盆底區由多個結構組成，包括括約肌、若干解剖層次和支持成分等，肌肉和韌帶是這些盆底結構的主要成分，可通過磁共振成像（MRI）直觀顯示。近年來，作為一種評價盆底的檢查方法，磁共振成像已被日益接受，眾所周知，MRI的優點是無電離輻射、極佳的軟組織對比和無結構重疊的多平面成像。盆底MRI包括靜態（形態學）和動態MRI。靜態MRI是指患者在靜息狀態下的盆底解剖形態成像，動態MRI是指盆底在靜息、提肛、強忍和排便或排尿狀態下的動態成像。

患者取仰臥位，采用盆腔或相控陣線圈及1.5特斯拉場強成像，這是當前盆底MRI技術的現狀。采用T2加權快速自旋回波序列（TSE），可精確評價盆底形態學。通過采用腔內（直腸內、陰道內、尿道內）線圈使空間分辨率得以提高。結合T2加權FSE序列，腔內線圈還可以提供高信噪比（SNR）和高分辨率圖像。然而，腔內線圈的缺點是視野有限，這些線圈只能為緊鄰線圈的結構提供充足的信號。因此，采用腔內線圈的成像方案總是要與相控陣線圈成像相結合。3.0TMRI系統目前已應用于臨床。與1.5T系統相比，該系統的最主要優勢是信噪比更高。因SNR隨場強呈線性變化，3.0T的信噪比預期可能達到1.5T的2倍。但實際上，受技術所限，3.0T的SNR通常僅是1.5T 的1.7～1.8倍。臨床上，3.0T場強下獲得的高SNR可增加空間分辨率或縮短采集時間。

肛瘺的主要治療方法是外科手術，術前明確瘺管的位置、走行、分支以及內口等對于手術的成功有重要的意義。瘺管造影術對大部分復雜性肛瘺不能得到良好的顯示，且無法判斷瘺管與肛門括約肌之間的關系，近幾十年來已逐漸被經肛直腸腔內超聲和磁共振所代替。經肛直腸腔內超聲初期臨床報道準確率達94%，但進一步的研究表明其準確率僅僅為60%～70%，主要問題是難以確定瘺管和肛門外括約肌的關系和內口的準確定位，肉芽竇道和瘢痕難以鑒別。我們在應用磁共振對克羅恩病患者檢查時發現磁共振能清楚顯示瘺管的走行，于是將其運用于肛瘺的檢查。磁共振成像能從矢狀位、冠狀位及橫截位獲得理想的影像圖片，從而可以充分顯示肛管直腸周圍肌肉，同時因瘺管與瘢痕存在不同的影像學信號而能準確分辨。T1W1能較好地反映肛管直腸周圍括約肌的解剖結構，T2W1和其抑脂序列能進行瘺管與括約肌關系的準確定位。瘢痕組織及術后纖維化在T1W1和T2W1脂肪抑制圖像上均呈低信號，增強后無強化，而活動性瘺道在T2W1脂肪抑制圖像上呈高信號，在T1W1圖像上呈低信號，增強后病變有強化。

MRI掃描序列各有不同，但較多的報道是自旋回波序列（SE），且以軸位作為常規檢查方法，它能評估肛瘺管與括約肌的關系，冠狀位像能提高內瘺口的顯示率，而矢狀位價值有限。

T1加權序列能顯示外括約肌、肛提肌，肛瘺管呈低信號，但不能顯示肛管黏膜、黏膜下及內括約肌。因肛瘺瘺管及肛周各結構均為低信號，有時兩者T1加權平掃很難鑒別。T1加權Gd-DTPA增強掃描能使富血管的炎性瘺管邊緣增強，明顯改善肛瘺及膿腫的顯示，T2加權顯示瘺管亦較好，呈高信號。

軟組織病理性改變，如水腫在STIR序列呈高信號，而脂肪組織呈低信號，與T2加權平相比，STIR明顯提高瘺管的檢出率，特別是肛瘺的瘺管分支檢出率得到提高。STIR序列的掃描時間明顯短于SE-T1加權參數，但STIR序列在肛瘺的顯示上也存在一些不足之處，因STIR序列是一種對水較敏感的序列，對分泌物少的非活動性肛瘺及術后瘢痕不敏感。

MR直腸線圈是一種表面線圈，因它貼近受檢組織，能接受到較弱的磁共振信號，提高空間分辨率，能數倍提高肛管括約肌群的信噪比，據文獻報道其肛瘺的內瘺口檢出率可達80%，但對復雜性肛瘺的敏感性低于體線圈，因它只能顯示括約肌及肛管附近的瘺管，使其檢查價值受限。插入的直腸線圈可能壓迫瘺管，影響瘺管的顯示，導致產生假陰性結果，有時因為線圈貼近受檢區形成過強輻射，信號過高而形成一種瘺管假象。作為一種“侵入性”檢查方法，病人有一定痛苦，約17%患者難以耐受此檢查。

此序列是一梯度回波序列，它采取層塊采集，信號無丟失，掃描時間比SE-T1加權、STIR要短，圖像分辨率高，應用T2加權3DFLASH序列平掃加增強圖像減影技術可提高瘺管信號強度，降低周圍軟組織信號，使瘺管的顯示更為突出。此序列結合STIR序列可作為肛瘺檢查的常規方法，它既可提高肛瘺檢出率，又明顯縮短了檢查時間。

在肛瘺檢查過程中，盆底磁共振檢查通常會使用直腸充盈對比劑，可以更好地顯示其輪廓。正常直腸中下段處于閉合狀態或半閉合狀態，只有將直腸中下段充分擴張，良好顯示直腸中下段結構，才有可能對肛瘺與肛管直腸環和鄰近臟器的關系作出較為準確地判斷，為制定臨床手術方案提供更多的信息。大多數學者主張經肛門直接注氣或者注水，但直接自肛門注入仍然不能使中下段直腸充分擴張，對于中老年患者，存在不同程度的肛門括約肌松弛，經肛門直接注水或注氣難以被患者耐受，又常常產生較為明顯的提肛反射，致使直腸壁收縮、增厚，反而達不到擴張直腸中下段的目的，甚至給診斷帶來不利影響。