十二日（丁未），湖廣總督仍辦臺灣軍務將軍常青等奏：『南路賊首莊大田于附近各處糾眾攻擾，官兵接戰屢勝；凡被脅從賊之各莊民人俱請給腰牌歸莊，臣等酌量發給。但賊匪尚在窺伺滋擾，若遽舍南趨北，恐近府賊窩又思竊發，而已經安業各莊不無惶惑；俟添調滿洲、粵東官兵到營，再圖進剿。又游擊邱能成解押軍裝、火藥前赴諸羅，現在鹿仔草被賊攔截，請兵接應；已派將弁帶兵四百前往』。諭軍機大臣等：『今日據常青奏到情形，則又似南路賊匪仍未潰散，尚在窺伺滋擾；而于賊匪乏食一節并未奏及，以掩飾其不即分兵往北之咎，是誠何心！常青、恒瑞同在府城營盤，一人統兵前往北路、一人留營駐守，有何可慮？豈得因賊匪牽制，并不挪移尺寸之地！若云保護村莊，則各處村莊甚多，即數萬之兵亦不足敷零星分撥防守；豈又將增添大兵乎！賊匪圍攻鹿仔草，游擊邱能成請兵接應；常青等既知派兵四百接應，何不親統大兵前往痛加剿殺，廓清路徑？似此弁兵四百，豈能得力！且鹿仔草系僻小村莊，前后皆有賊匪；此四百官兵應需口糧從何接濟？若再有挫失，咎將誰任？常青于此等事，何茫無主見若此！又藍元枚處亦屢有旨令其統兵自北而南直抵諸羅，合兵會剿；乃亦未能前進。看來常青、藍元枚總因持重怯懦，畏葸不前；常青不免蹈黃仕簡覆轍，而藍元枚遷延觀望亦與任承恩相仿。伊二人受恩深重，如非黃仕簡之老病頹廢、任承恩之少不更事者可比；若再事因循，其獲咎將甚于黃仕簡、任承恩矣！現在浙、粵二省駐防綠營及續調漳州兵早已到齊，計此旨到時，節候又屆深秋，暑氣已減、雨水已稀；該將軍惟當乘此兵力厚集，會合進剿。若俟福康安到彼一舉蕆功，伊二人將置身何地耶！至南路被脅從賊之人俱請給腰牌歸莊，該將軍等即應妥為撫慰，設法招集；遵照前旨，或令入伍、或令歸農，俾聞風投出，解散賊黨，方為妥善』。

十五日（庚戌），諭曰：『魏大斌援應諸羅，而邱能成所押糧餉、火藥仍被賊匪梗阻不能前進；看來竟系賊人狡計，將魏大斌放出重圍聽其入城，仍將糧餉截斷，道路梗阻。則柴大紀雖與魏大斌會合，仍不能剿散賊匪；而諸羅添此應援之兵，糧餉又被截斷，更恐軍糧不給。著常青，李侍堯將所運諸羅糧餉、火藥，究竟仍在鹿仔草或系全行運到？及鹿仔草道路曾否打通、不致梗阻之處？迅速馳奏。又據李侍堯奏：「徐鼎士稟稱：令鹿仔港大兵密訂進期，在大肚溪等處聲援；而徐鼎士分兵兩路，一攻大肚、一攻烏日莊，斷賊左右。烏日一破，即以大炮轟擊大里杙，使賊人腹背受敵；又可乘高而下，為搗穴擒渠之要策」。藍元枚前已有旨令其統兵徑赴諸羅，會合常青、柴大紀；今大甲一路既有可乘之機，該參贊又當與徐鼎士速行訂期夾攻，直搗賊巢。用兵之道，原貴相機而動，不必拘泥前旨；著李侍堯、藍元枚傳諭徐鼎士：若能督率兵民乘機進剿，傾其巢穴，則逆匪伙黨聞風解體，更無難迅速掃除撲滅；是平臺之功，徐鼎士實為第一，將來受朕恩眷豈復可量耶！徐鼎士務須倍加努力，速成大功』。

——以上見「大清高宗純皇帝實錄」卷一千二百八十六。

十九日（甲寅），閩浙總督李侍堯覆奏：『恒瑞在軍中，聞其諸事與常青和衷辦理，并無意見不合；惟常青滅賊之心雖切，而軍務素未歷練，是以不能扼要制勝。可否于武臣中如海蘭察者授為參贊大臣，令其前來會同常青督辦軍務？海蘭察久歷戎行，必能協力進剿；而常青處事亦極明白，自當坦懷商度，相與有成』。得旨：『已發往矣。恐常青管不住他，是求益而反損；已命福康安馳驛前往』。

二十日（乙卯），諭曰：『柴大紀處半月以來，總未據續有奏報。因思魏大斌應援之兵既已會合，柴大紀即不能進攻大里杙賊巢，自應令魏大斌分兵出城，將從前經過道路如鹿仔草一帶屯聚賊匪先行剿散，廓清道路；縱使魏大斌不能分身，亦應于將弁中擇其勇干可恃者，令其帶兵出城剿捕。何以魏大斌到彼，柴大紀仍復漫無舉動？豈添此魏大斌兵力徒令幫守縣城，甘心受賊圍困，而不思乘其新到銳氣相機進剿耶！著傳諭柴大紀應設法籌劃，倍加奮勉』。

二十一日（丙辰），諭軍機大臣曰：『魏大斌殺散賊匪、前抵諸羅，而一切軍火糧餉仍不能運送入城，道路梗阻；是不惟柴大紀被圍，而魏大斌又在賊圍之中。常青等接到稟報，即應親統大兵徑赴諸羅，打通道路接應柴大紀，方可得力；乃僅添派蔡攀龍等帶兵一千六百名前往援應。似此零星派撥，無益于事；不又似魏大斌乎！況柴大紀處被圍日久，其勢甚為急迫；常青于此時尚不親往救援，豈擁此重兵徒以株守府城營盤為事耶！為今之計，常青處添調官兵早已齊集，竟應留恒瑞駐守府城營盤，常青統速大兵直抵諸羅。藍元枚若已由大肚溪進兵，與徐鼎士訂期夾擊，固屬甚善；否則，即直赴諸羅會合常青、柴大紀，則得二、三萬大兵全力奮勇剿殺，進搗賊巢擒拏賊首賊目，庶可期迅速集事。至川省屯練降番，前已有旨派調二千人；該處兵丁自勝江西、廣西遠甚，是二千人足抵二萬人之用，尤可資以殺賊。但屯練降番，到彼尚須時日；常青此時不可坐待，惟應就現在添調已到之兵迅速帶往會合進剿，毋得再事因循，致蹈黃仕簡等覆轍，自干重戾。福康安在途，當趲程前往；于抵廈門后，毋庸等候屯練兵到，竟先帶同巴圖魯侍衛等星速前渡臺灣，即統領該處官兵徑赴諸羅會合常青、藍元枚、柴大紀搗穴擒渠，痛加剿殺，以期迅奏膚功』。

二十二日（丁巳），諭軍機大臣等：『昨據常青等奏「派兵接應諸羅」一折，反復思之，常青等辦理此事，實屬毫無定見，一籌莫展。既不能舍南趨北，又不分一人將南路之賊乘勢殲除；豈在臺灣坐守終老即能了事乎！常青何并未計及，止請于江西、廣西添調官兵。試思江西、廣西之兵與浙江之兵相等，豈能得力；而江西兵尤為綠營中之最無用者。若以此等無用之兵付伊等無用之人，徒以虛糜糧餉、輕試賊鋒；而常青又于各處東派西撥，于事更屬無益。從前黃仕簡株守郡城，猶得借口兵少力單，不敷剿捕。今常青原帶之兵已較黃仕簡在彼時為多，又經陸續添調閩省及粵東、浙江綠營駐防兵，共計不下二萬；兵力如此厚集，而復何所借口。常青可不勉圖進取，稍續前愆耶！至福康安已有旨令其趲程行走，一抵廈門，竟當直赴諸羅會合藍元枚、柴大紀等直搗賊巢，擒拏賊首賊目，以期迅速集事。常青究系年老，留于軍營亦屬無益；且軍中有將軍二人，恐事權不一，將弁無所稟承，轉多未便。福康安到后察看情形，如有必須留彼幫辦之處，即令常青于軍營亦可；若留彼無用，即當令其來京陛見。至恒瑞年力精壯，應仍留于軍營聽候調遣。福康安帶有「欽差關防」，即以欽差辦理將軍事務；其常青所帶「福州將軍印信」，仍著交與恒瑞可也』。

二十三日（戊午），諭軍機大臣曰：『常青初到臺灣，尚有振作之風；及不能取勝，又見賊多，竟致一籌莫展。此事惟仗福康安迅速到彼，督率籌辦，以期壁壘一新，及早蕆事；若福康安亦如此恇怯，豈不失朕所望乎！總之，賊伙雖多，不過脅從烏合，易聚易散；止須將其渠魁擒戮，伙匪自必聞風瓦解。彼時相機酌辦，或剿或撫，自無難迅速集事。若如常青零星派撥、分投堵御，徒使師老力疲，毫無寸進，轉與賊人以暇，俾得肆其狡計；惟知奏請添兵，豈賊有二、三十萬，亦將以二、三十萬官兵應之，有是理乎！從前伊犁、金川等處皆系番回部落，其人豈止百萬；大兵所臨，無不摧破克捷，掃穴犁庭，悉就平定。況臺灣本屬內地，林爽文等不過么囗〈麻上骨下〉小丑乘間竊發；以如許兵力而賊首尚日久稽誅，更復成何事體耶！至李侍堯駐札廈門，聞見自必真切；乃并未將常青年老無用、辦理竭蹶情形，據實陳奏。經朕降旨詢問，尚以常青處事明白，可無庸另派更換。試思常青近日所辦之事，尚能望其辦理完結乎？看來李侍堯惟恐奏明常青于剿捕事宜不能得力，必派伊前往臺灣接辦，是以含糊其詞，不肯直奏；此等處，亦不能逃朕洞鑒。其實李侍堯于地方軍糈辦理尚妥，而軍旅素未嫻習，石峰堡覆轍不遠；即往臺灣，與常青無異，朕亦斷不派伊前往也。現在添調之兵計月內早已齊集，常青若能先將南路賊匪悉力殲除、賊目莊大田拏獲，固可稍贖前愆；否則，速統大兵，乘其新到銳氣直趨北路、前抵諸羅，亦尚可補過。若惟知株守郡城，坐視柴大紀被賊圍困，致有疏虞，則是常青罪上加罪，恐不能當此重戾也。又，昨據常青奏：派令蔡攀龍等由海道前往諸羅援應；似由府城至諸羅之陸路已被賊人梗阻。現在發往柴大紀文報，究系于何路行走？而節次發給柴大紀諭旨，總未見覆奏；恐不免有在途遺失之事。若被賊人檢得，賊眾內不乏識字之人，轉可得知官兵虛實，關系緊要。此后所發柴大紀文報，若由臺灣府城赍遞，即交常青專差奮勇弁兵遞送；若由鹿仔港一路赍遞，即交藍元枚專差奮勇弁兵赍遞，毋致稍有遺失遲誤』。

二十四日（己未），欽差協辦大學士陜甘總督辦理將軍事務福康安奏：『臣遵旨在途拆閱常青等奏折，知南、北兩路官兵尚未得手；所稱兵力不足，似屬實在情形。現雖有添調之浙、粵官兵陸續配渡前往，但該兵丁等尚未出征，恐不能十分得力。至柴大紀力捍孤城，坐困已及兩月；常青雖派蔡攀龍等帶兵往援，而兵力無多，亦難實時進剿。若于郡城各營中撥兵援救，而賊人狡計百出，見大兵全集諸羅，又恐乘虛滋擾郡城。臣通盤籌劃，所有前奉諭旨令貴州、湖北、湖南各挑備兵二千并四川屯練降番二千，懇飭各督、撫速撥赴閩，聽候調用』。得旨：『即有旨諭；毋畏難、毋多慮，勉力行之，以全朕用人顏面』。

諭軍機大臣等：『前因常青等辦理剿捕事宜怯懦因循，茫無定見；是以特派福康安前往更換，督辦軍務。今閱奏到之折，看來福康安竟不免為常青所惑，略有畏難之意。現在常青處兵力雖經零星派撥，止存現兵四千名；但添調之浙粵駐防綠營兵五千名、又李侍堯于閩省泉州各營派撥兵三千名早應陸續到彼，加以川省屯練兵二千名昨已據鄂輝帶領星速前往，是添調之兵不為不多。況福康安帶領巴圖魯侍衛等百余人皆屬屢經行陣，趫健可用；以如許兵力而又得奮勇帶兵之人，更何必于此時先為鰓鰓過計乎！況就福康安所慮，如恐大兵往北，賊人乘虛滋擾郡城；試思賊匪等如由諸羅一路攻擾郡城，則賊人來路即福康安、常青等北去之路，正可迎頭截殺，賊人焉能逼近郡城！若慮賊從間道山徑潛出滋擾，我兵豈不可堵其出路。若慮南路之賊攻擾郡城，則常青在彼數月添兵未及到齊，尚能保守無虞；豈福康安與海蘭察等同往，各路增調之兵萬余又已到齊、且有巴圖魯侍衛等百余人，轉慮其乘虛滋擾之理！即使常青于福康安未到之前業已帶兵前赴北路，而郡城營盤尚有恒瑞帶兵駐守，豈不足以捍御；福康安又何所顧慮而先存畏怯之意，甚不滿朕所望矣！福康安身為統帥，軍中俱視其意向；若先有示怯之意，則以下將弁等更必心存懦怯，士氣豈能振奮耶！況即如請添調貴州、湖廣等兵，亦必須兩月之久方能到彼；設諸羅稍有意外之虞，已屬緩不濟急，于現在剿捕援應機宜有何裨益耶！福康安務須堅持定見，胸有成算，相機妥辦；不可稍涉游移。總之，此事全在得其囗〈穴上疑下〉要，決機制勝，以期鼓勇直前。朕廑念軍務，早已通盤籌劃；今不妨為福康安明白宣示，使之安心。若此時常青等剿捕得有轉機，早晚捷音奏至，即前此調備之黔、楚兵竟當停止征調，福康安自應速渡臺灣督兵奮剿。萬一常青等仍前株守，諸羅勢竟不支，甚或至臺灣全郡搖動，則其事必須大辦；且將調用京兵及各省兵，并不止于調派貴州、湖廣之兵而已。彼時自應令福康安駐札廈門，俟大兵齊集再圖進取，必不令福康安止帶屯練兵二千冒昧前進；何必于此時先存疑難畏怯之見乎！福康安接奉此旨，更當安心鎮定，勉圖克捷，毋負朕委任之意。再，現在臺灣剿捕賊匪添兵甚多，將來進攻大里杙賊巢，尤須用炮轟擊，火藥、鉛彈最關緊要；若運送軍營時，或被賊人乘間邀截搶奪，貽誤非細。著常青、李侍堯、藍元枚等務須加派弁兵，小心押運，加意防范；倘稍有疏虞，惟伊等是問』。