《黃飛鴻之西域雄獅》的故事講述的是黃飛鴻在廣州設立寶芝林醫館，與一班弟子鋤強扶弱，發揚中華武術。

其弟子牙擦蘇，遠渡重洋在舊金山開設分館，期望能把中華武術發揚海外。黃飛鴻為視察分館業務，并順道探望阿蘇，決定帶著十三姨、梁寬來到舊金山。

在途中的一次打斗中，黃飛鴻掉入河中，丟失了記憶力，被當地土族人所救。寶芝林所有人員后來被嫁禍搶了銀行為證明清白，黃飛鴻與真兇打斗，將其正法。

這其...