- 長(zhǎng)壽:當(dāng)人類不再衰老
- (美)大衛(wèi)·辛克萊 馬修·拉普蘭特
- 5250字
- 2022-06-24 15:58:32
術(shù)語(yǔ)介紹

等位基因:一個(gè)基因多種可能形態(tài)中的一種。每種在其DNA序列中含有一個(gè)明顯的突變。例如,一個(gè)“有害等位基因”是一個(gè)導(dǎo)致疾病的基因的一種形態(tài)。

氨基酸:合成蛋白質(zhì)的基本化學(xué)原料。在轉(zhuǎn)運(yùn)過程中,不同的氨基酸串聯(lián)在一起形成一條鏈,然后折疊成蛋白質(zhì)。

拮抗性多效基因:由喬治·C.威廉斯提出的一種對(duì)衰老做出進(jìn)化論解釋的理論。如果一個(gè)基因在生命早期的收益大于生命晚期的成本,那么它可能會(huì)被選擇用來縮短生命晚期的壽命。生存回路就是一個(gè)例子。

堿基:遺傳密碼的四個(gè)“字符”——A、C、T和G,是一種被稱為堿基或核堿基的化學(xué)基團(tuán)。A=腺嘌呤,C=胞嘧啶,T=胸腺嘧啶,G=鳥嘌呤。RNA(核糖核酸)含有一種叫作尿嘧啶(U)的堿基,而非胸腺嘧啶。

堿基對(duì):DNA的扭曲“拉鏈”上的“牙齒”。被稱為堿基的化學(xué)物質(zhì)組成一條DNA鏈,每條鏈的方向相反,堿基吸引與其相對(duì)的一方形成一個(gè)堿基對(duì)——C與G配對(duì),A與T配對(duì)(除了在RNA中,在RNA中是A與U配對(duì))。

生物追蹤/生物黑客:利用儀器和實(shí)驗(yàn)室測(cè)試來監(jiān)測(cè)身體,以決定如何選擇飲食、運(yùn)動(dòng)和其他生活方式,從而使身體機(jī)能達(dá)到最佳狀態(tài)。千萬別和生物黑客混為一談,生物黑客是一種自助強(qiáng)身健體的方法。

癌癥:細(xì)胞不受控制地生長(zhǎng)而引起的一種疾病。癌細(xì)胞可能形成團(tuán)塊或腫塊,稱為腫瘤,并可以通過一種叫作轉(zhuǎn)移的過程擴(kuò)散到身體的其他部位。

細(xì)胞:生物體的基本單位。活生物體中的細(xì)胞數(shù)量從一個(gè)(如酵母)到千萬億個(gè)(如藍(lán)鯨)不等。一個(gè)細(xì)胞由蛋白質(zhì)、脂質(zhì)、糖類和核酸四個(gè)關(guān)鍵大分子組成,這些大分子使細(xì)胞能夠發(fā)揮功能。除此之外,細(xì)胞可以合成和分解分子,可以移動(dòng)、生長(zhǎng)、分裂和死亡。

細(xì)胞重編程:細(xì)胞從一種組織到發(fā)育前一階段的變化。

細(xì)胞衰老:這一過程發(fā)生于正常細(xì)胞停止分裂并開始釋放炎癥分子時(shí),有時(shí)是端粒縮短、DNA損傷或表觀遺傳噪聲引起的。盡管衰老細(xì)胞看起來處于“僵尸”狀態(tài),但它們?nèi)匀换钪盟鼈兣懦龅难装Y分泌物破壞周圍的細(xì)胞。

染色質(zhì):纏繞在被稱為組蛋白的蛋白質(zhì)支架上的DNA鏈。常染色質(zhì)是一種開放式的染色質(zhì),允許基因被開啟,而異染色質(zhì)是一種封閉式的染色質(zhì),阻止細(xì)胞讀取某個(gè)基因,這個(gè)過程也叫作使基因沉默。

染色體:細(xì)胞DNA卷繞在蛋白質(zhì)周圍形成的一個(gè)緊密的結(jié)構(gòu)。不同生物的基因組排列成不同數(shù)量的染色體,人類細(xì)胞中有23對(duì)染色體。

互補(bǔ)性:用于描述任何兩個(gè)可以相互形成一系列堿基對(duì)的DNA或RNA序列。每個(gè)堿基與一個(gè)互補(bǔ)方形成一個(gè)鍵:(DNA中的)T或(RNA中的)U與A形成一個(gè)鍵,C與G形成一個(gè)鍵。

CRISPR:讀作“crisper”。它是在細(xì)菌和古細(xì)菌中發(fā)現(xiàn)的一種免疫系統(tǒng),被用作基因組工程工具,在基因組的精確位置切割DNA。CRISPR是“規(guī)律間隔成簇短回文重復(fù)序列”的縮寫,是宿主基因組的一部分,包含交替重復(fù)序列和外來DNA片段。CRISPR蛋白質(zhì),如Cas9——一種DNA切割酶,在尋找并破壞病毒DNA時(shí),將其用作“分子識(shí)別圖”。

DAF-16/FOXO:作為沉默信息調(diào)節(jié)因子的盟友,DAF-16/FOXO是一種被稱為轉(zhuǎn)錄因子的基因控制蛋白,它能激活細(xì)胞防御基因,上調(diào)這些基因可以延長(zhǎng)蠕蟲、蒼蠅、老鼠甚至可能還有人類的壽命;它同時(shí)是Daf-2延長(zhǎng)蠕蟲壽命所需的物質(zhì)。

去乙酰基化:通過酶去除蛋白質(zhì)中的“乙酰”標(biāo)記。組蛋白去乙酰化酶(HDAC)去除組蛋白中的乙酰基會(huì)使組蛋白變得更緊湊,這樣就可以關(guān)閉某個(gè)基因。沉默信息調(diào)節(jié)因子是依賴NAD的去乙酰化酶。脫酰作用是一個(gè)包羅萬象的術(shù)語(yǔ),包括去除乙酰基,以及去除其他更奇特的標(biāo)記,如丁酰基和琥珀酰基。

去甲基化:去甲基化即去除甲基,由組蛋白去甲基化酶(KDM)和DNA去甲基化酶(TET)進(jìn)行。甲基的附著是通過組蛋白或DNA甲基轉(zhuǎn)移酶(DMT或DNMT)實(shí)現(xiàn)的。

可拋棄體細(xì)胞:由托馬斯·柯克伍德提出的一個(gè)假說。物種進(jìn)化的目的是快速生長(zhǎng)和繁殖,或建立持久的身體,但兩者不可兼得。在自然環(huán)境中,因資源有限,所以兩者無法同時(shí)實(shí)現(xiàn)。

DNA:脫氧核糖核酸的縮寫,為細(xì)胞發(fā)揮功能或病毒復(fù)制編碼所需信息的分子。雙螺旋形態(tài),類似于扭曲的梯子或拉鏈。堿基(縮寫為A、C、T和G)位于梯子或拉鏈的兩側(cè),兩側(cè)伸展的方向相反。堿基能夠相互吸引,A與T配對(duì),而C與G配對(duì)。這些字母的序列被稱為遺傳密碼。

DNA雙鏈斷裂(DSB):發(fā)生于兩條DNA鏈斷裂,產(chǎn)生兩個(gè)游離端的時(shí)候。可由Cas9或I-PpoI這樣的酶來完成。細(xì)胞修復(fù)DNA以防止自己死亡,有時(shí)會(huì)改變斷裂處的DNA序列。為了改變DNA序列而啟動(dòng)或控制這一過程被稱為基因組工程。

DNA甲基化時(shí)鐘:DNA甲基化標(biāo)簽的數(shù)量和位置的變化可以用來預(yù)測(cè)壽命,可以用來標(biāo)記從出生起的時(shí)間。在生物體的表觀基因組重編程或克隆的過程中,甲基標(biāo)記被移除,從而會(huì)逆轉(zhuǎn)細(xì)胞的年齡。

酶:一種蛋白質(zhì),由數(shù)個(gè)氨基酸鏈組成,這些鏈折疊成一個(gè)球,可以進(jìn)行化學(xué)反應(yīng),這些化學(xué)反應(yīng)通常耗時(shí)較長(zhǎng),或者永遠(yuǎn)不會(huì)發(fā)生。例如,沉默信息調(diào)節(jié)因子是一種利用NAD從組蛋白中去除乙酰基的酶。

表觀遺傳:指細(xì)胞基因表達(dá)的改變,但DNA編碼不會(huì)發(fā)生改變。相反,DNA和DNA包裹的組蛋白會(huì)被可移動(dòng)的化學(xué)信號(hào)“標(biāo)記”(見去甲基化和去乙酰基化)。表觀遺傳標(biāo)記告訴其他蛋白質(zhì)何時(shí)何地讀取DNA,類似于在一本書的一頁(yè)上貼上一張寫著“跳過”的便條,看到這張便條,讀者會(huì)忽略這一頁(yè),但這本書本身并沒有改變。

表觀遺傳漂移和表觀遺傳噪聲:隨著年齡的增長(zhǎng),因甲基化的變化而發(fā)生的表觀基因組的改變,通常與個(gè)體暴露于環(huán)境因素有關(guān)。表觀遺傳漂移和噪聲可能是所有物種衰老的關(guān)鍵驅(qū)動(dòng)因素。DNA損傷,特別是DNA斷裂,是這個(gè)過程的驅(qū)動(dòng)因素。

分化異常:由于表觀遺傳噪聲而喪失細(xì)胞特性。分化異常可能是引起衰老的主要原因(參見表觀遺傳噪聲)。

染色體外核糖體DNA環(huán)(ERC):染色體外核糖體DNA環(huán)的產(chǎn)生,導(dǎo)致年老細(xì)胞中的核仁裂解,在酵母中,ERC會(huì)分散沉默信息調(diào)節(jié)因子的注意力并導(dǎo)致衰老。

基因:DNA片段,編碼用來制造蛋白質(zhì)的信息。每個(gè)基因是一組指令,用來制造一種特定的分子機(jī)器,幫助細(xì)胞、有機(jī)體或病毒發(fā)揮功能。

基因表達(dá):基于基因的產(chǎn)物,可以指RNA或蛋白質(zhì)。當(dāng)一個(gè)基因被打開時(shí),細(xì)胞機(jī)器通過將DNA轉(zhuǎn)錄成RNA和/或?qū)NA翻譯成氨基酸鏈來進(jìn)行表達(dá)。例如,一個(gè)高度表達(dá)的基因?qū)a(chǎn)生許多RNA副本,其蛋白質(zhì)產(chǎn)物可能大量存在于細(xì)胞中。

基因療法:作為一種醫(yī)學(xué)治療手段,將修正的DNA置入人類細(xì)胞。可以通過在特定細(xì)胞的基因組中加入健康的DNA序列來治療甚至治愈某些疾病。科學(xué)家和醫(yī)生通常使用無害的病毒將基因注入靶細(xì)胞或組織,然后該DNA會(huì)被嵌入細(xì)胞現(xiàn)有DNA的某個(gè)部位。CRISPR基因組編輯有時(shí)會(huì)被稱為一種基因治療技術(shù)。

轉(zhuǎn)基因生物(GMO):轉(zhuǎn)基因生物是指使用科學(xué)工具故意改變其DNA的生物。任何生物都可以通過這種方式被改造,包括微生物、植物和動(dòng)物。

基因組:生物或病毒的整個(gè)DNA序列。基因組本質(zhì)上是一個(gè)巨大的指令集,用于制造細(xì)胞的各個(gè)部分,并指導(dǎo)細(xì)胞的一切行為活動(dòng)。

基因組學(xué):研究基因組的一門科學(xué),即研究某一特定生物的全部DNA。該學(xué)科涉及基因組的DNA序列,基因的組織和控制,與DNA相互作用的分子,以及這些不同的成分影響細(xì)胞的生長(zhǎng)和功能的方式。

生殖細(xì)胞:參與有性繁殖的細(xì)胞,包括卵細(xì)胞、精子和發(fā)育成卵細(xì)胞或精子的前體細(xì)胞。生殖細(xì)胞中的DNA,包括任何突變或人為的基因編輯,都可能遺傳給下一代。早期胚胎中的基因組編輯被認(rèn)為是生殖系編輯,因?yàn)槿魏蜠NA的改變都有可能進(jìn)入最終出生的生物體內(nèi)的所有細(xì)胞。

組蛋白:構(gòu)成染色體上DNA包裝核心的蛋白質(zhì),以及三英尺長(zhǎng)的DNA能裝入細(xì)胞的原因。每個(gè)組蛋白被DNA包裹差不多兩次,就像串在一根線上的珠子一樣。組蛋白的包裝是由酶——比如增加和減少化學(xué)基團(tuán)的沉默信息調(diào)節(jié)因子——控制的。緊密包裝形成“沉默”的異染色質(zhì),而松散包裝形成開放式的常染色質(zhì),在常染色質(zhì)中基因可以被開啟。

興奮效應(yīng):任何殺不死你的東西都能讓你變得更強(qiáng)壯的概念。一定水平的生物損傷或逆境能刺激修復(fù)過程,對(duì)細(xì)胞生存和健康有益。人們觀察到,植物在被噴灑稀釋過的除草劑后會(huì)生長(zhǎng)得更快,進(jìn)而發(fā)現(xiàn)了這種效應(yīng)。

衰老信息理論:認(rèn)為衰老的成因是信息隨著時(shí)間的推移丟失,主要是表觀遺傳信息的丟失,其中大部分是可以恢復(fù)的。

二甲雙胍:一種從山羊豆中提取的分子,用于治療2型(年齡相關(guān))糖尿病,可能是一種長(zhǎng)壽藥。

線粒體:線粒體通常被稱為細(xì)胞的“發(fā)電站”,在一個(gè)叫作細(xì)胞呼吸的過程中分解營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)以產(chǎn)生能量。它們有自己的圓形基因組。

突變:從一個(gè)基因字符(核苷酸)到另一個(gè)基因字符的變化。DNA序列的變異導(dǎo)致了同一屬的不同生物之間令人難以置信的物種多樣性。雖然有些突變根本不會(huì)產(chǎn)生任何后果,但另一些突變可以直接導(dǎo)致疾病。突變可能是由DNA損傷劑引起的,比如紫外線、宇宙輻射或由酶進(jìn)行的DNA復(fù)制。突變也可以通過基因工程的方法被人為創(chuàng)造。

NAD:煙酰胺腺嘌呤二核苷酸,一種用于超過500種化學(xué)反應(yīng)的化學(xué)物質(zhì),這種化學(xué)物質(zhì)還參與沉默信息調(diào)節(jié)因子去除其他蛋白質(zhì)(如組蛋白)的乙酰基,以關(guān)閉基因或賦予它們細(xì)胞保護(hù)功能。健康的飲食和運(yùn)動(dòng)可以提高NAD水平。你有時(shí)看到的“+”符號(hào)——見于NAD+——表示它不攜帶氫原子。

核酸酶:一種分解RNA或DNA骨架的酶。斷開一條鏈會(huì)形成一個(gè)缺口,斷開兩條鏈會(huì)導(dǎo)致雙鏈斷裂。核酸內(nèi)切酶從RNA或DNA中間切割,而核酸外切酶從鏈的末端切割。Cas9和I-PpoI這兩種基因組工程工具屬于核酸內(nèi)切酶。

核酸或核苷酸:串聯(lián)在一起形成DNA或RNA的基本化學(xué)單位,由堿基、糖和磷酸鹽組成。磷酸鹽與糖連接形成DNA/RNA骨架,而堿基與其互補(bǔ)的一方結(jié)合形成堿基對(duì)。

核仁:核仁位于真核細(xì)胞的細(xì)胞核內(nèi),是核糖體DNA(rDNA)基因所在的區(qū)域,以及連接氨基酸形成蛋白質(zhì)的細(xì)胞機(jī)器的組裝地。

病原體:致病微生物。大多數(shù)微生物對(duì)人類沒有致病性,但有些菌株或菌種是有害的。

蛋白質(zhì):折疊成三維結(jié)構(gòu)的氨基酸鏈。每種蛋白質(zhì)都有特殊的功能來幫助細(xì)胞生長(zhǎng)、分裂和維持功能。蛋白質(zhì)是構(gòu)成所有生物的四大分子(蛋白質(zhì)、脂質(zhì)、糖類和核酸)之一。

雷帕霉素:又稱西羅莫司,是一種具有免疫抑制功能的化合物。它通過降低T細(xì)胞和B細(xì)胞對(duì)信號(hào)分子白細(xì)胞介素-2的敏感性來抑制其活性,并可通過抑制mTOR(哺乳動(dòng)物雷帕霉素靶蛋白)延長(zhǎng)壽命。

再分化:再分化是在逆轉(zhuǎn)衰老過程中發(fā)生的表觀遺傳改變。

核糖體DNA:核糖體DNA是細(xì)胞內(nèi)生成新蛋白質(zhì)的關(guān)鍵原料。核糖體DNA是核糖體RNA的基因源,后者是核糖體的組成部分。這些分子把氨基酸結(jié)合在一起,使其成為新的蛋白質(zhì)。

RNA:核糖核酸的縮寫。從DNA模板轉(zhuǎn)錄而來,通常用于指導(dǎo)蛋白質(zhì)的合成。CRISPR相關(guān)蛋白利用各類RNA作為向?qū)В贒NA中尋找匹配的靶序列。

senolytics:目前正在研發(fā)的有望殺死衰老細(xì)胞以減緩甚至逆轉(zhuǎn)與衰老相關(guān)的問題的藥物。

沉默信息調(diào)節(jié)因子:控制壽命的酶;它們存在于從酵母到人類的生物體中,并且需要NAD+才能發(fā)揮作用。它們從蛋白質(zhì)中去除乙酰基和酰基,以指導(dǎo)它們保護(hù)細(xì)胞免受逆境、疾病和死亡的傷害。在禁食或運(yùn)動(dòng)期間,沉默信息調(diào)節(jié)因子和NAD+水平升高,這可能解釋了為什么禁食和運(yùn)動(dòng)對(duì)健康有益。以酵母中的SIR2長(zhǎng)壽基因命名的哺乳動(dòng)物中的SIRT1~SIRT7(Sir2同系物1~7)基因在防止疾病和身體衰退方面起關(guān)鍵作用。

體細(xì)胞:多細(xì)胞生物中生殖細(xì)胞(卵細(xì)胞或精子)以外的所有細(xì)胞。體細(xì)胞DNA的突變或改變不會(huì)遺傳給后代,除非進(jìn)行克隆。

干細(xì)胞:有可能轉(zhuǎn)變成一種特定類型的細(xì)胞或分裂成更多干細(xì)胞的細(xì)胞。你身體中的大多數(shù)細(xì)胞都是分化形成的,也就是說,它們注定不能變成另一種細(xì)胞,例如,大腦中的一個(gè)細(xì)胞不能突然轉(zhuǎn)變成皮膚細(xì)胞。在身體長(zhǎng)期受損時(shí),成體干細(xì)胞會(huì)給身體重新注入活力。

鏈:一串相連的核苷酸,可以是DNA,也可以是RNA。當(dāng)互補(bǔ)時(shí),兩條DNA鏈可以交錯(cuò)著合在一起,堿基配對(duì)形成堿基對(duì)。DNA通常以雙鏈的形式存在,其形狀像扭曲的梯子或雙螺旋。RNA盡管可以折疊成復(fù)雜的形狀,但通常只由一條鏈組成。

生存回路:一種古老的細(xì)胞控制系統(tǒng),可能已經(jīng)進(jìn)化到能在逆境中將能量從生長(zhǎng)和繁殖轉(zhuǎn)移到細(xì)胞修復(fù)。在對(duì)逆境做出應(yīng)激反應(yīng)后,系統(tǒng)可能無法完全重置,隨著時(shí)間的推移,這會(huì)導(dǎo)致表觀基因組被擾亂和引起衰老的細(xì)胞身份喪失(見拮抗性多效基因)。

端粒/端粒丟失:一種保護(hù)染色體末端不受磨損的帽狀結(jié)構(gòu),類似于鞋帶末端防止磨損的金屬飾物或繩子燒焦的一端。隨著我們年齡的增長(zhǎng),端粒會(huì)不斷受到侵蝕,直到細(xì)胞達(dá)到海弗利克極限。這時(shí)細(xì)胞會(huì)認(rèn)為端粒是DNA斷裂處,于是會(huì)停止分裂并衰老。

轉(zhuǎn)錄:把遺傳信息復(fù)制到RNA鏈中的過程,由一種叫作RNA聚合酶的酶執(zhí)行。

轉(zhuǎn)化:基于RNA分子中編碼的指示制備蛋白質(zhì)的過程。由一種叫作核糖體的分子機(jī)器完成,核糖體將一系列組成氨基酸的原料連接在一起。由此產(chǎn)生的多肽鏈折疊成特定的三維物體,稱為蛋白質(zhì)。

病毒:一種具有傳染性的實(shí)體,只有通過劫持宿主有機(jī)體來復(fù)制自己才能生存。有自己的基因組,但技術(shù)上不被認(rèn)為是活的有機(jī)體。病毒感染從人類到植物再到微生物的所有有機(jī)體。多細(xì)胞生物有復(fù)雜的免疫系統(tǒng)來對(duì)抗病毒,而CRISPR系統(tǒng)則進(jìn)化來阻止病毒在細(xì)菌和古細(xì)菌中的感染。

沃丁頓地貌圖:一個(gè)描述細(xì)胞在胚胎發(fā)育過程中如何以三維地形圖的形式被賦予身份的生物學(xué)隱喻。代表干細(xì)胞的彈珠向下滾動(dòng)進(jìn)入分岔的山谷,每個(gè)山谷都標(biāo)志著細(xì)胞不同的發(fā)育途徑。

外源興奮假說:這一觀點(diǎn)認(rèn)為,我們的身體通過進(jìn)化來感知其他物種(如植物)的環(huán)境脅迫信號(hào),以便在即將來臨的逆境中蟄伏以保護(hù)自己。這就解釋了為什么這么多藥物來自植物。
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