前言

R語言是常用的數(shù)據(jù)分析處理工具之一，尤其是在臨床預(yù)測模型領(lǐng)域，目前尚無其他語言可替代。雖然一些軟件也可進行一定程度的臨床預(yù)測模型分析，但業(yè)內(nèi)對這些軟件的接受程度較低。雖然有一些小眾軟件可進行臨床預(yù)測模型分析，但是分析結(jié)果完全偏離真實結(jié)果，因此筆者不建議各位讀者使用R語言之外的軟件進行臨床預(yù)測模型分析。

近年來，隨著R語言的逐漸完善，只需要少量代碼即可完成各種常用的臨床預(yù)測模型的構(gòu)建、評價／比較、驗證及可視化。學(xué)習(xí)本書內(nèi)容，可在較短時間內(nèi)完成3~5分的臨床預(yù)測模型類的SCI，較為迫切地解決了廣大讀者的燃眉之急。

筆者的使用體會

R語言是開源的，生態(tài)完整，有大量的現(xiàn)成數(shù)據(jù)分析包。R語言在臨床預(yù)測模型的數(shù)據(jù)分析領(lǐng)域中是一個理想的工具，有豐富的模型構(gòu)建、評價／比較、驗證、可視化的代碼，整合了多種形式的預(yù)測模型，可處理高維大數(shù)據(jù)，開發(fā)方便、快捷，且可將模型轉(zhuǎn)換成應(yīng)用程序或網(wǎng)頁，更加高端地展示學(xué)術(shù)成果。

Rstudio是R語言的一種免費的集成開發(fā)環(huán)境。相對于在文本文件中編寫R語言代碼，Rstudio調(diào)試代碼更加方便，對新手更加友好。Rstudio支持Markdown，可以較為容易地編輯代碼文檔。利用Rstudio可以很好地記錄數(shù)據(jù)探索分析的過程，便于回顧、修改。

本書的特色

●　從零開始：從模型構(gòu)建開始，詳細介紹模型構(gòu)建的變量篩選方法，入門門檻低。

●　版本新穎：書中的大部分軟件包采用官網(wǎng)的最新版本（截至本書撰寫時）進行講解。

●　經(jīng)驗總結(jié)：全面歸納和整理作者多年的R語言臨床預(yù)測模型培訓(xùn)教學(xué)實踐經(jīng)驗。

●　內(nèi)容實用：結(jié)合大量案例進行講解，并對實現(xiàn)同一結(jié)果的多種代碼進行對比。

本書的內(nèi)容

本書可以分為三部分：第一部分是預(yù)測模型的構(gòu)建，第二部分是預(yù)測模型的評價／比較，第三部分是預(yù)測模型的驗證。

第一部分主要介紹線性回歸、Logistic回歸、Cox回歸、競爭風險模型的構(gòu)建，以及常用的變量篩選方法，如先單后多、逐步回歸、Lasso、隨機森林、最優(yōu)子集、主成分分析等。另外，本書對擬合模型中的常用統(tǒng)計指標均進行深度解讀，如OR、HR、sHR等指標。

第二部分主要介紹如何進行模型的評價／比較，涉及多種形式的列線圖、Calibration校準曲線、ROC曲線、DCA曲線等的繪制，不僅涉及單模型的可視化，也包括單模型多時點、多模型同時點的可視化；模型評價指標涉及C指數(shù)、AUC、NRI、IDI等。

第三部分主要介紹模型驗證，涉及簡單交叉驗證、K折交叉驗證、留一法交叉驗證及Bootstrap。

本書讀者對象

●　R語言零基礎(chǔ)入門人員；

●　醫(yī)學(xué)類院校本科生、碩士研究生、博士研究生；

●　高校及醫(yī)療機構(gòu)科研人員；

●　培訓(xùn)機構(gòu)講師；

●　對臨床預(yù)測模型感興趣的人員。

作者

2022年7月

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