- 陳鈞輝《普通生物化學(xué)》(第5版)筆記和課后習(xí)題(含考研真題)詳解
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- 7字
- 2021-05-28 19:32:41
第4章 核酸化學(xué)
4.1 復(fù)習(xí)筆記
一、核酸的類別、分布和組成
1類別
核酸分核糖核酸RNA與脫氧核糖核酸DNA。RNA中又分mRNA、tRNA和rRNA三種,此外還有許多其他種類的RNA。
2分布
DNA主要存在于細(xì)胞核的染色質(zhì)(chromatin)中,線粒體和葉綠體中也有。90%的RNA存在于細(xì)胞質(zhì)中,10%存在于細(xì)胞核中,rRNA主要存在于核糖體內(nèi)。
DNA和RNA核糖和嘧啶是有區(qū)別的。它們的組分區(qū)別如表4-1所示。
表4-1 RNA與DNA組分上的區(qū)別
3組成
(1)核糖及脫氧核糖
表4-2 RNA與DNA的組成與鑒定
(2)嘌呤堿
嘌呤堿為核酸中的嘌呤類物質(zhì),主要為腺嘌呤(A)和鳥嘌呤(G)兩種,次黃嘌呤、黃嘌呤與尿酸是腺嘌呤的代謝產(chǎn)物。
(3)嘧啶堿
嘧啶堿為核酸中的嘧啶類物質(zhì),核酸中存在的嘧啶堿有胞嘧啶(C)、尿嘧啶(U)及胸腺嘧啶(T)3種。DNA含胸腺嘧啶,RNA含尿嘧啶。
二、核苷與核苷酸
用核酸酶水解核酸可得到核苷酸,核苷酸經(jīng)核苷酸酶水解又產(chǎn)生核苷和磷酸。核苷酸為核酸的組成單位,核苷和磷酸是組成核苷酸的基本物質(zhì)。
圖4-1 核酸、核苷酸的化學(xué)組成
1核苷
核苷是由嘧啶和嘌呤與核糖或脫氧核糖相連組成的,嘌呤核苷是第9位氮與核糖或脫氧核糖第1′位碳相連,嘧啶核苷則由嘧啶第1位氮與糖第1′位碳相連。天然的核酸中只有5′-核糖磷酸。
表4-3 核苷的類別
2核苷酸
核苷酸是核苷的磷酸酯,由嘌呤堿或嘧啶堿、核糖或脫氧核糖和磷酸所組成。含核糖的核苷酸稱核(糖核)苷酸,含脫氧核糖的核苷酸稱脫氧核(糖核)苷酸。
表4-4 核苷酸的類別
(1)核苷酸的結(jié)構(gòu)
核苷酸分子中糖基與磷酸基的連接方式為核糖基的第2′、3′和5′碳位上的自由羥基,分別與磷酸連接可生成3種核糖-磷酸酯異構(gòu)體。
此外還有環(huán)式結(jié)構(gòu)如環(huán)腺苷酸(cAMP)和環(huán)鳥苷酸(cGMP)。
(2)核苷酸的性質(zhì)
①一般物理性質(zhì)
核苷酸為無色粉末或結(jié)晶,易溶于水,不溶于有機(jī)溶劑,具有旋光性,在酸性溶液中不穩(wěn)定,在中性及堿性溶液中很穩(wěn)定。
②互變異構(gòu)現(xiàn)象
凡堿基上有酮基的核苷酸都有酮式和烯醇式的互變異構(gòu)現(xiàn)象。酮式和烯醇式兩種互變異構(gòu)體常同時(shí)存在,并處于一定的平衡狀態(tài)。在體內(nèi)核酸結(jié)構(gòu)中酮式占優(yōu)勢(shì),這對(duì)于核酸分子中氫鍵的形成是很重要的。
③紫外吸收
由于嘌呤堿和嘧啶堿具有共軛雙鍵,所以堿基、核苷及核苷酸在260nm附近有最大吸收峰。
④核苷酸的兩性解離和等電點(diǎn)
核苷酸分子既含磷酸基,又含堿基,是兩性電解質(zhì),有等電點(diǎn)。
(3)核苷酸重要的衍生物
①ATP類的高能磷酸化合物:核苷二磷酸和核苷三磷酸。
②輔酶核苷酸:如尿苷-5′-二磷酸葡糖(UDPG)在代謝中作為輔酶以供給葡萄糖;煙酰胺核苷酸、黃素腺嘌呤二核苷酸和輔酶A等都參加氧化還原和其他代謝。
③核苷多磷酸和寡核苷多磷酸類化合物。
三、DNA的結(jié)構(gòu)
1DNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)
DNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)是指DNA分子中核苷酸之間的連接方式和核苷酸的序列。
(1)DNA分子中核苷酸之間的連接方式
核苷酸的連接方式是由一個(gè)核苷酸脫氧核糖第5′的磷酸與另一核苷酸脫氧核糖第3′位的-OH相連成3′,5′-磷酸二酯鍵,沒有支鏈。核苷酸鏈堿基的順序是5′→3′。
(2)與DNA結(jié)構(gòu)研究有關(guān)的工具酶
與DNA研究有關(guān)的工具酶如表4-5所示。
表4-5 與DNA研究有關(guān)的工具酶
(3)DNA分子中核苷酸的序列
①化學(xué)斷裂法
化學(xué)斷裂法利用一種多核苷酸激酶在被測DNA樣品的5′端羥基上標(biāo)記32P,然后根據(jù)堿基所在位置分為G、G+A、T+C和C 4組,采用不同專一性試劑修飾堿基,使每組樣品在其特定堿基位斷裂,即得長度不同的核苷酸片段。
②鏈終止法
鏈終止法又稱雙脫氧法或酶法,是用2′,3′-雙脫氧核苷三磷酸(2′,3′-ddNTP)為核苷酸鏈合成的抑制劑,根據(jù)DNA復(fù)制原理制備各種核苷酸片段。從互補(bǔ)鏈的核苷酸序列,即可推知被測核酸的核苷酸序列。
③DNA測序的新方法
DNA雜交法(sequencing by hybridization,SBH)、MALDI-TOF質(zhì)譜法、掃描隧道顯微鏡(scanning tunneling microscope,STM)和原子力顯微鏡(atomic force microscope,AFM)。
2DNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)——雙螺旋結(jié)構(gòu)
通過用X射線衍射法研究DNA,Watson與Crick提出了DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)模型。
大多數(shù)天然DNA是雙鏈DNA,也有單鏈、三鏈和四鏈的DNA。
(1)DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)
雙螺旋結(jié)構(gòu)式DNA的經(jīng)典模型結(jié)構(gòu),DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)模型結(jié)構(gòu)的下列特點(diǎn):
①兩條反向平行的多核苷酸鏈形成右手雙螺旋,它們平行地圍繞同一個(gè)中心軸盤繞。
②DNA的兩條多核苷酸鏈之間有兩條螺旋形的凹槽,一條深而且寬,稱為大溝,另一條淺而且窄,稱為小溝。這些溝對(duì)DNA和蛋白質(zhì)的相互識(shí)別是很重要的。
③堿基位于螺旋的內(nèi)部,脫氧核糖和磷酸位于螺旋的外側(cè),它們組成多核苷酸鏈的骨架。
④雙螺旋的直徑是2nm,兩個(gè)相鄰的堿基對(duì)之間的距離為0.34nm,每10個(gè)核苷酸形成螺旋的一轉(zhuǎn)。
⑤兩條多核苷酸鏈由堿基對(duì)之間的氫鍵相連,A與T配對(duì)形成兩個(gè)氫鍵;G與C配對(duì)形成三個(gè)氫鍵。這種堿基之間的配對(duì)關(guān)系稱作堿基互補(bǔ)。
⑥堿基互補(bǔ)具有重要的生物學(xué)意義,它是DNA復(fù)制、轉(zhuǎn)錄和逆轉(zhuǎn)錄等的分子基礎(chǔ)。
(2)DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性
DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)很穩(wěn)定的,穩(wěn)定DNA結(jié)構(gòu)的主要有3種作用力。包括:
①氫鍵
A與T相配對(duì),形成2個(gè)氫鍵;G與C相配對(duì),形成3個(gè)氫鍵;G與C配對(duì)更穩(wěn)定,DNA結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性與G+C的百分含量成正比。
②堿基堆積力
堿基形狀扁平,疏水,分布于螺旋的內(nèi)側(cè),大量鄰近堿基對(duì)的堆積,使其內(nèi)部形成一個(gè)強(qiáng)大的疏水區(qū),與介質(zhì)的水分子隔開,這種現(xiàn)象稱疏水作用。
③離子鍵
磷酸基上的負(fù)電荷與介質(zhì)中陽離子之間形成的離子鍵,可以有效地屏蔽磷酸基之間的靜電斥力。
(3)DNA雙螺旋的種類
①右手螺旋DNA
用X射線衍射分析研究DNA結(jié)構(gòu)時(shí),因DNA鈉鹽纖維樣品相對(duì)濕度或鹽的種類等條件不同,雙螺旋結(jié)構(gòu)的特征也不相同,通常用A、B、C 3種類型,均為右手螺旋。
表4-6 不同類型右手DNA雙螺旋比較
②左手螺旋DNA
左手螺旋DNA分子中磷原子的走向?yàn)殇忼X形,因而被稱為Z-DNA。其結(jié)構(gòu)特點(diǎn)為:
a.左手螺旋DNA分子中每12個(gè)核苷酸組成一個(gè)左手螺旋,比右手螺旋DNA的直徑略細(xì)。
b.堿基對(duì)偏離螺旋軸心而比較靠近螺旋分子外表,呈現(xiàn)堿基比較暴露的狀態(tài)。
c.小溝深窄,大溝平坦而不明顯。
d.Z-DNA中的鳥嘌呤為順式,核糖的C-3′外露,而右手螺旋DNA分子中的鳥嘌呤為反式,核糖C-2′為外露。
(4)DNA的三鏈結(jié)構(gòu)和四鏈結(jié)構(gòu)
①三鏈DNA
三螺旋DNA是在雙螺旋DNA的大溝中插入第三條鏈,從而形成三股螺旋,有Py型和Pu型兩種類型。
②四鏈DNA
X射線衍射和核磁共振的研究表明,合成序列(T/A)m Gn(m=1~4,n=1~8)的單鏈DNA中4個(gè)鳥嘌呤可通過Hoogsteen堿基配對(duì),形成分子內(nèi)或分子間的四螺旋結(jié)構(gòu),其基本結(jié)構(gòu)單元是鳥嘌呤四聯(lián)體。
3DNA的三級(jí)結(jié)構(gòu)
DNA的三級(jí)結(jié)構(gòu)是在二級(jí)結(jié)構(gòu)上進(jìn)一步扭曲、折疊而形成。
(1)超螺旋結(jié)構(gòu)
環(huán)狀DNA分子的雙螺旋多轉(zhuǎn)幾圈后產(chǎn)生額外張力使DNA內(nèi)部使原子的位置重排,DNA發(fā)生扭曲,這種DNA雙螺旋的扭曲為超螺旋。
雙鏈環(huán)狀DNA可形成共價(jià)閉環(huán)DNA的超螺旋結(jié)構(gòu)和開環(huán)DNA等三級(jí)結(jié)構(gòu),其中超螺旋是DNA三級(jí)結(jié)構(gòu)的一種最常見形式。
(2)超螺旋的分類
①負(fù)超螺旋
放松DNA雙螺旋形成的超螺旋為負(fù)超螺旋,自然界存在的超螺旋DNA分子絕大多數(shù)是負(fù)超螺旋,負(fù)超螺旋有利于DNA的解鏈,在DNA的復(fù)制和轉(zhuǎn)錄中具有重要意義。
②正超螺旋
旋緊DNA雙螺旋形成的超螺旋為正超螺旋。
4真核細(xì)胞染色體DNA的結(jié)構(gòu)的特點(diǎn)
真核生物形成高度有序和高度致密的結(jié)構(gòu)——染色體。
(1)有重復(fù)序列
真核細(xì)胞染色體DNA中有許多重復(fù)出現(xiàn)的核苷酸序列,為重復(fù)序列。除酵母以外的真核細(xì)胞都有重復(fù)序列,原核細(xì)胞中不存在重復(fù)序列。根據(jù)重復(fù)出現(xiàn)的次數(shù)不同,分為高度重復(fù)序列、中度重復(fù)序列和單一序列。
①高度重復(fù)序列
高度重復(fù)序列是指在整個(gè)基因組中重復(fù)的次數(shù)很高,大于105的重復(fù)序列,對(duì)維持染色體的結(jié)構(gòu)有關(guān)。
②中度重復(fù)序列
中度重復(fù)序列在整個(gè)基因組中重復(fù)次數(shù)為10~105。中度重復(fù)序列的DNA通常作為基因用,如rRNA基因、tRNA基因、組蛋白基因和免疫球蛋白基因等都屬于中度重復(fù)序列。
③單一序列
單一序列,又稱單拷貝基因,是指在整個(gè)基因組中只出現(xiàn)1次或少數(shù)幾次的序列。單一序列是作為基因用,絕大多數(shù)編碼蛋白質(zhì)(如血紅蛋白、卵清蛋白和絲心蛋白等)或酶的結(jié)構(gòu)基因?qū)儆趩我恍蛄小?/p>
(2)回文序列
回文序列又稱反向重復(fù)序列,回文序列變性和復(fù)性后可形成十字形結(jié)構(gòu)或發(fā)夾結(jié)構(gòu),原核細(xì)胞和真核細(xì)胞中均有,與DNA和蛋白質(zhì)之間的識(shí)別有關(guān)。
四、RNA的結(jié)構(gòu)
表4-7 mRNA、tRNA和rRNA的結(jié)構(gòu)
1RNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)
(1)RNA分子中核苷酸之間的連接方式
RNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)指核苷酸之間的連接方式和核苷酸的序列。RNA分子中核苷酸之間的連接方式是通過3′,5′-磷酸二酯鍵相連,形成有一個(gè)5′端和一個(gè)3′端的無支鏈RNA長鏈結(jié)構(gòu)。
(2)RNA分子中核苷酸的序列
常用的RNA分子中核苷酸的序列測定方法有:
①用專一性核糖核酸酶裂解RNA
用各種堿基專一的核糖核酸酶分別將RNA部分水解,得到長度不一的核苷酸片段,經(jīng)變性聚丙烯酰胺凝膠電泳,放射自顯影后即可讀出RNA的序列。
②用化學(xué)試劑裂解RNA
同DNA序列測定的化學(xué)斷裂法。
③逆轉(zhuǎn)錄成cDNA
先用逆轉(zhuǎn)錄酶(又稱RNA指導(dǎo)的DNA多聚酶),將被測RNA逆轉(zhuǎn)錄為互補(bǔ)DNA(cDNA),然后按照測DNA序列的化學(xué)斷裂法或鏈終止法進(jìn)行序列測定的。
(3)降解RNA的核酸酶
降解RNA的核酸酶稱核糖核酸酶,這是一類水解RNA的酶。常見的具有專一性的有RNaseⅠ和RNaseT1。非專一性核酸酶類如蛇毒磷酸二酯酶和牛脾磷酸二酯酶。專一性核糖核酸酶RNaseⅠ和RNaseT1的功能如表4-8所示:
表4-8 RNaseⅠ和RNaseT1的功能特性
(4)RNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)
①tRNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)
tRNA為單鏈多聚核苷酸,核苷酸之間以3′,5′磷酸二酯鍵相連。主要結(jié)構(gòu)特點(diǎn)有:
a.相對(duì)分子質(zhì)量很小。
b.各種tRNA的鏈長很接近,一般在73~93個(gè)核苷酸之間。
c.各種tRNA中約有20多個(gè)位置上的核苷酸是不變和半不變的。
d.各種tRNA的3′端都為CCA,這是接受氨基酸的一端;5′端大多數(shù)為pG,少數(shù)為pC。
e.tRNA含有較多的修飾成分。
②rRNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)
rRNA是指核糖體RNA,其一級(jí)結(jié)構(gòu)是由3′,5′-磷酸二酯鍵相連的多核苷酸核糖體,由大小兩個(gè)不同亞基組成。rRNA中修飾堿基的含量比tRNA少得多,但有甲基化核苷的存在。
③mRNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)
mRNA為單鏈多聚核苷酸,核苷酸之間以3′,5′磷酸二酯鍵相連。
a.mRNA種類多,分子量差異很大。
b.真核細(xì)胞mRNA為單順反子,有5′-非編碼區(qū)、3′-非編碼區(qū),中間的編碼區(qū)編碼一條多肽鏈。原核細(xì)胞mRNA為多順反子,一條mRNA有多個(gè)編碼區(qū)。
c.真核細(xì)胞mRNA5′端有一個(gè)帽子結(jié)構(gòu),可防止5′核酸外切酶的降解作用,同時(shí)有助于核糖體與mRNA的識(shí)別與結(jié)合。
d.大多數(shù)真核細(xì)胞mRNA 3′末端有poly(A)結(jié)構(gòu),與mRNA分子的穩(wěn)定性及運(yùn)輸有關(guān),原核細(xì)胞mRNA沒有poly(A)結(jié)構(gòu)。
2RNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)
大多數(shù)RNA分子鏈的許多區(qū)域自身發(fā)生回折。回折區(qū)內(nèi)的多核苷酸段呈螺旋結(jié)構(gòu)。由于鏈的回折配對(duì)的堿基之間形成氫鍵,不能配對(duì)的堿基形成突環(huán)。螺旋結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定因素主要也是堿基堆積力,其次才是氫鍵。
(1)tRNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)
tRNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)為三葉草形,由五部分構(gòu)成:氨基酸接受臂、DHU環(huán)、TψC環(huán)、可變環(huán)(或額外環(huán))、反密碼子環(huán)(圖4-2)。
①氨基酸接受臂由tRNA3′端和5′端附近的7對(duì)堿基所組成,3′端的CCA接受活化的氨基酸;
②二氫尿嘧啶環(huán):由8~12個(gè)核苷酸組成,具有兩個(gè)二氫尿嘧啶,與tRNA分子的其余部分相連。
③反密碼環(huán)具有反密碼子。
④Tψc臂與一個(gè)含有TψC序列的環(huán)和一個(gè)可變環(huán)(或稱額外環(huán))相連;
⑤額外環(huán),又稱可變環(huán),位于TψC環(huán)和反密碼環(huán)之間,其大小往往是tRNA分類的重要指標(biāo)。
圖4-2 酵母丙氨酸t(yī)RNA(tRNAAla)的三葉草形二級(jí)結(jié)構(gòu)
(2)rRNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)
rRNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)亦為三葉形。
(3)mRNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)
mRNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)也是通過單鏈自身回折而形成莖-環(huán)結(jié)構(gòu)。
3RNA的三級(jí)結(jié)構(gòu)
tRNA的三級(jí)結(jié)構(gòu)為倒L形。
五、核酸的性質(zhì)
1性狀和溶解度
DNA為白色纖維狀固體,RNA為白色粉末,微溶于水,鈉鹽溶解度較大。不溶于一般有機(jī)溶劑,可用乙醇和異丙醇沉淀核酸。
2分子大小
DNA和RNA分子量都很大,但DNA的分子量比RNA的更大,在1.6×106~2.2×109之間。DNA分子大多數(shù)是不對(duì)稱的。
3酸堿性質(zhì)
核酸分子中含有磷酸基和堿基,磷酸基可解離放出H+,堿基可接受H+,具有酸堿性質(zhì)。由于磷酸基的酸性較強(qiáng),所以其等電點(diǎn)較低。RNA的等電點(diǎn)為pH 2.0~2.5,而DNA的等電點(diǎn)在pH4~4.5范圍內(nèi)。
4紫外吸收特征
(1)嘌呤和嘧啶都含有共軛雙鍵,因此堿基、核苷、核苷酸、核酸都具有紫外吸收特性,最大吸收值在260nm附近。
(2)A260=1.0相當(dāng)于50μg/ml雙鏈DNA,40μg/ml單鏈或RNA以及20μg/ml寡核苷酸。
(3)利用A260/A280可以判斷核酸樣品的純度,純DNA樣品A260/A280為1.8,純RNA為2.0。
5核酸的變性及復(fù)性
(1)DNA變性
①DNA變性定義
DNA變性是指DNA雙鏈互補(bǔ)堿基對(duì)之間的氫鍵在某些理化因素(溫度、pH、離子強(qiáng)度等)作用下發(fā)生斷裂,使雙鏈DNA解離為單鏈的現(xiàn)象。
②熔解溫度(Tm)
a.溶解溫度的定義
熔解溫度又稱DNA的解鏈溫度,是指在解鏈過程中,DNA雙螺旋失去一半時(shí)的溫度。
b.Tm值可作為衡量DNA樣品均一性的標(biāo)準(zhǔn)。
c.DNA的Tm值與其DNA長短以及堿基的GC含量相關(guān)。GC的含量越高,Tm值越高,其經(jīng)驗(yàn)公式為:(G+C)%=(Tm-69.3)×2.44。
d.溶液的離子強(qiáng)度越高,Tm值越高,反之則相反。因此,DNA制品應(yīng)保存在較高濃度的溶液中,常保存在1 mol/L NaCl溶液中。
③DNA的增色效應(yīng)
DNA的增色效應(yīng)是指在DNA解鏈過程中,由于有更多的共軛雙鍵得以暴露,DNA在260nm處的吸光度隨之增加的現(xiàn)象,是監(jiān)測DNA雙鏈?zhǔn)欠癜l(fā)生變性的最常用的指標(biāo)。
(2)DNA復(fù)性
①復(fù)性的定義
復(fù)性是指兩條解離的互補(bǔ)鏈在變性條件緩慢地除去后可重新配對(duì),恢復(fù)原來的雙螺旋結(jié)構(gòu)的現(xiàn)象。
②復(fù)性的制約因素
a.DNA濃度較高時(shí),兩條互補(bǔ)鏈彼此相碰的機(jī)會(huì)增加,易于復(fù)性。
b.因加熱變性的DNA,當(dāng)溫度超過Tm后,即迅速冷卻到低溫時(shí),不能復(fù)性,可以用來保持DNA變性狀態(tài)。但當(dāng)溶液維持在Tm以下的較高溫度時(shí),則可能復(fù)性,一般比Tm低25℃左右時(shí)最佳。
c.DNA片段的大小也影響其復(fù)性的速度,大的線狀單鏈,其擴(kuò)散速度慢,碰撞機(jī)會(huì)小。
(3)雜交
來源不同具有互補(bǔ)堿基序列的多核苷酸片段在溶液中冷卻時(shí)可以再形成雙螺旋結(jié)構(gòu),稱為雜交作用。其基本原理是利用硝酸纖維素濾膜能牢固地結(jié)合單鏈核酸,而不能結(jié)合雙鏈DNA或雙鏈RNA。
①Southern印跡法,也稱DNA印跡法,是指通過將待測的單鏈DNA轉(zhuǎn)移并固定到特定的膜上并用標(biāo)記的探針進(jìn)行雜交,是檢測目的基因的一種分子雜交技術(shù)。具體方法步驟如圖4-3所示。
圖4-3 DNA印跡法步驟
②Northern印跡法,又稱RNA印跡法,是將變性RNA轉(zhuǎn)移到硝酸纖維素膜上,與放射性同位素標(biāo)記的RNA或與單鏈DNA探針進(jìn)行雜交的方法。
③Western印跡法,又稱蛋白質(zhì)印跡法,是根據(jù)抗體與抗原可以結(jié)合的原理,分析蛋白質(zhì)的方法。
6沉降
沉降是指在超離心機(jī)的離心力作用下,核酸分子下沉的現(xiàn)象。沉降DNA時(shí)常用氯化銫作介質(zhì)。DNA的浮力密度與DNA分子構(gòu)象有密切關(guān)系。經(jīng)沉降后的分布圖如圖4-4所示。
圖4-4 DNA的沉降
六、核酸的生物功能和實(shí)踐意義
核酸是基本遺傳物質(zhì),在蛋白質(zhì)的生物合成上占有重要位置,在個(gè)體的生長、生殖、遺傳、變異和轉(zhuǎn)化等一系列生命現(xiàn)象中起決定性作用
1DNA的生物功能
(1)DNA是基本的遺傳物質(zhì)
DNA主要存在于細(xì)胞核內(nèi),是染色體的主要成分,DNA是生物遺傳的主要物質(zhì)基礎(chǔ),是基因的基礎(chǔ)化學(xué)物質(zhì)。在遺傳過程中DNA的具體作用有兩方面。
①在細(xì)胞分裂時(shí)按照自己的結(jié)構(gòu)精確復(fù)制傳給子代。
②作為模板將所儲(chǔ)遺傳信息傳給mRNA。
細(xì)菌的轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn)第一次直接證明了DNA是遺傳物質(zhì),噬菌體感染實(shí)驗(yàn),又一次直接證明了具有遺傳作用的是DNA而不是蛋白質(zhì)。
(2)DNA與變異
①基因突變的定義
基因突變是由于DNA堿基對(duì)的置換、增添或缺失而引起的基因結(jié)構(gòu)的變化。
②基因突變的類型
按基因結(jié)構(gòu)改變的類型可分為堿基置換和移碼突變。基因突變的類型和機(jī)制如表4-9所示.
表4-9 基因突變的類型及機(jī)制
(3)DNA與病變
①DNA與遺傳性疾病
遺傳性疾病又稱先天性疾病,是由于遺傳缺陷而產(chǎn)生的,即是DNA結(jié)構(gòu)改變的結(jié)果。如血紅蛋白鏈中的谷氨酸密碼子發(fā)生突變變成纈氨酸導(dǎo)致鐮刀狀貧血病的發(fā)生,缺乏產(chǎn)生促黑素生成的酪氨酸酶的基因引起白化病。
②DNA與癌變
DNA與癌變的關(guān)系十分復(fù)雜,某些物理或化學(xué)因素導(dǎo)致DNA結(jié)構(gòu)改變,形成了一種變異的癌細(xì)胞的DNA,這種變異的DNA生物體不能修復(fù),最后會(huì)導(dǎo)致癌癥。
(4)克隆與克隆化
克隆是指由單一親代細(xì)胞用無性繁殖產(chǎn)生的子代細(xì)胞。形成克隆的過程稱克隆化。利用克隆技術(shù)可使新引入的基因擴(kuò)大化,產(chǎn)生大量DNA、單克隆抗體和某些稀有蛋白質(zhì)。克隆技術(shù)在基因工程和免疫學(xué)上有著重要作用。
2RNA的生物功能
(1)RNA與蛋白質(zhì)的生物合成
①RNA的功能和特性
3種RNA(mRNA、tRNA和rRNA)都參與了蛋白質(zhì)的生物合成。RNA可通過參與蛋白質(zhì)的合成、中心法則和逆轉(zhuǎn)錄過程傳遞遺傳信息。具體的功能如表4-10所示。
表4-10 mRNA、tRNA和rRNA參與蛋白質(zhì)合成的功能特性
②遺傳密碼
a.密碼子
密碼子,又稱三聯(lián)體密碼,是mRNA上3個(gè)相鄰的核苷酸序列,一個(gè)密碼子就代表一種氨基酸。共有64個(gè)密碼子,AUG稱為起始密碼子,UAA、UAG、UGA 3個(gè)密碼子為終止密碼子,不編碼任何氨基酸,只作為肽鏈合成終止的信號(hào)。
b.反密碼子
反密碼子是tRNA上與mRNA密碼子結(jié)合的特殊堿基三聯(lián)體。密碼子與反密碼子作用示意圖如圖4-6所示。
圖4-5 密碼子和反密碼子的關(guān)系
(2)RNA與遺傳
部分病毒以RNA作為遺傳物質(zhì)。
(3)RNA在傳遞遺傳信息上的作用
①mRNA是蛋白質(zhì)合成的模板。
②tRNA是氨基酸的運(yùn)載工具及蛋白質(zhì)生物合成的適配器。
③rRNA是核糖體的主要成分,是翻譯工作的場所。
④遺傳信息從DNA轉(zhuǎn)錄到mRNA,從mRNA翻譯為蛋白質(zhì)的遺傳信息傳遞過程稱為中心法則。逆轉(zhuǎn)錄現(xiàn)象的發(fā)現(xiàn)證明遺傳信息也可以從RNA逆轉(zhuǎn)錄到DNA,這一現(xiàn)象豐富了中心法則。
3核酸與病毒
(1)病毒是含DNA或RNA的核蛋白,結(jié)構(gòu)以核酸為中心,外包以保護(hù)性蛋白質(zhì)外殼,主要成分為糖蛋白。病毒一般為棒狀和球狀,有無定形者,病毒RNA一般為發(fā)夾形。
(2)可分為DNA病毒和RNA病毒兩大類。
常見的DNA病毒有:牛痘病毒、T4噬菌體。
RNA病毒有:煙草花葉病毒(TMV)、小兒麻痹病毒、流行感冒病毒、呼吸道及腸道病毒。
4核酸及其水解產(chǎn)物在人類生活上的實(shí)踐意義
目前,人類已利用核酸的水解物,如腺苷三磷酸(ATP)、肌苷酸(5-IMP)、環(huán)腺苷酸(cAMP)以及核酸水解后的核苷酸混合物等,已應(yīng)用于醫(yī)學(xué)(如ATP、cAMP、核酸水解物“核酪”)、工業(yè)(5-IMP用作增鮮劑)和農(nóng)業(yè)(核酸水解物用作農(nóng)作物的增產(chǎn))等各方面。
七、核酸的分離、合成和鑒定原理
核酸分離和純化的原則:DNA要注意保持分子完整性,RNA注意盡可能完全抑制RNA酶的活性。
1DNA的分離純化
DNA的分離純化步驟:將細(xì)胞破碎,提取DNA,然后用苯酚或氯仿等除去蛋白質(zhì),用2倍體積的乙醇沉淀DNA,得纖維狀DNA。用RNA酶除去RNA,再去多糖等雜質(zhì),得較純的DNA。最后用柱層析或密度梯度離心等方法純化,最終得到純的DNA。
2RNA的分離純化
RNA的提取可采用苯酚提取法,破碎細(xì)胞做成勻漿時(shí),直接加入含水苯酚,使含水苯酚與勻漿一起振蕩,然后離心。上層水相含RNA和多糖,取出水層,加入2倍體積的乙醇使RNA沉淀,再進(jìn)一步純化。
3合成
人工合成核酸的方法有兩類,一類是酶促合成法,另一類是化學(xué)合成法。酶促合成法主要是利用核苷酸磷酸化酶或有關(guān)專一性核酸聚合酶合成DNA或RNA。
4鑒定和含量測定
(1)核酸的鑒定
①RNA的鑒定方法
濃鹽酸和苔黑酚(3,5-二羥甲苯)與RNA反應(yīng)生成綠色物質(zhì),可以鑒定RNA,也可以在670nm測吸光度,通過標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算RNA的含量。
②DNA的鑒定方法
DNA在酸性條件(冰醋酸和少量濃硫酸)下與二苯胺反應(yīng)生成藍(lán)色物質(zhì),可以鑒定DNA,也可以在595nm測吸光度,通過標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算DNA的含量。
(2)核酸含量的鑒定
①根據(jù)磷元素的含量測定
RNA中含磷量為9.0%,DNA中含磷量為9.2%,因此可以根據(jù)磷元素的含量計(jì)算DNA和RNA的含量。含磷量的測定是用濃硫酸將核酸消化,使其有機(jī)磷變成無機(jī)磷,然后與鉬酸銨定磷試劑作用,生成藍(lán)色的鉬藍(lán)。在一定濃度范圍內(nèi),藍(lán)色的深淺和磷含量成正比,可在660nm比色測定。從磷的標(biāo)準(zhǔn)曲線可知樣品中磷的含量,從而求出核酸的含量。
②根據(jù)核糖和核脫氧核糖的含量測定
DNA與二苯胺反應(yīng)生成藍(lán)色物質(zhì),RNA與苔黑酚反應(yīng)生成綠色物質(zhì),再利用比色法計(jì)算DNA和RNA的含量。
③紫外吸收法
實(shí)驗(yàn)室中常見的是測量核酸在260nm和280nm的吸光度(A值),從A260/A280的比值可判斷樣品的純度。
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