光緒戊戌春，公度以病解湖南按察使任。三月，以三品京堂候補充出使日本大臣。由帝特簡，三詔敦促，有“無論行抵何處，著張之洞、陳寶箴傳令，瓚程迅速來京”之諭。然公度以久病，未能遽就道。到上海，病益亟，乃乞歸。奉旨俞允。八月政變作，或奏康、梁尚匿公度處，蓋因其藏匿日本使館而誤傳也。有旨命兩江總督查看，上海道蔡和甫張大其事，派兵二百名圍守，捧槍鵠立，若臨大敵。然公度所居，本上海道公所，且當時康已在香港矣。公度《己亥雜詩》所云“案頭英蕩門前戟，豈有覆庾冰”者，即指此。使事極工切。時寓滬西人，不知為所犯何事，懼公度蹈不測，有日夜逾垣，效黃衫客之所為者，卒被逐退。（全丈松岑為余言。）時袁昶方在總理衙門行走，為密言于樞部，力為剖白，且謂萬不可再事鈞求，致成黨禍。會外人亦以為請，遂得旨放歸。緹騎繞公度室者凡兩日云。