二、真菌種的概念

根據形態學特征可將真菌鑒定到種。其中包括一些概念：

多形性概念（polythetic concept）：需要合并真菌的各種特征。

生態學概念：根據真菌的特殊習性分類。

生物學概念：如交配試驗，用于有性期；繪圖方法，用于無性期。

種系發生概念：結合分子生物學技術，特別是核苷酸DNA的序列分析來分類種間、種內、種上、種下的各種分類群。

綜合上述概念，種系統發生概念又有了發展，根據形態學、真菌細胞壁成分、細胞學試驗、超微結構、細胞代謝、化石記錄、分子生物學技術等來分類。