林曉從古埃及穿越回現代后，被眼前的景象震驚得說不出話來。原本繁華的城市變得滿目瘡痍，街道上到處是殘垣斷壁，天空中彌漫著濃厚的陰霾，災難頻發，人們生活在恐懼和絕望之中。她意識到，自己和霍夫曼的穿越行為已經嚴重擾亂了時空秩序，必須盡快找到修復的方法，否則整個世界都將面臨毀滅。

回到實驗室，林曉看到陳教授正對著一堆數據愁眉不展。實驗室里的設備也因為時空紊亂受到了不同程度的損壞。林曉將自己的經歷詳細地告訴了陳教授，兩人決定立刻展開研究，尋找修復時空裂痕的方法。

他們查閱了大量的古籍和現代科研資料，對蝴蝶立方進行了無數次的測試和分析。經過艱苦的努力，他們終于發現蝴蝶立方創造的平行宇宙之間存在著一種微妙的聯系，就像一張錯綜復雜的巨大網絡，每一個節點都相互關聯、相互影響。要修復時空裂痕，就必須精準調整蝴蝶立方的能量頻率，使其與各個平行宇宙的能量場重新達到平衡。

然而，調整能量頻率談何容易。每一次嘗試都伴隨著巨大的風險，如果稍有差錯，可能會導致時空進一步紊亂，甚至引發宇宙大崩潰。但林曉和陳教授沒有退縮，他們日夜堅守在實驗室，不斷調整參數，進行模擬實驗。

在一次關鍵的實驗中，蝴蝶立方突然失控，釋放出強大的能量波動。實驗室里的儀器紛紛爆炸，林曉和陳教授陷入了生死危機。就在千鈞一發之際，林曉憑借著對蝴蝶立方的深入理解和頑強的意志，成功穩定住了它的能量輸出。

經過無數次的失敗和嘗試，他們終于找到了正確的能量頻率組合。林曉小心翼翼地操作著蝴蝶立方，將調整后的能量注入時空裂縫中。隨著能量的注入，時空裂縫開始逐漸愈合，城市的景象也慢慢恢復正常。

與此同時，他們通過蝴蝶立方的特殊能力，定位到了被困在混亂時空里的霍夫曼，并將他帶回了現實世界。霍夫曼被眼前的景象驚呆了，他終于意識到自己的貪婪和狂妄給世界帶來了多大的災難。

在法律的審判下，霍夫曼為自己的罪行付出了代價。而蝴蝶立方則被陳教授和林曉妥善封存起來，它的秘密被永遠埋藏，等待著人類科技和道德水平足以駕馭這份力量的那一天。

林曉望著被封存的蝴蝶立方，心中感慨萬千。這次驚心動魄的時空冒險讓她深刻認識到，科學的探索永無止境，但在追求知識和力量的道路上，必須始終保持敬畏之心，只有這樣，人類才能在宇宙的舞臺上穩健前行。