五大靈珠神秘而又強大，幾乎貫穿了仙劍系列。相傳盤古大神創建天地后身體崩解，原本蘊藏在盤古身體內的靈力逸散，結合天地間的光、色、型變換成不同的形體，最后成為了“神”，而盤古的肉身沉降于地，形成山川河流。雖然大部分的靈力都凝聚成了神這種生物，但是還是有部分剩余沒有成型的靈力逐漸分解為水、火、雷、風、土五種自然力量，并散于天地之間。

后來，因為天地間清氣升騰，濁氣下降，維持天地間距離的清濁平衡被打...