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黑太陽陡然出現在大阪都上空，墜落在城市郊外，如隕石天降，瞬間摧毀方圓數里的一切物質。

追殺華原翔失敗的泉光子郎進化為賢者獸穿越時空趕到第三新東京市，借助手中的時空之石切入數十千米粗細的時空通道中...