《蘇沈良方》中對醫(yī)理的闡述主要有三個方面：一是對人們求診疾病的指導；二是對人們養(yǎng)生益壽的指導；三是摘錄他人論述治療眼、齒的醫(yī)理。作者雖非醫(yī)者，但從自身求診經(jīng)驗、對前人養(yǎng)生理論的分析及對他人醫(yī)學理論的摘錄，從而提出自己的觀點，將道理論述得有理有據(jù)，值得后人參考、借鑒。

《脈說》以脈為題，卻非言如何診脈。《蘇沈良方》中先說診脈之難：“脈之難，古今之所病也。至虛有盛候，大實有羸狀，差之毫厘疑似之間，便有死生禍福之異，此古今所病也。病不可不謁醫(yī)，而醫(yī)之明脈者，天下蓋一二數(shù)。騏驥不時有，天下未嘗徒行；和扁不世出，病者終不徒死，亦因其長而護其短耳。士大夫多秘所患而求診，以驗醫(yī)之能否，使索病于冥漠之中，辨虛實冷熱于疑似之間。醫(yī)不幸而失，終不肯自謂失也，則巧飾遂非以全其名。至于不救，則曰是固難治也。間有謹愿者，雖或因主人之言，亦復參以所見，兩存而雜治，以故藥不效。此世之通患而莫之悟也。”脈診作為中醫(yī)四診“望、聞、問、切”中的一部分，在診斷疾病上有其優(yōu)勢亦有其局限性，不能僅以脈診為診斷疾病的唯一方法。如果患者不與醫(yī)生配合，就等于給醫(yī)生診療疾病增加了難度。蘇軾以自身就診經(jīng)驗為例，意圖向大家說明患者與醫(yī)生配合的重要性。“吾平生求醫(yī)，蓋于平時默驗其工拙，至于有疾而求療，必先盡告以所患，而后求診，使醫(yī)了然知患之所在也。然后求之診，虛實冷熱先定于中，則脈之疑似不惑也。故雖中醫(yī)，治吾病常愈。吾求疾愈而已，豈以困醫(yī)為事哉！”

在《續(xù)養(yǎng)生論》中，作者根據(jù)鄭子產(chǎn)與翼奉之理論提出：“火烈而水弱。烈生正，弱生邪。火為心，水為腎。故五臟之性，心正而腎邪。”以此推導出“鉛汞龍虎之說”。并以此說闡釋“內(nèi)丹”的修煉方法為“汞龍之出于火，流于腦，溢于玄英，必歸于根。心火不炎上，必從其妃，是火常在根也。故壬癸之英，得火而日堅，達于四肢，浹于肌膚而日壯。究其極，則金剛之體也，此鉛虎之自水出者也，龍虎生而內(nèi)丹成矣。故曰：順行則為人，逆行則為道，道則末也，亦可為長生不死之術(shù)矣。”文中有內(nèi)丹是長之生藥，修煉好內(nèi)丹則可長生不死之說，這雖有夸大之嫌，但通過五臟調(diào)理達到延年益壽的方法是很有借鑒意義的。文中還有對于臍的論述：“人之在母也，母呼亦呼，母吸亦吸，口鼻皆閉而以臍達，故臍者生之根也。”胎兒在母體中依靠臍帶吸收營養(yǎng)，所以臍帶是人生之根本。

《蘇沈良方》認為治眼、齒的方法不同，引張文潛之言“目忌點洗。目有病，當存之；齒有病，當勞之……”并舉例“治目當如治民，治齒當如治軍。治民當如曹參之治齊，治軍當如商鞅之治秦”加以解析。蘇軾自少年時期便常患眼疾，因此十分注重對眼、齒的治療及保健方法，而《蘇沈良方》中對眼、齒的治療及保健方法亦沿用至今。