產甲烷菌體內：其中一兩個體質較差的紅細菌由于缺乏碳流已經死亡，此刻最精彩的一幕出現了，紅細菌的殘骸被還活著紅細菌分解，隨后死去紅細菌巨大的基因組暴露在產甲烷菌體內，天哪，瞬間忙碌起來，轉錄、翻譯，忙的不易樂乎，一切都亂了套，產甲烷菌和紅細菌的蛋白漫天飄，具體細節太過復雜，可能再寫一本書描繪這些或稱都記錄不完。此時的這個內共生復合體處于一種病態，內部騷亂一團，更不要說分裂繁殖，值得可喜的是，能量的供應已經多樣化了。這里我們必須說的一點是真核生物的基因為何是斷裂基因，還記得再說露卡誕生時所說的自私基因片段嗎？此刻的它才是正忙碌的時候，它（Ⅱ型自剪接內含子）藏在宿主的DNA中，當宿主轉錄時，它可以自己將自己從RNA上剪切下來編碼逆轉錄酶，然后變為DNA片段重新插回DNA。當然還有另外一種內含子不不編碼逆轉錄酶，而是忠實的跟著宿主DNA的復制頻率。由于能量充足，如今這些自私基因大批量攻擊宿主DNA，它們隨意插入，競爭核糖體，這將是一場最大的毀滅沖擊。但是產甲烷菌怎么會允許這樣的情況出現，為了隔離自私基因的RNA與核糖體的接觸，它開始轉錄紅細菌的細菌膜，由于產甲烷菌時古菌，其膜脂結構與紅細菌（細菌）不同，所以生成的細菌油膜囊泡，不會被運送至細胞膜上，而是大量聚集在基因組周圍，形成不連續的雙層膜囊，這就是真核細胞細胞核的演化過程。

需要說明的是，自私基因促進了真核細胞核膜的形成，同時也形成了斷裂基因，不過這場攻擊導致大量原始真核生物死亡，最后活下來的寥寥無幾，所以，這就是為什么真核細胞進化只成功了一次，因為危險的過程太多了。核膜的出現防止了由于自私基因的胡亂插入而破壞生命運行的重要基因。這場騷亂多么急促和漫長，又多么驚心動魄以及驚天地泣鬼神。當然這場教訓也讓自私基因明白哪些地方可以插入，哪些不可以，只有遵守規矩才能繁衍下去。而還是那句話，富貴險中求，斷裂基因造就了真核生物的蛋白多樣性。

驚慌收場，如今的產甲烷菌，不對，如今的原始真核細胞代謝已經規律，紅細菌雖然可以收獲大量碳源，但是繁殖受限，于是逐漸丟棄了原本多樣化的代謝基因，將這些基因交給了產甲烷菌。經過長期磨合，紅細菌逐漸稱為現代線粒體。別著急，還沒有結束，有的人會敏銳的注意到，既然古菌是宿主，那么現代真核細胞的細胞膜為何是細菌樣的膜脂，而不是古菌的？其實我想也很好解釋，因為自私基因的隨意插入可能破壞了古菌膜脂的編碼基因，卻將紅細菌的膜脂基因保留下來。或許是因為其他什么原因丟棄了宿主膜脂編碼基因，誰知道呢？不過第一種解釋我認為最合理。

這里我還需要說明一點，紅細菌其實有兩個“后代”，一個是線粒體，伴隨宿主進入好氧世界，丟掉以氫氣為供電字體和產氫的途徑。一個是氫酶體，伴隨宿主進入厭氧世界，成為厭氧真核生物，以氫氣和有機物為電子供體，或以H+為電子受體產生氫氣，幫助緩解氧化壓力。