早在20世紀50年代，美國著名科學家、諾貝爾獎得主鮑林博士就提出：為什么不能從病因上找到治療乃至預防疾病的方法？隨后的二十年里，大量的基礎醫學科學研究揭示出人體器官、系統功能下降會導致眾多疾病的發生，“功能醫學”的概念隨之應運而生。

功能醫學既不是一門新的醫學學科，也不是一個新的醫學分支，它并不會從根本上徹底顛覆我們目前對生物醫學科學的認知。相反，功能醫學只是醫學的一個新興模式，它更多地是探索生理生化機制改變所引起的功能失衡。以往，“功能”這一術語被廣泛用于醫學領域，不僅用其描述患者的機體狀態，甚至引入到心理學范疇。而在“功能醫學”這個新興的醫學模式里，“功能”這個詞是被用來描述基礎的生理活動、生理活動所引起的各項體征指標的變化、生理活動紊亂的狀態以及慢性功能衰退性疾病。