能止。賡先收合滇兵入虔，元吉停兵皂口；曉諭贛州，極言滇兵棄城之罪，不許容駐。滇兵亦徑越贛，趨南康而去。是役也，粵帥童以振陣歿；陳深稱疾先奔，丁魁楚以其倡逃斬之。
金堡辭朝，從延平出汀、贛，趨衡州。
沙定洲分兵攻武定，參將高其勛固守月余；城陷，衣冠望北拜，服毒死。
二十七日（甲戌）
唐王封鄭成功為忠孝伯。
肅鹵伯黃斌卿以閩、浙不和，畏江上勢大，托平夷將軍定西侯張名振題請退駐舟山；斌卿德之，遂締姻婭，重之以盟誓。又以兵力單弱，力持名振攜眷，屬共駐舟山。
按舟山，隔蛟門二百六十里。東離普陀四十里，岱山、羊山屏其北，桃花山、劍山列其南。長一百三十里，闊五十里；戶田七萬畝，涂田四萬畝有奇：竹木、桑麻、桃梅、榛栗取之無盡，固海珍之藪、魚鹽之區也。越王句踐欲置夫差于甬東，即此地。元時為昌國衛；明省入定海，設參將一員以鎮之。崇禎間，斌卿為其地參將。
大清兵逼廣信，胡夢泰傾家募士，自鉛山走郡城，與周定仍等協力拒守。
時夢泰奉使旋里。
姜天衢與王得仁復戰于小箬渡及河口，大敗；退保鉛山。