長久以來，這些世家和中央政權關系密切。自清朝成立后，雖有一部分人選擇當遺民終老。但其子孫仍走上科舉一途，甚至在朝廷中結黨的風氣依舊存在，所不同者是設法攀附滿洲權貴，鞏固自身勢力。然而，諸大臣結黨營私卻阻礙皇權發展，兩者間必產生沖突。因此本節主要從康熙建儲問題，討論世家所結合的勢力，及其失勢后的各種遭遇。
陳氏自之遴降清后，其族人任官三品以上多達十一人。政務事功方面表現未必突出，而分樹黨援的作風并不亞于明代的陳與郊。首先是陳之遴和陳名夏植黨被放逐遼東。其后，陳元龍攀附明珠，卷入王位繼承問題。
陳元龍，康熙二十四年（1685）進士，次年由內閣大學士明珠等人推薦充起居注官。明珠一向是“輕財好施以招來新進”，與索額圖互植黨傾軋。索額圖是胤秖生母孝誠皇后的叔父。胤秖出生的第二年被立為皇太子，索額圖成了皇太子周圍政治勢力之首魁，勢傾朝野。明珠則是貴妃納拉氏之兄，貴妃生皇長子胤。明珠三子揆方又娶康熙九子胤禟之女覺羅氏為妻。而明珠本身助康熙平定三藩之亂，權勢威赫一時。康熙二十七年（1688）皇帝為維護太子地位，罷斥明珠。利用郭琇彈劾案，改授明珠為內大臣，漢人官員高士奇、王鴻緒、陳元龍等皆休致回籍，結束兩派的爭執。表面上，明珠不復柄用，然權勢猶在，與索額圖沖突未歇。十年后，康熙帝大封諸皇子。由是諸王各自開府，攫奪權利，竟有招權植黨謀陷東宮之事。四十一年（1702）十月，康熙南巡，次德州，皇太子得病，皇帝召回索額圖來此侍疾，他自己卻與詞臣談論書法。據該月五日起居注所載：
東宮違和，駐蹕行宮。巳時命侍讀學士陳元龍、侍講學士揆敘、侍讀宋大業、諭德查升、編修汪士鋐、陳壯屢、庶吉士勵廷儀入行宮賜食畢，內監引至御前……上召近御采前令書綾一幅。又令宋大業、查升各書綾一幅。
十七日又召陳元龍等人入行宮，賜御書數幅。十九日，再度召上述官員入宮，令觀御書。康熙帝三次召集明珠之子揆敘及其黨羽陳元龍等人，意味著明珠勢力復蘇，因此索額圖于四十二年（1703）下刑部論死，四十七年（1708），皇太子以狂疾廢。皇帝也表明無欲立胤為皇太子，認為他秉性躁急愚頑，不能當太子。于是，原來支持胤的滿漢官員轉而擁護胤禩。
康熙四十七年（1708）皇帝命眾王大臣保立東宮，王鴻緒后至，公然于掌書“八”字以示眾，當時阿靈阿、鄂倫岱、揆敘遂共保廉親王為儲位?；实巯略t切責，并宣稱胤禩不適合當儲君諸理由，命王鴻緒以原品休致。又派李煦暗中查看其行跡。康熙四十八年（1709），據李煦密奏：“臣聞原任戶部尚書王鴻緒，今歲解職回家之后，每必差家人進京，至伊兄都察院王九齡處，探聽宮禁之事?！贝文曛乖?，李煦再奏：“臣打聽得王鴻緒每云：‘我京中時常有密信來，東宮目下雖然復位，圣心猶未定?！睂▋λl的朋黨問題，康熙并沒有興大獄來打擊滿漢官員，一切適可而止。
最早受到建儲問題牽連的官員是王士禎?？滴跛氖辏?704）王士禎官刑部尚書因王五案“失出”革職，據《清實錄》載：
都察院遵旨察議，刑部審訊光棍金眼王五、吳謙等打死三人一案，既已遲延，又不審出實情，又為解脫，應將尚書安布祿降級調用。得旨。刑部前審此事，明系隱蔽，尚書安布祿降三級留任，尚書王士正、侍郎陳論俱降三級調用。
刑部審訊將罪重者誤失之輕，引起尚書遭降級，而王士禎調用不久亦被革職。其實真正原因是與廢太子唱和，借題被黜。
王脄，以其祖父錫爵于明神宗時以建儲事受惡名，遂于五十六年（1717）五月密奏建太子，疏留中。六十年（1721）正月復疏前事，三月又有御史柴謙等十三人上疏如脄所言。康熙帝曰：“王脄以伊祖王錫爵在明神宗時力奏建儲之事為榮，常夸耀于人，不知羞恥。王錫爵極力奏立泰昌，在位未及兩月。天啟庸懦稚子承統繼緒，魏忠賢等擅權，至愍帝不能保守，明祚遂亡，王錫爵不能辭其罪也。”又曰：“王脄結黨營私，將國家最大之事應候乾斷者，兩次妄行陳奏，至使陶彝等紛紛入奏?！敝T大臣請逮脄等治罪。詔王脄應謫戍軍，姑念年老免行，著其子奕清隨諸御史代往，為父贖罪。據《永憲錄》上記載，王脄引曾祖王錫爵奏建儲之事，欲力爭嫡長胤秖為皇太子?？墒牵瑩←[章所說：“王脄上書請立皇四子為儲貳”，因此雍正帝即位，召王脄復故官。王脄謝曰：“天生圣人為社稷福，老臣何敢居功也?！?
如果說王脄請立胤有功，二子投效邊地應可釋回，但王奕清兄弟倆一直等到雍正帝去世后才返京。雍正元年（1723）六月王奕清被削籍。七月，給官員蔭子，九月給封典，代父軍前效力的王奕清均不得授予。而且，在雍正二年（1724）王奕鴻又牽扯上年羹堯之事?！队缿椾洝份d：
復遣王奕鴻效力軍前，奕鴻由年羹堯奏，令振武將軍祁禮德帶回京師侍父，以伊諂媚年羹堯，復令伊兄奕清一同效力。
雍正認為他們諂附年羹堯，所以四年（1726）大赦謫發軍前諸監察御史陶彝等，咸歸原籍。卻令王奕鴻贍養阿爾泰一路驛站人夫贖罪。王脄在雍正六年（1728）去世，皇帝既無祭葬；亦無謚號。王奕清，及弟奕鴻兩人俱詣烏里雅蘇臺，即外蒙古喀爾喀地與俄羅斯接壤處。至乾隆元年（1736）始召還都，次年王奕清卒，奕鴻任官川東巡道。
而對攀附隆科多的查嗣庭，卻給予更嚴酷的懲治。雍正四年（1726）查嗣庭為江西鄉試正考官，皇帝料定其試題“顯露心懷怨望，譏諷時事之意”。首題“君子不以言舉人，不以人廢言”，顯然與皇帝下令官員薦舉人才的政策相違背。又，出《易經》題目“正大而天地之情可見矣”，《詩經》題目為“百室盈止，婦子寧止”。雍正帝便在“正”字和“止”字上做文章，原因是雍正二年（1724）汪景祺文字案中，汪論歷代年號，如正隆、正大、至正、正統等，凡有正字皆非吉兆，有一止之象。查嗣庭所出試題前用正字，后用止字，而易經第三題“其旨遠，其辭文”，則其寓意將前后聯絡，顯然與汪景祺語相同。況且，查嗣庭的日記中大書災異，又訕謗康熙帝用人不當，此皆成為詆毀朝政之證據。
查嗣庭被革職拿問后，十月，雍正帝派浙江巡撫李衛前往海寧抄家，巨細靡遺逐件翻尋，將搜出一切字跡書本盡數押送京城。此外，查嗣庭的兄弟、子侄俱于十一月逮入首都，詣刑部獄。次年，查嗣庭畏罪自殺，皇帝命人戮尸梟示，其妾史氏投環自盡。子查禨應斬，次子贅居天津，雍正四年（1726）卒。三子克上卒于獄中，婦浦氏在家聞變，投環而死。其余未滿十五歲之子克纘、銓、克敬俱處流罪三千里。嗣庭胞兄慎行，皇帝以其年老釋放回籍，不久亦去世。嗣庭仲兄嗣，及其子查基、查學、查開皆流放三千里。查氏因文字獄案而骨肉播遷，家產充公，門祚零落，一直到乾隆即位才釋回流放人員。
海寧陳家，從當官人數看來，似乎維持鼎盛局面。但細數雍正帝對陳氏的種種處分，不得不令人懷疑其實是整肅朋黨的一貫作風。雍正四年（1726），翰林院侍講錢名世，以諂附年羹堯的罪名，被逐回原籍。雍正親寫“名教罪人”四字的匾額，掛在錢氏家門，又命朝臣作詩諷刺，然侍讀學士陳邦彥、陳邦直卻以詩句乖誤的罪名落職。邦彥是陳元龍侄兒，邦直是他唯一的兒子。同年任官山東巡撫的陳世倌，因丁母憂回籍，皇帝改命他督修江南水利，尋因遲誤工程革職，乃命赴曲阜督修文廟，又依舊因遲緩工程之由，引發皇帝怒氣說：“陳世倌之為人，一無可取也?！?
對于明珠黨派下的陳元龍，雍正帝也加以清算。原來在康熙五十三年（1714）陳元龍任廣西巡撫。他與廣東巡撫滿丕以積貯最要，請開捐納，迄五十五年（1716）止。其中桂州、梧州、柳州、南寧四府共收一百十七萬八千余石糧，經布政使黃國材議定每石折銀一兩一錢，各府自存六錢為買谷蓋倉等費用，內有贏余，按察使及本道各得一份，陳元龍共分有十一萬兩余。康熙皇帝雖明知官員借捐納之便，通同舞弊，可是都不予追究。換上雍正帝卻是不同。七年（1729）李紱參奏此事，部議陳元龍應追賠得過羨余及認分賠部科等費共銀二十一萬二千兩。
康熙在位時間長達六十一年，皇位繼承問題也積累得更復雜。最初，皇太子胤秖與索額圖勢傾朝野，危及皇權，因此康熙拘捕索額圖，并廢太子。雖然皇帝曾下旨，有意寬赦與他們交結的漢人官僚，但從王士禎和王脄遭到落職的下場看來，皇帝并無網開一面。雍正朝查氏被抄家之事，主要原在于查嗣庭和滿臣隆科多的關系深厚，皇帝羅織文字獄，似乎過分殘酷、苛細。對海寧陳氏與滿漢大臣結黨，雍正亦予輕重不等的處分。這些政治事件反映出清朝皇帝伸張皇權的努力，而這些家族也因卷入政治斗爭，遭到各種懲治，影響家族的聲望。