功能亢進者以手術切除、放射治療或化學治療等療法為主。比如經蝶竇的垂體瘤切除術、經腹腔鏡腎上腺瘤切除術。另外由于目前不能直接治療甲狀腺自身免疫紊亂，只能通過藥物阻斷或放射線破壞甲狀腺組織從而減少甲狀腺素的合成和釋放。功能減退者以激素替代治療及病因治療為主。例如用甲狀腺素治療甲狀腺功能減退、用氫化可的松治療腎上腺皮質功能減退、胰島素治療1型糖尿病。

掌握各種降糖藥物的降糖效果、各種降壓藥物的降壓效果、抗骨質疏松藥物減少骨折的風險大小。一些藥物由于能夠針對疾病的發病機制，因此成為某些情況下的首選用藥。比如肥胖的2型糖尿病患者首選二甲雙胍類降糖藥物。2型糖尿病伴高血壓患者首選血管緊張素轉換酶抑制劑（ACEI）或血管緊張素Ⅱ受體阻斷劑（ARB）類降壓藥物。糖皮質激素誘發的骨質疏松癥首選二磷酸鹽類抗骨質疏松藥物。也有人提出初始治療采用作用機制不同的藥物聯合應用有助于增加療效，減少副作用。

掌握內分泌治療藥物的常用劑量及最大劑量。當常用劑量效果不佳后如何換用備選藥物或者聯用其他藥物。比如他汀類降脂藥物增1倍的劑量僅能增加6%的降脂效果，必要時可聯用膽固醇吸收抑制劑或煙酸類降脂藥物。治療高泌乳素血癥大約有25%的患者對溴隱亭（bromocriptine）抵抗，可改用卡麥角林（cabergoline）。

當各種藥物的療效相近時，應該按照避免藥物副作用的原則選擇藥物。告知患者服藥后可能出現的不良反應能夠提高依從性，減少醫源性不良事件的發生。比如服用降糖藥物時應注意低血糖的發生。服用抗甲亢藥物要注意粒細胞缺乏、肝功能異常等?？诜悠S明應注意體位性低血壓的發生?？剐奂に厮幬锶缏輧弱ヒ⒁庑杂麥p退、男性乳房發育等?？勾萍に厮幬锶缏让追乙⒁獍l熱、潮紅等副作用。

例如肝功能異常時，謹慎使用他汀類藥物。急性肝衰竭或失代償肝硬化是他汀類藥物的禁忌證。腎功能異常時，經腎臟排泄的藥物應減量或停用。例如二甲雙胍直接以原形經腎臟排泄，當腎功能損害時易發生二甲雙胍和乳酸在體內蓄積，從而增加乳酸性酸中毒風險，因而其用于慢性腎臟疾病（CKD）3a期［eGFR 45～59ml/（min·1.73m ²）］時應減量，CKD 3b～5期患者禁用［eGFR<45ml/（min·1.73m ²）］；大部分磺脲類僅用于CKD 1～2期的患者，在3期應減量或禁用，4～5期禁用；噻唑烷二酮類雖經肝臟代謝，但因有導致水鈉潴留、心力衰竭、骨折的風險，在CKD患者中也應謹慎應用；α-糖苷酶抑制劑可用于CKD 1～3期患者，而4～5期禁用。老年患者應選用作用時間短、副作用少、不影響功能狀態、使用方便的藥物，例如長效磺脲類促分泌劑格列本脲容易引起嚴重的低血糖，老年患者應盡量避免使用。

手術治療一般用于切除增生的腺體組織或腫瘤、減輕壓迫癥狀，可用于服藥無效或停藥后復發的患者，比如甲狀腺、垂體瘤和腎上腺腫瘤的切除術。圍術期應采取充分的措施保證手術的順利進行和預防術后并發癥的發生。比如甲亢患者行甲狀腺次全切除術前口服抗甲亢藥物控制癥狀，口服碘劑使甲狀腺縮小變硬，以利于手術。腎上腺手術前控制高血壓，糾正低血鉀和堿中毒后方可手術。術后要注意可能發生的內分泌危象、腺體功能減退等。

放療及化療更多的作為手術或內科治療的輔助手段，例如放療用于垂體瘤術后殘余腫瘤的治療、甲狀腺癌術后放射性 ¹³¹I清除殘留的甲狀腺癌組織。針對內分泌腫瘤的化療見于米托坦治療腎上腺皮質癌，阿霉素治療轉移性甲狀腺癌。在常規治療無效且處于進展狀態的晚期分化型甲狀腺癌患者中，可以考慮使用新型靶向藥物（如酪氨酸激酶抑制劑）治療。放療或化療的并發癥是逐漸出現的腺體功能減退和病灶周圍神經、血管的損傷。

學科進展越來越快，海量的研究文獻常常使人無所適從，因此各種疾病的指南應運而生。臨床指南由相關領域的專家、方法學家和信息專家共同制定，以最佳的臨床研究證據為基礎（對證據進行等級區分），對于規范醫生臨床實踐、提高醫療水平、保證醫患權益具有非常重要的意義。主要的內分泌代謝疾病如糖尿病、甲狀腺疾病、肥胖癥、高甘油三酯血癥、骨質疏松癥、原發性醛固酮增多癥、庫欣綜合征、高泌乳素血癥、肢端肥大癥、高尿酸血癥、多囊卵巢綜合征均有相關的指南。甚至在某種疾病的多個方面具有多個指南，比如糖尿病患者的醫學營養治療指南、低血糖管理指南、老年糖尿病指南、高血糖急性并發癥指南等。

指南定期進行更新。既往認為糖尿病患者的血壓控制目標為<130/80mmHg，但鑒于證據顯示進一步將收縮壓降至140mmHg以下不能帶來額外獲益反而增加風險，故美國糖尿病學會（ADA）糖尿病指南和2013美國成人高血壓指南（JNC8）都將糖尿病患者的降壓治療的收縮壓目標值由小于130mmHg放寬至小于140mmHg。

在研讀指南時應該注意證據的級別，是來自于專家共識、回顧性研究，還是前瞻性觀察性研究、隨機對照的臨床試驗（RCT）和薈萃分析。盡管指南以RCT和薈萃分析作為主要證據來源，但很多情況下在RCT證據不足時，專家觀點發揮了主導作用。此外，RCT通常是在嚴格的納入和排除標準下入選研究對象，排除了肝腎功能障礙、衰弱、妊娠、失能、癡呆、高齡等特殊人群及病情嚴重、合并癥較多的復雜病例。指南提供的是原則，考慮的是群體共性，臨床患者千變萬化，治療方案的最后確立，應在遵循普遍原則的基礎上，根據患者的具體病情和本單位的可操作性，由醫務人員和患者共同決定。

以循證醫學為指引，臨床上仍有許多未解之謎。比如抗甲亢藥物維持期治療容易復發，是選擇同位素 ¹³¹I治療或手術治療，還是長期低劑量維持？應激性高血糖能否使用口服藥物而非胰島素治療？亞臨床甲亢的治療應維持多長時間等。

內分泌激素影響多個器官，例如庫欣綜合征患者可能同時存在肥胖、糖耐量受損、高血壓、骨質疏松、腎結石等。糖尿病患者可能同時存在高血壓、高血脂、高尿酸、消化吸收紊亂、凝血功能異常等等。但是內分泌疾病也可能以某一種癥狀為主要表現，比如腹瀉除考慮胃腸道疾病以外，應想到全身性疾病比如糖尿病、甲亢等。其他系統疾病也可以和內分泌疾病合并存在，如肺結核、高血壓、胰腺癌、骨折等可以合并糖尿病或應激性高血糖，危重疾病可以合并低T ₃綜合征，肺癌合并抗利尿激素分泌失調綜合征。因此，內分泌疾病的治療應著眼整體的療效及副作用，例如糖皮質激素可能影響血糖和骨質疏松，甲狀腺素替代治療可能增加心房顫動和骨質疏松的風險。