正月初七日（丙子），常青奏言：彰化賊匪林爽文等，攻占城池，先經臣派撥三路官兵赴剿。惟是調往官兵雖有六千，內水師提臣黃仕簡帶領本標及調取南澳、銅山等營守兵，共計二千數百名。其由閩安出口派赴淡北之官兵一千五百名，臣于十二月十三日，據淡水同知程峻之子程必大稟報，竹塹地方亦被賊人占踞，因飭領兵之海壇鎮總兵郝壯猷，相度情形，非于新莊堵御，即赴南路應援。而鹿耳為臺地咽喉，尤須厚集兵力，庶可近護郡城，遠赴攻剿。茲臣復添派督撫二標兵一千名，檄令原任閩安協副將徐鼎士帶領，由省城南臺口配船；又調福寧鎮并銅山、羅源等營兵一千名，檄令福寧右管游擊延山帶領，于福安縣白石口配船。俱從各該處出口，候風直渡過臺，經由鹿耳門進口，交與水師提臣黃仕簡，聽其調度；俾軍容益昭壯盛，賊匪克期殄滅。臣一面仍再于各營兵丁內，預為挑備，酌量機宜，隨時策應。

同日，浙江巡撫瑯玕奏言：臺灣賊匪滋事，先經督臣常青咨會，臣即飛咨提鎮各臣，并飭沿海各營及地方官嚴密防范，毋致匪徒內竄。再于接壤之江山縣起至嘉興府屬出境止，酌添腰站馬匹、驛夫，以速郵報。茲又準福建撫臣徐嗣曾咨會：于附近水師營內酌撥備戰兵二、三千名配齊器械，在交界本境駐扎，以便征發，亦可藉為聲援等因。查浙省溫州府地方，由海至閩省之廈門，最為捷近，自應于附近之水師營內酌派。現在飛咨提鎮各臣，即于提標同溫州、黃巖二鎮標所屬營內，共揀派練習兵三千名，配齊器械，攜帶糧餉，在于本境交界之處駐扎，以待征調。其應派將備帶領前往一切事宜，現咨提臣陳大用酌定具奏。臣仍檄飭溫處道陸瑗隨同鎮臣在彼彈壓。此等匪徒，均系一時烏合之眾，現當閩省官兵合剿，不日即可殲盡。其匪黨自必四散避遁，各海口均關緊要，臣已分委道府等官，酌派兵丁，實力盤查截拿，俾無竄逸。均奏入。

上命軍機大臣傳諭常青、黃仕簡、任承恩、徐嗣曾、瑯玕曰：從前剿捕朱一貴、黃教二案，調兵若干名，該督自有成案可查。今常青既令任承恩帶兵由鹿耳門前進，又復加調官兵陸續渡臺，并咨會粵東、浙江酌備戰兵，以資策應。臺灣常有糾眾不法之事，此次常青等何以張皇畏懼至此？徐嗣曾亦有移咨鄰省一體預備之舉。而瑯玕此奏，尚有主見，不至過于惶遽。著傳諭該督等，務宜鎮定妥辦，不可張大其事，使沿海民人心生恐懼，于地方大有關系。至常青摺內稱：『探得澎湖兵于十二月十四日到臺郡安平，林游擊亦帶兵赴援，現在賊勢稍退』等語。郡城防守嚴密，全臺根本尚不致有他虞。黃仕簡等，務須俟各路官兵到齊，約會日期，同時并力夾攻，自無難一舉蕆事，剿捕凈盡。常青、徐嗣曾、瑯玕，尤宜嚴飭沿海文武員弁，截拿逸回匪犯，毋使一名幸脫。

初八日（丁丑），常青奏言：前派赴淡官兵，因聞竹塹已被賊踞；旋又據巡檢王增錞稟報，于艋舺地方召募鄉勇人等設守，隨又密飭統兵之總兵官郝壯猷，相度情形，非于新莊抵御，即赴南路應援。今該撫臣又經派兵一千五百名前往，實為緊要得力。惟是臣續調之督撫二標兵一千名，已派令副將徐鼎士帶領；而撫臣所謂之督撫二標兵一千五百名，據稱亦派該副將帶領，實緣省城距泉相隔數百里，同時調派，以致關會不及。至查督撫兩標除派撥防守外，統計備戰兵四千四百名，現在派出之數，已共三千三百名，會垣重地，尚須駐兵留守。據撫臣札稱，復調上游之建寧、延平鎮營兵一千名來省，以備調遣。應俟該二處兵丁到省，即留于會城駐扎。其撫臣所調之督撫二標兵一千五百名，即令副將徐鼎士帶領，前赴北淡。臣隨改派在省之延平副將林天洛帶領臣續派督撫二標兵一千名，仍遵前奏，由省城南臺配船飛渡，經由鹿耳門進口，隨同水師提臣黃仕簡協力進剿。

同日徐嗣曾奏言：臣以淡水地方緊要，即將派備之省兵一千五百名，飭令閩安協副將徐鼎士、臣標游擊吳秀等統領，克日進發。連日接據蚶江通判陳惇、廈門同知劉嘉會稟報：『查訊鹿仔港回棹商船，鹿仔港亦有泉州、興化、廣東客民各用布書寫「義民」字樣，共相守護』等語。復準提臣黃仕簡，亦因王增錞稟報，咨會撥兵救援。臣現已雇備船只，添派督標都司朱龍章、獲水師營參將羅禮璋，隨同副將徐鼎士等，迅速領兵前赴。正在候風遄發，接準督臣來咨，于未接臣咨之先，督標撥兵六百名，臣標二營撥兵四百名，交副將徐鼎士統領，由閩安出口至鹿耳門協剿等因。查淡水、新莊等處，待援既急，而鹿耳門一路，誠如督臣籌酌，尤當厚集兵力。臣前摺奏明預調延建兵一千名，原以備督臣調遣之用，與督臣所調兵數，適相符合，應即飭令赴泉，聽候督臣派員統領，赴鹿耳門進剿。查廈門對渡鹿耳門，較之由閩安出口，更為便捷。臣飛札廈門速備船只，該兵到廈之日，即可飛渡。同日，浙江提督陳大用奏言：接準福建撫臣徐嗣曾咨會：『浙省水師兵內挑撥備戰兵二、三千名，前往交界處所，以備調遣。溫州、黃嚴二鎮各撥兵一千名，尚少一千名、于提標及所屬水師兵內酌量選撥。并將一切戰船軍械妥協料理』等因。臣隨選派標下右營兵五百名，附近之鎮海營兵五百名，共足三千名之數；委派署右營游擊俞世盛、左營游擊裴起鰲、馮揚、鎮海營參將白國梁、右營守備江得勝、署守備張殿魁，并千把外委三十員，于十二月三十日帶領起程，赴閩浙交界之平陽縣屬北關洋面處所，以為聲援。并即飛咨督臣常青，酌量調用。再查有溫州鎮總兵魏大斌、瑞安營副將詹殿擢，均由福建臺灣水師升補來浙，彼處情形，素所熟悉，隨派委該鎮將作為總領，統率前往。其溫州地方，界聯閩省，現飭樂清協副將李長庚前往彈壓稽查。至寧波沿海口隘，均關緊要，現在臣會同寧紹臺道印憲曾選派員弁，時刻留心稽察，分路查緝截拿。均奏入。

上命軍機大臣傳諭常青、徐嗣曾曰：總督統轄管制全省兵弁，凡有調遣，自當聽督臣主政。巡撫雖亦有封疆之責，不得稍存膜視；但調發兵弁，應札商督臣公同檄調。況無迫不及待之情形也。此乃國家體制，不可紊越。今徐嗣曾惟恐毫無調度、跡涉推諉，是以紛紛征發，以見留心努力；并咨會廣東、浙江等處，挑備戰兵，預資策應，使本省兵弁號令兩岐，事權不一；且省垣重地，自應多兵駐守，今輾轉更調，亦非慎重根本之道。該撫于此案初起時，尚能鎮定，其后何以冒昧若此？但究屬為地方起見，尚無大咎。亦不得因有此旨，過于畏葸，而置要務于不問。且督撫因此或致不睦，更于公事無益。徐嗣曾惟當與常青彼此和衷，籌酌機宜，協同妥辦，以期迅速蕆事。至該督等摺內所稱，鹿仔港等處有客民義民共相糾集，守護地方等語。該此商民等，激發公義，保護地方，甚屬可嘉！著該督撫俟事竣后，會同查明，分別獎勵。

初十日（己卯），上諭內閣曰：臺灣奸民林爽文等糾眾滋事一案，該督常青剿捕逆匪，一切調度堵御機宜，辦理尚屬鎮靜妥協。現在，水陸兩提督業經渡臺，會剿逆匪，自無難立時撲滅。惟是海疆重地，將來善后事宜，均須妥協籌辦。常青系初任總督，恐未能料理裕如，李侍堯久任封疆，雖于軍旅未嫻，而辦理地方事務，于輕重緩急機宜，較為熟練。李侍堯著調補閩浙總督，即馳驛前赴新任。湖廣系腹地省分，且地方寧謐無事，常青自能勝任，即著調補湖廣總督。俟李侍堯到閩接印后，常青即來京請訓，再行赴任。現在李侍堯自京啟程，常青到楚，往返尚需時日。李封年老，兼署督篆，恐精神未能周到。所有湖廣總督印務，著舒常馳驛前往署理，俟常青抵任后，再行回京。

臣等謹案林爽文糾眾滋擾，府城經該鎮道等保護無虞，淡水、鹿仔港等處，又有義民幫同守御，爾時兩提督渡臺，即可合兵痛剿；而督臣常青于一切調度機宜，尚無貽誤。我皇上先事預籌，以常青初任總督，恐未能料理裕如，特命李侍堯調任閩浙，委以內地諸務，令駐廈門，用資經畫。厥后，總兵郝壯猷失守鳳山，退回府城，而黃仕簡病中昏憒，人心未免驚慌，次日，常青即抵府城，郡治得以無慮，兵民咸獲安堵。若非圣主知人善任，算秉幾先，則鳳山一失，郡城必至失守，迥非常情所能窺測萬一也。

上又命軍機大臣傳諭常青、徐嗣曾曰：常青甫經摺用總督，即遇地方有此等案件，亦其年運所致，會逢其適。但伊于辦理此案，尚無不合。惟是事定后，一切善后要務，均須妥協籌辦。常青究系新任，恐未能料理裕如，李侍堯久任封圻，能知事體之緩急輕重，是以降旨將伊與常青對調。所降諭旨，俟李侍堯將次到閩時，再行發抄。若不然，該省一聞李侍堯來閩之信，常青必心疑獲咎，恐欽差查辦、意存畏懼，轉致驚惶失措，于事尤屬無益。常青接奉此旨，固不可因調任在即，于調度剿捕一切事宜，稍存觀望；尤不可稍露端倪，致地方文武員弁聞總督業經更換，各存弛懈之見，以致呼應不靈。并傳諭徐嗣曾一體慎密，諸事幫同常青實力妥辦。若稍有泄漏，致文武員弁聞知，常青遇事掣肘，朕必重治其罪，恐徐嗣曾不能當此重戾也。