冬十月初七日（辛酉），諭軍機大臣等：『據崔應階等奏到：臺灣竊賊黃教糾眾豎旗，拒捕滋事；隨經官兵追拏，賊眾四散逃竄，首匪尚未弋獲等語。奸徒糾眾不法，情罪可惡；一經拏獲，本應立即刑誅。況臺灣遠隔重洋，更非內地可比；尤不當羈禁延緩，致有疏虞。至鄂寧所稱令解赴廈門質審，未免拘泥成例。此等匪惡渡海，管解防范稍有未周，或恐疏脫滋事；著派余文儀前往臺灣，將就獲各犯隨時審明，即在該處正法示眾。惟首犯黃教于獲到后，多派妥干員弁，沿途小心押解；交鄂寧嚴行審訊，照例凌遲處死。至現據奏到情節，不但黃教未經弋獲，余黨之竄者尚多。著傳諭鄂寧等即速嚴飭該處文武官弁，于番界海口加緊防守，無使兔脫遠揚；務將各犯盡數就擒，無使一人漏網。又所稱臺灣內山系生番地面，賊匪不能竄入；揆度事理，亦未甚嘗。此等亡命匪惡，避罪偷生，鋌而走險，急何暇擇；設或冒死逃往，潛匿山箐，亦未可知。即當設法曉諭生番，令其擒獻；或酌量懸賞，以勵番眾。總期盡絕根株，毋使稍留余孽。現在崔應階巡查浙江兼署撫篆，不必回閩；此案即著鄂寧就近辦理，仍將曾否弋獲首伙幾犯之處，速行據實具奏。并將此傳諭崔應階、吳必達知之』。

十二日（丙寅），軍機大臣等議奏：『據閩浙總督崔應階議覆大學士陳宏謀條奏巡查海口船只各事宜：一、閩、浙二省沿海商漁船，成造時報地方官給執照；請仿江省定限，一年一換。應行查報出入口岸，大口五日、小口十日；由汛員匯送地方官注冊備考。一、向例：船只閩省用黑篷、白字，浙省用白篷、黑字。但不得專恃篷色為別，應仍令該管州、縣及各口汛弁隨時查察。一、商船成造后租別人管駕，令先報地方官，再赴汛口取具互結。倘在洋滋事為匪，船主、租戶問罪；租戶遠揚，船主是問。一、閩、浙海洋口岸甚多，倘守備等官不敷差遣，應擇船只出入較多處所委守備以上一員按月輪替，其余小口仍委千、把防守；責成該處鎮、道稽查』。從之。

——以上見「大清高宗純皇帝實錄」卷八百二十。

十一月初八日（壬辰），諭：『昨據崔應階、鄂寧奏：臺灣岡山地方有匪犯黃教糾伙拒捕之事，并聲明該犯從前因行竊擬徒，援赦安插等語。因令刑部檢查原案，則黃教因伙竊牛只，聞捕潛逃，及馬快朱進等往拏，輒敢執刀拒捕，架格傷人；情罪實為兇惡。當日審轉各員，僅照尋常拒捕例，擬以杖徒；刑部亦不復加駁改：均屬非是！此等咨行案件，偶一查詢，即有不能允協之處。可見外省辦理審案，全不認真；而刑部之復核咨文，亦不過依樣葫蘆，漫無可否。若以事隔多年置之不究，則內外問刑衙門將復何所警畏乎！著將審擬此案之縣、府、道、司、據詳咨結之該撫及原辦之刑部堂司各官，俱著交部查明議處』。

——見「大清高宗純皇帝實錄」卷八百二十二。

十七日（辛丑），諭軍機大臣等：『鄂寧奏「臺灣賊匪黃教聚眾」一案，地方遇有逆匪糾眾不法之案，文武大員果能辦理得宜，立時擒治，自斷不致蔓延猖獗。今據稱賊匪等于十月十七等日尚有在北路一帶焚燒營房、拒傷官兵之事，則前此所報賊已四散竄匿及匪伙止有百余之說俱非確情。此實系地方官意在化大為小，稟報多有粉飾；外省積習如此，實可痛恨！至王巍雖在臺灣，于統兵調度之事未必能悉合機宜；且其人原本平常，殊不足恃。今吳必達現已帶兵前往，人尚歷練能事；自可克期剿捕，早絕根株。至擒獲各犯，前已諭余文儀迅往臺灣隨時審明，即于該處正法；諒已遵旨辦理。惟是漳、泉諸郡地近海濱，人情亦多獷悍；尤宜示以鎮靜，毋致稍涉驚疑，最為要務。其王巍辦理不善情形，昨已諭吳必達前往確查覆奏。所有臺郡文武員弁稟報不實之處，俟事竣后查明參處數人，以示警戒。目今情形，隨便速奏。將此傳諭鄂寧知之』。

二十一日（乙巳），諭軍機大臣等：『臺灣賊匪聚眾不法一案，前據該督、撫等奏到各情形，王巍等辦理不善之處，大略可見；節經諭令吳必達妥協經理。今日崔應階奏「據鎮、道等稟報情節」一折，是此事初發時，該鎮、道尚意在彌縫，則平日之姑息養奸，不問可知；而通核種種緣由，措置尤為失當。如原報十月初二日一聞黃教糾眾豎旗，即統率官兵剿捕；今折內稱初三日在城盤獲賊犯劉恭等二名，又續獲洪答等二十余名。鎮、府既領兵前往，則城內獲犯者何人？城內既獲如許賊犯，可見匪徒結聚已久，不止岡山一處。且稱黃教等豎旗聚眾，原想搶奪村莊，并無謀為不軌之意；此語更為大謬！試問賊眾搶奪村莊，非不軌而何？即此足見伊等欲化大為小、化有為無矣。又前折內稱王巍于初三日帶兵前赴岡山，知府鄒應元隨往協辦，該道張珽留郡彈壓防護；是鎮、道并不在一處。今折內何以稱連據鎮、道具稟！伊等既行守相隔，何以會合稟報？或王巍往岡山后，旋即回至臺灣，并未親身督剿耶？再折內有「第八名正犯方髓、第九名正犯韓筆」之語；賊匪并未有散札、傳帖等事，何由知其次序？殊不可解！此語得之何人？又稱「賊首雖未就擒，而賊眾驚惶；他處賊匪，難以會合」。此語益為荒誕！昨據鄂寧等奏，賊匪蔓延北路，有焚燒、拒捕之事；可見其并未解散。今驚惶瓦解之語，得自何來？前后矛盾殊甚！至稱挑選年力精壯、熟識山徑之人改裝進山，探聽賊蹤等語；更非情理所有。帶兵原為剿賊，況兵丁皆臺灣土著，何至不識路徑，另待挑人！若云竄入生番，兵即不能追捕；尤覺可怪！臺地與生番壤接，平時尚當懾以聲威；至賊匪竄入其境，何難一面諭令擒獻、一面統兵直入，曉以「剿緝內地逸匪，并不滋擾番地」，方為正理。乃因番境相隔，即生退阻；設使生番稍有不靖，竟將置之不辦乎？又王巍初二日差人赍奏雨水情形一折，今日亦已遞到。計其拜折日期，即系黃教事發之時；該鎮何難具折由驛速奏，可以早為指示！且總兵等準其奏事，原為地方要務起見；而緊要事件，并許驛函飛遞。今賊匪滋事之案，地方公務孰有要于此者？并非前此吳士勝馳折謝恩可比。王巍又何拘泥若此，竟不飛章渡海告之撫臣速赴郵傳耶？看來該鎮、道專欲消弭隱諱，故從未奏聞；而節次稟揭，措詞亦多粉飾。殊不知盜賊竊發，原不能保其必無，如漳浦縣逆犯盧茂等一案，文武各官上緊辦理妥貼，朕即加恩獎敘其出力員弁，并予升賞；王巍等豈無見聞！若黃教之事一有端倪，即迅速掩捕，何至賊眾逸出生事！乃不此之務，妄思以詭詞塞責，其取戾更甚；又何如先事之據實直陳耶！王巍等俟此案辦結后，再降諭旨。吳必達現已領兵赴臺，一切剿賊、緝犯，自能合宜。所有已獲各犯，并著交吳必達會同余文儀迅速嚴審，仍遵前旨即行在彼正法；如鎮、道及在事員弁有乖方貽誤應行究訊者，即一面令其解任、一面奏聞，亦無不可。仍即將日來查辦情形，星速具奏。并將此傳諭崔應階、鄂寧等知之』。

二十六日（庚戌），諭軍機大臣等：『據鄂寧等奏到「現在辦理逆匪黃教情形并吳必達帶領官兵船只前往剿捕」一折，所辦甚好。奸徒糾眾拒捕不法，實為罪大惡極；應即嚴行搜捕，務凈根株，以彰顯戮。至該鎮王巍本系駐札臺灣之員，自匪徒竊發以來，雖即督兵往剿，但首伙各犯尚多未獲，且自初八日具報以后，相隔兩旬未據將曾否獲犯續報撫、提諸臣。該鎮前后作何籌辦？是否妥協？吳必達到彼，自可得其實在情形；著即悉心查奏。其匪案起事緣由，應即確切根究，悉力擒拏，毋使一名漏網；獲犯之日，即于臺地正法宣示，俾眾人共知儆惕。又前據鄂寧等奏報：臺灣道張珽留駐郡城、知府鄒應元趕往參酌辦理；其事殊不可解！道員官階在知府之上，且兼轄兵備；辦賊乃其專責，自應隨營調度。知府身任地方，留郡彈壓，應為合宜。何以行守倒置若此！著傳諭鄂寧，即行查明據實具奏。將此一并諭吳必達知之』。

二十九日（癸丑），諭：『前據崔應階、鄂寧等節次奏報「臺灣匪犯黃教糾眾不法」一案，朕核其情節，即料及必系王巍在彼辦理不善與該道、府因循貽誤所致，業已諭令吳必達查辦。今閱王巍奏折，則該鎮于九月初一日抵臺灣地方，已知有積匪黃教糾伙滋擾之事；自應即行督兵親往上緊查拏，務期盡獲奸匪，以靖海疆。乃僅委守備一員、把總一員會同文員入山搜緝，致奸徒無所畏忌，釀成事端。至十月初二日，聞賊匪在山頂豎旗，糾集百有余人，始帶兵往剿；而所獲各犯，又屬寥寥。計其時距該鎮初聞此事，已及一月；是王巍等玩視賊情、稽延誤事，果不出朕所料。此次折內尚稱該處山嶺重迭，路徑崎嶇；是其怯懦觀望情形，更覺自難掩覆。看來此番賊匪蔓延，總由該鎮及道、府等始而意在彌縫，希圖了事；繼復由王巍心存畏意，不能奮往督剿，以致賊益鴟張。王巍實罪無可逭；著傳諭吳必達就近查明，據實嚴參。并將此諭崔應階、鄂寧知之』。

——以上見「大清高宗純皇帝實錄」卷八百二十三。

十二月乙卯朔，諭：『賊匪黃教糾眾不法一案，該鎮王巍于九月初一日抵臺灣，即據地方官報知其事；自應刻即親往剿捕，盡獲匪黨，以凈根株。乃僅派守備、把總入山搜拏，遷延一月，致賊匪得以肆行無忌；直至十月初二日，聞匪眾豎旗之事，始帶兵親往。昨閱伊奏折，其觀望畏葸情形畢露；即此一節，已難勝總兵大員之任！王巍著革職；俟督、提等查參到日，再降諭旨』。

調福建漳州鎮總兵葉相德為臺灣鎮總兵。……以福建澎湖水師副將許德為黃巖鎮總兵。

初四日（戊午），諭軍機大臣等：『崔應階奏「盤獲汀州傅元禧帶有旗信逆詞，隨即拏獲逆犯十一名」一折，總兵眉綬及府、縣各官辦理此事，尚屬妥協。此等奸匪敢于結盟散札，情甚可惡！務須上緊查拏，毋任一人漏網；從重處治，庶足以示懲儆。閩省現有臺灣匪犯尚未辦結，今復有此案即須查審，崔應階應速回閩省辦理。前已令永德回浙，如此時已到浙江，崔應階即將巡撫印務交代起程；若尚未回任，即將撫篆交劉純煒暫行護理。崔應階迅速前往汀州，就近查辦。其應拏廣東逆犯，已諭令李侍堯一體嚴拏；如有續經究出應拏之犯，該督可即飛咨粵省嚴緝務獲。至汀州府知府宋豐綏及該處文武各員內所有實力妥辦之人，著崔應階查明，據實具奏；有應送部引見者，亦并列名奏聞。再，閱該犯等逆詞，內多隱語，且開有藥方；其蹤跡甚為詭秘。或于此中究出造意割辮首犯，亦未可知。崔應階查審時，著一并留心根究』。

初六日（庚申），諭軍機大臣等：『據吳必達奏「督剿賊匪黃教」一折，內有「賊眾東突西擾，官兵疲于奔走，未易克期竣事」等語；所奏未免心存畏難。吳必達平日尚屬能事，昨一聞逆匪蔓延之信，即帶兵渡海督辦，頗覺勇往；何以甫至臺灣，輒爾張皇顧慮！此等么囗〈麻上骨下〉鼠竊，原屬不成事體；縱使避匿山洞，官兵奮力合剿，何難克期就獲！前據鄂寧等奏稱分調水師前往，合之臺灣本地之兵，已不為少。今該提督稱現兵不敷派撥，已飛咨督、撫添調；鄂寧現在廈門，自即派兵接應。吳必達應即上緊督兵，設法搜剿；迅速擒獲，以靖海疆。不得復以兵少為詞，致奸宄久稽顯戮。至此案初起時，不過匪徒偶聚深山，潛行滋擾，本非難辦之事。地方文武若即督率掩捕，原可立就撲滅；皆由總兵王巍畏葸觀望，遷延一月，致賊匪鴟張不法，實為貽誤！已降旨將伊革職。至伊統兵以來，尚容賊眾肆行竄突、焚掠拒捕，則其漫無調度更可想見矣；吳必達何以不即參奏？著再傳諭吳必達遵照前旨，將王巍懦怯乖方之處，據實嚴參究治；仍將現在剿賊情形，迅由六百里具奏。并諭崔應階、鄂寧知之』。

又諭：『據錢琦奏「現赴建寧查辦傅元禧等逆案」一折，該犯等于造作逆詞、結盟糾眾，情罪甚為可惡！自當徹底嚴究，務將首伙各犯迅即擒獲，重加懲治；不得因其茹供不吐，致令狡卸，稍有輕縱！錢琦聞信，即行親赴查辦，固屬分所應為；但省會重地，不可無大員彈壓。昨據崔應階奏至，已諭令迅回閩省督辦；崔應階一到甌寧，錢琦即應先回省城。俟傅元禧等一案辦畢之后，崔應階即赴廈門籌辦臺灣一切事宜，鄂寧即可回省辦理地方事務。可將此傳諭崔應階、鄂寧并錢琦知之』。

十四日（戊辰），諭：『據鄂寧奏：「臺灣道張珽于辦理逆匪黃教一案，平日既不能率屬稽查奸宄，及賊匪蔓延，又復安坐郡城，并不親往督捕；且一味存心諱飾，捏混欺朦。請旨革職」等語。張珽著革職；仍留臺灣，令其自備資斧協拏逆匪，俟事竣之日另行降旨。所有臺灣道員缺緊要，必須熟諳強干之員，方足以資整飭；孫孝愉著以按察使銜，管理臺灣道事務。其四川按察使員缺，著劉益補授』。

——以上見「大清高宗純皇帝實錄」卷八百二十四。

十六日（庚午），諭軍機大臣等：『昨因臺灣道員缺緊要，必須明干之員方克勝任；已降旨令孫孝愉以按察使銜管理臺灣道事。今該督以蔣允焄熟悉該處情形，奏請調補；朕觀孫孝愉尚屬明白勇往，于現在整飭諸務似屬相宜。著該督再行酌量，如臺灣地方必須蔣允焄辦理，即據實奏聞，將蔣允焄調補臺灣道；孫孝愉即以升銜管理汀漳道事，亦無不可。將此傳諭知之』。