在治療艙修復傷勢時，林雄的意識突然被混沌珠牽引，進入一段塵封的記憶。畫面中，太虛道君與一位機械生命體并肩作戰，他們面對的敵人，赫然是擁有九幽之心的初代暗月宗主。

“原來如此...“林雄醒來后喃喃自語，“九幽之心本是兩界合作開發的維度穩定器，卻被野心家扭曲成武器。“他找到蘇晴，將記憶片段導入分析系統。

蘇晴的瞳孔突然放大：“這個機械生命體的構造...和我在元始星域發現的技術殘片完全吻合！而且，它胸口的能源核心，與你體內的混沌珠頻率一致！“

線索指向了元始星域深處的機械古神遺跡。林雄帶領精英小隊出發，卻在遺跡入口遭遇時空亂流。混亂中，他與蘇晴意外被傳送到不同區域。

林雄醒來時，發現自己置身于一個巨大的數據庫中，無數光腦漂浮在空中，記錄著兩界文明的黑歷史。他讀取到一段關鍵信息：當年兩界戰爭爆發，正是因為有人篡改了維度穩定器的程序，將其變成毀滅武器。

與此同時，蘇晴在另一處發現了機械古神的殘骸。古神核心突然啟動，投影出最后影像：“九幽之心的真正威脅，不是它的力量，而是它會喚醒沉睡的...警告！檢測到時空悖論！“

影像戛然而止，遺跡開始崩塌。林雄與蘇晴憑借默契，在千鈞一發之際會合。撤離途中，他們遭遇神秘黑袍人的襲擊，黑袍人手中的武器，竟能斬斷空間，直取混沌珠。

“你們以為知道真相就能改變什么？“黑袍人冷笑，“有些秘密，永遠不該被揭開。“一場跨越空間的追逐戰就此展開，而林雄也意識到，他們面對的敵人，遠比想象中更接近真相核心。