伏允可汗聽說唐軍殺到，慌忙從帳后逃出，跨馬狂奔，所有妻妾子女都丟下不管。契苾何力舞刀直入，還管甚么生命不生命，見一個，殺一個，見一雙，殺一雙，非常勇猛。吐谷渾部眾在黑夜中還以為唐軍有幾十百萬人，慌忙嚇得四處逃命，很快都逃得精光，只剩下伏允的妻妾子女抱在一起，渾身發抖。契苾何力指顧軍兵把他們一一捆住，還繳獲了雜畜二十多萬頭。
李靖聽說先鋒打了勝仗，非常欣慰。這時候，侯君集等人也一路越過星宿川，來到柏海，與李靖會合。這時，吐谷渾派使者來投降。李靖詢問得知，伏允已經自殺，虜兵殺了天柱王，擁立伏允的兒子慕容順為主，上表大唐，愿意投降。李靖立即上奏，太宗下詔，封慕容順為西平郡王，仍然統轄原來的部落，并且命令李大亮駐兵幾千人，暫時留在當地作聲援，李靖等人一律還朝。李靖與侯君集等人上朝復旨，太宗對他們一一慰勞，論功行賞。
沒過多久，西平郡王慕容順由于懦弱無能，被族人殺害。他的兒子諾曷缽還是個孩子，嚇得躲了起來，才得以保住性命。大臣們都在爭權，國內大亂。李大亮打算率兵去鎮壓，但又擔心兵力不足，于是上表請求援助。太宗命令侯君集，引兵前去援助，候君集日夜兼行，到了吐谷渾，與李大亮一同殺進謀亂的吐谷渾部眾帳營之中，很快就把叛亂剿滅了，為首作亂的幾個賊人被正法，諾曷缽這才放心出來做了可汗。諾曷缽感念大唐的恩德，派人到大唐，向太宗稱臣，太宗非常高興，封他為河源郡王。貞觀十三年，諾曷缽親自上朝拜見太宗，太宗喜愛他的恭順，特地把女兒弘化公主賜給他做妻子。諾曷缽非常感激，帶著公主愉快地回國去了。
李靖出征吐谷渾時，唐室忽然遭遇大喪。太上皇李淵一病不起，在垂拱殿中歸天，享年七十一歲。太宗因為守喪的緣故，不方便臨朝，命皇太子李承乾暫時處理朝政。過了五月，太宗把太上皇葬于獻陵，廟號高祖，謚號大武。高祖陵墓的高度想仿照漢長陵，高九丈。秘書監虞世南上疏，建議高三丈，以昭示太宗的節儉美德，但是他的建議一直沒有得到回復，虞世南又上奏，太宗召集群臣商議。房玄齡等人建議折中，按照漢光武帝墓的規格，以六丈修筑。太宗聽取大臣的建議，修建了六丈的皇陵。下葬一年后，太宗才正式上朝處理政事。
誰知，過了半年，長孫皇后又得了重病，而且越來越嚴重。太宗心中很不安，命太子李承乾日夜守在母親身邊。李承乾想上奏，請求大赦天下，為母親祈福，并要請道士進宮做法消災。長孫皇后呵斥道：“死生有命，不是人力可以挽回的。如果修福能夠延長壽命，那我生平并沒有做過惡事，還需要他們做法嗎？況且大赦令關系到國家法典，佛、道都是遠方的異教，都是你父皇所反對的，怎么能因為我而亂了天下的法度呢？你千萬不要胡亂上奏啊！”太子聽了母親的教誨，這才不敢上奏，只是把這件事轉告了房玄齡。房玄齡把這件事告訴了太宗，太宗對皇后的做法贊嘆不止。
后來，群臣請求頒布大赦詔書，太宗有意答應，偏偏被皇后知道了，由于她的堅決反對，太宗這才沒發詔書。剛好碰到房玄齡犯了小罪，太宗讓他回家待著，皇后當時已經病得很重，流著淚跟太宗訣別：“房玄齡在陛下身邊多年，他處事小心謹慎，不愧是忠良之臣，如果沒有大的變故，一定不要疏遠他。臣妾的娘家本沒有什么功勞，只是因為臣妾嫁給陛下，才得到高官厚祿，這樣最容易惹禍，陛下就不要再給我家人委以重任了。臣妾一生沒有做什么貢獻，死后不要厚葬，只要葬在山上就可以了。不要修墳塋，不要用厚棺槨，喪事的器物用瓦木就可以了，一定要節約葬禮的費用，只有這樣臣妾才好過些。希望陛下不要忘記！”說到這里，長孫皇后喘息了好一會兒，又握著太宗的手，說道：“以后陛下處理朝政，一定要親君子，遠小人，接納忠諫，拒絕讒言，節省勞役，減少游獵，臣妾就算是死，也死得放心了。”太宗聽到這里不禁淚流滿面，只是向皇后點頭，卻說不出話來。長孫皇后擔心太宗太過傷心，也不再說話。第二天，長孫皇后病故了，享年只有三十六歲。
長孫皇后性情仁厚，對待其他妃嬪所生的兒子跟自己的兒子一樣好，因此，后宮的嬪妃都特別愛戴她。她經常用謙虛儉樸的道理訓誡自己的兒子。她的大哥長孫無忌本來就和太宗關系很好，太宗因為他立過很多功勞，封他為尚書仆射。皇后知道后，反而不是很高興，私下里讓哥哥辭職。于是，長孫無忌一再請求辭職，太宗沒辦法只好同意，皇后這才高興起來。太子李承乾的乳娘曾請求增加東宮的物資，皇后聽后很生氣，斥責道：“太子所要顧慮的是自己德行和名譽，怎么能請求增加用度呢？”皇后的女兒長樂公主下嫁給了長孫沖，太宗認為公主是皇后親生的，于是打算多給些陪嫁的物品，比長公主多一倍。魏征進諫勸阻，認為這個做法不妥，太宗聽了很不高興。他把這事告訴了皇后，皇后道：“臣妾曾聽說陛下器重魏征，一直不知道什么原因，現在聽了魏征的話，才知道他是在用禮義來引導陛下，這真是社稷之臣啊。”太宗聽了皇后勸解，隨即下令減少嫁妝，并賜給魏征四十匹布帛，四十萬貫銅錢。皇后也派人賜給魏征厚禮，并且傳旨，說道：“聽說您一直很正直，今天才得以證實，希望你一直直言勸諫，不要改變。”從此，魏征更敢大膽上諫了。
有一天，太宗散朝后，對皇后說：“我一定要殺了這個鄉巴佬。”皇后問鄉巴佬是誰？太宗道：“就是魏征。他一天到晚啰啰唆唆，竟然當著文武百官的面讓朕下不來臺，不給朕面子，只有殺了他才解我的心頭之恨啊！”皇后聽完太宗的話就退了出去，很快又穿著朝服，進來跪拜，并祝賀太宗，說道：“臣妾聽說，只有君主圣明大臣才正直，如今朝廷上有正直的大臣魏征，就體現了陛下的圣明啊。”太宗聽了皇后勸解，這才轉怒為喜，還像往常一樣對待魏征。
長孫皇后生平最喜歡看書，曾經收集古代婦女得失之事，整理成《女則》三十卷。皇后去世后，《女則》才由宮司上奏太宗，太宗邊讀邊哭，看完后舉起書對近臣道：“皇后的這本書可以流傳百世。從此以后，朕在后宮中就聽不到勸解了，失去了一個好幫手，實在是可惜啊！”太宗追封皇后為文德皇后，葬在昭陵，太宗親自寫表作序，刻在陵旁。太宗還在宮中修了一座高樓，經常在上面遙望昭陵。一天，太宗引魏征一同登上高樓，他對魏征說：“愛卿看到陵墓了嗎？”魏征看了好久，才說：“臣眼睛昏花，沒有看到。”太宗于是指著陵墓給魏征看，魏征答道：“臣以為陛下望的是獻陵，如果是昭陵那就早見到了。”太宗有所觸動，于是命令把高樓毀了。
皇后生了三個兒子，一個是太子李承乾，一個是魏王李泰，一個是晉王李治，就是后來的高宗皇帝。太宗懷念皇后，因此特別鐘愛他們。魏王李泰禮賢下士，又擅長文學，太宗特別喜歡他，就命令他在府中設置文學館，讓他自己招學士討論學問。諫臣們感覺這樣做不好，于是，太宗又命令王珪去當他的老師，并且對李泰道：“你對待王珪就像對待朕一樣。”李泰聽太宗的話，每次見到王珪就先下拜，王珪也很有師道尊嚴，沒有因為李泰是皇子而唯唯諾諾，一直非常自信。師徒二人一個真教，一個真學，兩人相處地非常融洽。
太宗又下令自己的兒子吳王李恪、齊王李祐、蜀王李愔、蔣王李惲、越王李貞、紀王李慎等人，分別擔任各州的都督或刺史。李恪是安州都督，他多次外出游獵，侵擾居民，侍御史柳范上書彈劾，于是，李恪被太宗免了官。后來，諫議大夫褚遂良上奏，稱：“皇子們還太小，缺乏從政經驗，不應該讓他們這么早就掌管州事。應該讓他們留在京師，等教養成熟了，再把他們派往各州府治理百姓。”太宗雖然覺得很有道理，但也只是召回了一兩個人而已。
貞觀十一年七月，連降大雨，洛河水溢出，流入洛陽宮，毀壞了很多居民的住宅，還淹死了六千多人。于是，太宗下詔將毀壞的宮室稍加修繕，并撤了明德宮內的玄圃院，把院中的材料賜給受災的百姓。太宗命令文武百官上書指出朝政的過失，大臣們奉旨紛紛上疏，指出利弊。其中以魏征的《十思疏》最為經典，大致說道：
人君善始者實繁，克終者蓋寡，豈取之易守之難乎？蓋在殷憂，必竭誠以待下，既得志，則縱情以傲物。竭誠則胡越為一體，傲物則骨肉為行路。雖董之以嚴刑，振之以威怒，終茍免而不懷仁，貌恭而不心服。怨不在大，所畏惟人。載舟覆舟，所宜審慎。誠能見可欲，則思知足以自戒；將有作，則思知止以安人；念高危，則思謙沖而自牧；懼滿盈，則思江海下百川；樂盤游，則思三驅以為度，憂懈怠，則思慎始而敬終；慮壅蔽，則思虛心以納下，懼讒邪，則思正身以黜惡；恩所加，則思無因喜以謬賞；罰所及，則思無以怒而濫刑。總此十思，宏茲九得，簡能而任之，擇善而從之，則文武并用，可垂拱而治矣。
第二年又遭遇大旱，魏征再上《十漸疏》：
臣奉侍幃幄十余年，陛下許臣以仁義之道，守而不失，儉約樸素，終始弗渝，德音在耳，不敢忘也。頃年以來，浸不克終，謹用條陳，聊裨萬一。陛下在貞觀初，清潔寡欲，化被荒外，今萬里遣使，市索駿馬，并訪怪珍，昔漢文帝卻千里馬，晉武帝焚雉頭裘，陛下居常論議，遠希堯舜，今所為反欲處漢文晉武下乎？此不克終一漸也。陛下在貞觀初，護民之勞，煦之如子，不輕營為，頃既奢肆，思用人力，乃曰百姓無事則易驕，勞役則易使，自古未有百姓逸樂而致傾敗者，何有逆畏其驕而為勞役哉？此不克終二漸也。陛下在貞觀初，役已以利物，出來縱欲以勞人，雖憂人之言，不絕于口，而樂人之事，實切于心，四語最中太宗病源。此不克終三漸也。陛下在貞觀初，親君子，斥小人，比來輕褻小人，禮重君子，重君子也，恭而遠之，輕小人也，狎而近之，近之莫見其非，遠之莫見其是。莫見其是，則不待間而疏，莫見其非，則有時而昵，昵小人，疏君子，而欲致治，非所聞也。此不克終四漸也。陛下在貞觀初，不作無益，而令難得之貨，雜然并進，玩好之作，無時而息。上奢靡而望下樸素，力役廣而冀農業興，不可得已，此不克終五漸也。陛下在貞觀初，求士若渴，賢者所舉，即信而任之，取其所長，常恐不及，比來由心好惡，以眾賢舉而用，以一人毀而棄，雖積年任而信，或一朝疑而斥。夫行有素履，事有成跡，一人之毀，未必可信，積年之行，不應頓虧，陛下不察其原以為臧否，使讒佞得行，守道疏間，此不克終六漸也。陛下在貞觀初，高居深拱，無田獵畢弋之好，數年之后，志不克固，鷹犬之貢，遠及四夷，晨出夕返，馳騁為樂，變起不測，其及救乎？此不克終七漸也。陛下在貞觀初，遇下有禮，群情上達，今外官奏事，顏色不結，間因所短，詰其細故，雖有忠款而不得伸，此不克終八漸也。陛下在貞觀初，孜孜治道，常若不足，比恃功業之大，負圣智之明，長傲縱欲，無事興兵，問罪遠裔，親狎者阿旨不肯諫，疏遠者畏威不敢言，積而不已，所損非細，此不克終九漸也。陛下在貞觀初，頻年霜旱，畿內戶口，并就關外，攜老扶幼，來往數年。卒無一戶亡去，此由陛下矜育撫寧，故死不攜貳也。比者疲于徭役，關中之人，勞敝尤甚，市物襁屬于廛，遞子背望于道，脫有一谷不收，百姓之心，恐不能如前日之帖泰，此不克終十漸也。夫禍福無門，惟人所召，人無釁焉，妖不妄作。今旱熯之災，遠被鄰國，兇丑之孽，起于轂下，此上天示戒，乃陛下恐懼憂勤之日也。千載體期，時難再得，明主可為而不為，臣所以郁結長嘆者也。
在《十漸疏》里，魏征直言不諱地指出了太宗內政外交上的種種過失，言辭非常懇切。太宗接受了這兩份奏疏中的建議，并特別嘉獎了魏征。
魏征雖然為人正直，也很忠心，但是他疏忽了太宗的一個大毛病。是什么大毛病呢？就是太宗很好色。太宗看到好看的女子，往往不肯放過，所以將弟媳婦楊氏和隋后蕭氏都納入后宮了。此外，后宮的妃嬪非常多，數都數不清。史書上記載著一個徐賢妃，說她五個月就會說話，四歲就能通讀《論語》、《詩經》，八歲能作文，到了十多歲后，秀外慧中，才名卓著，于是太宗把她召為才人，又升任賢妃，始終寵眷不衰。還有吳王李恪的母親，她本是隋煬帝的女兒，隋亡后輾轉入宮，也得恩寵。齊王李祐的母親陰妃、蔣王李惲的母親王妃、越王李貞的母親燕妃、紀王李慎的母親韋妃，都是太宗的佳眷。但是太宗還是不滿足，還想選一些美人作為后半世的娛樂。老天也似乎恨他好色，于是生出一個絕世美人來攪亂唐宮，闖出一場大禍，釀成千古未有的駭聞。這人是誰呢？她就是人人知曉的武則天。
武則天是并州文水人，她的父親名叫武士彟，是高祖李淵的故交。高祖留守太原的時候，武士彟就是行軍司鎧參軍，后來高祖稱帝，封武士彟為光祿大夫，兼義原郡公，后來又升任工部尚書，加封應國公，歷任利州、荊州都督。
武士彟的元配妻子是相里氏，生下兩個兒子，大兒子叫武元慶，二兒子名叫武元爽。后來，武士彟又娶了楊氏，生下三個女兒，大女兒嫁給賀蘭氏，青年守寡，二女兒就是武則天。則天并不是她的名字，武氏篡奪大唐，改年號為周之后，自稱為則天皇帝，她的乳名已經失傳。史書上說她叫作武曌，相傳古時候沒有曌字，是由武氏杜撰出來的，以日月懸空自比，于是取名為曌。
武氏長到十四歲的時候，已經艷名遠揚，并傳到宮廷。太宗正在留意物色，聽說有這樣的美人，于是派人去征召。他的母親楊氏突然接到詔書，不禁非常傷心，淚流滿面，武氏卻談笑自若，并且勸母親道：“女兒是去見天子的，是件好事啊，母親怎么哭了呢？”母親聽了她的勸慰，這才擦干眼淚，送她上路。到了京師，入宮拜見太宗，武氏一點兒也不慌張，談吐非常得體。太宗命她起來，仔細打量，真是面如芙蓉，豆蔻年華，體態婀娜，風情萬種。太宗當下讓她進宮，等到黃昏時候，便召她侍寢。武氏雖然年紀不大，但是很解風情，太宗喜歡她，賜給她一個芳名，叫作媚娘。一夜風流后，太宗第二天睡到很晚，他輕輕地叫了媚娘幾聲，武氏睜開惺忪的睡眼，連忙要起床謝恩，誰知太宗已經走了。上朝后，太宗立即下詔，冊封武媚娘為才人，武媚娘當然謝恩。太宗讓她住在福綏宮，并把那些年老的宮娥才女全都放出，連從前高祖所寵的尹、張二妃也讓她們出宮回家了，就是最近新寵的蕭后，也不再召幸，一心一意地愛戀這武媚娘了。