【顯慶五年（660年）十月，李治風疾發作，頭暈目眩，不能處理國家大事，于是讓武則天處理朝政。然而也讓二人之間逐漸出現了矛盾。

龍朔元年（661年）正月，武則天請禁止天下婦女為俳優之戲（指演滑稽戲的藝人），李治采納。四月，李治欲親征高句麗，在武則天及群臣勸諫下才作罷。

武則天最初能“屈身忍辱，奉順上意”，故而李治力排眾議，堅持立她為后。待到武則天得志后，“專作威福，上欲有所為，動為后所制”，李治不勝其忿。麟德元年（664年），宰相上官儀請求廢后，李治亦以為然，即命上官儀起草廢后詔書。

左右侍從及時奔告于武則天，武則天立即到李治面前自訴，使其“羞縮不忍，復待之如初”。李治又擔心武則天怨怒，因此哄騙她說：“我初無此心，皆上官儀教我。”從此每當李治理政，武則天便“垂簾于后，政無大小皆與聞之。天下大權，悉歸中宮，黜陟、生殺，決于其口”。

由于李治在位時期國力昌盛，武則天積極勸其封禪泰山。封禪時本應先由皇帝初獻，公卿亞獻。但武則天認為，封禪為祭地之儀，由太后配享，彰顯后土之德。所以她要自己充當亞獻，好孝敬自己的婆婆，李治應允，于麟德二年（665年）十月率文武百官、扈從儀仗，從東都洛陽出發，前往泰山封禪，武則天則率內外命婦隨行。車乘連綿數百里，隨行的還有突厥、于闐、波斯、天竺、倭國、新羅、百濟、高句麗等國的首領和使節。】

【唐太宗李世民：哼！雉奴你還真是！廢物！堂堂九五之尊，居然受制于一婦人！這事兒把我大唐的臉都丟盡了！】

李世民坐在椅子上，惡狠狠的盯著長孫皇后懷里的小奶娃，這正是剛剛出生沒多久的李治，如果不是這個小奶娃還一點事都不懂，李世民早就家法伺候了！

旁邊的太子李承乾、魏王李泰、長樂公主李麗質也都好奇的看著李治這個小奶娃，不知道為什么這么可愛的弟弟，以后居然會做出那么荒唐的事情，納了阿耶的才人就算了，還被人家輕輕松松的拿捏了，連上朝也要人家垂簾聽政！

長孫皇后也是一臉無奈的抱著小李治，這孩子什么玩意兒這是？真是氣死人了！

正在呼呼大睡的李治還不知道自己被父母兄長和姐姐盯上了，只感覺心里一慌、后背發涼，然后就直接‘哇’的一聲哭出來了。

【唐高宗李治：阿耶，你聽我狡辯...不是，解釋，我...】

【唐太宗李世民：什么玩意兒！話都不會說了！算了算了，反正我現在已經準備好好的培養你大哥承乾了，這邊的皇位跟你沒什么關系了，你那邊的事情我也懶得管，你自己看著辦吧！】

【唐高宗李治：額，阿耶，要不你再考慮考慮？我覺得我還能搶救一下！】

【始皇帝嬴政：李老二啊，你家這關系挺亂的哈！】

【唐太宗李世民：始皇陛下見笑了，不過朕已經下令了，我這邊已經讓人去把武士彟一家都抓回來了他們一家子都在天牢里面了，為了避免夜長夢多，我剛才讓人去秘密處決了！】

【唐高宗李治：阿耶，這...】

【唐太宗李世民：閉嘴！廢物！】

【唐高宗李治：額......】

【大周女帝武則天：太宗真是好手段！哼！】

武則天雖然對自己的家人沒什么好感，但是聽到李世民將一大家子都給殺了，心里邊也是滋味萬千，恨得牙癢癢！

【咸亨三年（672年）四月，武則天以兩萬貫脂粉錢，資助僧侶在洛陽龍門石窟雕刻盧舍那大佛。此工程歷時三年九個月完成。

上元元年（674年）八月，李治稱天皇，武則天稱天后。十二月，武則天上建言十二事，被李治悉數采納，下詔頒布施行。武則天重視農業生產，規定各州縣境內，“田疇墾辟，家有余糧”者予以升獎；“為政苛濫，戶口流移”者必加懲罰。她所編農書《兆人本業》，頒行天下，影響很大。而武則天執政期間，其宗教政策以尊崇佛教為主。

上元二年（675年），李治所患的風眩癥愈加嚴重，欲禪位給皇后，便與大臣們商議，準備讓武則天攝政，因宰相郝處俊勸諫，這才暫時停議。武則天得知后，就召集了大批文人學士，大量修書，先后撰成《玄覽》《古今內范》《青宮紀要》《少陽正范》《維城典訓》《紫樞要錄》《鳳樓新誡》《孝子傳》《列女傳》《內范要略》《樂書要錄》《百僚新誡》《兆人本業》《臣軌》等書；且密令這批學者參決朝廷奏議，以分割宰相的權力，被當時的人稱作“北門學士”。

永淳二年（683年），李治駕到奉天宮，當時武則天從封泰山以后，勸李治封禪中岳，因李治患病而中止。不久，李治命李顯代理國政，宰相裴炎、劉齊賢、郭正一等人協助理政。李治從奉天宮回東都，病情加重，于同年十二月駕崩于東都洛陽貞觀殿，臨終遺詔讓太子李顯于靈柩前即位，軍國大事有不能裁決者，由天后（武則天）決定。四天以后，李顯即位，是為唐中宗，尊武則天為皇太后。

嗣圣元年（684年）二月，李顯打算任命韋皇后之父韋玄貞為侍中，被裴炎阻止，怒道：”朕即使把天下都給韋玄貞，又有何不可？還在乎一個侍中嗎？”

武則天于是將李顯廢黜為廬陵王，遷于房州，轉而立第四子豫王李旦為帝，是為唐睿宗。武則天仍臨朝稱制。九月，武則天改元光宅，改東都(洛陽)為神都，同時令旗幟皆從金色，官服顏色、職省名稱一并改易，賜宮城名為太初宮。

同月，徐敬業等以扶持廬陵王為號召，在揚州舉兵反武，十多天內就聚合了十萬部眾。武則天當即以左玉鈐大將軍李孝逸為揚州道大總管，率兵三十萬前往征討。十一月，徐敬業兵敗自殺。

垂拱元年（685年）五月，武則天下詔允許內外九品以上官員和百姓向朝廷自薦，以求被任用。

垂拱二年（686年）正月，武則天還政于李旦，但李旦知其并非出自誠心，“奉表固讓”，于是武則天繼續臨朝稱制。三月，武則天下令制造銅匭（銅制的匣子，類似于檢舉箱、報冤盒），置于洛陽宮城前，分為延恩（獻賦頌、謀求仕途者投之）、招諫（言朝政得失者投之）、伸冤（有冤抑者投之）、通玄（言天象災變及軍機秘計者投之）四匭，隨時接納天下表疏，此舉廣開言路，對穩定當時的朝政起了重大作用。】