TAPVC不合并肺靜脈血流梗阻，且伴有足夠大的房間隔缺損，則患兒存活時間較長，手術預后較好。合并肺靜脈梗阻者及其他嚴重畸形的胎兒，在出生后嬰兒期即出現青紫、呼吸困難等嚴重癥狀，早期出現肺動脈高壓，約80%死于1歲內，因此產前TAPVC的早期診斷、盡早手術治療具有重要意義。PAPVC的預后好于TAPVC，其預后主要與其異位引流的數目相關，合并肺靜脈血流梗阻及其他心內畸形時，預后相對較差。