供受者的配型結果應該出自有相應資質的同一實驗室，原則上有條件的單位應對配型進行復核或確認。

首先根據HLA分型結果判斷是否是最佳供者：

1.當供者和受者是同性別的雙胞胎，HLA完全相合時，要鑒別是否為同基因供者。同基因供者必須經過權威部門如法醫鑒定中心認定；因為同卵雙生的同基因供者移植后不會發生移植物抗宿主病，移植物中也沒有腫瘤細胞污染，應該作為首選的供者。但也缺乏移植物抗白血病效應，需要加強移植后復發的檢測和預防。

2.一般認為HLA完全相合的同胞供者是異基因移植供者的首選，在高危復發的患者中，單倍體移植具有更強的GVL效應。

3.非血緣關系供者，當A、B、DRB1高分辨滿足5/6或6/6相合時，可以選擇作為供者。即便骨髓資料庫不斷擴容，也只有少部分患者可以檢索到合適的供者。因為查詢需要3～6個月的時間，是否等待需要結合患者的病情和意愿共同決定。

4.單倍體相合的移植供者選擇余地大。因為患者的同胞、父母、子女、患者父母的同胞（叔叔伯伯姑姑舅舅姨）及其各自的子女（堂親、表親）均可能成為候選的供者，這樣幾乎每個患者都可以在很短的時間內找到供者。配型不完全相合的同胞供者，需要父母參加配型以確定是NIMA還是NIPA供者。子女作為供者，或父母作為供者，父母親均需要參加配型，用以推導和確認單倍體相合。

5.臍帶血。對于兒童患者，檢索到A、B、DRB1 4/6以上相合的臍帶血，MNC達到2.7×10 ⁷/kg或以上，可以應用。但如果患者病情是復發高危，因為不能再得細胞進行細胞治療，選用臍帶血移植要慎重。對于SAA患者，因為不植入率高，也不建議應用。

北京大學人民醫院的資料顯示，在治療惡性血液病方面，單倍體相合的HSCT能夠獲得和配型相合同胞供者、無血緣關系供者或臍帶血移植供者相同的療效，而親緣供者在時效性上優于非血緣供者，在再次可得性上優于臍帶血。可根據患者意愿，決定是否尋找非血緣供者或臍帶血。在HLA匹配程度相同的多個供者中，選擇年輕男性。在單倍體相合的同胞供者中，北京大學血液病研究所的資料顯示選擇順序為年輕男性、子女、父親、非母系遺傳抗原（NIMA）不合的同胞、母親、旁系親屬，并結合DSA情況選擇供者（見供者選擇章節）。

供者在捐獻造血干細胞移植前的3個月內，要全面評估身體狀況，除外血液系統疾病，是否可以耐受麻醉、骨髓采集和G-CSF動員，是否有心臟、肝臟、肺臟和腎臟方面的其他疾病。HIV陽性、精神病沒有得到很好控制、沒有行為能力的供者均為捐獻造血干細胞的禁忌。患有結核病供者在控制結核后可以捐獻。乙型肝炎患者在HBV-DNA陰轉后可以捐獻。如果配型相合的供者具有心腦血管病史，盡量不注射細胞因子動員劑，如果無供者可替換可以采用靜態的骨髓，以避免G-CSF應用后可能的高凝狀態。如果供者有麻醉藥物過敏史，或脊柱畸形或不適合采集骨髓的其他情況，可以單獨采集外周血造血干細胞。供者的年齡沒有明確界定。北京大學人民醫院曾成功地為6歲和72歲的供者采集到造血干細胞。女性育齡期供者，在捐獻干細胞前，做妊娠檢查。孕婦不宜捐獻造血干細胞。