蔣介石經過一番分析，認為“定都武漢”有兩個風險：其一，唐生智。唐生智曾是湖南軍閥趙恒惕部第四師的師長，后來他歸順了北伐革命軍。但是此人驍勇善戰、處事果斷，不到一年的時間，自己的部隊已經擁有了十個師的兵力，且武器裝備精良，精神狀態好。而此時的唐生智又得到了共產黨和國民黨左派（皆為蔣介石死敵）的支持，讓蔣介石變得憂心忡忡。其二，武漢地區，工農運動高漲，不利于老蔣反共準備。尤其是武漢的工人力量一舉收回了漢口的英租界，震驚了世界。蔣介石經過權衡，必須堅決反對“定都武漢”，才能守住自己的革命果實。
在此期間，經陳果夫的介紹，另一位國民黨高參、號稱國民黨“文膽”的陳布雷加入了國民黨，后來成為中統的“影子領袖”。隨著一個又一個厲害角色的加入，CC系已經初露端倪。
此時的陳立夫已經不是那個懷揣“工礦夢想”的陳立夫，儼然已經成為一個政客，就連他的每個舉動都帶著政治色彩。后來他伙同自己的哥哥陳果夫上奏折，蔣介石再次動了心，他向陳立夫交代：“立夫啊，事情就交給你了，千萬不要讓我失望！”陳立夫也隨即發誓，決心替蔣介石解除另一塊“心病”。從某種程度上看，陳立夫是蔣介石的“心理醫生”，關鍵時候總能施展醫術。
于是蔣介石讓陳立夫聯系張靜江、張群、譚延闿等人來南昌，順便截留了一些準備去武漢的國民黨黨中央的執監委員和國民政府委員，準備召開國民黨中央政治會議第六次臨時會議（注意，只是臨時的），非法決定中央黨部和國民政府遷至南昌。蔣介石為此可謂處心積慮，他還親自跑到武漢游說：“革命時機尚不成熟，南昌更是適合作為黨政府的首都！”
沒想到蔣介石一個人的反對聲實在太小，被迅速淹沒在歷史潮流中。蔣介石不信“胳膊擰不過大腿”的道理，非要借機攪和攪和。而此時的陳立夫、陳果夫兄弟倆在蔣介石身邊解釋：“校長，其實定都武漢是大勢所趨啊……與南昌相比，武漢的革命氣氛更濃，而且地理位置更加重要。至于經濟，南昌更無可比性！所以我們要開辟新的地方……”
蔣介石：“開辟新的地方？你說去哪？”
陳立夫：“經濟是革命的后盾，凡事離不開錢。其次是政治氛圍，沒有擁護黨的氛圍，也是瞎忙活！”
蔣介石：“那好吧，你抽空去上海看看吧！”
1927年的3月，在漢口召開了國民黨中央執行委員會二屆三中全會，一致通過了《統一黨的領導機關案》、《軍事委員會組織大綱》、《國民革命軍總司令條例》、《撤銷中央軍人部案》等，大大縮小了蔣介石的黨政軍權力。此時的蔣介石不但沒有達到自己的目的，反倒暴露了“反革命”的真面目。
后來蔣介石以“退席二屆三中全會”為幌子打探自己的黨內地位，沒想到遭到各個黨代表的痛斥。甚至連申訴、還口的能力都沒有。一時間，蔣介石成了“人民公敵”，被眾家討伐。二屆三中全會結束后，“打倒蔣介石”的口號已經此起彼伏。蔣介石終于坐不住了，他重重地拍桌子，氣得臉色發紅。
遷都之爭沒有成功，但是陳立夫的赤誠忠心則完全打動了蔣介石。不管自己主子境遇如何，陳立夫一直忠心耿耿，不離不棄。不過后來，蔣介石費盡心思取代了譚平山，當上組織部部長，而毛澤東、林伯渠等共產黨人則紛紛被剝奪了職務，如此一來，共產黨已經被蔣介石完全排除掉了。而陳立夫和陳果夫也開始大張旗鼓地利用自己的身份，在各地區發展國民黨右派，在發展壯大自己的政治力量的同時，開始為另一個更加陰險的陰謀做準備。
5.九江、安慶事件
1927年是不平凡的一年，這一年發生的大事件太多了。陳立夫在1927年又有怎樣的表現呢？這一年，陳立夫有一個重要任務，那就是“清黨”！所謂“清黨”，就是清除黨內異派。遷都失敗之后，蔣介石一直在謀求新的方式同汪精衛等人斗爭。既然露出了狐貍尾巴，那就干脆摘掉面具，名正言順當個反派。1927年的春天，驚蟄剛過，蔣介石終于開始自己的行動。當然這個清黨，主要指的是“反蔣”派別，不僅僅是共產黨，還有國民黨左派和支持三民主義的民主人士等。正是因為清黨，陳立夫錯殺、濫殺無數革命黨員，在自己的人生簿上留下極不光彩的一筆。
清黨運動最大的特點就是：殘忍、血腥！采用武力殘酷排斥異己，一時間中國的上空籠罩了一層白色陰影。清黨開始的標志為“四一二”反革命政變。但是在謀劃“四一二”之前，殘酷的清黨運動已經秘密開始了。
1927年的2月21日，蔣介石在南昌召開了所謂的“政治會議”，與陳果夫、陳立夫以及溫建剛等人預謀，達成了一致共識。其一，全面奪取各地政權。其二，加緊準備與武漢破裂的所有條件。正是這次會議的召開，南昌所在地江西省的共產黨和國民黨左派力量幾乎被瓦解，成了蔣介石的反革命老巢。毛主席說過：槍桿子里出政權！其實蔣介石也知道這個道理。于是清黨的第一大目的就是搶奪各地軍權，其次才是黨政。對于清黨運動，憎恨共產黨的陳果夫、陳立夫早已經按捺不住了。他們不僅支持，而且是想盡辦法支持。他們認為，想要徹底清掃干凈，就要逐級、逐層一點一點清洗（類似洗衣服，去除污漬死角）。
與此同時，1927年的3月15日，蔣介石離開南昌，于次日一早抵達九江。到達九江后，陳立夫立刻與當地一黑惡勢力“青洪幫”接上了頭，為搗毀“左派黨部”做準備。有錢能使鬼推磨……陳立夫摟著青洪幫頭頭的肩膀頭子去了一家高檔飯店，宴會上便行賄青洪幫。陳立夫說：“校長是北伐軍的總司令，手里有錢也有權。以后打下江山，如果兄弟們支持他，他一定不會忘了你們！所以我要讓兄弟們幫幾個忙……”
陳立夫讓這群爪牙干了些什么事情呢？第一，散布謠言，說共產黨、左派是反革命分子，圖謀不軌。其二，打上標語旗號：總司令萬歲，打倒一切赤化分子！其三，為蔣介石的清洗壯膽。其四，作為先頭部隊，參與清黨、奪取政權的行動。蔣介石聽到陳立夫的匯報，感到十分滿意。于是下指令：如有反抗者，殺無赦！
“九江事件”就這樣慢慢拉開帷幕——在金錢刺激下，一群青洪幫分子、流氓、無賴（烏合之眾）等等開始圍攻國民黨九江黨部和總工會，打死打傷許多人，一下子將國民黨九江黨部和總工會搗個稀爛。利用這次九江事件，蔣介石順利拿下了九江的政權，掃清了江西范圍內的障礙，為繼續北上做準備。但此次事件，陳立夫也背上了一個“自相殘殺”的罪名。因為九江事件被打死、打傷的多數是國民黨左派，陳立夫甚至犯了欺師滅祖之罪。可見陳立夫為了維護蔣介石的利益，可謂“大義滅親”，不擇手段！
九江事件之后，也就是1927年的3月20日，蔣介石的先頭部隊北伐軍總司令部特務處處長楊虎、副處長姚爵吾等人乘坐永蜀號軍艦來安慶打前站，隨后蔣介石也抵達安慶，而陳立夫則寸步不離，與蔣介石形影相吊。蔣介石到達安慶后發現安慶沒有歡迎的標語和口號，并且撿到一份傳單，傳單上寫：許多反革命勢力正在總司令部內醞釀，請總司令清除反黨分子！于是蔣介石大發雷霆：“到底怎么搞的？安徽人是不是在搞革命？如此一盤散沙如何保住革命果實？”
1927年的3月20日晚，蔣介石終于得到消息，安徽政府里有支持三民主義的國民黨左派和大量的共產黨。所以蔣介石又開始擔心起來，便問陳立夫有什么想法。
陳立夫反倒問起安徽人楊虎：“楊兄，你到底有什么想法？”
楊虎考慮自己是安徽人，所以有些猶豫，便說：“現在很難分清哪些是共黨，哪些是左派，很難下手清理。如果強行清理，豈不落下個不好的名聲？”
陳立夫見楊虎吞吞吐吐，便親自下決定：“什么分開不分開，只要是反對校長的，一律斬草除根！這事我說了算，你去準備準備吧！”
3月22日，蔣介石剛剛參加完國民黨安徽省第一次代表大會的開幕式，總政治部的命令就下來了，要求右派省總工會“停止職權，聽候審查”！但該工會委員長舒沛澄拒不執行命令，率眾會見蔣介石，要求明令保護他們。而此時恰逢左派光明甫、周松圃、朱蘊山等人前來向蔣介石匯報代表大會的開幕情況，沒想到早已無法淡定的舒沛澄（綽號舒老四，青幫分子，右派魯班閣安徽總會的領導人物）在其他右派分子金維系等人的煽動下，命令他人圍毆光明甫，光明甫被打得鼻青臉腫。聞訊趕來的郭沫若義正詞嚴地說：“右派破壞了中山先生的三大政策，是明明白白的反動……”沒等郭沫若說完，蔣介石便拍了桌子：“簡直是胡扯！我也是革命功臣，趕快把你的有色眼鏡摘掉！”蔣介石發完火，便要求郭沫若盡快將左右兩派合并。
到了晚上，蔣介石依舊十分氣憤，對陳立夫說：“安徽人就是和稀泥，在這里搞革命真麻煩！”
陳立夫勸蔣介石息怒：“校長，如果你嫌麻煩，就把事情交給我，我來處理！”
蔣介石拍了拍陳立夫的肩膀說：“立夫，辛苦你了！”
陳立夫得到進一步授權，并交代楊虎：“需要錢的地方盡管說，只要把這個事搞好，你的前途大大的！”于是陳立夫向蔣介石請示，撥了一筆款子。為了鼓勵青洪幫、流氓無賴們的積極性，采用了金錢懸賞政策。流氓們見有“殺人還能發大財”這等事，便興奮起來。他們手持大棒，迅速組成了一百多人的敢死隊。
“3·23”安慶事件在一場春雨中爆發了。右派省工會委員長舒沛澄及楊虎、劉文明等人帶領著大批青洪幫流氓分子開始沖擊安徽省國民黨（右派）黨部和（左派）省總工會。他們見人就砸，見文件就搶，符合“恐怖打雜事件”的一切標準。此次行動打傷共產黨、國民黨左派人士數十人，沿途也開始放起鞭炮慶祝。事件結束后，青幫流氓無賴們如愿領了紅包，蔣介石的“反革命之心”暴露無遺，而陳立夫也在九江、安慶事件中不遺余力、出謀劃策，成了蔣介石身邊最厲害的人物。