嘉靖二十八年，浙直軍門朱紈題請福建添設參將一員。至三十五年，巡撫王忬題改設水陸參將二員，然未有專管汛地。三十八年，巡撫劉燾題請福建分南北中三路，添設參將三員，以漳州為南路，并水陸為一參將奉敕分守，所轄銅山、浯嶼二寨、浯銅、彭湖二游、漳州、銅山二浙營、陸鰲一土營；漳州、鎮海、泉州、永寧四衛、南詔、龍巖、陸鰲、銅山、玄鍾、崇武、福泉、金門、中左、高浦十所，自祥芝以至大城皆為汛地，蓋控漳而兼制泉也。先是南澳未設副總，遇汛則參將駐玄鍾調度，水陸防御。南澳設后，移駐銅山。萬歷二十年，倭躪朝鮮，議者謂銅山偏處一方，始兼移駐中左所居中調度焉。