廈門大學(xué)臺(tái)灣研究所成立于1980年7月9日，是海內(nèi)外最早公開成立的臺(tái)灣研究學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)，2004年改制升格為臺(tái)灣研究院。本院下設(shè)政治、經(jīng)濟(jì)、歷史、文學(xué)、法律、兩岸關(guān)系六個(gè)學(xué)科導(dǎo)向的研究所，以及遵循“問題導(dǎo)向、特色鮮明、基礎(chǔ)雄厚、學(xué)科融合”原則設(shè)立的民進(jìn)黨研究中心、兩岸青年研究中心、大數(shù)據(jù)與民意調(diào)查研究中心等跨學(xué)科研究機(jī)構(gòu)和《臺(tái)灣研究集刊》編輯部、文獻(xiàn)信息中心、繼續(xù)教育中心、院辦公室等部門。本院現(xiàn)有政治學(xué)理論、國際關(guān)系、區(qū)域經(jīng)濟(jì)學(xué)、經(jīng)濟(jì)法學(xué)、中國史、中國現(xiàn)當(dāng)代文學(xué)、臺(tái)灣研究（交叉學(xué)科）等博士招生專業(yè)，以及中外政治制度、區(qū)域經(jīng)濟(jì)學(xué)、中國史、中國現(xiàn)當(dāng)代文學(xué)、憲法學(xué)與行政學(xué)、臺(tái)灣研究（交叉學(xué)科）等碩士招生專業(yè)，各博士專業(yè)方向均招收博士后，目前是大陸高校中最大的涉臺(tái)研究和涉臺(tái)事務(wù)高端人才培養(yǎng)基地。以臺(tái)灣研究院為依托的廈門大學(xué)臺(tái)灣研究中心，吸收廈門大學(xué)校內(nèi)臺(tái)灣研究學(xué)者和海內(nèi)外知名臺(tái)灣研究專家組成的重大項(xiàng)目攻關(guān)團(tuán)隊(duì)，積極發(fā)揮學(xué)術(shù)和智庫研究雙重作用，2000年12月入選“教育部人文社會(huì)科學(xué)重點(diǎn)研究基地”。臺(tái)灣研究院和臺(tái)灣研究中心均是國家級(jí)“2011計(jì)劃”兩岸關(guān)系和平發(fā)展協(xié)同創(chuàng)新中心和本單位建設(shè)培育國家高端智庫的基礎(chǔ)和核心力量，入選廈門大學(xué)“雙一流”重點(diǎn)建設(shè)學(xué)科群。