此時的鐵木真心里非常明白，即將發生的將會是一場勝負難料的惡戰。所以他在出征之前做好了充分的準備，其中最重要的一項就是對乞顏部的軍隊進行整編。

鐵木真此次的整編行動大致包括如下內容：

一是廢除了蒙古人長久以來以氏族和部落為單位作戰的軍事建制，將各成員部落的人員重新整合后，全軍以十人組、百人組、千人組為單位進行重新編隊，委任千戶長、百戶長、十戶長等軍中各級官員。

二是從各千戶和氏族部落中的貴族子弟以及青壯年平民中挑選出智聰體健者，組建成了八十人的宿衛隊、七十人的近衛隊，專門負責保護鐵木真的住所和辦公場所。

三是由合撒兒自行選取勇健之士一千人，戰時做先鋒，平日里服侍鐵木真左右。這一千勇士被稱為“怯薛軍”，實際上就是鐵木真的近衛軍部隊。

四是進一步加強與改組了中央機構，任命了六名親信為扯兒必。“扯兒必”是一個類似于大汗顧問團的職務，扯兒必們常侍鐵木真身邊，在戰爭前線負責處理鐵木真交辦的機密事務。

通過這一次改革，徹底打亂了以血緣關系為基礎的各大小部落和氏族的建制。如果將此前位于鐵木真統治之下的大大小小各個部落和氏族比作是一個個相對獨立的家族企業的話，鐵木真的這一次整編行動的直接結果就是，將這些在此之前擁有較大自主權的“家族企業”全部實現了“國有化”。從此以后，在乞彥部的軍隊中只有鐵木真和他親自委派的官員們說了算數，各個部落和氏族的貴族首領們必須聽從鐵木真和他身邊的官員們的命令。

通過實施這些整編措施，乞顏部實現了比以往更加嚴格的集權統治，乞彥部軍隊的戰斗力也得到了前所未有的提升。