在第十一軍團(tuán)作為首先投入冉丹戰(zhàn)爭(zhēng)的部隊(duì)遭遇重創(chuàng)后，第二軍團(tuán)被緊急投入了戰(zhàn)爭(zhēng)。在戰(zhàn)斗中，第二軍團(tuán)的士兵們第一次遇見了那些遭遇冉丹人精神控制的成建制人類部隊(duì)。

當(dāng)?shù)谝徊鏌o表情的普通人類士兵被消耗殆盡后，第十一軍團(tuán)的被俘阿斯塔特們作為冉丹仆從軍被投入了戰(zhàn)斗。

與普通人不同，阿斯塔特們大多還保持有一絲自己的意識(shí)，但他們的身體依舊不能自控的向第二軍團(tuán)的同袍們撲殺過去。第二軍團(tuán)的士兵們見到了這些自己袍澤的痛苦，認(rèn)為他們還有被拯救的可能，于是很多士兵在試圖解救這些戰(zhàn)友時(shí)被這些受冉丹異形控制的戰(zhàn)友迅速的屠殺殆盡。一支看似被“拯救”的終結(jié)者小隊(duì)則在受原體召見時(shí)引爆了被異形植入體內(nèi)的熱熔炸彈，幾乎將軍團(tuán)的整個(gè)指揮部化為廢墟，而原體本人也因此受到重創(chuàng)。

指揮部遇襲讓第二軍團(tuán)一度喪失統(tǒng)一指揮。雪上加霜的是，最高指揮部并非唯一一個(gè)遭到這種“斬首”行動(dòng)的指揮單位。幾乎是一夜之間，第二軍團(tuán)的中高層指揮體系癱瘓了整整60%，多個(gè)重武器陣地、后勤倉(cāng)庫(kù)和太空港遭遇襲擊后被摧毀，大量經(jīng)驗(yàn)豐富指揮人員和重武器、后勤物資的損失造成的后果幾乎是立竿見影——冉丹異形，包括被他們控制的人類部隊(duì)在極短的時(shí)間內(nèi)將第二軍團(tuán)分割包圍，大量部隊(duì)被打散，隨后消失在敵軍的浪潮中。

局勢(shì)幾乎是瞬間變得岌岌可危。

關(guān)鍵時(shí)刻，第二軍團(tuán)長(zhǎng)期以來的素養(yǎng)成為了自己唯一的救命稻草。

重傷昏迷的原體蘇醒后第一件事就是立刻下達(dá)指令要求各部隊(duì)化整為零，靈活打擊敵人、拖住敵人，為帝國(guó)后續(xù)援軍的到來爭(zhēng)取時(shí)間。原體已經(jīng)明白：第二軍團(tuán)的失敗已經(jīng)無法挽回，但這場(chǎng)關(guān)乎人類存亡的戰(zhàn)爭(zhēng)不能失敗，第二軍團(tuán)必須做些什么防止冉丹異形擴(kuò)大自己的優(yōu)勢(shì)：“哪怕第二軍團(tuán)全軍覆沒，也必須牢牢把敵人拖在這里！”

第二軍團(tuán)的士兵們很快立刻調(diào)整了自己的戰(zhàn)術(shù)。團(tuán)、營(yíng)、連迅速化整為零，在以小隊(duì)、小組甚至單兵的規(guī)模憑借地形、建筑、地道等與異形周旋直至戰(zhàn)斗到最后一滴血。軍團(tuán)戰(zhàn)士們痛苦的放棄了他們的火力洗地打法，用單兵武器甚至自己的拳頭和牙齒與冉丹異形打起了近距離遭遇戰(zhàn)。

在之后的四年里，軍團(tuán)各部通過血腥而靈活的小規(guī)模近戰(zhàn)、伏擊戰(zhàn)一點(diǎn)點(diǎn)維持著局面。這種痛苦而漫長(zhǎng)的鏖戰(zhàn)讓即使精通游擊作戰(zhàn)的第二軍團(tuán)也難以忍受。

軍團(tuán)戰(zhàn)士們痛苦的放棄了自己的慈悲心，用爆彈、激光和等離子清洗他們見到的每一個(gè)可疑活物，不論是人類還是異形或者低等生物。由于此項(xiàng)作戰(zhàn)與他們一直以來的理念背道而馳，一些被隔絕敵后、沒有政治導(dǎo)師帶領(lǐng)的部隊(duì)里出現(xiàn)了零散的自殺情況。而每一名有被俘風(fēng)險(xiǎn)的戰(zhàn)士——不論是凡人輔助軍還是阿斯塔特都會(huì)在自己的脖子下加掛一枚熱熔炸彈，哪怕他本人因受傷或者其它原因無法用手引爆，也可以較為方便的用牙完成這一過程，這枚熱熔炸彈也被軍團(tuán)戰(zhàn)士們戲稱為“光榮彈”。據(jù)戰(zhàn)后統(tǒng)計(jì)，至少有1000名以上的阿斯塔特和數(shù)萬名凡人輔助軍使用“光榮彈”作為自己最后的抵抗，而實(shí)際人數(shù)肯定更多：因?yàn)榇罅坎筷?duì)都是全員戰(zhàn)死，無法確認(rèn)最后一刻發(fā)生了什么，甚至連他們?cè)诤翁幇l(fā)生戰(zhàn)斗都已經(jīng)無法知曉。

最終當(dāng)?shù)谝卉妶F(tuán)的援軍趕到時(shí)，第二軍團(tuán)的傷亡已高達(dá)70%，已經(jīng)接近失去戰(zhàn)斗力，但也是這寶貴的四年時(shí)間讓冉丹異形被牢牢拖住，無法向人類帝國(guó)開展進(jìn)一步攻擊。

對(duì)于第二軍團(tuán)而言，這四年戰(zhàn)爭(zhēng)中與人員和物資等有形的損失相比，他們所受的精神打擊幾乎是毀滅性的。在與冉丹人的血腥戰(zhàn)爭(zhēng)中，第二軍團(tuán)引以為傲的社會(huì)調(diào)查、發(fā)動(dòng)人民變得毫無用處，很多時(shí)候還因此中了敵方陷阱。痛苦的軍團(tuán)不得不頻繁發(fā)動(dòng)無差別攻擊，將自己發(fā)誓要保護(hù)的帝國(guó)人民與異形敵人一起汽化，這讓軍團(tuán)自原體以下都開始對(duì)自己長(zhǎng)久以來的理想信念發(fā)生了動(dòng)搖。當(dāng)?shù)谝卉妶F(tuán)接手戰(zhàn)事時(shí)，原體甚至向第一軍團(tuán)原體萊恩表示自己長(zhǎng)久以來的信念可能“確實(shí)錯(cuò)了”。

與第一軍團(tuán)一同到來的還有由帝皇和宰相馬卡多共同簽發(fā)的調(diào)令。

第二軍團(tuán)被勒令立即撤出戰(zhàn)斗，返回母星所在星域聽候下一步命令。原體本人則被命令返回泰拉向帝皇述職。

軍團(tuán)懷著沉重的心情接受了這一命令。誰(shuí)都知道，原體返回泰拉述職只是一個(gè)好聽的幌子，實(shí)際上這是一次恥辱的戰(zhàn)敗檢討。原體本人依舊盡職盡責(zé)與第一軍團(tuán)做好了交接，盡可能向萊恩轉(zhuǎn)述了自己的作戰(zhàn)經(jīng)驗(yàn)，并拜托萊恩在未來盡力照顧自己的軍團(tuán)。

原體已經(jīng)做好了承受一切處罰的準(zhǔn)備。

原體回到泰拉之后所發(fā)生的一切我們并不得而知，只知道泰拉皇宮中的基因原體雕像群當(dāng)時(shí)并沒有完成，而當(dāng)?shù)裣袢鹤罱K完工時(shí)，所有人都看見只有18座雕像屹立于皇宮之中。

原體回到泰拉后是否離開、第二軍團(tuán)最終的結(jié)局從此都成了一個(gè)永久的秘密。

關(guān)于這一切，其它原體曾經(jīng)有過各式各樣的猜測(cè)，而荷魯斯更是曾經(jīng)直闖皇宮內(nèi)廷試圖質(zhì)問自己的父親——然而他根本沒能進(jìn)入皇宮內(nèi)廷，直接在終焉之門前被宰相馬卡多擋了駕，雙方言辭激烈，甚至一度曾差點(diǎn)發(fā)生沖突，最終以荷魯斯被馬卡多強(qiáng)大的靈能力量壓跪在終焉之門前不能動(dòng)彈而告終。

而帝皇本人自始至終沒有露過面，也沒有任何指示從皇宮中傳出。

很難說荷魯斯后來的背叛是否與這一次的事件有關(guān)，但可以肯定的是:原體和第二軍團(tuán)就此從帝國(guó)的官方記錄中消失，甚至這個(gè)番號(hào)在帝國(guó)都成為了某種意義上的禁忌——一直到阿巴頓的第十三次黑色遠(yuǎn)征結(jié)束，帝國(guó)在亞空間的風(fēng)暴中危在旦夕時(shí)，重新回歸的第二軍團(tuán)才補(bǔ)上了這個(gè)記錄，我們也才得以知道這一萬多年中這個(gè)軍團(tuán)的傳奇。