企鵝是屬于企鵝目的企鵝科，算是較古老的鳥類，大約在5000萬年前，就已經在地球上生活了。

有的科學家根據發現的化石研究認為：企鵝有可能獨立于其他鳥類，單獨從爬行類演變進化而來。企鵝的鰭翅不是鳥類的翅膀變異形成的，而是由爬行類的前肢直接進化形成的，所以企鵝根本沒有經歷過飛翔階段，因而有翅膀也不會飛。但是，這只是科學家的推測。企鵝為什么不會飛的原因，科學家一直沒有給出統一結論。