余在臨證之際,主張辨病與辨證相結合、內治與外治相結合、辨病辨證與單方驗方相結合;在治療思路與方法上,認為辨證論治為疑難病證提供了治療原則,輔助檢查為疑難病證明確了治療方法,單方驗方為疑難病證豐富了治療手段;對某些疑難病證,用常法治療無效者,則另辟蹊徑,采用變法治療,常可獲得較滿意的療效;立方講究既不失古人之意,又不為古人之方所拘泥,創制了多首新方;臨床單一病證較少,數方合用可適應復雜、疑難病情的需要,因而常用合方治療疾病;由于對《傷寒雜病論》有過深入的鉆研,因而在經方運用上有所心悟;在時方的臨床應用上亦有心得,特別是對升降散的運用多有發揮;對當代醫家所創立的一些專方頗為重視,常摘錄之,并進行臨床驗證;對于書刊上介紹的單方,相機運用,收到了較好的療效;當應用某方治療某病無效或療效欠佳時,在立法選方無誤的基礎上,重視關鍵藥物的配伍;對治此而愈彼、一方而愈二病的常見現象進行研究,探討了其本質和意義;對于西醫學確診的疾病,在運用中醫藥治療時,強調要辨證論治。