陳垣的考據學，主要在校勘學，年代學和避諱學幾門輔助學科上。

先談校勘學。他既先后獲得沈家本刻的和方功惠舊藏抄本的《元典章》，認為《元典章》是考究元代政教、風俗、語言、文字的很好的一部參考資料。他細細地作了一次整理校勘工作。除方沈兩本外，他繼續買到和借到其他藏本三種，主要是借到故宮藏的元刻本。他先用元刻本對校沈刻本，再以其他諸本互校，得出沈刻本“偽誤、衍脫、顛倒”之處共一萬二千多條，寫成《...