清代雍正四年（1726年）以前，由寧夏（今銀川）東北50里，賀蘭山前插漢托輝地方至石嘴子等處，地方遼闊，“其土肥潤，其地尚暖”，易引水灌溉，可墾田萬畝。雍正四年五月，大理寺卿通智和川陜總督岳鐘琪奉旨勘察，于七月動工修建自河西寨至石嘴子堤200余里，開渠一道，招民開墾。這條渠經雍正皇帝賜名“惠農”，意謂惠澤農民。

民國二十九年（1940年），當時的寧夏省政府劃出平羅縣部分地區，增設一縣，因地近惠農渠，定名為惠農縣。顯然，惠農縣之名得自惠農渠。惠農縣縣治始在寶豐，后移至黃渠橋，1959年又移至石嘴山。1960年石嘴山市設立，惠農縣撤銷。1987年又在原石嘴山市郊區恢復惠農縣，縣治馬家灣。此為惠農縣沿革之大略。

2004年，設置惠農區。該區是由原石嘴山區和惠農縣合并組建，其轄地是原惠農縣與石嘴山區之地。兩地在歷史上曾先后同屬惠農縣、石嘴山市轄，區名定為惠農，既可避免市、區同名，亦有其歷史淵源。

綜上所述，惠農縣縣名源于惠農渠名，惠農區名，采用縣名。此乃區名來源之始末。