一些學者認為公元前1700年左右，地球上曾經存在著一個地震活躍期，印度河流域在這一時期也發生了地殼運動，導致河流改道，洪水泛濫。文明古城摩亨佐·達羅受到3次大洪水的襲擊。瘟疫流行，土壤鹽堿化。不利耕作，環境惡化，城市最終荒廢。

另一些學者從遺址第7層有亂七八糟的被殺者的殘骸推測，古城的消亡是由于內部紛爭，自相殘殺，逐漸衰微，從而給外族——雅利安人以可乘之機。然而考古學上并未發現任何雅利安...