陜西動(dòng)亂，讓圣駕一直待著遼東。朱由檢既不想返回京城那個(gè)牢籠中，又不敢去此次正在動(dòng)亂的陜西。

他一向秉持君子不立于危墻之下，除非真的是迫不得已。

趁這次機(jī)會(huì)，朱由檢走訪查看遼東，山海關(guān)，寧遠(yuǎn)，錦州等寧錦防線要地，關(guān)隘。

他隨后又在關(guān)寧鐵騎的陪伴下，和孫承宗一起去看了，已經(jīng)收復(fù)的，義州，廣寧，西平堡前線其他前線要地，此次與后金兩次戰(zhàn)爭(zhēng)，既沉重打擊了后金的囂張氣焰。也擴(kuò)張了明朝的版圖。原本寧遠(yuǎn)之戰(zhàn)前，大明能控制的就是山海關(guān)至錦州一線。當(dāng)時(shí)連大凌河城就放棄了。

現(xiàn)在明軍的勢(shì)力基本上可以控制遼河以西的土地了。

朱由檢指示，要重新修筑這些戰(zhàn)略要地。要把明軍的前線，往前移；隨后又撥付一百的軍餉來(lái)支持此次修筑。

在暗查走訪的日子，皇帝多次親臨士卒中間，傾聽(tīng)士兵的心聲，了解士兵的難處。

隨后便開(kāi)始了遼東十幾萬(wàn)將士的整頓。

一，是裁掉老弱病殘之輩，對(duì)于那些不想當(dāng)兵的人士發(fā)放遣散費(fèi)用，重新從遼民之中，招募年富力強(qiáng)之輩。現(xiàn)在財(cái)政寬裕不少，當(dāng)兵雖然危險(xiǎn)，但在亂世也算是一個(gè)混出頭的行業(yè)。朱由檢認(rèn)為，讓一個(gè)不喜歡當(dāng)兵的人去當(dāng)兵，恐怕戰(zhàn)力也強(qiáng)不到哪里去。于是十幾萬(wàn)大軍，裁減至十萬(wàn)。

二，對(duì)于軍制，以及軍紀(jì)問(wèn)題，軍內(nèi)貪污腐敗問(wèn)題，虐待士兵問(wèn)題朱由檢相當(dāng)關(guān)注，其中軍制主要是明后期的家丁和親軍的問(wèn)題。

明朝后期，將領(lǐng)們普遍克扣士卒糧餉是一個(gè)積極普遍的現(xiàn)象，他們盤剝朘削下級(jí)官兵，自己過(guò)著花天酒地的糜爛生活，且向兵部官員，監(jiān)視太監(jiān)，和紀(jì)功御史等人行賄，營(yíng)求升遷或開(kāi)脫罪責(zé)。

這就決定了他們和士卒的矛盾必然激化。平時(shí)矛盾就多戰(zhàn)時(shí)更可能做不到上下一心。

這些將領(lǐng)沒(méi)辦法，為了保住自己的性命和地位，采取了自養(yǎng)家丁的辦法，他們把克扣貪污的錢財(cái)拿出一部分，豢養(yǎng)一小批經(jīng)過(guò)挑選的士兵，給予較好的生活待遇和馬匹器械等裝備。將領(lǐng)即使革職離任了，家丁也依舊由他們帶回原籍供養(yǎng)。

這樣，到了關(guān)鍵時(shí)候，家丁就成了將領(lǐng)們邀功的王牌和逃命的盾牌。時(shí)人指出：明朝邊將“一萬(wàn)額兵，止有六千，以四千為交際、自給、養(yǎng)家丁之用。”

這些原本維護(hù)了整個(gè)封建王朝的統(tǒng)治的官兵變成家丁，相當(dāng)于是皇帝出錢給將領(lǐng)們養(yǎng)著為他們謀取私利的工具。這是朱由檢絕對(duì)不能接受的。

當(dāng)然，官兵變成家丁，除了上述將領(lǐng)貪污導(dǎo)致之外，也有明末士兵待遇較低，不能如時(shí)發(fā)餉有關(guān)。當(dāng)時(shí)這一問(wèn)題，在此時(shí)崇禎朝，已經(jīng)基本杜絕了。

對(duì)于上述問(wèn)題，朱由檢與孫承宗商量許久，決定還是冒險(xiǎn)實(shí)施改革方案。主要是孫承宗直屬掌握的軍隊(duì)已經(jīng)能控制大局，再加上遼東完全是后方供應(yīng)糧草。后金如今在角落里舔著傷口。

所以還是先把大明皇家銀行遼東分部建立，由銀行直接對(duì)士兵各自發(fā)放，每個(gè)士兵（把總以下）都做了一個(gè)鐵牌編號(hào)，拿著鐵牌編號(hào)，每月便可以前去存拿餉銀。

當(dāng)然把總以上的，守備，游擊，參將，副總兵，總兵，都由督師行營(yíng)直接發(fā)放。對(duì)于遼東將領(lǐng)，朱由檢覺(jué)得還是大方一些。盡量避免遼東軍改產(chǎn)生更大的阻力。朱由檢認(rèn)為能用錢，解決了問(wèn)題的，都不是問(wèn)題。更何況，他還不僅僅只給錢，還有功名利祿。

做皇帝就是這點(diǎn)好！給出一個(gè)大餅，就有人前仆后繼。

后世有位名人曾經(jīng)說(shuō)過(guò)，員工跳槽，要么是錢給的不夠，要么人受委屈了。朱由檢決定嚴(yán)格尊重該規(guī)定。既不讓錢太少（肯定比貪污少一些），又不能讓人受了委屈。

隨后朱由檢開(kāi)始對(duì)軍中，嚴(yán)重貪贓枉法的，嚴(yán)苛虐待士兵，就地查處，嚴(yán)厲打擊。后面不少將領(lǐng)覺(jué)得，如果再行貪污喝兵血，風(fēng)險(xiǎn)太大，上有督師嚴(yán)厲查處，下有士兵離心離德，恐怕得不償失。于當(dāng)風(fēng)險(xiǎn)跟收益不成正比時(shí)，就沒(méi)多少人干了。

當(dāng)然朱由檢解釋他也不是，飛鳥(niǎo)盡，良弓藏；狡兔死，走狗烹。馬放南山；而是遼東兵制，軍制早已積弊已久。已經(jīng)到了不改不行的時(shí)候。前兩次對(duì)金作戰(zhàn)實(shí)際上就產(chǎn)生了很多問(wèn)題。比如士兵戰(zhàn)斗力，凝聚力不夠，怕死，只能打順風(fēng)戰(zhàn)，守城戰(zhàn)。對(duì)于遭遇戰(zhàn)，野戰(zhàn)，大明的水平還差的不少。

隨后他便頒布詔令，一，設(shè)立講武堂，全面提高，高、中、下、級(jí)的政治思想，和軍事能力。由皇帝任為名譽(yù)校長(zhǎng)，孫承宗任第一校長(zhǎng)。

二，設(shè)定監(jiān)軍政委制度，此職只在軍中宣傳皇帝恩德以及朝堂關(guān)于軍隊(duì)的政策，監(jiān)察軍中不法等問(wèn)題。當(dāng)然軍政委制度，有一明一暗，明的就是朝廷委派的御史，或者觀政進(jìn)士；一暗，就是錦衣衛(wèi)的諜探。

朱由檢深深知道，刀把子必須要掌控在自己手中，才會(huì)安心。只有皇帝才能指揮軍隊(duì)，而不是軍隊(duì)來(lái)指揮皇帝。趁著這個(gè)機(jī)會(huì)，他把所有軍將召集起來(lái)說(shuō)道，朕不是不相信愛(ài)卿，但原來(lái)軍中積弊不少。要想徹底杜絕，就要先從思想上自我革新。

其實(shí)從另外的角度來(lái)看，皇帝這是在跟遼東軍將做交易。

皇帝對(duì)于軍中將領(lǐng)貪贓枉法，軍紀(jì)敗壞，除非是天怒人怨，或者殺雞儆猴的，在軍制改革之前將從輕發(fā)落，一律減一等；但是對(duì)于此次軍制改革之后，必須嚴(yán)厲打擊。

皇帝在遼東的半年時(shí)間內(nèi)，一直為孫承宗整頓軍制，保駕護(hù)航。可以說(shuō)半年后的大明軍，將是一種向新式軍隊(duì)轉(zhuǎn)變的軍隊(duì)。

隨后，遼東軍制改制，便也傳到袁崇煥總督的薊州軍鎮(zhèn)。

另外皇帝下令，要求，以后的軍糧由漕運(yùn)改為海軍，這一制度改革，直接讓遼東原來(lái)每年五百六萬(wàn)兩白銀的軍費(fèi)，直接減少到四百萬(wàn)了。

隨著孫承宗又建議遼東可以實(shí)施屯田。

朱由檢立即發(fā)布詔令要求遼民屯田，由于收復(fù)大凌河及遼河以西部分領(lǐng)土，再加上屯田主要是以種植高產(chǎn)，抗旱，抗寒的農(nóng)作物為主，相信不遠(yuǎn)的將來(lái)，在遼東軍隊(duì)總?cè)藬?shù)不變的情況下。遼東的軍費(fèi)開(kāi)支還會(huì)大幅度下降。